┌─ fig|6666666.5357.peg.2605 TY-2482 (6-237/296) strain (33) ┌┴─ Escherichia coli (6-237/296) E22 (1) ┌┴─ Escherichia coli (1-238/297) B185 ┌┴─ fig|1040638.4.peg.2965 O104:H4 (1-238/297) str. LB226692 (31) ┌┴─ Escherichia coli (1-238/297) B7A [2] ┌──────────────────────────────────────────┴┬─ Escherichia coli (1-238/297) 042 (10) │ └┬─ Escherichia coli (37-268/327) 042 (2) ┌──────────────┤ └─ Escherichia coli (1-238/297) TA280 │ └───────────────────────────┬─ Escherichia coli (7-239/317) MS 115-1 │ └─ Escherichia coli (7-239/317) MS 21-1 │ ┌─ Escherichia coli (31-262/323) M605 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (31-262/323) 1044A (25) │ ┌────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (31-262/323) B354 │ ┌───────────────┴──────────────────────────────────────────── Escherichia coli (27-240/326) 83972 (24) │ │ ┌─ Escherichia coli (6-248/309) S88 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-248/309) 101-1 ┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-248/309) ETEC H10407 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-248/309) K12 (48) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-248/309) MS 124-1 (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-248/309) EC4100B │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-248/309) O111:H- str. 11128 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (13-255/316) E110019 (2) │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-248/309) OP50 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-248/309) APEC O1 (8) │ │ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.3590 O104:H4 (6-248/309) str. LB226692 (32) │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-248/309) MS 200-1 └─────┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-248/309) 1044A (25) │ │└┬─ Escherichia coli (6-248/309) 2362-75 │ ┌───────────────┤ └─ Escherichia coli (13-255/316) E2348/69 (1) │ ┌───────────────┤ └─ Escherichia coli (6-248/309) TA280 │ │ └──────────────────────────┬─ Escherichia coli (10-242/298) TA280 │ │ └┬─ Escherichia coli (10-242/298) IAI39 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (10-242/298) K12 (121) │ │ └┬─ Escherichia coli (10-242/298) O157:H7 EDL933 [2] │ │ └┬─ Escherichia coli (10-242/298) IHE3034 │ │ └─ Escherichia coli (3-228/284) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-246/298) 101-1 (25) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-246/301) WV_060327 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-246/301) F11 (1) └─────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (6-246/301) APEC O1 (2) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-246/301) ED1a (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (6-246/301) MS 69-1 │ ┌────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (6-246/301) 2362-75 (2) │ │ └─ Escherichia coli (6-246/301) NC101 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-245/310) K12 (68) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-245/310) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-245/310) O103:H2 str. 12009 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-245/310) 536 (4) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-245/310) MS 185-1 └───┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-245/310) 83972 (4) │ │└┬─ Escherichia coli (1-245/310) 2362-75 │ ┌──────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (1-245/310) 042 (39) │ │ └─ Escherichia coli (1-245/310) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-243/310) IAI1 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-243/310) MS 145-7 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-243/310) 101-1 (26) └───┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-243/310) K12 (6) │ ┌┴─ Escherichia coli (4-243/310) B088 (12) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-243/297) 1827-70 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-243/250) M718 │ ┌────────────────────┤└─ fig|1040638.4.peg.5465 O104:H4 (4-243/310) str. LB226692 (43) └────────┤ └─ Escherichia coli (4-243/310) SE15 │ ┌─ Escherichia coli (1-253/308) B185 └──────────────────────┤┌─ Escherichia coli (1-253/308) FVEC1302 (3) └┤┌─ Escherichia coli MS 107-1 └┤┌─ Escherichia coli (1-253/308) TA280 ││ ┌─ Escherichia coli (1-253/308) K12 (67) └┤┌┴─ Escherichia coli (1-253/308) MS 119-7 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5209 O104:H4 str. LB226692 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-240/308) E110019 (1) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-253/308) O103:H2 str. 12009 │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.4889 TY-2482 (1-253/308) strain (11) │┌┴┬─ Escherichia coli (1-240/251) BL21 └┤ └─ Escherichia coli (1-253/308) ATCC 8739 (1) └┬─ Escherichia coli (1-253/308) HS (1) └┬─ Escherichia coli (1-253/308) H299 └┬─ Escherichia coli (1-253/308) NC101 (1) └┬─ Escherichia coli (1-253/308) O83:H1 str. NRG 857C (1) └┬─ Escherichia coli (1-253/308) APEC O1 (7) └─ Escherichia coli (1-253/308) 2362-75 (16)
| Hypothetical lysR-family transcriptional regulator YdhB | (17) |
| Hypothetical transcriptional regulator yeeY | (15) |
| DNA-binding transcriptional activator of the allD operon | (14) |
| Putative HTH-type transcriptional regulator yahB | (8) |
| LysR-family transcriptional regulator YhaJ | (6) |
| Hca operon (3-phenylpropionic acid catabolism) transcriptional activator HcaR | (6) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (3) |
| LysR family transcriptional regulator YbhD | (2) |
| COG0583: Transcriptional regulator | (1) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| Hypothetical lysR-family transcriptional regulator YbbS | (1) |
| Others | (6) |