┌─ fig|1040638.4.peg.5637 O104:H4 (19-295/314) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (19-295/314) 101-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) 55989 ├─ Escherichia coli (47-323/342) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (19-295/314) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (19-295/314) B171 ├─ Escherichia coli (25-301/320) B354 ├─ Escherichia coli (19-295/314) B7A ├─ Escherichia coli (DE3 19-295/314) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (19-295/314) DH1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) E110019 ├─ Escherichia coli (19-295/314) E22 ├─ Escherichia coli (19-295/314) E24377A ├─ Escherichia coli (19-295/314) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (19-295/314) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (19-295/314) H736 ├─ Escherichia coli (19-295/314) HS ├─ Escherichia coli (25-301/320) IAI1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) KO11 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (25-301/320) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (19-295/314) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (19-295/314) OP50 ├─ Escherichia coli (19-295/314) TA143 ├─ Escherichia coli (19-295/314) TA280 ├─ Escherichia coli (19-295/314) W ├─ Escherichia coli (19-295/314) W3110 ┌┼─ Escherichia coli (19-295/314) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (19-295/314) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (25-301/320) W │├─ Escherichia coli (19-295/314) UMN026 │├─ Escherichia coli (19-295/314) TA271 │├─ Escherichia coli (19-295/314) SE11 │├─ Escherichia coli (19-295/314) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (19-295/314) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 115-1 │├─ Escherichia coli (19-295/314) M718 │├─ Escherichia coli (19-295/314) K12 │├─ Escherichia coli (25-301/320) IAI1 │├─ Escherichia coli (19-295/314) HS │├─ Escherichia coli (25-301/320) H591 │├─ Escherichia coli (19-295/314) FVEC1302 │├─ Escherichia coli (19-295/314) EC4100B ┌┤├─ Escherichia coli (19-295/314) E24377A ││├─ Escherichia coli (19-295/314) E22 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) E110019 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) BW2952 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) BL21 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) B7A ││├─ Escherichia coli (19-295/314) B171 ││├─ Escherichia coli (78-354/373) B088 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) 55989 ││├─ Escherichia coli (19-295/314) 1827-70 ││└─ fig|6666666.5357.peg.1773 TY-2482 (25-301/320) strain ││ ┌─ Escherichia coli (25-301/320) O157:H7 str. EC869 ││┌┼─ Escherichia coli (25-301/320) O157:H7 str. FRIK966 │││└─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. FRIK2000 │││┌─ Escherichia coli (19-295/314) 042 │││├─ Escherichia coli (19-295/314) 1125A │││├─ Escherichia coli (19-295/314) 536A │││├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 │││├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 EDL933 │└┤├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4042 ┌┤ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4076 ││ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4115 ││ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4206 ││ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. TW14359 ││ └┼─ Escherichia coli (19-295/314) O55:H7 str. CB9615 ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4113 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (25-301/320) O157:H7 str. EC4045 │││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) O157:H7 str. EC4024 │││ ├─ Escherichia coli (25-301/320) O157:H7 EDL933 │││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) B185 │││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) 1212A │││ ├─ Escherichia coli (19-295/314) 1044A │││ └─ Escherichia coli (47-323/342) 042 ┌┤││┌─ Escherichia coli (19-295/314) MS 175-1 │││└┤┌─ Escherichia coli (19-295/314) MS 21-1 │││ └┤┌─ Escherichia coli (19-295/314) IAI39 │││ └┼─ Escherichia coli (19-295/314) SMS-3-5 │││ └─ Escherichia coli (19-295/314) IAI39 ││└─ Escherichia coli (19-295/314) M605 │└─ Escherichia coli (19-295/314) H299 │┌─ Escherichia coli (25-301/320) 536 │├─ Escherichia coli (19-295/314) 83972 │├─ Escherichia coli (19-295/314) APEC O1 ┌────────────────────────────────────────────────────────────────┤├─ Escherichia coli (19-295/314) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (47-323/342) E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) F11 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) S88 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) TA206 │ │├─ Escherichia coli (19-295/314) UTI89 │ └┼─ Escherichia coli (25-301/320) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) UM146 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) SE15 │ ├─ Escherichia coli (25-301/320) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) NC101 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) MS 200-1 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) IHE3034 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) F11 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (47-323/342) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (19-295/314) ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli (25-301/320) 536 │ └─ Escherichia coli (19-295/314) 2362-75 │ ┌─ Escherichia coli (26-317/317) 1827-70 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) 53638 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) B7A │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) DH1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) E110019 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) H736 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) HS │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) KO11 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 124-1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) W │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) W3110 │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┼─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) W │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) TA271 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 116-1 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) K12 │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) IAI1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (26-317/317) HS │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) B7A │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) ATCC 8739 │ ││└─ Escherichia coli (26-317/317) 53638 │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5324 O104:H4 (26-317/317) str. LB226692 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) 55989 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (26-317/317) 55989 │ ││┌┤└─ fig|6666666.5357.peg.4708 TY-2482 (26-317/317) strain │ │││└─ Escherichia coli (26-317/317) SE11 │ │└┤┌─ Escherichia coli (26-317/317) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (26-317/317) E24377A │ ┌┤ └┤┌┴─ Escherichia coli (26-317/317) E24377A ┤ ││ ││ ┌─ Escherichia coli (26-317/317) B171 │ ││ └┤ ├─ Escherichia coli (26-317/317) E22 │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (26-317/317) O103:H2 str. 12009 │ ││ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) E22 │ ││ └┤└─ Escherichia coli (26-317/317) B171 │ ││ │┌─ Escherichia coli (26-317/317) EC4100B │ ││ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 107-1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (26-317/317) MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) H591 │ ││ └─ Escherichia coli (26-317/317) B088 │ ││┌─ Escherichia coli (26-317/317) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 26-317/317) BL21(DE3) │ │└┼─ Escherichia coli (26-317/317) OP50 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 187-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) BL21 │ ││ └─ Escherichia coli (26-317/317) 101-1 │ ││┌─ Escherichia coli (26-317/317) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) 536A │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4076 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4206 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4486 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. Sakai │ ┌┤│├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. TW14588 │ ││└┼─ Escherichia coli (26-317/317) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. TW14359 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. FRIK966 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC869 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 str. EC4045 │ │││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) O157:H7 EDL933 │ │││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) B185 │ │││ ├─ Escherichia coli (26-317/317) 1212A │ │││ └─ Escherichia coli (26-317/317) 1044A │ ┌┤│└─ Escherichia coli (26-317/317) B354 │ ││└─ Escherichia coli (26-317/317) H299 │ ││ ┌─ Escherichia coli (26-317/317) 042 │ ││┌┴─ Escherichia coli (26-317/317) 042 │ │││┌─ Escherichia coli (26-317/317) FVEC1412 │ │└┤├─ Escherichia coli (26-317/317) IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 21-1 │ ┌───────────────────────────────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (26-317/317) TA143 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (26-317/317) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) TA280 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 69-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) MS 198-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-317/317) IAI39 │ │ │ └─ Escherichia coli (26-317/317) FVEC1302 │ │ └─ Escherichia coli (26-317/317) SMS-3-5 │ │ ┌─ Escherichia coli (13-312/312) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli 536 │ │ ├─ Escherichia coli 83972 │ │ ├─ Escherichia coli APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli NC101 │ │ ├─ Escherichia coli UM146 │ │ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli TA206 │ │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli F11 │ │ ││├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ││├─ Escherichia coli 536 │ │ ││└─ Escherichia coli (13-312/312) F11 │ │ ┌┤│┌─ Escherichia coli 2362-75 │ │ ││└┼─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C └─────────────────┤ ││ ├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (13-312/312) E2348/69 │ ││└─ Escherichia coli S88 │ ││ ┌─ Escherichia coli (13-312/312) CFT073 │ ┌┤└┬┴─ Escherichia coli CFT073 │ ││ └┬─ Escherichia coli ED1a │ ││ └─ Escherichia coli ED1a │ │└┬─ Escherichia coli SMS-3-5 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli IAI39 │ ││ └─ Escherichia coli IAI39 │ ││┌─ Escherichia coli M605 │ │└┼─ Escherichia coli WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli SE15 │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli H299 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (13-312/312) 042 │ │ │┌┼─ Escherichia coli TA143 │ │ ││└─ Escherichia coli 042 │ │ └┤┌─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ │├─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ └┼─ Escherichia coli UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ └─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ ┌─ Escherichia coli H736 │ │┌┴─ Escherichia coli MS 146-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli B171 │ ││ ├─ Escherichia coli B7A │ ││ ├─ Escherichia coli E22 └──────────────────────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli E24377A ││ ├─ Escherichia coli EC4100B ││ ├─ Escherichia coli MS 119-7 ││ ├─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli SE11 ││ ┌┼─ Escherichia coli TA271 ││ │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli MS 78-1 ││ │├─ Escherichia coli MS 145-7 ││ │├─ Escherichia coli H591 ││ ┌┤├─ Escherichia coli E24377A ││ ││├─ Escherichia coli E22 ││ ││├─ Escherichia coli B7A ││ ┌┤│└─ Escherichia coli B171 └┤ ││└─ Escherichia coli B088 │ │└─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ ┌┤┌─ fig|6666666.5357.peg.404 TY-2482 strain │ ││├─ Escherichia coli 55989 │ ││├─ Escherichia coli IAI1 │ │└┼─ Escherichia coli MS 84-1 │┌┤ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │││ ├─ Escherichia coli IAI1 │││ ├─ Escherichia coli 55989 │││ └─ fig|1040638.4.peg.5296 O104:H4 str. LB226692 ││└─ Escherichia coli MS 107-1 ││ ┌─ Escherichia coli 1827-70 ││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli DH1 ││ ├─ Escherichia coli E110019 ││ ├─ Escherichia coli HS ││ ├─ Escherichia coli KO11 ││ ├─ Escherichia coli W ││ ├─ Escherichia coli W3110 ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B └┤ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli W │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │┌┤├─ Escherichia coli K12 │││├─ Escherichia coli HS │││├─ Escherichia coli E110019 │││├─ Escherichia coli BW2952 │││└─ Escherichia coli ATCC 8739 ││└┬─ Escherichia coli ETEC H10407 ││ └─ Escherichia coli MS 116-1 └┤ ┌─ Escherichia coli 101-1 │ ┌┼─ Escherichia coli 53638 │┌┤└─ Escherichia coli 53638 ││└┬─ Escherichia coli TA280 ││ └─ Escherichia coli B354 ││┌─ Escherichia coli M718 │││┌─ Escherichia coli 1125A └┤│├─ Escherichia coli 536A ││├─ Escherichia coli O157:H7 ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli B185 ├─ Escherichia coli 1212A └─ Escherichia coli 1044A
| Putative LysR-family transcriptional regulator YbdO | (126) |
| Probable transcriptional activator for leuABCD operon | (118) |
| LysR-family transcriptional regulator YbeF | (97) |
| Probable HTH-type transcriptional regulator leuO | (7) |
| Others | (6) |