┌─ Escherichia coli (102-311/341) B171 ├─ Escherichia coli (102-311/341) O103:H2 str. 12009 ┌┼─ Escherichia coli (402-611/641) O111:H- str. 11128 ┌┤└─ Escherichia coli (102-311/341) B171 │└┬─ Escherichia coli (102-311/341) WV_060327 ┌┤ └─ Escherichia coli (9-218/248) E110019 │└┬─ Escherichia coli (102-311/341) APEC O1 │ └─ Escherichia coli (42-251/281) APEC O1 ┌┤┌─ Escherichia coli (102-311/341) 042 ││├─ Escherichia coli (102-311/341) M718 │└┼─ Escherichia coli (102-311/341) SMS-3-5 ┌┤ ├─ Escherichia coli (102-311/341) H299 ││ └─ Escherichia coli (102-311/341) 042 │└┬─ Escherichia coli (102-311/341) MS 196-1 ┌─────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (102-311/341) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (42-251/281) IHE3034 │ └─ Escherichia coli (102-311/341) TA280 │ ┌─ Escherichia coli (139-375/404) MS 124-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (139-375/404) NC101 │ ┌┤└─ Escherichia coli (139-375/404) MS 84-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (139-375/404) ETEC H10407 │ │└┬─ Escherichia coli (139-375/404) ABU 83972 │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (139-375/404) 83972 │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (139-375/404) strain │ │ └┼─ Escherichia coli (139-375/404) 55989 │ ┌───┤ ├─ Escherichia coli (139-375/404) 55989 │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (139-375/404) str. LB226692 │ ┌──┤ └─── Escherichia coli (139-375/396) SE11 │ │ └──────┬─ Escherichia coli (152-388/417) ED1a │ ┌───────────────────┤ └─ Escherichia coli (152-388/417) ED1a │ │ └─────┬─ Escherichia coli (142-375/396) TA280 │ │ └┬─ Escherichia coli (142-375/392) MS 21-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (142-375/396) MS 84-1 │ ┌─────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (142-375/396) MS 124-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (137-379/402) B7A │ │ │ ┌───────┴─ Escherichia coli (137-379/402) B7A │ │ └──────┤ ┌─ Escherichia coli (137-381/415) M605 │ ┌─────┤ └───────────┤┌─ Escherichia coli (137-370/418) MS 196-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (137-370/416) IAI39 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (137-370/416) IHE3034 │ │ │ └─ Escherichia coli (137-370/416) IAI39 │ │ └──────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (133-353/376) ETEC H10407 │ │ └─ Escherichia coli (133-353/375) 1827-70 │ │ ┌─ Escherichia coli (101-356/356) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) M605 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4042 ┤ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (32-287/287) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli 536A │ │ │├─ Escherichia coli (32-287/287) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4045 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (101-356/356) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (101-356/356) H736 │ │ ││├─ Escherichia coli (101-356/356) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (101-356/356) B171 │ │ ││└─ Escherichia coli (101-356/356) B str. REL606 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (101-356/356) E2348/69 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (101-356/356) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (101-356/356) O26:H11 str. 11368 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli (103-358/358) O111:H- str. 11128 │ │ ││┌┤└─ Escherichia coli (101-356/356) 2362-75 │ │ │││└─ Escherichia coli (101-356/356) MS 182-1 │ │ ┌┤└┤ ┌─ Escherichia coli (101-356/356) 042 │ │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (101-356/356) MS 115-1 │ │ ││ ││└─ Escherichia coli (101-356/356) 042 └─┤ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (101-356/356) H299 │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (101-356/356) MS 84-1 │ ││ └┤└─ Escherichia coli (101-356/356) MS 124-1 │ ┌┤│ │ ┌─ Escherichia coli (101-356/356) ATCC 8739 │ │││ └┬┴─ Escherichia coli (101-356/356) ATCC 8739 │ │││ └┬─ Escherichia coli E110019 │ │││ └─ Escherichia coli E110019 │ ││└─ Escherichia coli (101-356/356) OP50 │ ┌┤└─ Escherichia coli (101-356/356) EC4100B │ ││ ┌─ Escherichia coli IAI39 │ ││┌┴─ Escherichia coli IAI39 │ │││┌─ Escherichia coli (101-356/356) 55989 │ │└┤├─ Escherichia coli (101-356/356) E24377A │ │ │├─ Escherichia coli (101-356/356) H591 │ │ │├─ fig|1040638.4.peg.4985 O104:H4 str. LB226692 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli MS 196-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (101-356/356) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (101-356/356) E24377A │ ││ ├─ Escherichia coli (101-356/356) 55989 │ ┌───┤│ └─ fig|6666666.5357.peg.4258 TY-2482 (101-356/356) strain │ │ ││┌─ Escherichia coli (101-356/356) FVEC1412 │ │ │└┼─ Escherichia coli (101-356/356) UMN026 │ │ │ └─ Escherichia coli (101-356/356) FVEC1302 │ ┌────────┤ └┬─ Escherichia coli (101-356/356) IAI1 │ │ │ └─ Escherichia coli (101-356/356) IAI1 │ │ │ ┌── Escherichia coli (1-245/246) E2348/69 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (102-355/357) 53638 │ │ └──┤┌┴─ Escherichia coli (102-355/357) 53638 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (102-355/356) O111:H- str. 11128 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (102-355/356) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (48-301/303) WV_060327 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (102-355/357) O83:H1 str. NRG 857C │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (102-355/357) B7A │ │ │┌┴─ Escherichia coli (102-355/357) B7A │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (102-355/357) E22 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (102-355/357) E22 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (102-355/357) E2348/69 │ │ └┼─ Escherichia coli (102-355/357) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (102-355/357) 2362-75 │ │ ┌─ Escherichia coli (102-355/358) 53638 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (102-355/358) 53638 │ │┌─────────────────┴┬─ Escherichia coli (101-355/371) O26:H11 str. 11368 │ ││ └─ Escherichia coli (101-355/358) M605 │ ││ ┌─ Escherichia coli (91-339/339) 1044A │ ││ ├─ Escherichia coli (91-339/339) 1212A │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4042 │ ││ ├─ Escherichia coli (57-305/305) O157:H7 str. EC4076 └────────┤│ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (91-339/339) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (91-339/339) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. Sakai ││ ┌┼─ Escherichia coli (91-339/339) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC869 ││ │├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4206 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (91-339/339) O157:H7 str. EC4113 ││ ││├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 str. EC4045 ││ ││├─ Escherichia coli (91-339/339) O157:H7 str. EC4024 ││ ││├─ Escherichia coli (124-372/372) O157:H7 EDL933 ││ ┌┤│├─ Escherichia coli (91-339/339) 536A ││ │││└─ Escherichia coli (124-372/372) 1125A ││ ││└─ Escherichia coli (27-271/271) O157:H7 str. EC4196 ││ │└┬─ Escherichia coli (124-372/372) B171 ││ │ └─ Escherichia coli (124-372/372) B171 ││ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (124-372/372) CFT073 ││ ││┌┼─ Escherichia coli (124-372/372) MS 45-1 ││ │││└─ Escherichia coli (124-372/372) CFT073 ││ │││┌─ Escherichia coli (124-372/372) E2348/69 ││ │││├─ Escherichia coli (91-339/339) FVEC1302 ││ │└┤├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 124-1 ││ │ │├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 198-1 └┤ │ │├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 84-1 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (124-372/372) UMN026 │ ││ └┼─ Escherichia coli (124-372/372) WV_060327 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 69-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 175-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (124-372/372) MS 116-1 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (124-372/372) ETEC H10407 │ │││ └─ Escherichia coli (124-372/372) 2362-75 │ ││└┬─ Escherichia coli (124-372/372) O111:H- str. 11128 │ ││ └┬─ Escherichia coli (124-372/372) 53638 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (124-372/372) 53638 │ ││└┬─ Escherichia coli (124-372/372) B7A │ ││ └─ Escherichia coli (124-372/372) B7A │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (124-372/372) E24377A │ ││ └─ Escherichia coli (124-372/372) E24377A │ │└┬─ Escherichia coli (124-372/372) O103:H2 str. 12009 │ ┌────────────┤ └─ Escherichia coli (124-372/372) 101-1 │ │ │┌─ Escherichia coli (124-372/372) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (124-372/372) E22 │ │ └┼─ Escherichia coli (124-372/372) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (124-372/372) E22 │ │ └─ Escherichia coli (124-372/372) E110019 │ │ ┌─ Escherichia coli (131-375/375) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (131-375/375) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (131-375/375) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌──────┤└─ Escherichia coli (131-375/375) W3110 │ │ │ └─ Escherichia coli (128-370/376) B088 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (130-378/380) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4206 └──────────┤ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌┼─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (130-378/380) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (130-378/380) 536A │ │ ││└─ Escherichia coli (130-378/380) 1125A │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (130-378/380) TA280 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (130-378/380) F11 └──┤ ││┌┴─ Escherichia coli (130-378/380) F11 │ │││┌─ Escherichia coli (130-378/380) APEC O1 │ │││├─ Escherichia coli (130-378/380) M605 │ │└┤├─ Escherichia coli (130-378/380) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) SE15 │ │ │├─ Escherichia coli (130-378/380) UTI89 │ │ └┼─ Escherichia coli (130-378/380) UTI89 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (130-378/380) UM146 │ ││ ├─ Escherichia coli (130-378/380) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (130-378/380) NC101 │ ││ ├─ Escherichia coli (130-378/380) IHE3034 │ ││ └─ Escherichia coli (130-378/380) APEC O1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (130-378/445) IAI39 │ ││┌┴─ Escherichia coli (130-378/445) IAI39 │ │││┌─ Escherichia coli (130-378/380) ABU 83972 │ │└┤├─ Escherichia coli (130-378/380) CFT073 │ ┌──┤ │├─ Escherichia coli (130-378/380) MS 200-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (130-378/380) MS 45-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) MS 21-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) MS 185-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) CFT073 │ │ │ └─ Escherichia coli (130-378/380) 83972 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (130-378/380) EC4100B │┌───┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (130-378/380) B354 ││ │ │┌┴─ Escherichia coli (130-378/380) 1827-70 ││ │ └┤┌─ Escherichia coli (130-378/380) FVEC1412 ││ │ └┼─ Escherichia coli (130-378/380) UMN026 ││ │ ├─ Escherichia coli (130-378/380) MS 198-1 ││ │ └─ Escherichia coli (130-378/380) FVEC1302 └┤ └── Escherichia coli (130-372/380) MS 116-1 │ ┌─ Escherichia coli (127-376/376) E22 │ ┌┴─ Escherichia coli (127-376/376) E22 │ │ ┌─ Escherichia coli (127-376/376) E24377A │ │ ┌┴─ Escherichia coli (127-376/376) E24377A │ │ ┌┴─ Escherichia coli (127-376/376) B088 │ │┌┴─ Escherichia coli (127-376/376) B185 └───────────┤│ ┌─ fig|1040638.4.peg.4577 O104:H4 (128-376/376) str. LB226692 ││┌┴─ fig|6666666.5357.peg.3394 TY-2482 (128-376/376) strain │││ ┌─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4024 │││ ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4045 │││ ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4113 │││ ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4115 └┤│ ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. TW14359 ││ ┌┼─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4196 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4115 ││ ││├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4076 ││ ┌┤│└─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4042 └┤ ││└─ Escherichia coli (127-376/376) MS 196-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (127-371/372) O157:H7 str. EC869 │ │└┬─ Escherichia coli (127-373/427) O55:H7 str. CB9615 │┌┤ └┬─ Escherichia coli (127-376/376) ED1a │││ └─ Escherichia coli (127-376/376) ED1a ││└┬─ Escherichia coli (127-376/376) 55989 ││ └─ Escherichia coli (127-376/376) 55989 ││┌─ Escherichia coli (127-376/376) 042 ││├─ Escherichia coli (127-376/376) 1125A ││├─ Escherichia coli (127-376/376) 2362-75 ││├─ Escherichia coli (127-376/376) 83972 ││├─ Escherichia coli (127-376/376) APEC O1 ││├─ Escherichia coli (127-376/376) E2348/69 └┤├─ Escherichia coli (127-376/376) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (127-376/376) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (127-376/376) UTI89 └┼─ Escherichia coli (127-376/376) UTI89 ├─ Escherichia coli (127-376/376) S88 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O157:H7 ├─ Escherichia coli (127-376/376) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (127-376/376) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (127-376/376) IHE3034 ├─ Escherichia coli (127-376/376) APEC O1 ├─ Escherichia coli (127-376/376) ABU 83972 ├─ Escherichia coli (127-376/376) 536A ├─ Escherichia coli (127-376/376) 1212A ├─ Escherichia coli (127-376/376) 1044A └─ Escherichia coli (127-376/376) 042
| Phage integrase | (181) |
| Integrase | (82) |
| Putative integrase | (17) |
| Prophage lambda integrase | (12) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (2) |
| prophage lambda integrase | (1) |
| putative enzyme; Integration, recombination (Phage or Prophage Related) | (1) |
| putative integrase | (1) |
| phage-related integrase | (1) |
| site-specific recombinase, phage integrase family protein | (1) |
| integrase | (1) |
| integrase-like protein | (1) |
| Putative integrase encoded by prophage CP-933K; partial | (1) |
| Others | (6) |