┌─ Escherichia coli (10-287/296) 1827-70 ├─ Escherichia coli (10-287/296) 536 ├─ Escherichia coli (10-287/296) 53638 ├─ Escherichia coli (10-287/296) 83972 ├─ Escherichia coli (10-287/296) APEC O1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (10-287/296) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (10-287/296) B7A ├─ Escherichia coli (21-298/307) CFT073 ├─ Escherichia coli (10-287/296) DH1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) ED1a ├─ Escherichia coli (10-287/296) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (10-287/296) F11 ├─ Escherichia coli (10-287/296) IAI39 ├─ Escherichia coli (10-287/296) IHE3034 ├─ Escherichia coli (10-287/296) KO11 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 175-1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (10-287/296) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (10-287/296) S88 ├─ Escherichia coli (10-287/296) SE15 ├─ Escherichia coli (10-287/296) TA206 ├─ Escherichia coli (10-287/296) UTI89 ├─ Escherichia coli (10-287/296) W3110 ├─ Escherichia coli (10-287/296) str. K-12 substr. DH10B ┌┼─ Escherichia coli (10-287/296) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (10-287/296) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (10-287/296) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (10-287/296) UTI89 │├─ Escherichia coli (10-287/296) UM146 │├─ Escherichia coli (10-287/296) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (10-287/296) SE11 │├─ Escherichia coli (10-287/296) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (10-287/296) NC101 │├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 200-1 │├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 185-1 │├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 146-1 │├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 124-1 │├─ Escherichia coli (10-287/296) M605 ┌┤├─ Escherichia coli (10-287/296) K12 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) IAI39 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) H736 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) F11 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) ED1a ││├─ Escherichia coli (21-298/307) E2348/69 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) CFT073 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) BW2952 ││├─ Escherichia coli (10-287/296) B7A ││├─ Escherichia coli (10-287/296) ATCC 8739 ┌┤│├─ Escherichia coli (10-287/296) APEC O1 │││├─ Escherichia coli (10-287/296) ABU 83972 │││├─ Escherichia coli (10-287/296) 53638 │││├─ Escherichia coli (10-287/296) 536 │││└─ Escherichia coli (10-287/296) 2362-75 ││└─ Escherichia coli (10-287/296) WV_060327 ││ ┌─ Escherichia coli (10-287/296) 101-1 ││ ├─ Escherichia coli (DE3 10-287/296) BL21(DE3) ┌────────────────────────────────────────────────────────┤│┌┼─ Escherichia coli (10-287/296) OP50 │ │││├─ Escherichia coli (10-287/296) MS 187-1 │ │└┤└─ Escherichia coli (10-287/296) BL21 │ │ │┌─ Escherichia coli (10-287/296) B171 │ │ │├─ Escherichia coli (10-287/296) E22 │ │ └┼─ Escherichia coli (10-287/296) O103:H2 str. 12009 ┌───┤ │ ├─ Escherichia coli (10-287/296) E22 │ │ │ └─ Escherichia coli (10-287/296) B171 │ │ └─ Escherichia coli (10-287/296) H299 │ │ ┌────────────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (8-266/285) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ┌─ Escherichia coli M718 │ └─┤ ┌─┴─ Escherichia coli H299 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli ED1a │ └────────────────────────────────────────────────┤┌─ fig|6666666.5357.peg.3723 TY-2482 strain │ │├─ Escherichia coli 55989 │ └┼─ Escherichia coli SE15 │ ├─ Escherichia coli 55989 │ └─ fig|1040638.4.peg.657 O104:H4 str. LB226692 │ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) K12 │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (4-266/285) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-266/285) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) W3110 │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 116-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-266/285) H736 │ ││└─ Escherichia coli (4-266/285) DH1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) B7A │ ││┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) B7A │ │└┤┌─ fig|6666666.5357.peg.4677 TY-2482 (4-266/285) strain │ │ ││┌─ Escherichia coli (4-266/285) 55989 │ │ └┤├─ Escherichia coli (4-266/285) EC4100B │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 107-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) W │ │ └┼─ Escherichia coli (4-266/285) W │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) 55989 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2842 O104:H4 (4-266/285) str. LB226692 │ ││┌─ Escherichia coli (4-266/285) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) H591 │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 124-1 │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) SE11 │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (4-266/285) TA271 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 84-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) E24377A │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) E110019 │ ││ └─ Escherichia coli (4-266/285) B088 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) MS 182-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O111:H- str. 11128 │ ││┌┼─ Escherichia coli (4-266/285) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤└┤└─ Escherichia coli (4-266/285) MS 78-1 │ ││ │┌─ Escherichia coli (4-266/285) MS 187-1 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (4-266/285) B str. REL606 │ ││ │├─ Escherichia coli (DE3 4-266/285) BL21(DE3) ┤ ││ └┼─ Escherichia coli (4-266/285) OP50 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) BL21 │ ││ └─ Escherichia coli (4-266/285) 101-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) ATCC 8739 │ ││┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) ATCC 8739 │ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (4-266/285) 53638 │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-266/285) 53638 │ ││ └─ Escherichia coli (4-266/285) 1827-70 │ ││┌─ Escherichia coli (4-266/285) M718 │ │││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) B171 │ │││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) B185 │ │││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) E22 │ │││┌┼─ Escherichia coli (4-266/285) O103:H2 str. 12009 │ │└┤│├─ Escherichia coli (4-266/285) E22 │ │ ││└─ Escherichia coli (4-266/285) B171 │ │ ││┌─ Escherichia coli (4-266/285) 1125A │ │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) 536A │ │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4024 │ │ └┤├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4045 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC869 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. FRIK966 │ ││ │├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. TW14359 │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-266/285) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC508 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4486 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 str. EC4042 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) 1212A │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (4-266/285) 1044A │ │││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) IAI39 │ │││ ┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) IAI39 │ │││ ┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) SMS-3-5 │ │││┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) B354 │ ││└┤┌─ Escherichia coli (4-266/285) MS 21-1 │ ││ ││ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) HS │ ││ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) HS │ ┌──────────────────────────┤│ │┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) MS 115-1 │ │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (4-266/285) 042 │ │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (4-266/285) 042 │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (4-266/285) FVEC1412 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-266/285) UMN026 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-266/285) MS 198-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-266/285) FVEC1302 │ │ │└─ Escherichia coli (3-265/284) MS 69-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-266/285) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (3-265/284) H299 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-263/282) M718 └──────────────────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (2-263/282) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (2-263/282) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (2-263/282) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (2-263/282) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (2-263/282) M605 │ │ ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 45-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-263/282) WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli (2-263/282) SE15 │ │ │├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-263/282) IAI39 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-263/282) H299 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-263/282) ABU 83972 └───────────────────────────────────────────┤ ┌┤│└─ Escherichia coli (2-263/282) 2362-75 │ ││└─ Escherichia coli (2-263/282) NC101 │ │└┬─ Escherichia coli (23-287/306) O127:H6 str. E2348/69 │┌┤ └─ Escherichia coli (23-287/306) E2348/69 │││┌─ Escherichia coli (23-287/306) CFT073 ││└┼─ Escherichia coli (23-287/306) TA280 ││ └─ Escherichia coli (23-287/306) 042 ││ ┌─ Escherichia coli (2-263/282) 536 ││ ├─ Escherichia coli (2-263/282) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (2-263/282) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (2-263/282) IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli (2-263/282) O83:H1 str. NRG 857C ││ ├─ Escherichia coli (2-263/282) TA206 ││ ┌┼─ Escherichia coli (2-263/282) UTI89 └┤ │├─ Escherichia coli (2-263/282) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (2-263/282) S88 │ │├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 200-1 │┌┤├─ Escherichia coli (2-263/282) F11 │││├─ Escherichia coli (2-263/282) ED1a │││└─ Escherichia coli (2-263/282) 536 │││┌─ Escherichia coli (23-287/306) F11 ││└┼─ Escherichia coli (23-287/306) UM146 ││ └─ Escherichia coli (23-287/306) APEC O1 ││ ┌─ Escherichia coli (23-287/306) 53638 ││ ├─ Escherichia coli (23-287/306) HS ││ ├─ Escherichia coli (23-287/306) O157:H7 └┤ ├─ Escherichia coli (23-287/306) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (23-287/306) B171 │ ├─ Escherichia coli (23-287/306) E110019 │┌┼─ Escherichia coli (23-287/306) E24377A ││├─ Escherichia coli (23-287/306) E22 ││├─ Escherichia coli (23-287/306) B7A ││├─ Escherichia coli (23-287/306) MS 69-1 ││├─ Escherichia coli (23-287/306) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (23-287/306) K12 ││└─ Escherichia coli (23-287/306) B088 └┤ ┌─ Escherichia coli (23-287/306) ATCC 8739 │┌┴─ Escherichia coli (2-263/282) ATCC 8739 ││ ┌─ Escherichia coli (2-263/282) IAI1 ││┌┴─ Escherichia coli (2-263/282) IAI1 │││┌─ Escherichia coli (2-263/282) EC4100B ││││┌─ fig|6666666.5357.peg.2629 TY-2482 (2-263/282) strain ││││├─ Escherichia coli (2-263/282) 1044A └┤││├─ Escherichia coli (2-263/282) 1212A │││├─ Escherichia coli (2-263/282) 53638 │││├─ Escherichia coli (2-263/282) 55989 │││├─ Escherichia coli (2-263/282) B str. REL606 │││├─ Escherichia coli (2-263/282) B354 │││├─ Escherichia coli (DE3 2-263/282) BL21(DE3) └┤│├─ Escherichia coli (2-263/282) DH1 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) FVEC1412 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) H736 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) KO11 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 115-1 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 119-7 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 146-1 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 187-1 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 198-1 ││├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 78-1 └┤├─ Escherichia coli (2-263/282) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (2-263/282) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (2-263/282) SE11 │├─ Escherichia coli (2-263/282) TA143 │├─ Escherichia coli (2-263/282) UMN026 │├─ Escherichia coli (2-263/282) W │├─ Escherichia coli (2-263/282) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (2-263/282) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (2-263/282) B7A │├─ Escherichia coli (2-263/282) E22 │├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 145-7 └┼─ Escherichia coli (2-263/282) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (2-263/282) E24377A ├─ Escherichia coli (2-263/282) E110019 ├─ Escherichia coli (2-263/282) B171 ├─ Escherichia coli (2-263/282) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (2-263/282) W3110 ├─ Escherichia coli (2-263/282) W ├─ Escherichia coli (2-263/282) TA271 ├─ Escherichia coli (2-263/282) SMS-3-5 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (2-263/282) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (2-263/282) HS ├─ Escherichia coli (2-263/282) H591 ├─ Escherichia coli (2-263/282) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (2-263/282) BW2952 ├─ Escherichia coli (2-263/282) BL21 ├─ Escherichia coli (2-263/282) B185 ├─ Escherichia coli (2-263/282) 55989 ├─ Escherichia coli (2-263/282) 536A ├─ Escherichia coli (2-263/282) 1827-70 ├─ Escherichia coli (2-263/282) 1125A ├─ Escherichia coli (2-263/282) 101-1 └─ fig|1040638.4.peg.2991 O104:H4 (2-263/282) str. LB226692
| Putative transcriptional regulator | (126) |
| Sialic acid utilization regulator, RpiR family | (86) |
| Transcriptional regulator of D-allose utilization, RpiR family | (70) |
| Transcriptional regulator, RpiR family | (16) |
| RpiR family transcriptional regulator | (7) |
| hypothetical protein | (5) |
| Transcriptional regulator | (1) |
| Others | (6) |