┌─ Escherichia coli (9-307/307) 042 (1) ┌┴─ Escherichia coli (9-307/307) FVEC1302 (3) ┌┴─ Escherichia coli (9-307/307) TA143 ┌┴─ Escherichia coli IAI39 (2) ┌┴┬─ Escherichia coli M718 │ └┬─ Escherichia coli B185 (1) ┌┤ └─ Escherichia coli K12 (13) ┌┤└─ Escherichia coli (13-311/311) MS 115-1 (2) │└─ Escherichia coli (9-307/307) MS 69-1 ┌┤ ┌─ Escherichia coli (9-307/307) B088 (17) ││┌┴─ Escherichia coli MS 78-1 │└┤ ┌─ Escherichia coli (9-307/307) TA271 (4) ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli (9-307/307) E22 (9) ││ └┬─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ┌┤│ └─ Escherichia coli (9-307/307) O157:H7 str. EC4486 (24) ││└─ Escherichia coli MS 21-1 ┌───────────────────┤└─ Escherichia coli B354 │ └─ Escherichia coli TA280 │ ┌─ Escherichia coli (18-299/300) B354 │ ┌┴─ Escherichia coli (18-299/300) TA280 ┌┤ ┌┴─ Escherichia coli (18-299/300) 101-1 (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (18-299/300) 1044A (26) ││ ┌─────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (18-299/300) M718 │└─────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (33-312/320) O157:H7 str. EC869 (2) │ └───────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (55-334/342) 042 (25) │ └┤┌─ Escherichia coli (27-306/314) K12 (64) │ └┤ ┌─ Escherichia coli (27-306/314) IAI39 (2) │ └┬┴─ Escherichia coli (27-306/314) MS 21-1 │ └┬─ Escherichia coli (27-306/314) MS 175-1 │ └┬─ Escherichia coli (27-306/314) M605 │ └┬─ Escherichia coli (27-306/314) H299 │ └─ Escherichia coli (27-306/314) 2362-75 (25) │ ┌─ Escherichia coli (9-298/302) E110019 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (9-298/302) K12 (7) │ ┌┴─ Escherichia coli (9-298/302) HS (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (9-298/302) B7A (2) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (9-298/302) 101-1 (52) │ │└─ Escherichia coli (9-298/302) M605 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (9-298/302) 042 (3) │ │└┬┴─ Escherichia coli (9-298/302) FVEC1302 (3) │ ┌───────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (9-298/302) MS 69-1 ┤ │ │ └─ Escherichia coli (9-298/302) B354 (1) │ ┌────────────────┤ └─ fig|6666666.5357.peg.1333 TY-2482 (9-298/302) strain (21) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-296/312) O26:H11 str. 11368 │ │ └─────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (9-296/312) MS 21-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (9-296/312) K12 (120) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (9-296/312) IAI1 (1) │ ┌───┤ │┌┴─ Escherichia coli (9-296/312) B088 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (9-296/312) M605 (1) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (9-296/312) O111:H- str. 11128 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (9-296/312) MS 115-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (9-296/312) B354 │ │ └────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (12-302/305) MS 196-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (12-297/302) 1044A (25) │ │ └┬─ Escherichia coli (12-297/302) E24377A (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (12-297/302) MS 21-1 (1) │ │ └─ Escherichia coli (12-302/305) TA143 │ │ ┌──────────────────────────────────────── Escherichia coli (4-283/294) 83972 (19) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-285/308) MS 116-1 (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-285/308) MS 145-7 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-285/308) APEC O1 (8) │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-285/308) 2362-75 (2) └─┤ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-285/308) 101-1 (12) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-285/308) K12 (52) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-285/308) B354 │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-285/308) B185 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-285/308) 1125A (16) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (6-285/308) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-285/308) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (6-285/308) MS 69-1 │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-285/308) 83972 (7) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-285/308) 042 (6) │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-285/308) H299 (1) │ │ ┌────────────────────┤ └─ Escherichia coli (6-285/308) MS 21-1 │ │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (6-285/308) TA280 │ │ │ └─────────────────────────── Escherichia coli (3-287/296) B7A (7) │ │ ┌───────────┤ ┌─ Escherichia coli (32-321/338) B171 (4) └───┤ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (11-300/317) B185 (1) │ │ └────────────────────┤┌┴─ Escherichia coli (4-293/310) K12 (7) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (11-300/317) IAI1 (1) │ │ └┤┌┴─ fig|6666666.5357.peg.2190 TY-2482 (11-300/317) strain (94) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (11-300/317) MS 115-1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (32-321/338) 53638 (1) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (11-300/317) MS 21-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (11-300/317) SE15 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (4-293/310) M605 │ │ └┬─ Escherichia coli (11-300/317) E24377A (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (11-300/317) MS 187-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-293/310) B354 │ │ └─ Escherichia coli (11-300/317) SMS-3-5 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-288/297) B171 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-288/297) E22 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-288/297) KO11 (2) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3641 O104:H4 (6-288/297) str. LB226692 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-288/297) E110019 (50) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-288/297) 53638 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-288/297) K12 (22) └──┤ │└┬─ Escherichia coli (6-288/297) O111:H- str. 11128 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-288/297) EC4100B │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-288/297) MS 21-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-288/297) SMS-3-5 │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-288/297) B354 │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-288/297) MS 115-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-288/297) O83:H1 str. NRG 857C (1) │ ┌──────────────────────┤└─ Escherichia coli (6-288/297) FVEC1302 (5) │ │ └┬─ Escherichia coli (6-288/297) E2348/69 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (6-288/297) 2362-75 (23) │ ┌────────────┤ └─ Escherichia coli (6-288/297) ED1a (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-295/297) TA280 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (23-316/318) SMS-3-5 │ │ └─────────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-295/297) IAI39 (2) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (32-325/327) 042 (6) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-294/296) B354 (2) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-295/297) B185 │ │ └┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.2965 O104:H4 (2-295/297) str. LB226692 (57) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-294/296) B7A (4) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-294/296) K12 (15) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-294/296) E22 (1) │ │ └─ Escherichia coli (1-294/296) B171 (7) └──┤ ┌───────────────────────────────── Escherichia coli (6-290/311) MS 119-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (5-281/293) 1044A (23) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-281/293) O157:H7 EDL933 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-281/293) B185 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-281/293) M718 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (5-281/293) B7A (2) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (5-281/293) B171 (16) │ │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.4278 O104:H4 (5-281/293) str. LB226692 (12) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (5-281/293) EC4100B │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (5-281/293) 53638 (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (5-281/293) SMS-3-5 │ │ │└┬─ Escherichia coli (5-281/293) SE15 └───┤ │ └┬─ Escherichia coli (5-281/293) 536 (22) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (5-281/293) WV_060327 │ ││ └┬─ Escherichia coli (5-281/293) E2348/69 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (5-281/293) 2362-75 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (5-281/291) 042 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (5-281/293) B354 (4) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (5-281/291) FVEC1302 (3) │ ││ └─ Escherichia coli (5-281/293) MS 21-1 │┌───────────────────────────────────┤└┬─ Escherichia coli (5-281/293) K12 (23) ││ │ └─ Escherichia coli (1-281/293) ETEC H10407 ││ └─ Escherichia coli (5-281/291) H299 ││ ┌─ Escherichia coli (1-295/299) MS 21-1 (1) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-295/299) IAI39 [2] │ ┌──────────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-291/292) B354 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-283/293) K12 (80) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-283/293) MS 21-1 └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (6-283/293) O111:H- str. 11128 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (6-283/293) 042 (6) │ ┌───────────────────────────┴─ Escherichia coli (6-283/293) B354 └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (7-286/311) FVEC1302 (5) └────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (7-286/311) MS 69-1 └┤┌─ Escherichia coli (7-286/311) 042 (1) └┤ ┌─ Escherichia coli (7-286/311) 83972 (11) │┌┴─ Escherichia coli (7-286/311) MS 185-1 └┤ ┌─ Escherichia coli (7-286/311) 2362-75 (18) │┌┴─ Escherichia coli (7-286/311) WV_060327 └┤┌─ Escherichia coli (7-287/311) B354 └┤ ┌─ Escherichia coli (7-286/311) K12 (9) │┌┴─ Escherichia coli (7-286/311) B185 (1) └┤ ┌─ Escherichia coli (7-286/311) 101-1 (42) └┬┴─ Escherichia coli (7-286/311) H736 (1) └┬─ Escherichia coli (7-286/311) MS 182-1 (1) └┬─ Escherichia coli (7-286/311) E24377A (3) └┬─ Escherichia coli (7-286/311) O157:H7 EDL933 (1) └─ Escherichia coli (7-286/311) 1044A (23)
| LysR family transcriptional regulator YneJ | (21) |
| Cyn operon transcriptional activator | (18) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (17) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (17) |
| Transcriptional activator protein LysR | (16) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (13) |
| Hca operon (3-phenylpropionic acid catabolism) transcriptional activator HcaR | (10) |
| Regulatory protein (induces abgABT, used to catabolize p-aminobenzoyl-glutamate) | (10) |
| Threonine catabolic operon transcriptional activator TdcA | (9) |
| Probable transcriptional activator for leuABCD operon | (9) |
| LysR family transcriptional regulator YeiE | (5) |
| Putative LysR-family transcriptional regulator YbdO | (5) |
| Putative transcriptional regulator | (5) |
| LysR family transcriptional regulator STM2281 | (3) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| LysR family regulatory protein CidR | (1) |
| LysR family transcriptional regulator near succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase | (1) |
| Others | (5) |