┌─ fig|1040638.4.peg.210 O104:H4 (22-77/134) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ├─ Escherichia coli (22-77/134) CFT073 ├─ Escherichia coli (22-77/134) E110019 ├─ Escherichia coli (22-77/134) E110019 ├─ Escherichia coli (22-77/134) E22 ├─ Escherichia coli (22-77/134) ED1a ├─ Escherichia coli (22-77/134) F11 ├─ Escherichia coli (22-77/134) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (22-77/134) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (22-77/134) MS 175-1 ├─ Escherichia coli (22-77/134) MS 198-1 ├─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (22-77/134) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (22-77/134) UM146 ├─ Escherichia coli (22-77/134) UMN026 ├─ Escherichia coli (22-77/134) UTI89 ┌┼─ Escherichia coli (22-77/134) MS 21-1 │├─ Escherichia coli (22-77/134) H299 │├─ Escherichia coli (22-77/134) UTI89 │├─ Escherichia coli (22-77/134) UMN026 │├─ Escherichia coli (22-77/134) SE15 │├─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (22-77/134) MS 69-1 │├─ Escherichia coli (22-77/134) MS 185-1 │├─ Escherichia coli (22-77/134) MS 116-1 │├─ Escherichia coli (22-77/134) FVEC1412 │├─ Escherichia coli (22-77/134) F11 │├─ Escherichia coli (22-77/134) ED1a │├─ Escherichia coli (22-77/134) E22 ┌──────────────────────────┤├─ Escherichia coli (22-77/134) E110019 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) E110019 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 │ │├─ Escherichia coli (22-77/134) B171 ┌────────────────┤ │└─ fig|6666666.5357.peg.4488 TY-2482 (22-77/134) strain │ │ └─┬─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 │ │ └─ Escherichia coli (22-77/134) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (114-167/225) B171 │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (114-167/225) B171 │ │ │ └─ Escherichia coli (114-167/225) B171 │ │ │┌─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ └──────────────────────────────┤├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ │├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │ │├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │ │├─ Escherichia coli (82-135/193) E22 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) E24377A │ └┼─ Escherichia coli (43-96/154) E24377A │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) E24377A │ ├─ Escherichia coli (127-180/238) E22 │ ├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │ ├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │ ├─ Escherichia coli (104-157/215) E110019 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ ├─ Escherichia coli (104-157/215) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ └─ Escherichia coli (114-167/225) 042 ┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.2517 O104:H4 (23-89/144) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (24-90/145) 042 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) ED1a │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) MS 198-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (23-89/144) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (23-89/144) MS 69-1 │ │├─ Escherichia coli (23-89/144) FVEC1302 │ │├─ Escherichia coli (24-90/145) CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (23-89/144) 042 │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3445 TY-2482 (23-89/144) strain │ │└─ Escherichia coli (24-91/125) B088 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-46/50) 83972 │ ││├─ Escherichia coli (1-46/50) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (1-46/50) MS 185-1 │ │└┼─ Escherichia coli (1-46/50) TA206 │ ┌───────────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (1-46/50) MS 45-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-46/50) H299 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-46/50) ABU 83972 │ ┌─────┤ │ └─ Escherichia coli (24-69/73) CFT073 │ │ │ └─ Escherichia coli (23-89/144) TA280 │ │ └──────────────────────────┬─── Escherichia coli (24-83/136) TA271 │ │ └─ Escherichia coli (24-83/136) MS 182-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-61/120) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) F11 │ │ ┌─────┼─ Escherichia coli (1-61/120) MS 200-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-61/120) 536 │ │ │ ┌──── Escherichia coli (22-67/83) TA280 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-61/137) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌───┴──── Escherichia coli (1-61/111) M605 └────────────────┤ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (22-64/64) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-64/64) E2348/69 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (22-82/98) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/124) ED1a │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/118) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) H299 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 55989 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) ED1a │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) 042 └────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (25-85/144) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 55989 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-61/120) 55989 │ │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 │ │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 └─┤ │├─ Escherichia coli (1-61/120) SE15 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) E110019 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) 55989 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (22-82/141) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (22-82/141) H591 │ │├─ Escherichia coli (22-82/141) ED1a │ │├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │┌┤├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │││├─ fig|1040638.4.peg.682 O104:H4 (22-82/141) str. LB226692 │││├─ Escherichia coli (22-82/141) ED1a │││├─ Escherichia coli (22-82/141) E110019 │││├─ Escherichia coli (22-82/141) EC4100B │││├─ Escherichia coli (1-61/120) 55989 │││├─ Escherichia coli (1-61/77) O103:H2 str. 12009 │││├─ Escherichia coli (22-82/124) ED1a │││└─ Escherichia coli (1-61/77) E22 │││ ┌─ fig|1040638.4.peg.979 O104:H4 (22-82/141) str. LB226692 │││┌┴─ Escherichia coli (14-63/122) MS 175-1 ││││ ┌─ Escherichia coli (1-61/80) O103:H2 str. 12009 ││└┤┌──┴─ fig|1040638.4.peg.356 O104:H4 (3-60/112) str. LB226692 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (1-61/120) O103:H2 str. 12009 ││ └┤┌┼─ Escherichia coli (1-61/120) O55:H7 str. CB9615 ││ ││└─ Escherichia coli (1-61/120) O103:H2 str. 12009 ││ └┤┌─ Escherichia coli (22-82/141) E22 ││ │├─ Escherichia coli (22-82/141) O127:H6 str. E2348/69 └┤ │├─ Escherichia coli (1-61/120) B171 │ └┼─ Escherichia coli (1-61/120) E22 │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (22-82/141) E2348/69 │ └─ Escherichia coli (22-82/141) B171 │ ┌─ Escherichia coli (22-82/141) HS │┌┴─ Escherichia coli (1-61/120) HS ││ ┌─ Escherichia coli (22-82/141) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (22-82/141) MS 116-1 ││ ├─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC508 └┤ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-61/120) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (1-61/120) 536A └──────────┤├─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 │└─ Escherichia coli (22-82/141) 1125A │ ┌─ Escherichia coli (22-82/141) 536 │ ┌───┴─ Escherichia coli (22-65/70) 536 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-82/131) MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) FVEC1412 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-61/120) UMN026 │ │ │└─ Escherichia coli (1-61/120) FVEC1302 │ │┌┤┌─ Escherichia coli (1-61/120) CFT073 │ ││└┼─ Escherichia coli (1-61/120) MS 69-1 └──┤│ └─ Escherichia coli (22-82/141) ABU 83972 ││ ┌─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4206 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-61/120) O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4401 └┤ │├─ Escherichia coli (1-61/120) O157:H7 str. EC4076 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-61/120) 536A │ ││├─ Escherichia coli (1-61/120) 1125A │ ││└─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 str. EC4486 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 EDL933 │ ││ └─ Escherichia coli (22-82/141) O157:H7 EDL933 │ │└┬─ Escherichia coli (1-61/120) MS 185-1 │┌┤ └─ Escherichia coli (1-61/120) ABU 83972 │││┌─ Escherichia coli (1-61/120) UM146 ││└┼─ Escherichia coli (1-61/120) UTI89 ││ ├─ Escherichia coli (1-61/120) UTI89 └┤ └─ Escherichia coli (1-61/120) F11 │ ┌─ Escherichia coli (26-86/145) F11 │ ├─ Escherichia coli (1-61/120) 536 │ ┌─────┼─ Escherichia coli (1-61/120) F11 │ │ └─ Escherichia coli (1-61/120) 536 └─┤ ┌────── fig|6666666.5357.peg.4616 TY-2482 (22-84/84) strain │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.416 O104:H4 (1-62/78) str. LB226692 │ │ ┌───┼─ Escherichia coli (1-62/78) ED1a └────────┤ │ └─ Escherichia coli (1-62/78) 55989 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-83/94) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (1-62/73) ETEC H10407 └─────┤ ├─ Escherichia coli (1-62/73) MS 84-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-62/73) NC101 │ │├─ Escherichia coli (1-62/73) MS 124-1 │ │└─ Escherichia coli (22-83/94) MS 200-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-84/84) 55989 └─┤ ├─ Escherichia coli (22-84/84) 83972 │ ├─ Escherichia coli (22-84/84) SE15 │ ├─ Escherichia coli 042 │ ├─ Escherichia coli H299 │ ├─ Escherichia coli MS 45-1 └─┼─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli MS 185-1 ├─ Escherichia coli ABU 83972 ├─ fig|1040638.4.peg.670 O104:H4 str. LB226692 ├─ Escherichia coli (22-84/84) CFT073 ├─ Escherichia coli (22-84/84) 55989 └─ Escherichia coli (22-84/84) 042
ISSfl3 orfA | (122) |
Insertion Sequence Associated | (59) |
unknown in ISEc8 | (30) |
hypothetical protein | (29) |
conserved hypothetical protein | (6) |
unknown in putative ISEc8 | (2) |
IS, phage, Tn; Transposon-related functions | (2) |
COG2963: Transposase and inactivated derivatives | (1) |
Unknown in ISEc8 | (1) |
Unknown protein encoded by ISEc8 | (1) |
Others | (10) |