Alignment colored by consensus

fig\|1040638.4.peg.513	Escherichia coli O104:H4 str. LB226692	`MSNHNIGTPRPELGEYTFALPVERHMVYFLQTDTEIVIIRILSQHQDASRHFN`
fig\|6666666.5357.peg.1529	Escherichia coli TY-2482	`MSNHNIGTPRPELGEYTFALPVERHMVYFLQTDTEIVIIRILSQHQDASRHFN`
fig\|409438.11.peg.4883	Escherichia coli SE11	`MSNHNIGTPRPELGEYTFALPVERHMVYFLQTDTEIVIIRILSQHQDASRHFN`
fig\|585055.8.peg.5081	Escherichia coli 55989	`MSNHNIGTPRPELGEYTFALPVERHMVYFLQTDTEIVIIRILSQHQDAGRHLN`
fig\|585397.6.peg.5	Escherichia coli ED1a	`MSNHNIGTPRPELGEYTFALPVERHMVYFLQTDTEIVIIRILSQHQDAGRHLN`
fig\|749527.3.peg.1504	Escherichia coli MS 21-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPEEIIVIRILNQNQDASRHLH`
fig\|1040638.4.peg.3165	Escherichia coli O104:H4 str. LB226692 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|6666666.5357.peg.262	Escherichia coli TY-2482 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585055.6.peg.2374	Escherichia coli 55989 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585055.8.peg.2381	Escherichia coli 55989 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|550672.3.peg.1802	Escherichia coli B088 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|344601.3.peg.3233	Escherichia coli B171 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|344601.5.peg.3378	Escherichia coli B171 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|550676.3.peg.2380	Escherichia coli B185 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340184.3.peg.4682	Escherichia coli B7A (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340184.6.peg.4927	Escherichia coli B7A (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340186.3.peg.2465	Escherichia coli E110019 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340186.5.peg.2545	Escherichia coli E110019 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340185.3.peg.1206	Escherichia coli E22 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|340185.4.peg.1273	Escherichia coli E22 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|562.375.peg.2304	Escherichia coli EC4100B (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|656393.3.peg.3109	Escherichia coli H299 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|656408.3.peg.2287	Escherichia coli H591 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585034.4.peg.2134	Escherichia coli IAI1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585034.5.peg.2129	Escherichia coli IAI1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|595495.4.peg.2937	Escherichia coli KO11 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|656419.3.peg.2839	Escherichia coli M718 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|679207.4.peg.3860	Escherichia coli MS 107-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|749537.3.peg.884	Escherichia coli MS 115-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|679206.4.peg.1585	Escherichia coli MS 119-7 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|679205.4.peg.2964	Escherichia coli MS 124-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|679204.3.peg.114	Escherichia coli MS 145-7 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|749540.3.peg.191	Escherichia coli MS 146-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|749545.3.peg.2	Escherichia coli MS 182-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|749532.3.peg.4095	Escherichia coli MS 78-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|749533.3.peg.428	Escherichia coli MS 84-1 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585395.4.peg.2678	Escherichia coli O103:H2 str. 12009 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585396.4.peg.2896	Escherichia coli O111:H- str. 11128 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|573235.3.peg.3058	Escherichia coli O26:H11 str. 11368 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|409438.11.peg.2507	Escherichia coli SE11 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|656443.3.peg.2782	Escherichia coli TA271 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|566546.3.peg.2491	Escherichia coli W (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|566546.4.peg.2226	Escherichia coli W (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|701177.3.peg.2628	Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 (44-96/98)	`LSNNNVGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|525281.3.peg.3885	Escherichia coli 83972 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPEEIIVIRILNQNQYASRHLH`
fig\|655817.3.peg.2526	Escherichia coli ABU 83972 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPEEIIVIRILNQNQYASRHLH`
fig\|439855.10.peg.1136	Escherichia coli SMS-3-5 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPEEIIVIRILNQNQYASRHLH`
fig\|331111.12.peg.2655	Escherichia coli E24377A (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLTFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|331111.3.peg.116	Escherichia coli E24377A (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLTFERHVIYFLQSPGEIIVIRILNQNQDATRHLH`
fig\|585057.4.peg.984	Escherichia coli IAI39 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYLLQSPEEIIVIRILNQNQYASRHLH`
fig\|585057.6.peg.981	Escherichia coli IAI39 (44-96/98)	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYLLQSPEEIIVIRILNQNQYASRHLH`
Consen1	Primary consensus	`LSNNNIGTPRPELGEGIFVLPFERHVIYFLQSPgEIIVIRILNQNQDAtRHLH`
Consen2	Secondary consensus	`e s`

Consensus 1 (when a gap)

Conservative difference

Consensus 2 (when a gap)

Nonconservative diff.

Other character