┌─ Escherichia coli (60-373/373) B088 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli EC4100B ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli MS 107-1 ├─ Escherichia coli MS 124-1 ├─ Escherichia coli MS 182-1 ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli TA271 ├─ fig|6666666.5357.peg.1773 TY-2482 (7-320/320) strain ├─ Escherichia coli (7-320/320) IAI1 ├─ Escherichia coli (7-320/320) MS 84-1 ┌┼─ Escherichia coli (7-320/320) W │├─ Escherichia coli (7-320/320) IAI1 │├─ Escherichia coli (7-320/320) H591 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli SE11 │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli MS 78-1 │├─ Escherichia coli MS 145-7 │├─ Escherichia coli MS 119-7 │├─ Escherichia coli KO11 │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli E24377A │├─ Escherichia coli E22 │├─ Escherichia coli E110019 │├─ Escherichia coli B7A │├─ Escherichia coli B171 ┌┤├─ Escherichia coli 55989 ││└─ fig|1040638.4.peg.5637 O104:H4 str. LB226692 ││┌─ Escherichia coli 101-1 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli BL21 ││├─ Escherichia coli BW2952 ││├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli FVEC1412 ││├─ Escherichia coli K12 ││├─ Escherichia coli MS 115-1 ││├─ Escherichia coli MS 187-1 ││├─ Escherichia coli MS 198-1 ││├─ Escherichia coli OP50 ││├─ Escherichia coli TA280 ││├─ Escherichia coli W3110 ││├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │└┼─ Escherichia coli (7-320/320) B354 ┌┤ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││ ├─ Escherichia coli UMN026 ││ ├─ Escherichia coli TA143 ││ ├─ Escherichia coli MS 69-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 196-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 116-1 ││ ├─ Escherichia coli M718 ││ ├─ Escherichia coli H736 ││ ├─ Escherichia coli FVEC1302 ││ ├─ Escherichia coli DH1 ││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││ ├─ Escherichia coli B str. REL606 ││ ├─ Escherichia coli 1827-70 ││ └─ Escherichia coli (29-342/342) ATCC 8739 ││┌─ Escherichia coli M605 │││┌─ Escherichia coli H299 ││││┌─ Escherichia coli (29-342/342) E2348/69 │└┤│├─ Escherichia coli 83972 │ ││├─ Escherichia coli APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli CFT073 │ ││├─ Escherichia coli F11 │ └┤├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 ┌┤ │├─ Escherichia coli SE15 ││ │├─ Escherichia coli UM146 ││ │├─ Escherichia coli UTI89 ││ │├─ Escherichia coli (7-320/320) 536 ││ └┼─ Escherichia coli (7-320/320) WV_060327 ││ ├─ Escherichia coli (7-320/320) O83:H1 str. NRG 857C ││ ├─ Escherichia coli (7-320/320) 536 ││ ├─ Escherichia coli UTI89 ││ ├─ Escherichia coli TA206 ││ ├─ Escherichia coli S88 ││ ├─ Escherichia coli NC101 ││ ├─ Escherichia coli MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli F11 ││ ├─ Escherichia coli CFT073 ││ ├─ Escherichia coli ABU 83972 ││ ├─ Escherichia coli 2362-75 ││ └─ Escherichia coli (29-342/342) APEC O1 ││ ┌─ Escherichia coli (29-342/342) 042 ││┌┴─ Escherichia coli 042 │││ ┌─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │││ ┌┼─ Escherichia coli (7-320/320) O157:H7 str. FRIK966 │││┌┤└─ Escherichia coli (7-320/320) O157:H7 str. EC869 │└┤│└─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ┌┤ ││┌─ Escherichia coli 1125A ││ ││├─ Escherichia coli 536A ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││ └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (7-320/320) O157:H7 EDL933 ││ └┼─ Escherichia coli (7-320/320) O157:H7 str. EC4045 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ┌┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ┌─────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli B185 │ │││ ├─ Escherichia coli 1212A │ │││ └─ Escherichia coli 1044A │ ││└─ Escherichia coli MS 175-1 │ ││┌─ Escherichia coli IAI39 │ │└┼─ Escherichia coli SMS-3-5 ┌─────────┤ │ └─ Escherichia coli IAI39 │ │ └─ Escherichia coli MS 21-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (10-301/311) 101-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (10-301/311) MS 175-1 │ │ ┌────────────────────┤└─ Escherichia coli (10-301/311) BL21 │ └─────────────┤ └─ Escherichia coli (26-303/326) MS 146-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-282/295) TA280 │ └──────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (1-282/295) B354 │ └┤┌─ Escherichia coli (1-282/295) FVEC1412 │ │├─ Escherichia coli (1-282/295) MS 69-1 │ └┼─ Escherichia coli (1-282/295) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (1-282/295) TA143 │ ├─ Escherichia coli (1-282/295) MS 198-1 │ └─ Escherichia coli (1-282/295) FVEC1302 │ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 198-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 69-1 ┤ ┌┤└─ Escherichia coli (7-283/300) FVEC1412 │ ││┌─ Escherichia coli (7-283/300) 042 │ │└┼─ Escherichia coli (7-283/300) TA143 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (19-295/312) 042 │ ││┌─ Escherichia coli (7-283/300) M605 │ │└┼─ Escherichia coli (7-283/300) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (7-283/300) H299 │ │ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (19-295/312) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) TA206 │ │ ├─ Escherichia coli (7-283/300) UTI89 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) UTI89 └───────────────────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (7-283/300) UM146 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) S88 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 185-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (7-283/300) F11 │ ││├─ Escherichia coli (19-295/312) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) ABU 83972 │ ││└─ Escherichia coli (7-283/300) 536 │ ││┌─ Escherichia coli (19-295/312) E2348/69 │┌┤└┼─ Escherichia coli (7-283/300) O83:H1 str. NRG 857C │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O127:H6 str. E2348/69 │││ └─ Escherichia coli (7-283/300) 2362-75 │││ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) ED1a ││└┬┴─ Escherichia coli (7-283/300) ED1a ││ └┬─ Escherichia coli (7-283/300) CFT073 ││ └─ Escherichia coli (19-295/312) CFT073 └┤ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) IAI39 │┌┴─ Escherichia coli (7-283/300) IAI39 ││┌─ Escherichia coli (7-283/300) SMS-3-5 │││ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) 1044A │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) 1212A │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) B185 │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 EDL933 │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4024 └┤│ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4045 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC869 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. FRIK966 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. TW14359 └┤ ┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4206 │ ┌┤├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4115 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4076 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) O157:H7 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) 536A │ ││└─ Escherichia coli (7-283/300) 1125A └───┤└─ Escherichia coli (7-283/300) M718 │┌─ Escherichia coli (7-283/300) ETEC H10407 ││ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) 101-1 ││┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) 53638 │││└─ Escherichia coli (7-283/300) 53638 │││ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) 1827-70 │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) DH1 └┤│ ├─ Escherichia coli (7-283/300) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) HS ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) KO11 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) W ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) W3110 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. DH10B ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. DH10B └┤ ┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) W │ │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 196-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (7-283/300) K12 │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) HS │ ││├─ Escherichia coli (7-283/300) E110019 │┌┤│├─ Escherichia coli (7-283/300) BW2952 ││││└─ Escherichia coli (7-283/300) ATCC 8739 │││└─ Escherichia coli (7-283/300) MS 116-1 ││└┬─ Escherichia coli (7-283/300) MS 146-1 └┤ └─ Escherichia coli (7-283/300) H736 │┌─ Escherichia coli (7-283/300) MS 107-1 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5296 O104:H4 (7-283/300) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (7-283/300) IAI1 └┤ ├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 124-1 │┌┼─ Escherichia coli (7-283/300) MS 84-1 ││├─ Escherichia coli (7-283/300) IAI1 ││├─ Escherichia coli (7-283/300) 55989 ││└─ fig|6666666.5357.peg.404 TY-2482 (7-283/300) strain └┤ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) TA280 │┌┴─ Escherichia coli (7-283/300) B354 ││ ┌─ Escherichia coli (7-283/300) O111:H- str. 11128 ││┌┴─ Escherichia coli (7-283/300) B088 └┤│┌─ Escherichia coli (7-283/300) B171 ││├─ Escherichia coli (7-283/300) B7A ││├─ Escherichia coli (7-283/300) E22 └┤├─ Escherichia coli (7-283/300) E24377A │├─ Escherichia coli (7-283/300) H591 │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (7-283/300) O26:H11 str. 11368 └┼─ Escherichia coli (7-283/300) TA271 ├─ Escherichia coli (7-283/300) SE11 ├─ Escherichia coli (7-283/300) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (7-283/300) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (7-283/300) EC4100B ├─ Escherichia coli (7-283/300) E24377A ├─ Escherichia coli (7-283/300) E22 ├─ Escherichia coli (7-283/300) B7A └─ Escherichia coli (7-283/300) B171
| Putative LysR-family transcriptional regulator YbdO | (126) |
| Probable transcriptional activator for leuABCD operon | (118) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (8) |
| Probable HTH-type transcriptional regulator leuO | (7) |
| Cyn operon transcriptional activator | (4) |
| Others | (4) |