┌─ Escherichia coli (11-288/293) B354 ┌┴─ Escherichia coli (11-288/293) TA280 ┌┴─ Escherichia coli (11-288/293) MS 69-1 ┌┴─ Escherichia coli (11-288/293) TA143 ┌┴┬─ Escherichia coli (11-288/293) MS 21-1 ┌┤ └─ Escherichia coli (11-288/293) SMS-3-5 │└─ Escherichia coli (26-303/308) EC4100B ┌┤┌─ Escherichia coli (11-288/293) K12 (24) │└┤ ┌─ Escherichia coli (11-288/293) H299 (3) │ └┬┴─ Escherichia coli (11-288/293) ED1a (1) │ └┬─ Escherichia coli (11-288/293) NC101 ┌┤ └┬─ Escherichia coli (11-288/293) 536 (12) ││ └┬─ Escherichia coli (11-288/293) APEC O1 (6) ││ └─ Escherichia coli (11-288/293) 2362-75 (2) ┌┤└┬─ Escherichia coli (26-303/308) 042 (1) ││ └─ Escherichia coli (11-288/293) FVEC1302 (3) ┌┤└┬─ fig|1040638.4.peg.3008 O104:H4 (11-288/293) str. LB226692 (3) ││ └─ Escherichia coli (26-303/308) B7A (10) ┌┤└─ Escherichia coli (11-288/293) O26:H11 str. 11368 │└┬─ Escherichia coli (26-303/308) B171 (15) ┌┤ └┬─ Escherichia coli (11-288/293) MS 115-1 ││ └─ Escherichia coli (11-288/293) ETEC H10407 ┌┤└─ Escherichia coli (26-303/308) B088 ┌┤└─ Escherichia coli (26-298/308) 1044A (25) ┌──────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (11-283/293) M718 │ └─ Escherichia coli (11-283/293) B185 ┌─────┤ ┌─ Escherichia coli (1-285/293) O111:H- str. 11128 (1) │ └─────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-285/293) K12 (80) │ └┬┴─ Escherichia coli (1-285/293) MS 21-1 ┌────┤ └┬─ Escherichia coli (1-285/293) B354 │ │ └─ Escherichia coli (1-285/293) 042 (6) │ │ ┌─────────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (9-297/312) IAI1 (1) │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (12-296/299) MS 69-1 (1) │ │ ┌──────────────────────────────┴─ Escherichia coli (12-296/299) M718 (2) │ └───┬────────────────┴─────────────────────── Escherichia coli (1-301/311) MS 119-7 │ └──────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (5-294/305) M718 │ └┬─ Escherichia coli (5-294/305) K12 (128) │ └─ Escherichia coli (5-294/305) O55:H7 str. CB9615 │ ┌─ Escherichia coli (31-309/311) HS (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (31-309/311) 53638 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (31-309/311) K12 (10) │ ┌┴─ Escherichia coli (31-309/311) 101-1 (7) │ ┌┴─ Escherichia coli (31-307/315) TA143 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (19-307/315) B185 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (19-307/315) IAI39 (1) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (19-307/314) 536 (7) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (19-307/315) SMS-3-5 │ ││ └─ Escherichia coli (19-309/311) MS 21-1 │ ││┌─ Escherichia coli (19-309/311) SE15 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (19-309/311) APEC O1 (7) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (19-307/315) M605 │ ┌───────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (19-309/311) TA206 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (19-309/311) ED1a (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (19-307/315) 83972 (2) ┤ ┌──────┤ │ └─ Escherichia coli (21-309/317) CFT073 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (19-307/314) IAI39 (1) │ │ └────────────────────────┬─ Escherichia coli (11-284/305) B185 │ ┌───────────┤ └┬─ Escherichia coli (11-284/305) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (11-284/305) K12 (113) │ │ │ └─ Escherichia coli (11-284/305) B171 (1) │ │ └─────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (13-302/302) 1044A (25) │ │ ┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli B088 │ │ ┌┴─ Escherichia coli B185 │ │ ┌┴─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli ETEC H10407 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli 042 (1) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli TA280 │ │ ││ └─ Escherichia coli FVEC1302 (4) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli 1044A (24) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli B354 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli IAI39 (2) │ │ │└┬─ Escherichia coli M718 │ │ │ └┬─ Escherichia coli HS (4) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli 101-1 (9) │ │ ││┌─ Escherichia coli H299 │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli SE15 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli M605 │ │ ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli 2362-75 (2) │ │ ││ └┬─ Escherichia coli WV_060327 └─┤ ││ └┬─ Escherichia coli APEC O1 (10) │ ┌┤│ └─ Escherichia coli 536 (11) │ ││└─ Escherichia coli K12 (18) │ ┌┤└─ Escherichia coli 53638 (1) │ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.5493 O104:H4 str. LB226692 (12) │ ┌────────────────────────┤└─ Escherichia coli H591 (5) │ ┌┤ └─ Escherichia coli E110019 (1) │ │└───┬────────────────────────────────── Escherichia coli (17-311/318) TA206 │ │ └─────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (10-291/298) B354 │ │ └┬─ Escherichia coli (10-291/298) FVEC1302 (4) │ │ └┬─ Escherichia coli (10-291/298) B185 │ │ └─ Escherichia coli (10-291/298) MS 21-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-293/310) 1044A (23) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-293/310) O157:H7 EDL933 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-293/310) TA271 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-293/310) B7A (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-293/310) MS 124-1 (1) │ │ │└┬─ Escherichia coli (8-293/310) EC4100B │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-293/310) K12 (48) │ │ │└┬─ Escherichia coli (24-309/326) 83972 (24) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-293/310) 042 (19) │ │ ┌────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (8-293/310) B354 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (8-293/310) TA143 └────────┤ ┌────────────────────┤ └─ Escherichia coli (8-293/310) ETEC H10407 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-294/307) MS 107-1 (1) │ │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (9-294/307) MS 69-1 │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.3875 O104:H4 (9-294/307) str. LB226692 (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (16-301/314) 042 (74) │ │ └┬─ Escherichia coli (9-294/307) K12 (7) │ │ └─ Escherichia coli (9-294/307) 1827-70 (13) │ │ ┌─ Escherichia coli (31-315/323) 83972 (5) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (31-315/323) F11 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (31-315/323) ED1a (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (31-315/323) APEC O1 (7) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (31-315/323) 2362-75 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (31-315/323) M605 (1) │ │ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.2153 O104:H4 (31-315/323) str. LB226692 (32) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) O111:H- str. 11128 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) E110019 (1) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) MS 146-1 (1) │ │ ││ └─ Escherichia coli (31-315/323) K12 (16) └─┤ ┌┤└─ Escherichia coli (31-315/323) B185 │ │└┬─ Escherichia coli (31-315/323) MS 21-1 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) IAI39 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) TA143 │ ││ └┬─ Escherichia coli (31-315/323) 042 (7) │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (31-315/323) B354 │ ││└─ Escherichia coli (31-315/323) H299 │ ┌┤└─ Escherichia coli (31-315/323) 1044A (25) │ ┌─────────────────────┤└─ Escherichia coli (31-315/323) 53638 (1) │ │ └─ Escherichia coli (31-315/323) 1827-70 (4) │ ┌───┤ ┌─ Escherichia coli (1-285/303) MS 116-1 │ │ └──────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-285/303) ED1a (1) │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.1827 O104:H4 (1-285/303) str. LB226692 (108) │ ┌───┤ └┬─ Escherichia coli (1-285/303) O157:H7 EDL933 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-291/309) O157:H7 EDL933 │ │ │ └─ Escherichia coli (5-291/309) K12 (18) │ │ └───────────────────────────── Escherichia coli (4-290/294) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌────────────────────────────────── Escherichia coli (4-293/299) FVEC1302 (5) └─┤ │ ┌─ Escherichia coli (33-322/329) 042 (5) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-301/308) B354 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-322/329) 2362-75 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-301/308) TA143 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (12-301/308) B185 (5) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (33-322/329) WV_060327 └──────────┤ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (12-301/308) M605 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (12-301/308) 536 (20) │ ┌────────────────────┤└─ Escherichia coli (12-301/308) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli (12-301/308) 1044A (8) │ │ └─ Escherichia coli (12-301/308) 1125A (15) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-293/299) 1044A (24) │ │ ┌─────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-293/299) M718 └──┤ │ ┌─ Escherichia coli (1-288/302) 53638 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-288/302) K12 (21) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-288/302) B171 (8) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-288/302) B7A (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-288/302) EC4100B (10) └──┤ ┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.4749 O104:H4 (1-288/302) str. LB226692 (3) │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-288/302) B088 (5) │ │└┬─ Escherichia coli (1-288/302) TA271 │ ┌───────────────┤ └─ Escherichia coli (1-288/302) SE11 │ │ └─ Escherichia coli (1-288/302) IAI39 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (9-292/294) B354 (8) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (9-292/294) 042 (1) └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (9-292/294) B185 │ ┌──┴┬─ Escherichia coli (9-292/294) O55:H7 str. CB9615 │ ┌──────────────────┤ └─ Escherichia coli (9-292/294) 1044A (23) │ │ └─── Escherichia coli (10-293/295) 101-1 └────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-293/299) 1044A (25) │ │ ┌─ Escherichia coli (8-293/299) K12 (24) └────────────────┤┌┴─ Escherichia coli (8-293/299) ETEC H10407 ││ ┌─ Escherichia coli (8-293/299) B088 (18) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-293/299) E110019 (1) │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.4093 O104:H4 (8-293/299) str. LB226692 (3) │┌┴─ Escherichia coli (8-293/299) O26:H11 str. 11368 └┤┌─ Escherichia coli (8-293/299) ATCC 8739 (2) └┤┌─ Escherichia coli (8-293/299) B185 └┤ ┌─ Escherichia coli (8-293/299) TA206 └┬┴─ Escherichia coli (8-293/299) 536 (12) └┬─ Escherichia coli (8-293/299) H299 └┬─ Escherichia coli (8-293/299) MS 185-1 └─ Escherichia coli (8-293/299) 042 (21)
| LysR family transcriptional regulator YfiE | (25) |
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (24) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (20) |
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (20) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (19) |
| D-serine dehydratase transcriptional activator | (18) |
| LysR family transcriptional regulator YcjZ | (13) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (7) |
| Positive regulator of Tartrate dehydrogenase/decarboxylase/D-malic enzyme | (5) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (5) |
| Glycine cleavage system transcriptional activator GcvA | (4) |
| hypothetical protein | (4) |
| Hydrogen peroxide-inducible genes activator | (3) |
| Transcriptional regulator | (3) |
| Hypothetical transcriptional regulator yafC | (1) |
| Threonine catabolic operon transcriptional activator TdcA | (1) |
| Putative transcriptional regulator | (1) |
| transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| Others | (7) |