┌─ Escherichia coli (6-124/128) 042 ├─ Escherichia coli (6-124/128) 101-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) 2362-75 ├─ Escherichia coli (6-124/128) 536 ├─ Escherichia coli (6-124/128) 53638 ├─ Escherichia coli (6-124/128) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (6-124/128) APEC O1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (6-124/128) B088 ├─ Escherichia coli (6-124/128) B171 ├─ Escherichia coli (6-124/128) B7A ├─ Escherichia coli (6-124/128) BL21 ├─ Escherichia coli (6-124/128) BW2952 ├─ Escherichia coli (6-124/128) CFT073 ├─ Escherichia coli (6-124/128) E22 ├─ Escherichia coli (6-124/128) E2348/69 ├─ Escherichia coli (6-124/128) E24377A ├─ Escherichia coli (6-124/128) ED1a ├─ Escherichia coli (6-124/128) F11 ├─ Escherichia coli (6-124/128) H299 ├─ Escherichia coli (6-124/128) HS ├─ Escherichia coli (6-124/128) IAI1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) IAI39 ├─ Escherichia coli (6-124/128) IHE3034 ├─ Escherichia coli (6-124/128) M605 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (6-124/128) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (6-124/128) OP50 ├─ Escherichia coli (6-124/128) SE15 ├─ Escherichia coli (6-124/128) TA206 ├─ Escherichia coli (6-124/128) TA280 ├─ Escherichia coli (6-124/128) UTI89 ├─ Escherichia coli (6-124/128) W3110 ├─ Escherichia coli (6-124/128) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (6-124/128) str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli (6-124/128) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (6-124/128) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (6-124/128) WV_060327 │├─ Escherichia coli (6-124/128) UTI89 │├─ Escherichia coli (6-124/128) UM146 │├─ Escherichia coli (6-124/128) TA271 │├─ Escherichia coli (6-124/128) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (6-124/128) S88 │├─ Escherichia coli (6-124/128) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (6-124/128) NC101 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 200-1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 175-1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 115-1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) M718 │├─ Escherichia coli (6-124/128) K12 │├─ Escherichia coli (6-124/128) IAI39 │├─ Escherichia coli (6-124/128) IAI1 │├─ Escherichia coli (6-124/128) HS ┌┤├─ Escherichia coli (6-124/128) H591 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) F11 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) ED1a ││├─ Escherichia coli (6-124/128) E24377A ││├─ Escherichia coli (6-124/128) E22 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) DH1 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) CFT073 ││├─ Escherichia coli (DE3 6-124/128) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli (6-124/128) B7A ││├─ Escherichia coli (6-124/128) B185 ││├─ Escherichia coli (6-124/128) B171 ┌┤│├─ Escherichia coli (6-124/128) B str. REL606 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) APEC O1 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) 83972 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) 53638 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) 536 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) 1827-70 │││└─ Escherichia coli (6-124/128) 042 ││└┬─ Escherichia coli (6-124/128) MS 146-1 ││ └─ Escherichia coli (6-124/128) H736 ││┌─ Escherichia coli (6-124/128) SE11 │└┤┌─ Escherichia coli (6-124/128) FVEC1412 │ │├─ Escherichia coli (6-124/128) TA143 │ └┼─ Escherichia coli (6-124/128) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 198-1 ┌┤ └─ Escherichia coli (6-124/128) FVEC1302 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.4619 O104:H4 (6-124/128) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) EC4100B ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O111:H- str. 11128 ││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) W ││┌┼─ Escherichia coli (6-124/128) W │││├─ Escherichia coli (6-124/128) O26:H11 str. 11368 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) MS 78-1 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) KO11 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) E110019 │││├─ Escherichia coli (6-124/128) 55989 │││└─ fig|6666666.5357.peg.2305 TY-2482 (6-124/128) strain ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (6-124/128) 1125A ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) 536A ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 EDL933 ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. EC4501 ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. EC869 ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. TW14588 ││ └┼─ Escherichia coli (6-124/128) O55:H7 str. CB9615 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. Sakai │││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. FRIK2000 │││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 str. EC508 │││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 EDL933 │││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) O157:H7 ┌────────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli (6-124/128) 1212A │ │││ └─ Escherichia coli (6-124/128) 1044A │ ││└─ Escherichia coli (11-124/128) MS 69-1 │ │└┬─ Escherichia coli (15-124/128) B354 │ │ └─ Escherichia coli (15-124/128) O83:H1 str. NRG 857C │ └─ Escherichia coli (25-133/137) MS 124-1 │ ┌─ Escherichia coli (20-121/129) H299 │ ┌┴─ Escherichia coli (20-121/129) M718 │ ┌──────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (20-121/129) SMS-3-5 │ ┌─────────┴───────────────── Escherichia coli (1-126/130) TA206 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-143/145) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (17-143/145) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-143/145) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (22-148/150) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (17-143/145) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (17-143/145) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (22-148/150) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ fig|6666666.5357.peg.3957 TY-2482 (1-127/129) strain │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) B088 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 1-127/129) BL21(DE3) │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) EC4100B │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) ED1a │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) HS ┤ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) M605 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 119-7 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 182-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 78-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) TA143 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) UM146 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) W │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-127/129) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) str. K-12 substr. MG1655 └──────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (1-127/129) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) W3110 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) W │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) TA280 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) TA206 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) SE11 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) OP50 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 69-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 146-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 115-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-127/129) M718 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) KO11 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) IHE3034 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) H736 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) H299 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) E22 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) DH1 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) BL21 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) B354 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) B171 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (1-127/129) APEC O1 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (1-127/129) 83972 │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 55989 │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 53638 │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 536 │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 1212A │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 1044A │ │││├─ Escherichia coli (1-127/129) 042 │ │││├─ fig|1040638.4.peg.1690 O104:H4 (1-127/129) str. LB226692 │ │││├─ Escherichia coli (17-143/145) HS │ │││├─ Escherichia coli (17-143/145) E2348/69 │┌─────┤││├─ Escherichia coli (17-143/145) E110019 ││ │││├─ Escherichia coli (17-143/145) B7A ││ │││├─ Escherichia coli (17-143/145) ATCC 8739 ││ │││└─ Escherichia coli (17-143/145) 53638 ││ ││└─ Escherichia coli (1-127/129) 2362-75 ││ ││┌─ Escherichia coli (1-127/129) FVEC1412 ││ │└┼─ Escherichia coli (1-127/129) UMN026 ││ │ ├─ Escherichia coli (1-127/129) MS 198-1 └┤ │ └─ Escherichia coli (1-127/129) FVEC1302 │ └┬─ Escherichia coli (1-127/129) E24377A │ └─ Escherichia coli (17-143/145) E24377A │ ┌─ Escherichia coli (14-141/141) TA143 │ ┌┴─ Escherichia coli (14-141/141) TA280 │ │ ┌─ Escherichia coli (14-141/141) MS 115-1 │ │┌┴─ Escherichia coli (14-141/141) MS 146-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (14-141/141) MS 196-1 └─────┤│ ├─ Escherichia coli MS 124-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 84-1 ││┌┤└─ Escherichia coli 2362-75 │││└┬─ Escherichia coli MS 116-1 │││ └─ Escherichia coli (14-141/141) MS 175-1 └┤│ ┌─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 EDL933 ││┌┴─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 EDL933 │││ ┌─ Escherichia coli (14-141/141) E24377A │││┌┴─ Escherichia coli E24377A ││││┌─ Escherichia coli (25-152/152) APEC O1 ││││├─ Escherichia coli (25-152/152) CFT073 ││││├─ Escherichia coli (14-141/141) 042 └┤││├─ Escherichia coli (14-141/141) 1044A │││├─ Escherichia coli (14-141/141) 53638 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) 55989 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) B171 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) B7A │││├─ Escherichia coli (14-141/141) DH1 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) E110019 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) E22 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) F11 │││├─ Escherichia coli (14-141/141) H299 └┤│├─ Escherichia coli (14-141/141) H736 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) IAI39 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) K12 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) M605 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) MS 119-7 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) MS 198-1 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O111:H- str. 11128 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4076 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4115 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4401 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC508 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. FRIK2000 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. TW14359 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) O55:H7 str. CB9615 ││├─ Escherichia coli (14-141/141) SE11 └┤├─ Escherichia coli (14-141/141) TA271 │├─ Escherichia coli (14-141/141) WV_060327 │├─ Escherichia coli (14-141/141) str. K-12 substr. MG1655 │├─ fig|1040638.4.peg.947 O104:H4 str. LB226692 │├─ Escherichia coli 1212A │├─ Escherichia coli 536 │├─ Escherichia coli 53638 │├─ Escherichia coli ABU 83972 │├─ Escherichia coli ATCC 8739 │├─ Escherichia coli B088 │├─ Escherichia coli B354 │├─ Escherichia coli BL21 │├─ Escherichia coli CFT073 │├─ Escherichia coli ED1a │├─ Escherichia coli FVEC1302 │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli IAI1 │├─ Escherichia coli MS 107-1 │├─ Escherichia coli MS 185-1 │├─ Escherichia coli MS 200-1 │├─ Escherichia coli MS 45-1 │├─ Escherichia coli MS 78-1 │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli SMS-3-5 │├─ Escherichia coli UMN026 │├─ Escherichia coli UTI89 │├─ Escherichia coli W └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli W3110 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli UTI89 ├─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli S88 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli MS 69-1 ├─ Escherichia coli MS 21-1 ├─ Escherichia coli MS 187-1 ├─ Escherichia coli MS 145-7 ├─ Escherichia coli IHE3034 ├─ Escherichia coli IAI1 ├─ Escherichia coli FVEC1412 ├─ Escherichia coli ED1a ├─ Escherichia coli EC4100B ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B str. REL606 ├─ Escherichia coli APEC O1 ├─ Escherichia coli 83972 ├─ Escherichia coli 536 ├─ Escherichia coli 1827-70 ├─ fig|6666666.5357.peg.1798 TY-2482 strain ├─ Escherichia coli (14-141/141) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (14-141/141) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (14-141/141) UM146 ├─ Escherichia coli (14-141/141) SE15 ├─ Escherichia coli (14-141/141) OP50 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (14-141/141) O157:H7 ├─ Escherichia coli (14-141/141) NC101 ├─ Escherichia coli (14-141/141) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (14-141/141) M718 ├─ Escherichia coli (14-141/141) KO11 ├─ Escherichia coli (14-141/141) IAI39 ├─ Escherichia coli (14-141/141) HS ├─ Escherichia coli (14-141/141) H591 ├─ Escherichia coli (14-141/141) F11 ├─ Escherichia coli (14-141/141) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (14-141/141) E22 ├─ Escherichia coli (14-141/141) E110019 ├─ Escherichia coli (14-141/141) BW2952 ├─ Escherichia coli (14-141/141) B185 ├─ Escherichia coli (14-141/141) 55989 ├─ Escherichia coli (14-141/141) 536A ├─ Escherichia coli (14-141/141) 1125A ├─ Escherichia coli (14-141/141) 101-1 ├─ Escherichia coli (25-152/152) E2348/69 ├─ Escherichia coli (25-152/152) ATCC 8739 └─ Escherichia coli (25-152/152) 042
| Hypothetical protein TdcF in cluster with anaerobic degradation of L-threonine to propionate | (130) |
| Protein YjgF, putative endoribonuclease L-PSP | (128) |
| Possible ring-opening amidohydrolase RutC in novel pyrimidine catabolism pathway | (120) |
| Endoribonuclease L-PSP | (8) |
| UPF0076 protein rutC (Pyrimidine utilization protein C) | (1) |
| Others | (6) |