┌─ Escherichia coli (3-284/293) K12 (80) ┌┴─ Escherichia coli (3-284/293) MS 21-1 ┌┴─ Escherichia coli (3-284/293) O111:H- str. 11128 (1) ┌┴─ Escherichia coli (3-284/293) 042 (6) ┌─────────────────────────────┴─ Escherichia coli (3-284/293) B354 ┌────────┴──────────────────────────────┬─ Escherichia coli (1-288/292) B354 │ └┬─ Escherichia coli (1-298/299) IAI39 [2] ┌────────┤ └─ Escherichia coli (1-298/299) MS 21-1 (1) │ └─────────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (1-292/293) SE15 │ └┬─ Escherichia coli (1-292/293) M605 │ └┬─ Escherichia coli (1-292/293) 536 (22) │ └┬─ Escherichia coli (1-292/293) WV_060327 │ └┬─ Escherichia coli (1-292/293) 2362-75 │ └─ Escherichia coli (1-292/293) E2348/69 (1) │ ┌─ Escherichia coli (16-289/312) ABU 83972 │ ┌┴─ Escherichia coli (16-286/309) E2348/69 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (16-289/312) 101-1 (43) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (16-289/312) APEC O1 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (16-289/312) 042 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (16-289/312) M605 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (16-289/312) CFT073 (2) │ ┌─────────────────────────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (16-289/312) MS 115-1 (57) │ │ └┬─ Escherichia coli (16-289/312) K12 (18) │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (16-289/312) ETEC H10407 │ │ └──────────────────────────────┬─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli K12 (125) │ │ └┬─ Escherichia coli E110019 (2) │┌─────┤ └┬─ Escherichia coli M718 ││ │ └┬─ Escherichia coli NC101 ┤│ │ └─ Escherichia coli B354 (1) ││ └──────────────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (28-323/323) H299 ││ └┬─ Escherichia coli (28-323/323) 53638 (1) ││ └┬─ Escherichia coli (28-323/323) O111:H- str. 11128 ││ └─ fig|1040638.4.peg.2153 O104:H4 (28-323/323) str. LB226692 (28) ││ ┌─ Escherichia coli (7-287/304) FVEC1302 (4) ││ ┌┴─ Escherichia coli (7-287/304) 042 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli (7-287/304) TA280 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (7-287/304) B185 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (7-287/304) B354 (2) ││ │└┬─ Escherichia coli (7-287/304) MS 69-1 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (7-287/304) 1044A (24) ││ │└┬─ Escherichia coli (7-287/304) M718 ││ │ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) HS (4) ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) 101-1 (9) ││ ││ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) B088 ││ ││ └─ Escherichia coli (7-287/304) O111:H- str. 11128 (1) ││ ┌┤└─ Escherichia coli (7-287/304) IAI39 (2) ││ ││ ┌─ Escherichia coli (7-292/304) APEC O1 (10) ││ ││ ┌┴─ Escherichia coli (7-287/304) 536 (11) ││ │└┬┴─ Escherichia coli (7-292/304) WV_060327 ││ │ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) 2362-75 (3) ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) K12 (18) └┤ ││ └┬─ fig|1040638.4.peg.5493 O104:H4 (7-287/304) str. LB226692 (12) │ ││ └┬─ Escherichia coli (7-287/304) E110019 (1) │ ┌────────────────────────────────────┤│ └─ Escherichia coli (7-287/304) H591 (5) │ │ │└─ Escherichia coli (7-287/304) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (7-287/304) M605 │ ┌────────┤ ┌─ Escherichia coli (4-290/308) TA280 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-292/308) SMS-3-5 │ │ └───────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-292/308) MS 21-1 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-292/308) H299 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-292/308) 042 (6) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-290/308) O157:H7 EDL933 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-290/308) 1125A (16) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-290/308) O157:H7 str. EC4486 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-290/308) B185 (1) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-290/308) 83972 (7) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-292/308) MS 69-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-290/308) B354 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-290/308) 101-1 (12) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (4-290/308) APEC O1 (8) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-290/308) MS 116-1 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-290/308) 2362-75 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-290/308) K12 (52) │ │ └─ Escherichia coli (4-290/308) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-278/280) 536 (7) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-278/280) TA206 └───┤ ┌┴─ Escherichia coli (11-305/307) ABU 83972 (16) │ ┌┴─ Escherichia coli (11-305/307) 2362-75 (2) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-278/280) BL21 (10) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (58-352/354) K12 (8) │ │└┬─ Escherichia coli (58-352/354) EC4100B │ ┌┤ └─ Escherichia coli (34-328/330) 042 (22) │ ┌┤└─ Escherichia coli (11-305/307) O111:H- str. 11128 │ │└┬─ Escherichia coli (11-305/307) 1044A (25) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (58-352/354) M718 │ │└┬─ Escherichia coli (58-352/354) MS 21-1 (1) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-278/280) H299 │ ││ └─ Escherichia coli (3-278/280) 1827-70 (7) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (11-305/307) FVEC1302 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (3-278/280) MS 198-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (11-305/307) 55989 (6) │ ┌────────────────────────────────────────────────┤└─ fig|6666666.5357.peg.3613 TY-2482 (3-278/280) strain (2) │ │ └─ Escherichia coli (58-352/354) E110019 (1) │ │ ┌────────────────────────────── Escherichia coli (3-288/296) B7A (7) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-279/310) B354 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-279/310) HS (1) └─┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-286/317) B185 (1) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (5-286/317) SMS-3-5 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-286/317) MS 187-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (26-307/338) 53638 (1) │ │ │└─ Escherichia coli (5-286/317) MS 21-1 └──┤ ┌┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.2190 TY-2482 (5-286/317) strain (92) │ │└┬┴─ Escherichia coli (5-286/317) IAI1 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (5-286/317) MS 115-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-279/310) K12 │ ││ └─ Escherichia coli (5-286/317) BW2952 (6) │ ┌──────────────────────┤└┬─ Escherichia coli (1-279/310) M605 │ │ │ └─ Escherichia coli (5-286/317) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (1-279/310) B171 [2] └──┤ ┌─ Escherichia coli (4-308/311) B354 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-308/311) MS 69-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-308/311) 042 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-308/311) FVEC1302 (5) └────────────────────────────────────────────────────┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-308/311) 83972 (11) │┌┤ └─ Escherichia coli (4-308/311) MS 185-1 ││└┬─ Escherichia coli (4-308/311) WV_060327 ││ └─ Escherichia coli (4-308/311) 2362-75 (18) └┤ ┌─ Escherichia coli (4-308/311) 1044A (23) │ ┌┴─ Escherichia coli (4-308/311) O157:H7 EDL933 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (4-308/311) E24377A (3) │┌┴─ Escherichia coli (4-308/311) MS 182-1 (1) └┤┌─ fig|1040638.4.peg.2736 O104:H4 (4-308/311) str. LB226692 (28) └┤ ┌─ Escherichia coli (4-308/311) M718 └┬┴─ Escherichia coli (4-308/311) B185 └┬─ Escherichia coli (4-308/311) 101-1 (13) └┬─ Escherichia coli (4-308/311) H736 (1) └─ Escherichia coli (4-308/311) K12 (9)
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (21) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (18) |
| LysR family transcriptional regulator YdcI | (18) |
| Transcriptional activator protein LysR | (17) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (14) |
| LysR family transcriptional regulator lrhA | (10) |
| LysR family transcriptional regulator YneJ | (6) |
| Hydrogen peroxide-inducible genes activator | (6) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (5) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (3) |
| LysR family transcriptional regulator STM2281 | (3) |
| Hypothetical transcriptional regulator yafC | (1) |
| LysR family transcriptional regulator near succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase | (1) |
| Others | (5) |