┌─ Escherichia coli (5-54/67) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (5-54/67) MS 124-1 ┌─┼─ Escherichia coli (5-54/67) NC101 │ ├─ Escherichia coli (5-54/67) MS 84-1 ┌─┤ └─ Escherichia coli (5-54/67) ETEC H10407 ┌─┤ └────────── Escherichia coli (4-52/63) M605 │ └───────┬─ Escherichia coli (4-54/67) ED1a │ └─ Escherichia coli (4-54/67) ED1a ┌─┤ ┌─ Escherichia coli (8-55/68) ETEC H10407 │ │ ┌─────┼─ Escherichia coli (8-55/68) MS 78-1 │ └──┤ └─ Escherichia coli (8-55/68) MS 182-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (5-55/68) IAI1 ┌──────┤ └──┼─ Escherichia coli (5-55/68) MS 115-1 │ │ └─ Escherichia coli (5-55/68) IAI1 │ │┌─────── Escherichia coli (8-55/68) MS 107-1 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (5-55/68) E24377A │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (16-66/79) E24377A │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (5-55/68) O157:H7 ┌─────────────────────────┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-55/68) O157:H7 EDL933 │ │ └───────┤┌─ Escherichia coli (10-69/82) 1125A │ │ └┼─ Escherichia coli (10-69/82) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (10-69/82) 1212A │ │ └─ Escherichia coli (10-69/82) 1044A │ └─────────── Escherichia coli (17-64/77) MS 21-1 │ ┌─ Escherichia coli (13-62/72) B7A │ ├─ Escherichia coli (13-62/72) KO11 │ ├─ Escherichia coli (13-62/72) W │ ├─ Escherichia coli (13-62/72) 83972 │ ├─ Escherichia coli (13-62/72) MS 45-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (13-62/72) MS 69-1 │ │├─ Escherichia coli (13-62/72) ABU 83972 │ │├─ Escherichia coli (13-62/72) W │ ┌─┤├─ Escherichia coli (13-62/72) M605 │ │ │└─ Escherichia coli (13-62/72) B7A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-57/67) W │ │ └────────────────┼─ Escherichia coli (8-57/67) W │ │ └─ Escherichia coli (8-57/67) KO11 │ │ ┌────────────────────────────────────────── Escherichia coli (3-65/96) TA206 ┤ │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.76 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ ├─ Escherichia coli 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 └───────────────────────┤ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ┌─┤├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ │ │├─ Escherichia coli E110019 │ │ │ │├─ Escherichia coli 536A │ │ │ │├─ Escherichia coli 1125A │ │ │ │└─ fig|6666666.5357.peg.1290 TY-2482 strain │ │ │ │┌─ Escherichia coli CFT073 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ┌┤ └┤├─ Escherichia coli H299 │ │ ││ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli TA206 │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ││ └─ Escherichia coli 83972 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-44/57) IAI39 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-44/57) IAI39 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-64/77) MS 124-1 │ │ ┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (1-64/77) MS 84-1 │ │ ││ ││┌─ Escherichia coli (28-91/104) MS 200-1 │ │ ││ └┤├─ Escherichia coli (1-64/77) 536 └─┤ ││ │├─ Escherichia coli (1-64/77) UM146 │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-64/77) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) UTI89 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (1-64/77) F11 │ │││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) 536 │ │││ └─ Escherichia coli (28-91/104) F11 │ ││└┬─ Escherichia coli (1-64/77) S88 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-64/77) MS 84-1 │ ││ └─ Escherichia coli (1-64/77) MS 124-1 │ │└─ Escherichia coli (1-64/77) MS 116-1 │ │┌─ Escherichia coli (1-64/77) 536 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-64/77) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) H299 │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) MS 182-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-64/77) SMS-3-5 │ │└┼─ Escherichia coli (1-64/76) ETEC H10407 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-64/77) MS 21-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) H591 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) H299 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-64/77) APEC O1 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (1-64/77) 536 │ ││└┬───────── Escherichia coli (1-72/104) M605 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-64/77) B171 │ ││ └─ Escherichia coli (1-64/77) B171 │ ││┌─ Escherichia coli (1-65/78) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (1-65/78) MS 69-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-65/76) E24377A │ │└┼─ Escherichia coli (1-65/76) E24377A │ ┌────────┤ ├─ Escherichia coli (1-65/78) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-65/78) IAI39 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-65/78) APEC O1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-65/78) MS 124-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-65/78) M718 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (1-65/78) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-65/78) MS 119-7 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-65/78) SMS-3-5 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-65/78) 83972 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-65/78) ABU 83972 │ │ ││ ┌──── Escherichia coli (2-54/67) MS 21-1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-65/78) MS 185-1 │ │ │┌┴─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-65/78) 042 └───┤ └┤├─ Escherichia coli (1-65/78) 55989 │ │├─ Escherichia coli (1-65/78) MS 182-1 │ └┼─ Escherichia coli (1-65/78) TA271 │ ├─ Escherichia coli (1-65/78) 55989 │ ├─ Escherichia coli (1-65/78) 2362-75 │ └─ Escherichia coli (1-65/78) 042 │ ┌────── Escherichia coli (9-58/69) SE11 │ │ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) E22 │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (9-58/68) O103:H2 str. 12009 │ │ ┌─────┴────── Escherichia coli (9-58/68) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) H299 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) MS 107-1 └──────┤ │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) TA206 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-58/68) CFT073 │ │ ││└─ Escherichia coli (9-58/68) ABU 83972 │ │ │└─ Escherichia coli (9-56/56) MS 45-1 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (9-58/68) ABU 83972 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-58/68) FVEC1412 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 45-1 │ │ │└┼─ Escherichia coli (9-58/68) UMN026 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 198-1 └─┤ ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) FVEC1302 │ ││ └─ Escherichia coli (9-58/68) 83972 │ │└─ fig|6666666.5357.peg.4262 TY-2482 (1-47/57) strain │ │ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) ED1a │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (9-58/68) SE15 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-51/61) 042 │ │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) F11 └──┤ │├─ Escherichia coli (9-58/68) 536 │ │├─ fig|1040638.4.peg.86 O104:H4 (9-58/68) str. LB226692 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) TA280 │┌┤├─ Escherichia coli (9-58/68) M605 │││├─ Escherichia coli (9-58/68) ED1a │││├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 │││└─ fig|1040638.4.peg.2275 O104:H4 (9-58/68) str. LB226692 ││└─ Escherichia coli (1-47/57) 101-1 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.721 O104:H4 (74-123/133) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (33-82/92) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 21-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) S88 ││ │├─ Escherichia coli (9-58/68) ETEC H10407 └┤ │├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-58/68) 042 │ ││└─ Escherichia coli (74-123/133) 042 │ ││┌─ Escherichia coli (9-58/68) E24377A │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (9-58/68) MS 116-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) HS │ ││ └─ Escherichia coli (33-82/92) HS │┌┤└┬─ Escherichia coli (9-58/68) MS 78-1 │││ └─ Escherichia coli (9-58/68) B171 │││┌─ Escherichia coli (9-58/68) CFT073 ││└┼─ Escherichia coli (9-58/68) MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (27-76/86) CFT073 ││ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) MS 116-1 └┤┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) E24377A ││└─ Escherichia coli (9-58/68) E24377A ││ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) B171 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) O103:H2 str. 12009 ││┌─┼─ Escherichia coli (9-58/68) O55:H7 str. CB9615 │││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) O103:H2 str. 12009 │││ └─ Escherichia coli (9-58/68) B171 └┤│ ┌─ Escherichia coli (33-82/92) 042 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 107-1 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 196-1 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) NC101 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 042 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 198-1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) TA271 └┤ │├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 84-1 │ ││├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 145-7 │┌┤│└─ Escherichia coli (9-58/68) ETEC H10407 │││└─ Escherichia coli (10-58/68) MS 200-1 ││└── Escherichia coli (9-58/68) MS 182-1 ││ ┌─ Escherichia coli (33-82/92) B7A ││┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) O26:H11 str. 11368 │││└─ Escherichia coli (9-58/68) B7A └┤│ ┌─ Escherichia coli (9-58/68) 2362-75 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) FVEC1412 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 198-1 ││┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) UMN026 │││├─ Escherichia coli (9-58/68) M718 │││└─ Escherichia coli (9-58/68) FVEC1302 └┤│ ┌─ Escherichia coli (33-82/92) CFT073 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 536 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) 83972 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) CFT073 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (9-58/68) UM146 └┤ ┌┼─ Escherichia coli (9-58/68) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) SE15 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (9-58/68) M605 │┌┤├─ Escherichia coli (9-58/68) F11 │││├─ Escherichia coli (9-58/68) ABU 83972 │││├─ Escherichia coli (9-58/68) 536 │││└─ Escherichia coli (33-82/92) F11 ││└─ Escherichia coli (1-47/57) MS 45-1 ││┌─ Escherichia coli (33-82/92) E22 └┤├─ Escherichia coli (9-58/68) 1827-70 │├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 │├─ Escherichia coli (9-58/68) APEC O1 │├─ Escherichia coli (9-58/68) H299 │├─ Escherichia coli (9-58/68) M718 │├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 175-1 │├─ Escherichia coli (9-58/68) O103:H2 str. 12009 └┼─ Escherichia coli (9-58/68) SMS-3-5 ├─ Escherichia coli (9-58/68) S88 ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (9-58/68) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (9-58/68) H591 ├─ Escherichia coli (9-58/68) E22 ├─ Escherichia coli (9-58/68) 55989 ├─ Escherichia coli (9-58/68) 53638 ├─ fig|1040638.4.peg.3555 O104:H4 (9-58/68) str. LB226692 └─ Escherichia coli (33-82/92) 53638
| hypothetical protein | (233) |
| Transcriptional regulator, AlpA like | (12) |
| putative DNA binding protein | (4) |
| phage transcriptional regulator, AlpA | (2) |
| COG3311: Predicted transcriptional regulator | (2) |
| orf; Unknown function | (2) |
| FIG00638000: hypothetical protein | (1) |
| FIG00643076: hypothetical protein | (1) |
| Others | (7) |