┌─ Escherichia coli (1-310/332) ED1a (2) ┌┴─ Escherichia coli (1-310/332) 83972 (9) ┌┴─ Escherichia coli (1-310/332) APEC O1 (5) ┌┴─ Escherichia coli (1-310/332) MS 145-7 ┌┴─ Escherichia coli (1-310/332) K12 (29) ┌┴┬─ Escherichia coli (1-310/332) B7A (1) │ └┬─ Escherichia coli (1-310/332) 536 (4) ┌┤ └─ Escherichia coli (1-310/332) M718 ┌─────────────────┤└─ Escherichia coli (1-310/332) MS 124-1 (1) │ └─ Escherichia coli (1-310/332) MS 196-1 ┌──────┤ ┌─ Escherichia coli (3-326/331) 101-1 (7) │ └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-326/331) M718 │ │┌┴─ Escherichia coli (3-326/331) 042 (53) │ └┤┌─ Escherichia coli (6-316/321) str. K-12 substr. DH10B │ └┤┌─ Escherichia coli (3-326/331) APEC O1 (6) ┌─────────────────┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-326/331) MS 185-1 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-326/331) MS 21-1 │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (3-326/331) str. LB226692 (13) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-326/331) 1044A (41) │ │ └─ Escherichia coli (6-316/321) O157:H7 EDL933 (1) │ └─────────────┬──────────────── Escherichia coli (12-333/339) H299 (1) ┌──┤ └──────────────────┬─ Escherichia coli (12-331/343) TA271 │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.666 O104:H4 (12-331/343) str. LB226692 (6) │ │ └┬─ Escherichia coli (12-331/343) 83972 (7) │ │ └─ Escherichia coli (12-331/343) ETEC H10407 (3) │ │ ┌──────────── Escherichia coli (3-318/331) M718 │ └────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-325/331) 536 (4) │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-301/317) O127:H6 str. E2348/69 │ │┌┴─ Escherichia coli (34-346/362) E2348/69 (2) │ └┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.2778 O104:H4 (3-325/331) str. LB226692 (19) │ └┬┴─ Escherichia coli (3-325/331) SE11 │ └┬─ Escherichia coli (24-346/352) B354 │ └┬─ Escherichia coli (3-325/331) FVEC1412 (3) │ └┬─ Escherichia coli (3-317/331) 1125A (27) ┌┤ └─ Escherichia coli (3-325/331) E24377A (15) ││ ┌─ Escherichia coli (12-326/350) 1044A (20) ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-313/337) O157:H7 (4) ││ ┌┴─ Escherichia coli (12-326/350) 101-1 (5) ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (12-326/350) O111:H- str. 11128 (1) ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (12-326/350) B185 ││ │└┬─ Escherichia coli (12-326/350) HS [2] ││ │ └┬─ Escherichia coli (12-326/350) NC101 ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (4-313/337) F11 ││ ││ └─ Escherichia coli (12-326/350) 536 (10) ││ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.2577 O104:H4 (12-326/350) str. LB226692 (6) ││ ┌─────────────────────┤└─ Escherichia coli (12-326/350) MS 69-1 │└────────────┤ └─ Escherichia coli (12-326/350) MS 21-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-314/346) O111:H- str. 11128 │ └─────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (2-314/346) 101-1 ┌──┤ │┌┴─ Escherichia coli (2-316/348) 042 (1) │ │ └┤┌─ fig|1040638.4.peg.3225 O104:H4 (2-314/346) str. LB226692 (3) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-314/346) IAI39 (1) │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-314/346) B7A (6) │ │ │┌┴┬─ Escherichia coli (2-314/346) 53638 (1) │ │ └┤ └─ Escherichia coli (2-313/346) M718 │ │ └┬─ Escherichia coli (2-314/346) K12 (12) │ │ └┬─ Escherichia coli (2-314/346) 042 (38) │ │ └┬─ Escherichia coli (2-314/346) 1044A (25) │ │ └─ Escherichia coli (2-314/346) B185 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-320/336) SMS-3-5 │ │ ┌────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-320/336) E24377A (1) │ │ ┌─────┴─────────────────────────────────── Escherichia coli (6-338/342) M605 (1) │ │ ┌───┴───────────────────── Escherichia coli (8-323/344) 83972 (13) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-324/356) MS 116-1 │ └─┤ ┌─────────────┴─ Escherichia coli (7-324/356) H736 │ │ ┌───┴──────────────────── Escherichia coli (1-309/358) TA206 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-326/363) K12 (31) │ └────────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) E24377A (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (7-326/363) HS (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-323/360) MS 21-1 │ └──────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) SMS-3-5 │ │┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) FVEC1302 (3) │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-323/360) TA143 ┌─┤ └┤┌┴─ Escherichia coli (7-326/363) 042 (1) │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (4-323/360) str. LB226692 (5) │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) MS 115-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) B088 (6) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) 2362-75 (27) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-323/360) O83:H1 str. NRG 857C │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-323/360) 536 (9) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-323/360) M605 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (4-323/360) H299 │ │ └┬── Escherichia coli (4-323/360) CFT073 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-323/360) TA206 │ │ └─ Escherichia coli (4-323/360) 83972 (7) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-307/330) H736 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (11-318/341) ED1a (1) │ │ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 (1-307/330) str. LB226692 (3) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (11-318/341) 55989 (2) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-307/330) 101-1 (48) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (11-318/341) K12 (64) │ │ │└┬─ Escherichia coli (11-318/341) 2362-75 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (11-318/341) M605 │ │ ┌────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-307/330) SE15 ┌────┤ │ │ │ └─ Escherichia coli (11-318/341) MS 69-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (11-318/341) MS 115-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-319/341) K12 (75) │ │ └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-302/324) B088 │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-319/341) ABU 83972 (3) │ │ │ ┌──────────────┤ └─ Escherichia coli (3-319/341) 2362-75 (13) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-319/341) E24377A (1) │ │ └─────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-313/327) 2362-75 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-313/327) H591 (2) │ │ └─────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-313/327) E24377A (6) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-316/330) E24377A │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-316/330) ATCC 8739 [2] │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-313/327) B str. REL606 (2) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-316/330) APEC O1 [2] │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.1465 O104:H4 (1-313/327) str. LB226692 (78) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-313/327) M605 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-316/330) K12 (12) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-313/327) 1212A (1) │ │ └─ Escherichia coli (1-313/327) B354 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-330/332) O55:H7 str. CB9615 │ └───────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) 1044A (24) │ └┤┌─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-330/332) str. LB226692 (5) │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-330/332) MS 196-1 │ └┤┌┴─ Escherichia coli (4-330/332) K12 (25) │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-330/332) O111:H- str. 11128 │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-330/332) B088 (23) ┤ │┌┴─ Escherichia coli (4-330/332) E110019 (1) │ └┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) MS 69-1 │ └┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) M718 │ └┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) TA280 │ └┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) IAI39 (1) │ └┤┌─ Escherichia coli (4-330/332) H299 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-330/332) SMS-3-5 │ │┌┴─ Escherichia coli (4-330/332) MS 21-1 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-330/332) WV_060327 │ └┬┴─ Escherichia coli (4-330/332) APEC O1 (6) │ └┬─ Escherichia coli (4-330/332) ED1a (2) │ └┬─ Escherichia coli (4-330/332) SE15 │ └┬─ Escherichia coli (4-330/332) M605 │ └┬─ Escherichia coli (4-330/332) 2362-75 (14) │ └─ Escherichia coli (4-330/332) NC101 │ ┌─ Escherichia coli MS 145-7 │ ┌┴─ Escherichia coli ED1a (1) │ ┌┴─ Escherichia coli 536 (12) │ ┌┴─ Escherichia coli K12 (8) │ ┌┴┬─ Escherichia coli 101-1 (2) │ ┌┤ └─ Escherichia coli TA280 │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.942 O104:H4 str. LB226692 (54) │ │ └┬─ Escherichia coli 1125A (21) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 (1) │ ││ └─ Escherichia coli 1044A (4) │ ┌─────────────────────────────────────┤└┬─ Escherichia coli TA143 │ │ │ └─ Escherichia coli 042 (1) └──┤ └─ Escherichia coli B088 (16) │ ┌─ Escherichia coli (12-332/339) 1827-70 │ ┌┴─ Escherichia coli (3-320/327) ATCC 8739 (5) └───────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) O111:H- str. 11128 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) K12 (22) └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) 53638 (1) └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) MS 124-1 (1) └┤┌─ fig|1040638.4.peg.2229 O104:H4 (3-320/327) str. LB226692 (20) └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) B171 (1) └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) MS 69-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-320/327) 042 (6) │┌┴─ Escherichia coli (3-320/327) B185 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) M718 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) O157:H7 EDL933 [2] └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) 1044A (23) └┤ ┌─ Escherichia coli (3-320/327) B354 │┌┴─ Escherichia coli (3-320/327) MS 115-1 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) TA280 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) 536 (1) └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) NC101 └┤┌─ Escherichia coli (3-320/327) 83972 (5) └┤ ┌─ Escherichia coli (3-320/327) H299 │ ┌┴─ Escherichia coli (3-320/327) F11 (3) └┬┴─ Escherichia coli (3-320/327) O83:H1 str. NRG 857C └┬─ Escherichia coli (3-320/327) 2362-75 (2) └┬─ Escherichia coli (3-320/327) APEC O1 (9) └─ Escherichia coli (3-320/327) ED1a (2)
| Evolved beta-D-galactosidase transcriptional repressor | (25) |
| Transcriptional repressor of the lac operon | (21) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (20) |
| Trehalose operon transcriptional repressor | (12) |
| AscBF operon repressor | (11) |
| Ribose operon repressor | (11) |
| Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (11) |
| Positive regulator of L-idonate catabolism | (10) |
| Transcriptional (co)regulator CytR | (10) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (9) |
| Sucrose specific transcriptional regulator CscR, LacI family | (9) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (5) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (5) |
| Putative ThuR, regulatory protein for trehalosemaltose transport | (2) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (1) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (1) |
| Others | (11) |