┌─ Escherichia coli (8-409/413) BW2952 ├─ Escherichia coli (8-409/413) K12 ├─ Escherichia coli (8-409/413) str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli (8-409/413) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (8-409/413) W3110 ┌┤└─ Escherichia coli (8-409/413) DH1 │└┬─ Escherichia coli (8-409/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤ └─ Escherichia coli (8-409/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤└─ Escherichia coli (8-395/413) MS 115-1 ┌┤└─ Escherichia coli (8-395/413) MS 146-1 │└─ Escherichia coli (8-396/396) WV_060327 ┌──────┤ ┌─ Escherichia coli (8-395/413) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) H591 │ └─┼─ Escherichia coli (8-395/413) TA271 │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) 55989 ┌──┤ └─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-395/413) strain │ │ ┌─ Escherichia coli (8-398/403) M605 │ │ ┌─────┴── Escherichia coli (8-397/398) ATCC 8739 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 │ └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (8-396/413) B185 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-396/414) 042 │ └────────┤ └─ Escherichia coli (8-396/414) 042 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-396/413) O111:H- str. 11128 ┌───┤ └─┤┌─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a │ │ └┼─ Escherichia coli (8-396/413) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (8-396/413) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (22-419/423) 042 │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (22-419/423) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-419/423) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-408/409) 101-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-408/409) BL21 │ └────────────┤ ├─ Escherichia coli (8-408/409) E24377A │ │ ┌┼─ Escherichia coli (35-435/436) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (35-435/436) E24377A │ │┌┤├─ Escherichia coli (DE3 8-408/409) BL21(DE3) │ │││└─ Escherichia coli (8-408/409) B str. REL606 │ └┤└─ Escherichia coli (8-408/409) MS 78-1 │ │┌─ Escherichia coli (22-422/423) ETEC H10407 ┌────┤ ││ ┌─ Escherichia coli (22-421/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┤ │┌─ Escherichia coli (22-421/423) B171 │ │ │ │├─ Escherichia coli (22-421/423) B7A │ │ └─┤├─ Escherichia coli (22-421/423) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (22-421/423) KO11 │ │ │├─ Escherichia coli (22-421/423) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (22-421/423) SE11 │ │ └┼─ Escherichia coli (22-421/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) O26:H11 str. 11368 ┌─┤ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-421/423) B171 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-421/423) B088 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-397/412) O157:H7 str. EC4024 │ │ └─────────────────────────┼─ Escherichia coli (6-397/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (6-397/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ └─ Escherichia coli (6-397/412) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (35-424/425) E2348/69 │ └──────────────────┬──────────────────┴─ Escherichia coli (35-424/425) O127:H6 str. E2348/69 │ └──────────────┬─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (4-404/405) strain │ └┬─ Escherichia coli (4-404/405) O127:H6 str. E2348/69 │ └─ Escherichia coli (4-404/405) E2348/69 │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) 1044A │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) 1212A │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-420/421) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-420/421) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (1-420/421) 536A │ ││└─ Escherichia coli (1-420/421) 1125A │ ││┌─ Escherichia coli (1-420/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (1-420/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (1-420/421) E22 │ ││├─ Escherichia coli (1-420/421) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (1-420/421) O103:H2 str. 12009 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (1-420/421) O127:H6 str. E2348/69 │ ││└┼─ Escherichia coli (1-420/421) O26:H11 str. 11368 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O111:H- str. 11128 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) B171 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) B171 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (1-420/421) B171 │ ││└┬─ Escherichia coli (1-420/421) ATCC 8739 │ ││ └─ Escherichia coli (1-420/421) ATCC 8739 │ ││ ┌─ Escherichia coli ED1a │ ││ ┌┴─ Escherichia coli ED1a │ ││┌┴─ Escherichia coli MS 107-1 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli CFT073 │ │ │┌┴─ Escherichia coli CFT073 │ ┌┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) IAI39 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) IAI39 │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli IAI39 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli IAI39 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli APEC O1 │ ││ └┼─ Escherichia coli S88 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 119-7 │ ││ └─ Escherichia coli APEC O1 │ │└─ Escherichia coli (1-420/421) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) MS 124-1 │ ┌┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) MS 84-1 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli M718 │ ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-420/421) MS 200-1 │ ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-420/421) MS 185-1 │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli MS 107-1 │ ││ │└─ Escherichia coli MS 187-1 │ ││┌┤┌─ Escherichia coli H299 │ │││└┤┌─ Escherichia coli 2362-75 │ │││ └┤┌─ Escherichia coli 55989 │ │││ └┼─ Escherichia coli 55989 │ │└┤ └─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ ┌─ Escherichia coli B185 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) M605 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli H591 │ │ │┌┴┬─ Escherichia coli ED1a │ ┌──┤ ││ └─ Escherichia coli ED1a │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) CFT073 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) CFT073 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) FVEC1302 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) MS 198-1 │ │ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-420/421) UMN026 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-420/421) FVEC1412 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-420/421) MS 21-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-420/421) ABU 83972 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) APEC O1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-420/421) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) APEC O1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-420/421) 83972 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) EC4100B │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-418/419) O111:H- str. 11128 │ ┌──┤ ││┌─ Escherichia coli NC101 │ │ │ └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) 536 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) F11 │ │ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-420/421) F11 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-420/421) 536 │ │ │ ││└┬─ Escherichia coli (1-420/421) 042 │ │ │ └┤ └─ Escherichia coli (1-420/421) 042 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli E24377A ┤ │ │ │┌┴─ Escherichia coli E24377A │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli 042 │ │ │ │├─ Escherichia coli 55989 │ │ │ └┼─ Escherichia coli 55989 │ ┌─┤ │ ├─ Escherichia coli 042 │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ └─── Escherichia coli (1-414/417) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (23-444/444) E2348/69 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ ┌─┤└─ Escherichia coli 2362-75 │ │ │ ┌─────────┤ └─ Escherichia coli (1-422/424) O111:H- str. 11128 │ │ │ │ └──┬─ Escherichia coli (1-421/424) ED1a │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-421/424) ED1a │ │ ││└┬───── Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │ ││ └─── Escherichia coli (1-413/415) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-413/416) IAI1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-413/416) IAI1 │ │ │┌───┴─ Escherichia coli (1-415/416) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli KO11 │ │ ││┌───┼─ Escherichia coli W │ │ └┤│ └─ Escherichia coli W │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-421/422) B7A │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-421/422) B7A │ │ ││ ┌┴─┬─ Escherichia coli (1-415/417) 042 │ │ └┤┌─┤ └─ Escherichia coli (1-415/417) 042 │ │ ││ └──┬─ Escherichia coli (1-417/422) W │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-417/422) W │ │ ││ ┌─ Escherichia coli TA271 │ │ ││┌─┴─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └┤│ ┌─ Escherichia coli 83972 │ ┌┤ ││ ├─ Escherichia coli F11 │ ││ ││ ┌┼─ Escherichia coli UM146 │ ││ ││ │├─ Escherichia coli MS 200-1 │ ││ ││ ┌┤└─ Escherichia coli ABU 83972 │ ││ └┤ │└┬─ Escherichia coli UTI89 │ ││ │ ┌┤ └─ Escherichia coli UTI89 │ ││ │ │└┬─ Escherichia coli 536 │ ││ │ │ └─ Escherichia coli 536 │ ││ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) 55989 │ ││ │ │ ├─ Escherichia coli (1-420/421) MS 124-1 │ ││ └──┤ ├─ Escherichia coli (1-420/421) MS 84-1 │ ││ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-420/421) SMS-3-5 │ ││ │ │├─ Escherichia coli (1-420/421) MS 45-1 │ ││ │┌┤└─ Escherichia coli (1-420/421) 55989 │ ││ ││└─ Escherichia coli (1-420/421) M718 │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-420/421) ED1a │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (1-420/421) ED1a │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (1-405/413) H736 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (1-420/421) IAI39 │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-420/421) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-420/421) IAI39 │ ││ └─ Escherichia coli (1-420/421) ETEC H10407 │ ││┌──────────── Escherichia coli (25-440/443) MS 145-7 │ │││ ┌─── Escherichia coli (1-415/420) WV_060327 │ │││ ┌──────┴──── Escherichia coli (2-415/420) TA206 │ │││ │ ┌─ Escherichia coli (1-417/423) 536 │ │└┤ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) IHE3034 │ ┌───────┤ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) MS 200-1 │ │ │ └────┤ ├─ Escherichia coli (1-417/423) NC101 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) UTI89 │ │ │ │ ┌──┼─ Escherichia coli (1-417/423) UTI89 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) UM146 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) MS 45-1 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) MS 185-1 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-417/423) CFT073 │ │ │ └─────┤ ├─ Escherichia coli (1-417/423) ABU 83972 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-417/423) 536 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-415/420) ED1a │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-415/420) ED1a │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-415/420) FVEC1302 │ │ │ └──┤┌┴─ Escherichia coli (1-415/420) UMN026 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-415/420) IAI39 │ │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli (1-415/420) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-415/420) IAI39 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-415/420) H299 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-415/420) 53638 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (1-415/420) 55989 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-415/420) E110019 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-415/420) MS 124-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-415/420) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-415/420) MS 198-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-415/420) E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-415/420) 55989 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-415/420) 53638 │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (1-415/420) str. LB226692 │ │ │ ┌─────────── Escherichia coli (26-440/445) M605 │ │ └────┤ ┌─ Escherichia coli (8-425/427) MS 116-1 │ │ │ ┌─────┴─ Escherichia coli (8-425/427) MS 175-1 │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-416/418) EC4100B │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-419/424) O157:H7 str. EC869 │ │ │┌─┼─ Escherichia coli (1-419/424) O157:H7 str. FRIK966 │ │ └┤ └─ Escherichia coli (1-419/424) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-419/421) TA280 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-416/420) O26:H11 str. 11368 │ │ └┬─ Escherichia coli WV_060327 │ │ └─ Escherichia coli IHE3034 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-399/412) IHE3034 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-399/412) UM146 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-399/412) TA280 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-399/412) 53638 │ │ │ └─ Escherichia coli (8-399/412) 53638 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (8-399/412) F11 │ │ │└┼─ Escherichia coli (8-399/412) MS 200-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-399/412) F11 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (8-399/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (8-399/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-391/407) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (8-391/407) O157:H7 str. EC4501 │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (8-399/412) MS 175-1 └─┤ │ └──┬─ Escherichia coli (14-413/415) E110019 │ ┌─────────────┤ └─ Escherichia coli (8-407/409) E110019 │ │ └───── Escherichia coli (8-390/406) SMS-3-5 │ ┌─────────┤ ┌─ Escherichia coli (406-793/807) 042 │ │ └────┬────────────┴─ Escherichia coli (406-793/807) 042 │ ┌───────────┤ └────────────┬─ Escherichia coli (7-396/413) MS 84-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (7-396/413) MS 124-1 │ ┌──────────┤ └───────────────────────────── Escherichia coli (1-397/412) MS 182-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-418/419) 2362-75 │ │ └──────────────────────┤┌─ Escherichia coli (4-414/417) MS 21-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-418/419) MS 182-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (32-446/447) 042 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-418/419) 042 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (24-439/440) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (24-439/440) O157:H7 str. TW14588 │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (4-419/420) O103:H2 str. 12009 │ ┌───┤ └─┼─ Escherichia coli (4-419/420) O157:H7 str. EC508 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-419/420) 1125A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-391/395) HS │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/395) HS │ │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (2-391/396) MS 115-1 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-391/396) B354 │ │ │ ┌──────┤└─ Escherichia coli (2-391/395) 2362-75 │ │ │ │ └─┬─ Escherichia coli (2-391/402) B7A │ │ └────────────────┤ └─ Escherichia coli (2-391/402) B7A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-408/417) E2348/69 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-408/417) O127:H6 str. E2348/69 │ ┌────┤ └──────────┤┌─ Escherichia coli (2-392/415) M605 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-392/416) MS 198-1 │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/418) ETEC H10407 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-392/416) FVEC1302 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/418) MS 196-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-392/416) IHE3034 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 │ │ └────────────────────┬─ Escherichia coli (2-384/391) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (2-391/391) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli (35-429/431) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (35-429/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (35-429/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (35-429/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (35-429/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌─┤└─ Escherichia coli (35-429/431) K12 │ │ ┌─────────────────┤ └─ Escherichia coli (6-400/402) MS 187-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 │ │ │ └─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-385/385) APEC O1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) BW2952 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) IHE3034 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) S88 └─┤ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (14-397/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (14-397/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (14-397/397) UTI89 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-385/385) UM146 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-385/385) K12 │ │ ││├─ Escherichia coli (14-397/397) DH1 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (2-385/385) APEC O1 │ │ ││└─ Escherichia coli (14-397/397) B354 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-381/385) MS 119-7 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (2-381/385) B088 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) E2348/69 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-382/385) strain │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (2-382/385) 55989 │ │ ┌┤ └┤└─ Escherichia coli (2-382/385) 55989 │ │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (14-393/397) TA143 │ │ ││ └┬┴─ Escherichia coli (14-393/397) H591 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (14-397/397) B7A │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-385/385) B7A │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-385/385) IAI39 │ │ ┌┤│ ┌┴─ Escherichia coli (2-385/385) IAI39 └──┤ │││┌┴─ Escherichia coli (2-385/385) O26:H11 str. 11368 │ ││└┤┌─ Escherichia coli (2-385/385) W │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-385/385) W │ ││ └─ Escherichia coli (2-385/385) KO11 │ │└─ Escherichia coli (2-381/385) TA271 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (14-397/397) O55:H7 str. CB9615 │ │││┌─ Escherichia coli (2-385/385) 1125A │ │││├─ Escherichia coli (2-385/385) 536A │ │││├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 EDL933 │ │││├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4024 │ │││├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 str. EC4045 │ │└┤├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. TW14359 │ ┌─────────────────┤ └┼─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-385/385) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-397/397) 1212A │ │ │ └─ Escherichia coli (14-397/397) 1044A │ │ └┬─ Escherichia coli (2-381/385) MS 198-1 │ │ └─ Escherichia coli (2-381/385) FVEC1302 └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/394) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (11-398/404) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/394) SMS-3-5 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-388/396) MS 84-1 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) MS 124-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/392) MS 21-1 │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) TA280 │ │ └───────────────┬─ Escherichia coli ED1a │ │ └─ Escherichia coli ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (1-393/404) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-393/404) MS 84-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-393/404) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-393/404) NC101 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-393/404) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-393/404) 83972 │ │ ┌──┤┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (1-393/404) strain └─┤ │ └┼─ Escherichia coli (1-393/404) 55989 │ ┌───┤ ├─ Escherichia coli (1-393/404) 55989 │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (1-393/404) str. LB226692 │ │ └────┬─ Escherichia coli (1-387/396) SE11 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-395/402) HS │ ││ └─ Escherichia coli (14-408/415) HS │ │└──┬────── Escherichia coli (1-394/397) MS 115-1 │┌┤ └─────┬─ Escherichia coli (14-406/417) ED1a │││ └─ Escherichia coli (14-406/417) ED1a ││└──────────┬─ Escherichia coli (1-391/396) MS 84-1 └┤ └─ Escherichia coli (1-391/396) MS 124-1 │ ┌──────── Escherichia coli (17-403/407) SE15 │┌──┴─────── Escherichia coli MS 145-7 ││ ┌────── Escherichia coli O26:H11 str. 11368 └┤ │ ┌─ Escherichia coli (33-438/439) KO11 │ │ ┌───┼─ Escherichia coli (33-438/439) W └──┤ │ └─ Escherichia coli (1-406/407) W │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) H299 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) ETEC H10407 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/394) 101-1 └─┤ │ ├─ Escherichia coli (1-388/394) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (1-388/394) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (1-388/394) M718 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-388/394) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (1-388/394) MS 187-1 └─┤ │├─ Escherichia coli (1-388/394) CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli (DE3 1-388/394) BL21(DE3) │ ││└─ Escherichia coli (1-388/394) B str. REL606 │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (1-388/394) str. LB226692 │┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-388/394) MS 182-1 │││ └┬─ Escherichia coli (1-388/394) IAI39 │││ └─ Escherichia coli (1-388/394) IAI39 ││└─ Escherichia coli (1-392/394) TA280 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/393) 536 │┌┴─ Escherichia coli (1-388/393) 536 ││┌─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC508 │││┌─ Escherichia coli (25-415/417) 1125A └┤│├─ Escherichia coli (25-415/417) 536A ││├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4045 └┤├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. TW14588 └┼─ Escherichia coli (1-391/393) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 ├─ Escherichia coli (1-391/393) 1212A └─ Escherichia coli (25-415/417) 1044A
| Integrase | (220) |
| Phage integrase | (103) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (24) |
| Prophage CP4-57 integrase | (19) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (18) |
| Phage Integrase | (15) |
| COG0582: Integrase | (7) |
| Putative integrase | (6) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| prophage P4 integrase | (3) |
| putative P4-type integrase | (3) |
| phage integrase family protein | (3) |
| putative phage integrase | (2) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (2) |
| integrase-like protein | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| phage and prophage-related functions; integration, recombination | (2) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| Others | (15) |