┌─ Escherichia coli (334-403/419) 2362-75 ┌┼─ Escherichia coli (281-350/369) MS 196-1 ┌┤└─ Escherichia coli (334-403/417) MS 21-1 │└┬─ Escherichia coli (334-403/419) 042 ┌─┤ └─ Escherichia coli (362-431/447) 042 │ └─ Escherichia coli (334-403/419) MS 182-1 ┌───────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (335-404/419) O127:H6 str. E2348/69 │ └──┼─ Escherichia coli (335-404/419) TA206 ┌───────────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (369-438/453) E2348/69 ┌───┤ └────────────────────────── Escherichia coli (319-389/396) MS 21-1 │ └─────────────┬─ Escherichia coli (320-390/417) O127:H6 str. E2348/69 │ └─ Escherichia coli (320-390/417) E2348/69 │ ┌─ Escherichia coli (336-399/421) 042 │ ┌┼─ Escherichia coli (336-399/421) M605 │ ┌──────────────────────────┤└─ Escherichia coli (336-399/421) 042 │ │ └─ Escherichia coli (336-399/420) MS 187-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (314-397/400) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4486 ┤ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) UM146 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (43-126/129) E110019 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (76-159/162) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 str. EC4024 └───────────┤ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) O111:H- str. 11128 │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) 1212A │ ┌──────────────────────────────┤│├─ Escherichia coli (314-397/400) 1044A │ │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) MS 45-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (314-397/400) CFT073 │ │ ││└─ Escherichia coli (314-397/400) ABU 83972 │ │ │└─┬─ Escherichia coli (258-346/346) MS 119-7 │ │ │ └─ Escherichia coli (314-402/402) SMS-3-5 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (314-405/405) E2348/69 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (314-405/405) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.616 O104:H4 str. LB226692 │ │ └─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (314-405/405) strain │ ┌─────────┤ ┌─ Escherichia coli (330-389/412) 1125A │ │ │ ├─ Escherichia coli (330-389/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ │┌─────────────────────┼─ Escherichia coli (330-389/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││ └─ Escherichia coli (330-389/412) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (334-394/413) ED1a │ │ ││ ├─ Escherichia coli (334-394/413) MS 21-1 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (334-394/413) O26:H11 str. 11368 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli (334-394/413) ED1a │ │ ││ │└─ Escherichia coli (334-394/413) O111:H- str. 11128 │ │ └┤ ┌┤┌─ Escherichia coli (334-394/413) 53638 │ │ │ │└┼─ Escherichia coli (334-394/413) B185 │ │ │ ┌─────────┤ └─ Escherichia coli (334-394/413) 53638 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (334-394/414) 042 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (334-394/414) 042 │ │ │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3049 O104:H4 (58-122/140) str. LB226692 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (331-395/413) 55989 │ │ └───────┤ ├─ Escherichia coli (331-395/413) H591 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (331-395/413) TA271 │ │ │ │├─ Escherichia coli (331-395/413) MS 119-7 │ │ │┌┤├─ Escherichia coli (331-395/413) 55989 │ │ │││└─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (331-395/413) strain │ │ └┤└── Escherichia coli (331-393/413) MS 146-1 │ │ │┌─ Escherichia coli (331-393/413) MS 115-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (331-396/396) WV_060327 │ │ ││┌─ Escherichia coli (331-393/413) DH1 └─────────┤ └┤├─ Escherichia coli (331-393/413) W3110 │ │├─ Escherichia coli (331-393/413) str. K-12 substr. DH10B │ └┼─ Escherichia coli (331-393/413) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (331-393/413) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (331-393/413) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (331-393/413) K12 │ └─ Escherichia coli (331-393/413) BW2952 │ ┌─ Escherichia coli (357-424/431) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (357-424/431) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (357-424/431) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (357-424/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (357-424/431) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤└─ Escherichia coli (357-424/431) K12 │ │└───┬─ Escherichia coli (355-420/428) ATCC 8739 │ ┌──────────────┤ └─ Escherichia coli (355-420/428) ATCC 8739 │ │ └┬─ Escherichia coli (328-393/402) MS 187-1 │ │ └─ Escherichia coli (280-345/353) MS 146-1 │ │ ┌────── Escherichia coli (325-384/389) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (341-410/410) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) O157:H7 str. EC4115 └──────┤ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. TW14588 │ │ ┌───────┼─ Escherichia coli (341-410/410) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4401 └──────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4196 │ ┌────┤ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli (151-220/220) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli (324-393/393) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) O157:H7 EDL933 │ ┌──┤ │ ├─ Escherichia coli (341-410/410) 536A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (341-410/410) 1125A │ │ │ └─────── Escherichia coli (341-399/407) SE15 │ │ └┬─ Escherichia coli (327-388/393) 042 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (327-388/393) 042 │ │ │ ┌─── Escherichia coli (327-384/387) SMS-3-5 │ │ │ ┌┴────────────── Escherichia coli (325-386/392) MS 145-7 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (327-394/395) O157:H7 str. EC869 │ │ └─┤ ┌┼─ Escherichia coli (327-394/395) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (327-394/395) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ │└───────┬─ Escherichia coli (277-338/338) E110019 │ │ └─┤ └─ Escherichia coli (308-369/369) E110019 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (327-386/390) MS 185-1 │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (327-390/391) ATCC 8739 │ │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (327-390/391) ATCC 8739 └─┤ └──┤ ┌─ Escherichia coli (327-392/395) F11 │ └──────┼─ Escherichia coli (161-226/229) MS 200-1 │ └─ Escherichia coli (327-392/395) F11 │ ┌─ Escherichia coli (327-386/396) MS 124-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (327-386/396) MS 84-1 │ ┌─┴── Escherichia coli (94-153/163) O26:H11 str. 11368 │┌──┴──── Escherichia coli (327-393/396) TA206 ││┌────── Escherichia coli (312-391/397) MS 115-1 │││ ┌─ Escherichia coli (349-417/427) 83972 │││ ┌─┼─ Escherichia coli (325-393/403) MS 45-1 │││ ┌┤ └─ Escherichia coli (349-417/427) ABU 83972 └┤│ │└┬─ Escherichia coli (349-410/428) B7A ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (325-386/404) B7A ││ ││ ┌─ Escherichia coli (325-388/407) W ││ │└─────┼─ Escherichia coli (357-420/439) W ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (357-420/439) KO11 └┤ ││┌──── Escherichia coli (325-386/399) MS 145-7 │ │└┤┌─── Escherichia coli (325-394/396) SE11 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (325-386/394) SMS-3-5 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (325-386/402) HS │ │ └┼─ Escherichia coli (59-120/136) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (67-128/144) MS 116-1 │ │ └─ Escherichia coli (338-399/415) HS │ │ ┌─ Escherichia coli (325-388/404) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/404) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/404) MS 84-1 └──┤ ┌┼─ Escherichia coli (325-388/404) NC101 │ │├─ Escherichia coli (325-388/404) MS 124-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (325-388/404) ABU 83972 │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (325-388/404) strain │ │└┼─ Escherichia coli (325-388/404) 55989 │┌─┤ ├─ Escherichia coli (325-388/404) 55989 ││ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (325-388/404) str. LB226692 ││ └┬─ Escherichia coli (338-401/417) ED1a ││ └─ Escherichia coli (338-401/417) ED1a ││ ┌─ Escherichia coli (325-393/393) 536 ││ ┌┴─ Escherichia coli (325-393/393) 536 ││ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (325-388/394) str. LB226692 └┤ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) M718 │ │ ├─ Escherichia coli (325-388/394) MS 187-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (325-388/394) OP50 └─┤ │├─ Escherichia coli (325-388/394) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (325-388/394) IAI39 │ │├─ Escherichia coli (325-388/394) CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli (DE3 325-388/394) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (325-388/394) B str. REL606 │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.4635 TY-2482 (300-363/369) strain │ │└─ Escherichia coli (325-394/394) TA280 │ │ ┌─ Escherichia coli (337-398/404) E24377A │ │ ┌┼─ Escherichia coli (327-388/394) SMS-3-5 └─┤ ┌┤└─ Escherichia coli (327-388/394) E24377A │┌┤└─ Escherichia coli (327-388/396) TA280 ││└┬─ Escherichia coli (327-388/392) MS 21-1 ││ └┬─ Escherichia coli (327-388/396) MS 124-1 ││ └─ Escherichia coli (327-388/396) MS 84-1 ││ ┌─ Escherichia coli (325-388/396) ETEC H10407 └┤┌┴─ Escherichia coli (325-388/396) H299 ││┌─ Escherichia coli (349-417/417) 1125A ││├─ Escherichia coli (349-417/417) 536A ││├─ Escherichia coli (325-393/393) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4045 └┤├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (325-393/393) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. TW14359 └┼─ Escherichia coli (325-393/393) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (325-393/393) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (325-393/393) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (349-417/417) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (325-393/393) O157:H7 ├─ Escherichia coli (325-393/393) 1212A └─ Escherichia coli (349-417/417) 1044A
| Integrase | (88) |
| Phage integrase | (52) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (47) |
| Prophage CP4-57 integrase | (14) |
| putative prophage integrase | (5) |
| Putative integrase | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| putative enzyme; Integration, recombination | (3) |
| phage integrase family protein | (3) |
| putative integrase | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| Phage Integrase | (1) |
| site-specific recombinase, phage integrase family protein | (1) |
| integrase | (1) |
| Others | (8) |