┌───────────────────────────── Escherichia coli (1-135/138) 101-1 │ ┌─ Escherichia coli (1-128/131) 1044A │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) 1212A │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. Sakai │ ┌┼─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 EDL933 │ ┌──┤├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 │ │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) 536A │ │ │└─ Escherichia coli (1-128/131) 1125A │ │ │┌─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4206 ┤ │ │├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. TW14359 │ ┌──┤ └┼─ Escherichia coli (1-128/131) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4196 │ ┌───────────────────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-128/131) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ └─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └┬─ fig|6666666.5357.peg.2983 TY-2482 (1-128/131) strain │ ┌──────────────────┤ └─ fig|1040638.4.peg.329 O104:H4 (1-128/131) str. LB226692 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-132/135) 53638 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-127/130) 53638 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-123/131) ED1a │ │ └───────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-123/131) ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └─┤ ┌┴─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │ │┌─ Escherichia coli 042 │ │ └─┤├─ Escherichia coli ABU 83972 │ ┌───────┤ │├─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ │ ├─ Escherichia coli 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (6-135/135) 042 │ │ │ ┌───────────────── Escherichia coli (1-133/139) 53638 └─┤ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-133/143) ED1a │ └───────┬──────────┴─ Escherichia coli (1-133/143) ED1a │ └─┬─ Escherichia coli (1-137/140) 042 │ └─ Escherichia coli (1-137/140) 042 │ ┌─ Escherichia coli 1212A │ ┌──┴─ Escherichia coli 536A │ │┌─ Escherichia coli M605 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) B171 │ ││ ┌──┴─ Escherichia coli (1-137/140) B171 │ ││┌┴──┬─ Escherichia coli (1-133/140) ED1a └──────┤││ └─ Escherichia coli (1-133/140) ED1a │││ ┌─ Escherichia coli (1-133/140) 55989 │││ ┌┼─ Escherichia coli (1-133/140) MS 145-7 │││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-133/140) 55989 │││ │└┬─ Escherichia coli (1-133/140) MS 107-1 │││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-133/140) B171 └┤│ │└┬─ Escherichia coli MS 69-1 ││ │ └─ Escherichia coli (1-133/140) 101-1 ││ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-133/140) APEC O1 ││ ││┌┴─ Escherichia coli (1-133/140) S88 ││ │└┤┌─ Escherichia coli (1-133/140) UM146 ││ │ └┼─ Escherichia coli (1-133/140) UTI89 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-133/140) UTI89 ││ ││ └─ Escherichia coli (1-133/140) IHE3034 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) E22 ││ ││┌┴─ Escherichia coli (1-137/140) E22 ││ ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (1-137/140) E2348/69 └┤ ││ └┼─ Escherichia coli (1-137/140) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ └─ Escherichia coli (1-137/140) 2362-75 │ │└┬─ Escherichia coli (1-137/140) B7A │ │ └─ Escherichia coli (1-137/140) B7A │ │ ┌─ Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7 │┌┤ ┌──┴─ Escherichia coli (1-136/140) TA271 │││ ┌──┴──┬─ Escherichia coli (1-133/140) B7A │││┌┤ └─ Escherichia coli (1-133/140) B7A ││││└┬─ fig|1040638.4.peg.4661 O104:H4 str. LB226692 ││││ └─┬─ Escherichia coli 55989 ││└┤ └─ Escherichia coli 55989 ││ │ ┌─ Escherichia coli (1-133/141) 55989 ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-133/141) 55989 ││ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-131/132) MS 124-1 ││ └─┬┴─ Escherichia coli (1-131/132) MS 84-1 ││ └┬─ Escherichia coli (6-141/143) APEC O1 ││ └┬─ Escherichia coli (1-136/138) 042 ││ └─ Escherichia coli (6-141/143) 042 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-138/141) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-138/141) WV_060327 │ ┌┴── Escherichia coli (18-139/140) M718 │ ┌┴─── Escherichia coli (1-137/140) SE11 │┌┴┬── Escherichia coli (1-133/141) IHE3034 ││ └─── Escherichia coli (1-137/140) O111:H- str. 11128 ││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) E22 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-137/140) E22 ││ ┌┴─ Escherichia coli E22 ││ ┌┴── Escherichia coli (1-135/136) B088 ││┌┴─── Escherichia coli (1-133/140) TA143 │││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) E24377A │││ ┌┴─ Escherichia coli (1-137/140) E24377A └┤│┌┴┬─ Escherichia coli (1-133/140) W │││ └─ Escherichia coli (1-133/140) W │││ ┌─ Escherichia coli 042 │││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli IAI1 │││ ├─ Escherichia coli IAI39 │││ ├─ Escherichia coli KO11 │││ ├─ Escherichia coli W │││ ┌┼─ Escherichia coli W └┤│ │├─ Escherichia coli MS 21-1 ││ │├─ Escherichia coli IAI39 ││ ┌─┤├─ Escherichia coli IAI1 ││ │ │├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ┌┤ │└─ Escherichia coli 042 ││ ││ └─ Escherichia coli TA271 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-137/140) CFT073 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-137/140) CFT073 ││ ││┌─── Escherichia coli (1-133/140) O83:H1 str. NRG 857C ││ │└┤┌─ Escherichia coli EC4100B ││ │ └┤┌─ Escherichia coli FVEC1412 ││ │ │├─ Escherichia coli MS 198-1 ││ │ └┼─ Escherichia coli UMN026 └┤ ┌┤ ├─ Escherichia coli H299 │ ││ └─ Escherichia coli FVEC1302 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-133/140) H591 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-133/140) MS 107-1 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-133/140) MS 119-7 │ │└─┤└─ Escherichia coli (1-133/140) M718 │┌┤ │┌─ Escherichia coli (1-137/140) MS 116-1 │││ └┼─ Escherichia coli (1-137/140) MS 45-1 │││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) MS 175-1 │││ └─ Escherichia coli (1-137/140) ETEC H10407 │││┌─────── Escherichia coli (1-133/140) MS 119-7 ││└┤ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) B str. REL606 ││ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-137/140) TA280 ││ └─┤└─ Escherichia coli (1-137/140) OP50 ││ │ ┌─ Escherichia coli (1-129/139) M718 ││ └─────┼─ Escherichia coli (1-129/139) MS 78-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-129/139) O26:H11 str. 11368 ││ └─ Escherichia coli (1-129/139) 1827-70 ││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 str. EC4501 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 str. TW14588 └┤ │├─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 str. Sakai │ ┌─────┤├─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 EDL933 │ │ │└─ Escherichia coli (1-137/140) O157:H7 │ │ └─┬── Escherichia coli SE11 │ ┌┤ └─┬─ Escherichia coli (1-139/143) MS 84-1 │ ││ └─ Escherichia coli (1-139/143) MS 124-1 │ ┌┤└─── Escherichia coli (1-137/140) MS 69-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-133/141) MS 145-7 │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-133/141) MS 196-1 │ │└─ Escherichia coli (1-133/141) MS 124-1 │┌┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.955 TY-2482 (1-133/141) strain ││└┬┴─ Escherichia coli (1-133/141) H299 ││ └┬── Escherichia coli (6-142/145) B088 ││ └──┬─ Escherichia coli (1-133/135) O55:H7 str. CB9615 ││ └┬─ Escherichia coli (1-133/141) E110019 ││ └─ Escherichia coli (1-133/141) E110019 ││ ┌─ Escherichia coli E110019 └┤ ┌┴─ Escherichia coli E110019 │ ┌──┴─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │┌──┴─── Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ ┌─ Escherichia coli (1-133/134) E22 ││ ┌──────┴─ Escherichia coli (1-133/134) E22 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-134/135) APEC O1 ││ ┌───┴┬── Escherichia coli (1-134/135) TA280 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-134/135) TA280 └┤ │└──────── Escherichia coli (1-137/140) MS 182-1 │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 └──┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 └─────┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli 536A ├─ Escherichia coli 1125A └─ Escherichia coli (6-142/142) O157:H7 str. EC4486
| LygF | (192) |
| Phage LygF, possible repressor | (9) |
| Phage or Prophage Related | (1) |
| Putative exclusion protein ren of cryptic prophage CP-933P | (1) |
| hypothetical protein | (1) |
| Others | (5) |