┌─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 (6-333/342) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (6-333/342) 042 ├─ Escherichia coli (6-333/342) 1044A ├─ Escherichia coli (6-333/342) 2362-75 ├─ Escherichia coli (6-333/342) 55989 ├─ Escherichia coli (6-333/342) B088 ├─ Escherichia coli (6-333/342) B171 ├─ Escherichia coli (6-333/342) B7A ├─ Escherichia coli (6-333/342) E22 ├─ Escherichia coli (6-333/342) E2348/69 ├─ Escherichia coli (6-333/342) E24377A ├─ Escherichia coli (6-333/342) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (6-333/342) IAI1 ├─ Escherichia coli (6-333/342) IAI39 ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (6-333/342) SE11 ├─ Escherichia coli (6-333/342) TA280 ├─ Escherichia coli (6-333/342) W ┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) W │├─ Escherichia coli (6-333/342) UMN026 │├─ Escherichia coli (6-333/342) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (6-333/342) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (6-333/342) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 84-1 │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (6-333/342) KO11 │├─ Escherichia coli (6-333/342) IAI39 │├─ Escherichia coli (6-333/342) IAI1 │├─ Escherichia coli (6-333/342) EC4100B │├─ Escherichia coli (6-333/342) E24377A ┌┤├─ Escherichia coli (6-333/342) E22 ││├─ Escherichia coli (6-333/342) B7A ││├─ Escherichia coli (6-333/342) B185 ││├─ Escherichia coli (6-333/342) B171 ││├─ Escherichia coli (6-333/342) 55989 ││├─ Escherichia coli (6-333/342) 536A ││├─ Escherichia coli (6-333/342) 1212A ││├─ Escherichia coli (6-333/342) 042 ││└─ fig|6666666.5357.peg.3940 TY-2482 (6-333/342) strain ││ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) 536 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) F11 ││ ┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) MS 200-1 ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) F11 ││┌┤└─ Escherichia coli (6-333/342) 536 │││└┬─ Escherichia coli (6-333/342) E110019 │││ └─ Escherichia coli (6-333/342) E110019 │││ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) 83972 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) CFT073 │└┤ ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 185-1 │ │┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) MS 45-1 │ ││├─ Escherichia coli (6-333/342) CFT073 │ ││└─ Escherichia coli (6-333/342) ABU 83972 │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) ED1a │ └┤ ├─ Escherichia coli (6-333/342) NC101 ┌┤ │┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) WV_060327 ││ ││├─ Escherichia coli (6-333/342) O83:H1 str. NRG 857C ││ ││└─ Escherichia coli (6-333/342) ED1a ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) M605 ││ │┌┴─ Escherichia coli (6-333/342) SE15 ││ ││┌─ Escherichia coli (6-333/342) APEC O1 ││ └┤├─ Escherichia coli (6-333/342) S88 ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) UTI89 ││ └┼─ Escherichia coli (6-333/342) UTI89 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) UM146 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) IHE3034 ││ └─ Escherichia coli (6-333/342) APEC O1 ││ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) 1125A ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4486 ││┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. TW14359 │││├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC508 │││├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4401 │││├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4196 │││├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4113 │└┤├─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4045 │ │└─ Escherichia coli (6-333/342) O157:H7 str. EC4024 │ │┌─ Escherichia coli (6-333/342) MS 21-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-333/342) 101-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) BL21 ┌┤ └┤ ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 187-1 ││ │┌┼─ Escherichia coli (6-333/342) OP50 ││ ││├─ Escherichia coli (DE3 6-333/342) BL21(DE3) ││ ││└─ Escherichia coli (6-333/342) B str. REL606 ││ └┤┌─ Escherichia coli (5-316/325) 1827-70 ││ ││┌─ Escherichia coli (6-333/342) MS 115-1 ││ │││┌─ Escherichia coli (6-333/342) 53638 ││ └┤│├─ Escherichia coli (6-333/342) ATCC 8739 ││ ││├─ Escherichia coli (6-333/342) DH1 ││ ││├─ Escherichia coli (6-333/342) H736 ││ └┤├─ Escherichia coli (6-333/342) HS ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 116-1 ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 196-1 ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli (6-333/342) str. K-12 substr. DH10B ┌┤│ │├─ Escherichia coli (6-333/342) str. K-12 substr. MG1655 │││ └┼─ Escherichia coli (6-333/342) str. K-12 substr. MG1655 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) str. K-12 substr. DH10B │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) W3110 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) O111:H- str. 11128 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) MS 146-1 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) K12 │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) HS │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) ETEC H10407 ┌───────────────────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) BW2952 │ │││ ├─ Escherichia coli (6-333/342) ATCC 8739 │ │││ └─ Escherichia coli (6-333/342) 53638 │ ││└┬─ Escherichia coli (5-316/325) TA271 │ ││ └─ Escherichia coli (5-316/325) FVEC1412 │ ││┌─ Escherichia coli (6-333/342) H299 │ │└┼─ Escherichia coli (6-333/342) MS 69-1 │ │ └─ Escherichia coli (6-333/342) B354 ┌───────┤ └─ Escherichia coli (6-333/342) M718 │ │ ┌─ Escherichia coli (10-321/344) ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (19-330/353) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) M605 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) UM146 │ └────────────────────────┼─ Escherichia coli (10-321/344) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) UTI89 ┌─────┤ ├─ Escherichia coli (10-321/344) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (19-330/353) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (10-321/344) APEC O1 │ │ └─ Escherichia coli (10-321/344) 83972 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-331/336) E24377A │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-331/336) E24377A │ │ ┌─────┴─ Escherichia coli (1-331/336) SMS-3-5 │ └───────────────────────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-311/336) MS 107-1 │ └─┼─ Escherichia coli (1-311/336) MS 175-1 │ ├─ Escherichia coli (1-311/336) MS 119-7 │ └─ Escherichia coli (1-311/336) M718 │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ ├─ Escherichia coli 1212A │ ├─ Escherichia coli B171 │ ├─ Escherichia coli B185 │ ├─ Escherichia coli B7A │ ├─ Escherichia coli E22 │ ├─ Escherichia coli H591 │ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli SE11 │ ┌┼─ Escherichia coli TA271 │ │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli MS 145-7 │ ┌┤├─ Escherichia coli MS 119-7 │ ││├─ Escherichia coli EC4100B │ ││├─ Escherichia coli E22 │ ││├─ Escherichia coli B7A │ ││├─ Escherichia coli B171 │ ││├─ Escherichia coli 536A │ ││└─ Escherichia coli 1125A │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1745 TY-2482 strain │ ││├─ Escherichia coli 55989 │ ││├─ Escherichia coli E110019 │ ││├─ Escherichia coli IAI1 │ ┌┤│├─ Escherichia coli MS 107-1 │ │││├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ││└┼─ Escherichia coli W │ ││ ├─ Escherichia coli W │ ││ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ ││ ├─ Escherichia coli KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli IAI1 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli E110019 │ │││ ├─ Escherichia coli 55989 │ │││ └─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 str. LB226692 │ ││└┬─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤│ └┬─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │││ └─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││└─ Escherichia coli MS 21-1 │ │└─ Escherichia coli MS 185-1 │ ┌┤┌─ Escherichia coli APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli S88 │ ││├─ Escherichia coli UTI89 │ │└┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli UM146 │ │ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ └─ Escherichia coli APEC O1 │ │┌─ Escherichia coli 042 │ │├─ Escherichia coli 2362-75 │ │├─ Escherichia coli 536 │ │├─ Escherichia coli 53638 │ │├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ │├─ Escherichia coli CFT073 │ │├─ Escherichia coli DH1 │ │├─ Escherichia coli ED1a │ ┌┤├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli F11 │ ││├─ Escherichia coli FVEC1412 │ ││├─ Escherichia coli H736 │ ││├─ Escherichia coli HS │ ││├─ Escherichia coli IAI39 │ ││├─ Escherichia coli MS 116-1 │ ││├─ Escherichia coli MS 175-1 │ ││├─ Escherichia coli MS 198-1 │ ││├─ Escherichia coli MS 45-1 │ ││├─ Escherichia coli NC101 │ ││├─ Escherichia coli SE15 │ ││├─ Escherichia coli TA143 │ ││├─ Escherichia coli TA280 │ ││├─ Escherichia coli W3110 │ ││├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │└┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli TA206 │ │ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ││ ├─ Escherichia coli MS 69-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 196-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 146-1 │ ││ ├─ Escherichia coli M605 │ ││ ├─ Escherichia coli IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli HS │ ││ ├─ Escherichia coli H299 │ ││ ├─ Escherichia coli FVEC1302 │ ││ ├─ Escherichia coli F11 │ ││ ├─ Escherichia coli ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli E2348/69 │ ┌───────────────┤│ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ││ ├─ Escherichia coli BW2952 │ │ ││ ├─ Escherichia coli B354 ┤ │ ││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 83972 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 53638 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 536 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 1827-70 │ │ ││ └─ Escherichia coli 042 │ │ │└─ Escherichia coli M718 │ │ │┌─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ │├─ Escherichia coli E24377A │ │ │├─ Escherichia coli MS 115-1 │ │ └┼─ Escherichia coli OP50 │ │ ├─ Escherichia coli MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli E24377A │ │ ├─ Escherichia coli BL21 │ ┌───────────┤ └─ Escherichia coli 101-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (11-342/342) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli IAI39 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli TA206 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli IAI39 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli CFT073 │ │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (11-342/342) APEC O1 │ │ │ │ ││├─ Escherichia coli UM146 │ │ │ │ │└┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ └────────────────────────┤ ┌┤ ├─ Escherichia coli UTI89 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli APEC O1 │ │ │┌┤│┌─ Escherichia coli ED1a │ │ │││└┼─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ │││ └─ Escherichia coli ED1a │ │ ││└─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.970 O104:H4 str. LB226692 │ │ ││ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ ││ ├─ Escherichia coli EC4100B │ │ ││ ├─ Escherichia coli HS │ │ ││ ├─ Escherichia coli W │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli W │ │ ││ │├─ Escherichia coli KO11 │ │ └┤ │├─ Escherichia coli HS │ │ │┌┤├─ Escherichia coli 55989 │ │ │││└─ fig|6666666.5357.peg.1198 TY-2482 strain │ ┌───────────────────┤ │││┌─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ │ ││└┤ ┌─ Escherichia coli B7A │ │ │ ││ │┌┴─ Escherichia coli B7A │ │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli M718 │ │ │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli 536 │ │ │ ││ │┌┴─ Escherichia coli 536 │ │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli F11 │ │ │ ││ └┼─ Escherichia coli MS 200-1 │ │ │ └┤ └─ Escherichia coli F11 │ │ │ │┌─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ │ │├─ Escherichia coli BW2952 │ │ │ │├─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ │ │├─ Escherichia coli K12 │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli OP50 │ │ │ │├─ Escherichia coli TA143 │ │ │ │├─ Escherichia coli W3110 │ │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli SE15 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli FVEC1412 │┌────┤ │ ├─ Escherichia coli DH1 ││ │ │ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││ │ │ └─ Escherichia coli 2362-75 ││ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-322/339) H299 ││ │ │ ┌─────────────────────┴─ Escherichia coli (12-322/339) M718 ││ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-337/343) TA271 ││ │ └─────────────┤ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.666 O104:H4 (12-337/343) str. LB226692 ││ │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) 042 ││ │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) 55989 ││ │ └─────────────────────┤┌┼─ Escherichia coli (12-337/343) SE15 ││ │ ││├─ Escherichia coli (12-337/343) 55989 ││ │ ││├─ Escherichia coli (12-337/343) 042 ││ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3715 TY-2482 (12-337/343) strain ││ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (12-337/343) ETEC H10407 ││ │ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) MS 84-1 ││ │ │┌┼─ Escherichia coli (12-337/343) NC101 ││ │ ││└─ Escherichia coli (12-337/343) MS 200-1 ││ │ └┤┌─ Escherichia coli (12-337/343) ABU 83972 ││ │ │├─ Escherichia coli (12-337/343) CFT073 ││ │ │├─ Escherichia coli (12-337/343) MS 185-1 ││ │ └┼─ Escherichia coli (12-337/343) TA206 ││ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) MS 45-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) H299 ││ │ ├─ Escherichia coli (12-337/343) CFT073 ││ │ └─ Escherichia coli (12-337/343) 83972 ││ └─────┬───────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (3-317/331) M718 ││ └─────────────────────────┬──────────────────────────── Escherichia coli (5-313/358) TA206 ││ └───────────────┬─ Escherichia coli (1-315/356) MS 116-1 ││ └─ Escherichia coli (1-315/356) H736 ││ ┌─ Escherichia coli (6-330/343) MS 107-1 ││ ┌───────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (6-330/343) MS 78-1 ││ │ └─ Escherichia coli (6-330/343) MS 69-1 ││ │ ┌─ Escherichia coli (4-312/348) 042 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) 1827-70 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) ATCC 8739 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) B088 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) BL21 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) E110019 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) EC4100B ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) FVEC1412 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) H591 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) HS ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) IAI1 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) M718 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 115-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 119-7 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 187-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 21-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 84-1 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O26:H11 str. 11368 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) SMS-3-5 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) TA271 ││ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) UMN026 ││ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-310/346) W ││ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) W ││ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) TA280 └┤ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) TA143 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O111:H- str. 11128 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 69-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 198-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 107-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) KO11 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) IAI1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-310/346) HS │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) H299 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) FVEC1302 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (DE3 2-310/346) BL21(DE3) │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) B354 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) B str. REL606 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-312/348) ATCC 8739 │ │ ││└─ Escherichia coli (2-310/346) 042 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-314/346) 53638 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (2-314/346) 53638 │ │ │││┌─ Escherichia coli (2-310/346) B7A │ │ ┌┤└┤├─ Escherichia coli (2-310/346) E24377A │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 182-1 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-310/346) MS 78-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 145-7 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) E24377A │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-310/346) B7A │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-310/346) B171 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) E22 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (2-310/346) O103:H2 str. 12009 │ │ │││├─ Escherichia coli (2-310/346) E22 │ │ │││└─ Escherichia coli (2-310/346) B171 │ │ │││┌─ Escherichia coli (2-310/346) DH1 │ │ │└┤├─ Escherichia coli (2-310/346) H736 │ │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 146-1 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 196-1 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) str. K-12 substr. DH10B │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-310/346) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) str. K-12 substr. DH10B │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) W3110 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 175-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) K12 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) ETEC H10407 │ │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (2-310/346) BW2952 │ │ │││┌─ Escherichia coli (2-310/346) 101-1 │ │ ││└┤┌─ fig|6666666.5357.peg.499 TY-2482 (2-310/346) strain │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-310/346) 55989 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3225 O104:H4 (2-310/346) str. LB226692 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-310/346) NC101 │ │ │││┌─ Escherichia coli (4-312/348) E2348/69 │ │ ││││┌─ Escherichia coli (2-310/346) 536 │ │ │└┤│├─ Escherichia coli (2-310/346) 83972 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) APEC O1 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (4-312/348) CFT073 └───┤ │ ││├─ Escherichia coli (2-310/346) ED1a │ │ └┤├─ Escherichia coli (2-310/346) F11 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) IHE3034 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 45-1 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (2-310/346) S88 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) TA206 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-310/346) UTI89 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-310/346) WV_060327 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) UM146 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) SE15 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O83:H1 str. NRG 857C │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) MS 200-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) M605 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-312/348) APEC O1 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-310/346) ABU 83972 │ ┌─────────────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (2-310/346) 536 │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-310/346) 2362-75 │ │ │└─ Escherichia coli (2-310/346) B185 │ │ │┌─ Escherichia coli (2-310/346) 1125A │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) 536A │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4024 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4045 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. TW14359 │ │ └┼─ Escherichia coli (2-310/346) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (2-310/346) 1212A │ │ └─ Escherichia coli (2-310/346) 1044A │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3714 O104:H4 (3-321/341) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) FVEC1412 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) HS │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 116-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 69-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. TW14588 └───┤ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O55:H7 str. CB9615 │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) TA271 │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) W │ ┌┼─ Escherichia coli (3-321/341) W3110 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) TA280 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) TA143 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) SE11 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 115-1 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) M718 │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) K12 │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-321/341) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) H736 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) H299 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) E22 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) B7A │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) B171 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) 1212A │ ││├─ Escherichia coli (3-321/341) 1044A │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.1860 TY-2482 (3-321/341) strain │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-321/341) ABU 83972 │ ┌────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 185-1 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (3-321/341) MS 45-1 │ │ │││└─ Escherichia coli (3-321/341) CFT073 │ │ │││┌─ Escherichia coli (3-321/341) 536 │ │ │││├─ Escherichia coli (3-321/341) APEC O1 │ │ │└┤├─ Escherichia coli (3-321/341) F11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) MS 200-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-321/341) TA206 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-321/341) WV_060327 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) UM146 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) M605 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-321/341) 536 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-321/341) 2362-75 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-321/341) E24377A │ │ └─ Escherichia coli (3-321/341) E24377A │ │ ┌───────── Escherichia coli (4-324/336) O157:H7 str. EC4024 └────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (4-322/332) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4113 └───────────────────────────────────────┤ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) 536A │ ││└─ Escherichia coli (4-322/332) 1125A │ │└─ Escherichia coli (4-322/332) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-322/332) 2362-75 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 45-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/332) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 200-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) F11 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-322/332) E2348/69 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) 83972 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (4-322/332) 536 │ │ ││└─ Escherichia coli (4-322/332) NC101 └──┤ │└┬─ Escherichia coli (4-322/332) M605 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-322/332) SE15 │ ││┌─ Escherichia coli (4-322/332) ED1a │ │└┼─ Escherichia coli (4-322/332) TA206 │┌┤ └─ Escherichia coli (4-322/332) ED1a │││ ┌─ Escherichia coli (4-322/332) SMS-3-5 │││┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) MS 21-1 ││└┤┌─ Escherichia coli (4-322/332) WV_060327 ││ ││┌─ Escherichia coli (4-322/332) APEC O1 ││ └┤├─ Escherichia coli (4-322/332) S88 ││ │├─ Escherichia coli (4-322/332) UTI89 ││ └┼─ Escherichia coli (4-322/332) UTI89 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) UM146 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) IHE3034 ││ └─ Escherichia coli (4-322/332) APEC O1 ││ ┌─ Escherichia coli (4-322/332) B088 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) B171 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) B7A ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) E22 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) E24377A ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) H591 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 119-7 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 145-7 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 78-1 └┤ ├─ Escherichia coli (4-322/332) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) SE11 │ ├─ Escherichia coli (4-322/332) W │ ┌┼─ Escherichia coli (4-322/332) W │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) TA271 │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 124-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-322/332) KO11 │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (4-322/332) E22 │┌┤│├─ Escherichia coli (4-322/332) B7A ││││└─ Escherichia coli (4-322/332) B171 │││└─ Escherichia coli (4-322/332) O111:H- str. 11128 ││└┬─ Escherichia coli (4-322/332) E110019 ││ └─ Escherichia coli (4-322/332) E110019 ││ ┌─ Escherichia coli (4-322/332) IAI39 ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) IAI39 ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) TA280 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) H299 │ ┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) MS 69-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (4-322/332) M718 │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.1436 TY-2482 (4-322/332) strain │┌┤├─ Escherichia coli (4-322/332) 55989 ││└┼─ Escherichia coli (4-322/332) IAI1 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) IAI1 ││ ├─ Escherichia coli (4-322/332) 55989 ││ └─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-322/332) str. LB226692 └┤┌─ Escherichia coli (4-322/332) MS 196-1 ││┌─ Escherichia coli (4-322/332) 1827-70 ││├─ Escherichia coli (4-322/332) 53638 ││├─ Escherichia coli (4-322/332) ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli (4-322/332) BL21 ││├─ Escherichia coli (4-322/332) BW2952 └┤├─ Escherichia coli (4-322/332) ETEC H10407 │├─ Escherichia coli (4-322/332) HS │├─ Escherichia coli (4-322/332) K12 │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 116-1 │├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 175-1 │├─ Escherichia coli (4-322/332) W3110 │├─ Escherichia coli (4-322/332) str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli (4-322/332) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (4-322/332) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (4-322/332) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 187-1 ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (4-322/332) MS 115-1 ├─ Escherichia coli (4-322/332) HS ├─ Escherichia coli (4-322/332) H736 ├─ Escherichia coli (4-322/332) DH1 ├─ Escherichia coli (DE3 4-322/332) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (4-322/332) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (4-322/332) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (4-322/332) 53638 └─ Escherichia coli (4-322/332) 101-1
Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (129) |
Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (128) |
Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (128) |
Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (120) |
Purine nucleotide synthesis repressor | (94) |
Positive regulator of L-idonate catabolism | (59) |
Transcriptional regulator, LacI family | (33) |
Putative ThuR, regulatory protein for trehalosemaltose transport | (7) |
Transcriptional repressor of the lac operon | (3) |
Ribose operon repressor | (3) |
hypothetical transcriptional regulator YcjW | (2) |
Sucrose specific transcriptional regulator CscR, LacI family | (1) |
LacI-family transcriptional regulatory protein | (1) |
Others | (14) |