fig|1040638.4.peg.721
Escherichia coli O104:H4 str. LB226692 (66-133/133)
M
A
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LMD
D
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fig|216592.1.peg.5506
Escherichia coli 042 (66-133/133)
M
A
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P
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fig|199310.1.peg.3568
Escherichia coli CFT073 (19-86/86)
M
T
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fig|216592.1.peg.2784
Escherichia coli 042 (25-92/92)
M
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fig|340186.3.peg.4867
Escherichia coli E110019 (25-92/92)
M
A
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fig|331112.3.peg.1997
Escherichia coli HS (25-92/92)
M
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P
RP
fig|199310.1.peg.2437
Escherichia coli CFT073 (25-92/92)
M
A
TPVS
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SRP
fig|340197.3.peg.46
Escherichia coli F11 (25-92/92)
M
A
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SRP
fig|340184.3.peg.2215
Escherichia coli B7A (25-92/92)
M
A
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SRP
fig|344610.3.peg.1999
Escherichia coli 53638 (25-92/92)
M
A
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AQ
SRP
fig|340185.3.peg.1108
Escherichia coli E22 (25-92/92)
M
A
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SRP
fig|1040638.4.peg.86
Escherichia coli O104:H4 str. LB226692
M
T
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SRP
fig|362663.8.peg.3031
Escherichia coli 536
M
T
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D
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SRP
fig|362663.9.peg.3040
Escherichia coli 536
M
T
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D
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SRP
fig|340197.3.peg.1914
Escherichia coli F11
M
T
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SRP
fig|340197.5.peg.2017
Escherichia coli F11
M
T
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SRP
fig|431946.3.peg.4372
Escherichia coli SE15
M
T
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AQ
SRP
fig|1040638.4.peg.2275
Escherichia coli O104:H4 str. LB226692
M
N
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LMD
D
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SRP
fig|216592.3.peg.4690
Escherichia coli 042
M
N
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SRP
fig|585055.6.peg.3386
Escherichia coli 55989
M
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SRP
fig|585055.8.peg.3391
Escherichia coli 55989
M
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SRP
fig|585397.7.peg.5141
Escherichia coli ED1a
M
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SRP
fig|585397.9.peg.5142
Escherichia coli ED1a
M
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SRP
fig|656417.3.peg.5261
Escherichia coli M605
M
N
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AQ
SRP
fig|749527.3.peg.5226
Escherichia coli MS 21-1
M
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SRP
fig|656444.3.peg.5613
Escherichia coli TA280
M
N
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LMD
D
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RI
AQ
SRP
fig|199310.4.peg.3435
Escherichia coli CFT073
M
T
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LMD
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RI
AQ
SRP
fig|749531.3.peg.803
Escherichia coli MS 69-1
M
T
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LMD
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AQ
SRP
fig|316401.4.peg.5078
Escherichia coli ETEC H10407
M
N
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D
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AQ
SRP
fig|331111.12.peg.3607
Escherichia coli E24377A
M
T
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LMD
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RI
AQ
SRP
fig|331111.3.peg.1031
Escherichia coli E24377A
M
T
TPVS
LMD
D
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AQ
SRP
fig|525281.3.peg.4794
Escherichia coli 83972
M
T
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D
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AQ
SRP
fig|655817.3.peg.286
Escherichia coli ABU 83972
M
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AQ
SRP
fig|199310.1.peg.294
Escherichia coli CFT073
M
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SRP
fig|199310.4.peg.286
Escherichia coli CFT073
M
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SRP
fig|656393.3.peg.2881
Escherichia coli H299
M
T
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SRP
fig|656440.3.peg.51
Escherichia coli TA206
M
T
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RI
AQ
SRP
fig|550676.3.peg.3093
Escherichia coli B185
M
K
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RI
AQ
SRP
fig|344601.3.peg.4678
Escherichia coli B171
M
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RI
AQ
SRP
fig|344601.5.peg.4939
Escherichia coli B171
M
N
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LMD
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L
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RI
AQ
SRP
fig|585395.4.peg.3739
Escherichia coli O103:H2 str. 12009
M
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TPVS
LMD
D
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RI
AQ
SRP
fig|585395.4.peg.5153
Escherichia coli O103:H2 str. 12009
M
N
TPVS
LMD
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RW
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RI
AQ
SRP
fig|701177.3.peg.3668
Escherichia coli O55:H7 str. CB9615
M
N
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LMD
D
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RI
AQ
SRP
fig|525281.3.peg.3306
Escherichia coli 83972
M
N
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TQ
SRP
fig|655817.3.peg.3464
Escherichia coli ABU 83972
M
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RI
TQ
SRP
fig|656379.3.peg.4435
Escherichia coli FVEC1302
M
N
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LMD
D
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L
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RI
TQ
SRP
fig|656380.3.peg.4347
Escherichia coli FVEC1412
M
N
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LMD
D
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RI
TQ
SRP
fig|749549.3.peg.3651
Escherichia coli MS 198-1
M
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LMD
D
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RI
TQ
SRP
fig|749528.3.peg.4355
Escherichia coli MS 45-1
M
N
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LMD
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TQ
SRP
fig|585056.7.peg.3574
Escherichia coli UMN026
M
N
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LMD
D
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RI
TQ
SRP
fig|670897.3.peg.1692
Escherichia coli 2362-75
M
A
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LMD
D
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AQ
SRP
fig|656379.3.peg.697
Escherichia coli FVEC1302
M
A
TPVS
LMD
D
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AQ
SRP
fig|656380.3.peg.688
Escherichia coli FVEC1412
M
A
TPVS
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D
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AQ
SRP
fig|656419.3.peg.1
Escherichia coli M718
M
A
TPVS
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D
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M
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QA
RI
AQ
SRP
fig|749549.3.peg.696
Escherichia coli MS 198-1
M
A
TPVS
LMD
D
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PIK
M
GR
S
S
--------
RW
L
KSEV
EA
WL
QA
RI
AQ
SRP
fig|585056.7.peg.5040
Escherichia coli UMN026
M
A
TPVS
LMD
D
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M
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--------
RW
L
KSEV
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QA
RI
AQ
SRP
fig|749538.3.peg.2590
Escherichia coli MS 116-1
M
T
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M
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RW
L
KSEV
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QA
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AQ
SRP
fig|749538.3.peg.116
Escherichia coli MS 116-1
M
T
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Escherichia coli MS 182-1
M
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M
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Escherichia coli MS 107-1
M
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Escherichia coli MS 145-7
M
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fig|749548.3.peg.4777
Escherichia coli MS 196-1
M
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fig|749533.3.peg.873
Escherichia coli MS 84-1
M
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fig|753642.3.peg.47
Escherichia coli NC101
M
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Escherichia coli O26:H11 str. 11368
M
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Escherichia coli 042
M
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fig|585055.8.peg.4986
Escherichia coli 55989
M
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fig|340186.5.peg.5132
Escherichia coli E110019
M
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fig|316401.4.peg.2421
Escherichia coli ETEC H10407
M
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fig|749527.3.peg.1328
Escherichia coli MS 21-1
M
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fig|585035.6.peg.4785
Escherichia coli S88
M
A
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fig|216592.3.peg.2335
Escherichia coli 042
M
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fig|679205.4.peg.5611
Escherichia coli MS 124-1
M
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Escherichia coli MS 198-1
M
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fig|656443.3.peg.2187
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M
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fig|679207.4.peg.1623
Escherichia coli MS 107-1
M
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fig|331111.12.peg.5089
Escherichia coli E24377A
M
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fig|331112.6.peg.2084
Escherichia coli HS
M
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fig|362663.8.peg.2035
Escherichia coli 536
M
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fig|362663.9.peg.2040
Escherichia coli 536
M
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fig|525281.3.peg.7
Escherichia coli 83972
M
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fig|655817.3.peg.2418
Escherichia coli ABU 83972
M
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fig|199310.4.peg.2350
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M
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fig|340197.5.peg.49
Escherichia coli F11
M
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fig|714962.3.peg.2254
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M
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fig|656417.3.peg.2640
Escherichia coli M605
M
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fig|749540.3.peg.3847
Escherichia coli MS 146-1
M
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fig|749546.3.peg.389
Escherichia coli MS 185-1
M
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fig|749550.3.peg.290
Escherichia coli MS 200-1
M
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fig|431946.3.peg.1954
Escherichia coli SE15
M
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fig|869729.3.peg.1463
Escherichia coli UM146
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fig|364106.7.peg.2282
Escherichia coli UTI89
M
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fig|364106.8.peg.2284
Escherichia coli UTI89
M
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fig|344601.5.peg.871
Escherichia coli B171
M
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fig|749550.3.peg.3659
Escherichia coli MS 200-1
M
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fig|340184.6.peg.2325
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M
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fig|573235.3.peg.5664
Escherichia coli O26:H11 str. 11368
M
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SRP
fig|1040638.4.peg.3555
Escherichia coli O104:H4 str. LB226692
M
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Escherichia coli 1827-70
M
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SRP
fig|344610.7.peg.4494
Escherichia coli 53638
M
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fig|585055.6.peg.2276
Escherichia coli 55989
M
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SRP
fig|585055.8.peg.2282
Escherichia coli 55989
M
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fig|405955.13.peg.2167
Escherichia coli APEC O1
M
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SRP
fig|340185.4.peg.1167
Escherichia coli E22
M
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SRP
fig|656393.3.peg.2997
Escherichia coli H299
M
A
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AQ
SRP
fig|656408.3.peg.2175
Escherichia coli H591
M
A
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LMD
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SRP
fig|656419.3.peg.2728
Escherichia coli M718
M
A
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SRP
fig|679206.4.peg.5046
Escherichia coli MS 119-7
M
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SRP
fig|749544.3.peg.780
Escherichia coli MS 175-1
M
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L
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RI
AQ
SRP
fig|749531.3.peg.1575
Escherichia coli MS 69-1
M
A
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L
KSEV
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QA
RI
AQ
SRP
fig|585395.4.peg.2580
Escherichia coli O103:H2 str. 12009
M
A
TPVS
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L
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RI
AQ
SRP
fig|585035.6.peg.2064
Escherichia coli S88
M
A
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SRP
fig|439855.10.peg.1231
Escherichia coli SMS-3-5
M
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Escherichia coli 101-1
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Escherichia coli MS 45-1
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Escherichia coli E22 (1-67/68)
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Escherichia coli O103:H2 str. 12009 (1-67/68)
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fig|749546.3.peg.4274
Escherichia coli MS 185-1 (16-74/78)
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Escherichia coli B7A (7-71/72)
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Escherichia coli B7A (7-71/72)
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Escherichia coli KO11 (7-71/72)
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Escherichia coli M605 (7-71/72)
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fig|566546.3.peg.3031
Escherichia coli W (7-71/72)
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fig|566546.4.peg.4578
Escherichia coli W (7-71/72)
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Escherichia coli 042 (16-74/78)
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Escherichia coli 042 (16-74/78)
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fig|670897.3.peg.1478
Escherichia coli 2362-75 (16-74/78)
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fig|585055.6.peg.4868
Escherichia coli 55989 (16-74/78)
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fig|585055.8.peg.4873
Escherichia coli 55989 (16-74/78)
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fig|749545.3.peg.2111
Escherichia coli MS 182-1 (16-74/78)
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Escherichia coli TA271 (16-74/78)
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fig|525281.3.peg.1395
Escherichia coli 83972 (16-74/78)
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Escherichia coli ABU 83972 (16-74/78)
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Escherichia coli E24377A (16-74/76)
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Escherichia coli E24377A (16-74/76)
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Escherichia coli APEC O1 (16-74/78)
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Escherichia coli IAI39 (16-74/78)
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fig|585057.6.peg.4370
Escherichia coli IAI39 (16-74/78)
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Escherichia coli MS 69-1 (16-74/78)
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fig|585035.6.peg.3208
Escherichia coli S88 (16-74/78)
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Escherichia coli 83972 (5-71/72)
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Escherichia coli ABU 83972 (5-71/72)
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fig|749528.3.peg.2920
Escherichia coli MS 45-1 (5-71/72)
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fig|749531.3.peg.3583
Escherichia coli MS 69-1 (5-71/72)
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fig|679205.4.peg.2694
Escherichia coli MS 124-1 (14-73/77)
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Escherichia coli MS 84-1 (14-73/77)
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Escherichia coli MS 84-1 (16-74/78)
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Escherichia coli MS 116-1 (15-73/77)
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Escherichia coli ETEC H10407 (15-73/76)
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Escherichia coli 536 (15-73/77)
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Escherichia coli 536 (15-73/77)
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Escherichia coli APEC O1 (15-73/77)
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fig|405955.9.peg.3936
Escherichia coli APEC O1 (15-73/77)
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Escherichia coli CFT073 (15-73/77)
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Escherichia coli CFT073 (15-73/77)
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Escherichia coli CFT073 (15-73/77)
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Escherichia coli CFT073 (15-73/77)
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Escherichia coli ED1a (15-73/77)
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Escherichia coli ED1a (15-73/77)
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fig|656393.3.peg.278
Escherichia coli H299 (15-73/77)
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Escherichia coli H299 (15-73/77)
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fig|656408.3.peg.3317
Escherichia coli H591 (15-73/77)
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fig|749545.3.peg.1153
Escherichia coli MS 182-1 (15-73/77)
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fig|749527.3.peg.930
Escherichia coli MS 21-1 (15-73/77)
D
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fig|439855.10.peg.4874
Escherichia coli SMS-3-5 (15-73/77)
D
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Escherichia coli M718 (16-74/78)
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fig|679206.4.peg.4474
Escherichia coli MS 119-7 (16-74/78)
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Escherichia coli B171 (15-73/77)
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Escherichia coli B171 (15-73/77)
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fig|340197.5.peg.848
Escherichia coli F11 (42-100/104)
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fig|749550.3.peg.3643
Escherichia coli MS 200-1 (42-100/104)
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fig|679205.4.peg.5399
Escherichia coli MS 124-1 (16-74/78)
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fig|439855.10.peg.3359
Escherichia coli SMS-3-5 (16-74/78)
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fig|585035.6.peg.4557
Escherichia coli S88 (15-73/77)
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fig|749533.3.peg.3012
Escherichia coli MS 84-1 (15-73/77)
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SR
fig|679205.4.peg.5522
Escherichia coli MS 124-1 (15-73/77)
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fig|362663.8.peg.4604
Escherichia coli 536 (15-73/77)
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fig|362663.9.peg.4621
Escherichia coli 536 (15-73/77)
D
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fig|340197.3.peg.815
Escherichia coli F11 (15-73/77)
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fig|869729.3.peg.4719
Escherichia coli UM146 (15-73/77)
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fig|364106.7.peg.4819
Escherichia coli UTI89 (15-73/77)
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fig|364106.8.peg.4819
Escherichia coli UTI89 (15-73/77)
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Escherichia coli KO11 (2-66/67)
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Escherichia coli W (2-66/67)
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fig|566546.4.peg.3902
Escherichia coli W (2-66/67)
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fig|585057.4.peg.4724
Escherichia coli IAI39 (1-53/57)
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fig|585057.6.peg.4732
Escherichia coli IAI39 (1-53/57)
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fig|749527.3.peg.2315
Escherichia coli MS 21-1 (5-63/67)
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Escherichia coli O104:H4 str. LB226692 (15-64/65)
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Escherichia coli TY-2482 (15-64/65)
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Escherichia coli 1044A (15-64/65)
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Escherichia coli 1125A (15-64/65)
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Escherichia coli 1212A (15-64/65)
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Escherichia coli 536A (15-64/65)
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Escherichia coli E110019 (15-64/65)
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Escherichia coli E110019 (15-64/65)
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Escherichia coli O111:H- str. 11128 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 EDL933 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 EDL933 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 EDL933 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 EDL933 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 (15-64/65)
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fig|478006.5.peg.1218
Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 (15-64/65)
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fig|478007.5.peg.2011
Escherichia coli O157:H7 str. EC508 (15-64/65)
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fig|478008.5.peg.4012
Escherichia coli O157:H7 str. EC869 (15-64/65)
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fig|637388.3.peg.4444
Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 (15-64/65)
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fig|570506.3.peg.550
Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 (15-64/65)
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Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 (15-64/65)
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Escherichia coli O26:H11 str. 11368 (15-64/65)
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Escherichia coli 83972 (15-64/65)
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Escherichia coli ABU 83972 (15-64/65)
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Escherichia coli MS 185-1 (15-64/65)
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Escherichia coli MS 45-1 (15-64/65)
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Escherichia coli CFT073 (1-44/45)
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Escherichia coli M605 (15-72/104)
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Escherichia coli TA206 (16-64/96)
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Escherichia coli MS 78-1 (7-64/68)
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Escherichia coli IAI1 (5-64/68)
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Escherichia coli MS 115-1 (5-64/68)
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Escherichia coli MS 21-1 (6-73/77)
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Escherichia coli ED1a (4-63/67)
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Escherichia coli ED1a (4-63/67)
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Escherichia coli E24377A (5-64/68)
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Escherichia coli E24377A (16-75/79)
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Escherichia coli 1044A (13-78/82)
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Escherichia coli 1125A (13-78/82)
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Escherichia coli 1212A (13-78/82)
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Escherichia coli 536A (13-78/82)
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Escherichia coli MS 115-1 (11-68/72)
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Escherichia coli O26:H11 str. 11368 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 EDL933 (5-64/68)
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Escherichia coli MS 84-1 (5-63/67)
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Escherichia coli NC101 (5-63/67)
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Escherichia coli B185 (22-80/88)
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Escherichia coli E110019 (22-80/88)
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Escherichia coli F11 (22-80/88)
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Escherichia coli F11 (22-80/88)
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Escherichia coli IHE3034 (22-80/88)
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Escherichia coli M605 (22-80/88)
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Escherichia coli MS 124-1 (22-80/88)
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Escherichia coli MS 200-1 (22-80/88)
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fig|749527.3.peg.5436
Escherichia coli MS 21-1 (22-80/88)
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fig|749533.3.peg.2949
Escherichia coli MS 84-1 (22-80/88)
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fig|478008.5.peg.905
Escherichia coli O157:H7 str. EC869 (22-80/88)
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fig|573235.3.peg.5082
Escherichia coli O26:H11 str. 11368 (22-80/88)
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Escherichia coli SMS-3-5 (22-80/88)
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Escherichia coli WV_060327 (22-80/88)
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fig|562.376.peg.424
Escherichia coli WV_060327 (22-80/88)
ITQ
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fig|656444.3.peg.172
Escherichia coli TA280 (22-80/88)
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fig|656440.3.peg.3026
Escherichia coli TA206 (5-59/61)
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fig|562.371.peg.1289
Escherichia coli 1044A (17-78/86)
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fig|562.373.peg.349
Escherichia coli 1125A (17-78/86)
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fig|562.372.peg.744
Escherichia coli 1212A (17-78/86)
PVS
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fig|562.374.peg.5903
Escherichia coli 536A (17-78/86)
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fig|83334.1.peg.383
Escherichia coli O157:H7 (17-78/86)
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fig|155864.1.peg.295
Escherichia coli O157:H7 EDL933 (17-78/86)
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fig|155864.8.peg.294
Escherichia coli O157:H7 EDL933 (17-78/86)
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fig|444454.5.peg.4762
Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 (17-78/86)
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fig|444449.5.peg.5103
Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 (17-78/86)
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fig|444448.5.peg.2978
Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 (17-78/86)
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fig|444453.5.peg.3950
Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 (17-78/86)
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fig|478004.5.peg.2577
Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC508 (17-78/86)
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fig|478008.5.peg.3719
Escherichia coli O157:H7 str. EC869 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 (17-78/86)
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fig|570506.3.peg.1793
Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. Sakai (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 (17-78/86)
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Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 (17-78/86)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 (6-60/69)
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Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 (6-60/69)
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fig|656444.3.peg.1494
Escherichia coli TA280 (6-60/69)
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Escherichia coli WV_060327 (12-61/65)
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Escherichia coli SMS-3-5 (10-65/74)
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fig|340197.5.peg.2288
Escherichia coli F11 (6-60/69)
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fig|749550.3.peg.3683
Escherichia coli MS 200-1 (6-60/69)
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Consen1
Primary consensus
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Consen2
Secondary consensus
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Consensus 1
(when a gap)
Conservative difference
Consensus 2
(when a gap)
Nonconservative diff.
Other character