┌──────────────────────────────────────────── Escherichia coli (8-640/736) TA280 │ ┌─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4196 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4076 │ ││└─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4042 │ │└┬─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-643/648) O103:H2 str. 12009 │ ││┌─ Escherichia coli (1-643/648) O111:H- str. 11128 │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4501 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-643/648) 1044A │ │ └┤├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 │ │ │├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 EDL933 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-643/648) 536A │ ││ └─ Escherichia coli (1-643/648) 1044A │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-643/648) 1212A │ ┌┤└┬┴─ Escherichia coli (1-643/648) 536A │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-646/648) O157:H7 str. TW14588 │ ││ └─ Escherichia coli (1-646/648) O157:H7 str. EC4501 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-643/648) 1212A │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-643/648) 536A │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4115 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4196 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4024 │ ┌─┤ └┤├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4076 │ ┌┤ │ ├─ Escherichia coli (1-643/648) O157:H7 str. EC4042 │ ││ │ └─ Escherichia coli (1-643/648) 1125A │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-643/648) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┤│ └┬─ Escherichia coli (1-643/648) E22 │ │││ └─ Escherichia coli (1-643/648) E22 │ ││└─ Escherichia coli (1-640/645) EC4100B │ │└┬─ Escherichia coli (1-640/645) O103:H2 str. 12009 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-640/645) O26:H11 str. 11368 │ ┌───────┤ └─ Escherichia coli (1-640/645) O111:H- str. 11128 ┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 EDL933 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4486 │ │ │┌─────┴─ Escherichia coli (1-640/645) 1125A │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-640/645) O111:H- str. 11128 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-640/645) O26:H11 str. 11368 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-640/645) 1212A │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC869 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4024 │ ┌────┤ │┌┴─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-640/645) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (17-608/614) 536A │ ┌──────────┤ │ ├─ Escherichia coli (17-608/614) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (17-608/614) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ └──────────────────┼─ Escherichia coli (17-608/614) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (17-608/614) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (17-608/614) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (82-673/679) O157:H7 │ │ │ └─ Escherichia coli (17-608/614) 1044A │ │ │ ┌─────────────────────── Escherichia coli (1-645/646) B088 │ │ └───────┤ ┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ │ │┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └──────┤│┌─ Escherichia coli 1125A │ │ ││├─ Escherichia coli 536A │ │ └┤├─ Escherichia coli E22 │ ┌──────────────┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ │ └─ Escherichia coli 1044A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-648/653) 83972 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-648/653) ABU 83972 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-651/653) EC4100B │ │ │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (1-651/653) S88 │ │ └────────┤ ┌─ Escherichia coli ED1a │ │ │ ┌─────────────────────────────────┴─ Escherichia coli ED1a │ │ └────┤ ┌─ Escherichia coli (1-660/662) ED1a └──┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-660/662) ED1a │ └────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-660/662) ED1a │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (1-660/662) ED1a │ └────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-658/660) ED1a │ └─────────┬┴─ Escherichia coli (1-658/660) ED1a │ └┬─ Escherichia coli (1-658/660) ED1a │ └─ Escherichia coli (1-658/660) ED1a │ ┌──────────── Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-619/620) B171 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-619/620) B171 │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (1-619/620) 55989 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-619/620) 55989 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-616/617) MS 196-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-616/617) MS 21-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-616/617) 042 └──────────────────┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-616/617) 042 │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-621/621) E2348/69 │ ┌────┤└──┼─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─ Escherichia coli 2362-75 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-617/618) 55989 │ │ └─ Escherichia coli (1-617/618) 55989 │ │ ┌─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ ┌───────┴───────── Escherichia coli O26:H11 str. 11368 └──────┤ ┌───┴── fig|1040638.4.peg.52 O104:H4 str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) 2362-75 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-616/617) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │└─ Escherichia coli (1-616/617) E2348/69 │ │ │┌─ Escherichia coli (1-616/617) 2362-75 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli E110019 └───┤ ││ ┌┴─ Escherichia coli E110019 │ ││ ┌─┴──┬─ Escherichia coli E110019 │ ││ │ └─ Escherichia coli E110019 │ ││ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 └─┤│ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ││ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ │ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ││ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ││ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ │ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││ │ ││└─ Escherichia coli 1212A └┤ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli 1125A │ │ ┌┤│ └── Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ ││└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ││ └─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │└─ Escherichia coli 536A │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 EDL933 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 EDL933 │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) B171 │ │ │ │┌─┴─ Escherichia coli (1-616/617) B171 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. TW14588 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4501 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-616/617) 1044A │ │ ││┌─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli E2348/69 │ │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli EC4100B └──┤ ┌┤ │┌┴─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli B171 │ ││ └┼─ Escherichia coli E22 │ ││ ├─ Escherichia coli E22 │ ││ └─ Escherichia coli B171 │ ││┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │└┤┌─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 EDL933 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 EDL933 │ │ └┤│┌─ Escherichia coli 1125A │ │ ││├─ Escherichia coli 536A │ │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ││ └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ││ └┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │┌─┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 ││ ││ ├─ Escherichia coli 1212A ││ ││ └─ Escherichia coli 1044A ││ │└─ Escherichia coli 2362-75 ││ └┬─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ││ └─ Escherichia coli (1-616/617) O26:H11 str. 11368 ││┌─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │││ ┌─ Escherichia coli 1044A └┤│ ├─ Escherichia coli 1212A ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ││ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 └┤ ┌┤│└─ Escherichia coli 1125A │ ││└─ Escherichia coli 536A │ ┌┤└┬─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ││ └─ Escherichia coli O157:H7 │ │└┬─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ └─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │┌─ Escherichia coli 1125A │┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 │││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││└┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 └┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli 536A │ └─ Escherichia coli 1044A │ ┌─ Escherichia coli E110019 │┌┴─ Escherichia coli E110019 ││ ┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 └┤ ┌┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │┌┤└─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││└─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 └┤┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ││┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 └┤│ ┌─ Escherichia coli E22 ││ ┌┴─ Escherichia coli E22 └┤ ┌┴─ Escherichia coli WV_060327 │┌┴─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ││ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4113 ││┌┴─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4486 └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 ││┌┼─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. Sakai └┤│├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4501 ││└─ Escherichia coli (1-616/617) 1212A ││ ┌─ Escherichia coli (1-616/617) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 └┤ ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. Sakai │┌┼─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. TW14588 ││├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC869 ││└─ Escherichia coli (1-616/617) 536A ││┌─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4024 └┤├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC508 └┼─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (1-616/617) O157:H7 str. EC4042 └─ Escherichia coli (1-616/617) 1125A
| hypothetical protein | (169) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933V | (82) |
| FIG00639776: hypothetical protein | (3) |
| orf; Other or unknown (Phage or Prophage Related) | (2) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933U | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933R | (1) |
| conserved hypothetical protein similar to yjhS for cryptic prophage CP-933M | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933N | (1) |
| conserved hypothetical YjhS family protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| Others | (1) |