┌─ Escherichia coli (304-643/648) 1125A ├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. TW14359 ┌┼─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4206 ┌┤├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4076 ││├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4042 ┌┤│└─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4024 ││└┬─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4115 ┌┤│ └─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4024 ││└─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4196 ┌┤└─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4115 ┌┤└─ Escherichia coli (1-330/335) O157:H7 str. EC4076 ┌┤└─ Escherichia coli (1-330/335) O157:H7 str. EC4196 │└┬─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC508 ┌┤ └─ Escherichia coli (301-640/645) 1125A │└─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4024 │ ┌─ Escherichia coli (304-643/648) E22 │ ┌┴─ Escherichia coli (304-643/648) E22 │┌┴─ Escherichia coli (204-543/548) O111:H- str. 11128 ┌┤│┌─ Escherichia coli (204-543/548) O157:H7 EDL933 │││├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4042 │││├─ Escherichia coli (204-543/548) O157:H7 str. EC4045 │││├─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4076 │└┤├─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (204-543/548) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. TW14359 │ └┼─ Escherichia coli (304-643/648) O55:H7 str. CB9615 ┌┤ ├─ Escherichia coli (204-543/548) O157:H7 str. TW14359 ││ ├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (222-561/566) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4076 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4045 │││ ├─ Escherichia coli (204-543/548) O157:H7 str. EC4042 │││ ├─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4024 │││ └─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 EDL933 ││└─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4115 ┌┤└┬─ fig|1040638.4.peg.327 O104:H4 (131-469/475) str. LB226692 ││ └─ Escherichia coli (204-543/548) O103:H2 str. 12009 ││ ┌─ Escherichia coli (304-643/648) 1212A ││┌┴─ Escherichia coli (304-643/648) 536A │└┤┌─ Escherichia coli (301-640/645) EC4100B │ └┤┌─ Escherichia coli (304-642/648) O111:H- str. 11128 │ ││┌─ Escherichia coli (304-642/648) 1044A │ └┤├─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 ┌┤ │├─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 EDL933 ││ └┼─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (304-642/648) 536A ││ └─ Escherichia coli (304-642/648) 1044A ││ ┌─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 str. EC4501 ││┌┴─ Escherichia coli (304-642/648) O157:H7 str. TW14588 ┌┤└┤┌─ Escherichia coli (304-643/648) O103:H2 str. 12009 ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (304-643/648) 1212A ││ │┌┼─ Escherichia coli (304-643/648) 536A ││ └┤└─ Escherichia coli (301-640/645) 1212A ││ │┌─ Escherichia coli (301-640/645) O111:H- str. 11128 ┌┤│ └┼─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. FRIK2000 │││ ├─ Escherichia coli (301-640/645) O157:H7 str. EC869 │││ └─ Escherichia coli (301-640/645) O103:H2 str. 12009 ┌───────┤│└─ Escherichia coli (304-643/648) O157:H7 str. EC4501 │ │└─ Escherichia coli (301-640/645) O111:H- str. 11128 │ └┬─ Escherichia coli (301-640/645) O26:H11 str. 11368 │ └─ Escherichia coli (301-640/645) O26:H11 str. 11368 ┌──────┤ ┌─ Escherichia coli (272-608/614) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (272-608/614) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (272-608/614) O157:H7 str. FRIK966 │ └─────────┼─ Escherichia coli (272-608/614) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (272-608/614) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (272-608/614) O157:H7 str. FRIK2000 ┌───────┤ ├─ Escherichia coli (337-673/679) O157:H7 │ │ └─ Escherichia coli (272-608/614) 1044A │ │ ┌───────── Escherichia coli (307-645/646) B088 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (301-645/645) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (258-602/602) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ │└─ Escherichia coli (249-593/593) O157:H7 str. FRIK2000 │ └─────────┤ │┌─ Escherichia coli (301-645/645) 1125A │ │ │├─ Escherichia coli (301-645/645) 536A │ │ │├─ Escherichia coli (301-645/645) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (301-645/645) O157:H7 │ └────┤├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (301-645/645) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. TW14359 ┌──┤ │├─ Escherichia coli (301-645/645) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┼─ Escherichia coli (56-400/400) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (301-645/645) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (301-645/645) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (86-430/430) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (301-645/645) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (301-645/645) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (301-645/645) 1212A ┌────────────┤ │ └─ Escherichia coli (301-645/645) 1044A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (266-629/634) ED1a │ │ │ ┌─────────────────────┴─ Escherichia coli (266-629/634) ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (302-661/662) ED1a │ │ └───────────┤ ┌─┴─ Escherichia coli (302-661/662) ED1a │ │ │ ┌─────┴┬─ Escherichia coli (302-661/662) ED1a │ │ └──────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (302-661/662) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (304-659/660) ED1a │ │ └───┬┴─ Escherichia coli (304-659/660) ED1a ┌────┤ │ └┬─ Escherichia coli (304-659/660) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (304-659/660) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (300-657/657) ED1a │ │ └──────────┬─────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (300-657/657) ED1a │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (300-647/653) S88 │ │ └┬─ Escherichia coli (300-647/653) EC4100B │ │ └┬─ Escherichia coli (300-647/653) ABU 83972 │ │ └─ Escherichia coli (300-647/653) 83972 ┤ └───────────────────────────────────────── Escherichia coli (305-640/736) TA280 │ ┌─────── Escherichia coli (288-613/613) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (288-617/617) 042 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (288-617/617) 042 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (253-582/582) MS 145-7 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (288-617/617) MS 21-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (288-617/617) MS 196-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (291-620/620) B171 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (291-620/620) B171 └──────────────────────────┤ │└┬─ fig|1040638.4.peg.4647 O104:H4 str. LB226692 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (291-620/620) 55989 │ ││ └─ Escherichia coli (291-620/620) 55989 │ │└──┬─ Escherichia coli (288-618/618) 55989 │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (288-618/618) 55989 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (293-621/621) E2348/69 │ │ └─┼─ Escherichia coli (288-616/616) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (288-616/616) 2362-75 │ │ ┌─── Escherichia coli (300-625/625) O26:H11 str. 11368 └───────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (226-551/552) 55989 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (253-578/579) 55989 │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.52 O104:H4 (291-617/617) str. LB226692 │ │ ┌───┴─ Escherichia coli (300-625/625) MS 198-1 │ │┌┤ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 └─┤│└───┬┴─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 ││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 ││ └─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 ││ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) 2362-75 ││ ┌┼─ Escherichia coli (291-617/617) O127:H6 str. E2348/69 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (291-617/617) E2348/69 └┤ ┌─┤└─ Escherichia coli (291-617/617) 2362-75 │ │ └┬─ Escherichia coli (82-407/407) B171 │ │ └─ Escherichia coli (82-407/407) B171 │ │ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) B171 │ │┌┴─ Escherichia coli (291-617/617) B171 │ ││ ┌─ Escherichia coli (90-416/416) B171 │ ││ ┌─┴─ Escherichia coli (90-416/416) B171 └─┤│ │ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) 1044A ││ │ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 ││ │ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. Sakai ││ │ ┌┼─ Escherichia coli (54-380/380) 1125A ││ │ │├─ Escherichia coli (39-365/365) 536A ││ │ │├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4501 ││ │ ┌┤└─ Escherichia coli (291-617/617) 1212A └┤ │ ││┌─ Escherichia coli (291-617/617) 536A │ │ ││├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC869 │ │ │└┼─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (291-617/617) 1212A │ │ ││┌─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4115 │ │ ││├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4206 │ │ ││├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC508 └─┤ │└┼─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. TW14359 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4196 │ ││ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4042 │ ││ └─ Escherichia coli (291-617/617) 1125A │ ││ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4113 │ ││┌┼─ Escherichia coli (291-617/617) O26:H11 str. 11368 │┌┤└┤└─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4486 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) O55:H7 str. CB9615 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) O111:H- str. 11128 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) O111:H- str. 11128 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) E22 │││ └─ Escherichia coli (291-616/616) E22 ││└┬─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 EDL933 ││ └─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 EDL933 ││ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 ││ ┌┴─ Escherichia coli (291-616/616) E110019 ││ ┌┴─ Escherichia coli (43-359/359) E110019 └┤┌┴┬─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 ││ └─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 ││ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O111:H- str. 11128 ││ ┌┼─ Escherichia coli (291-616/616) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (291-616/616) O111:H- str. 11128 ││┌┤└─ Escherichia coli (291-616/616) WV_060327 │││└─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 │││ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) B171 │││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) E22 │││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O103:H2 str. 12009 └┤│ ├─ Escherichia coli (248-573/573) O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 ││ ┌┼─ Escherichia coli (291-616/616) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O103:H2 str. 12009 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (291-616/616) E22 ││ ││└─ Escherichia coli (291-616/616) B171 ││┌┤└─ Escherichia coli (291-616/616) O111:H- str. 11128 ││││ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) EC4100B │││└┬┴─ Escherichia coli (188-513/513) O26:H11 str. 11368 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) 2362-75 │││ └┬─ Escherichia coli (291-616/616) O127:H6 str. E2348/69 └┤│ └─ Escherichia coli (291-616/616) E2348/69 ││ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) 536A ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4024 ││ ├─ Escherichia coli (163-488/488) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC869 ││ ┌┼─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. Sakai ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC508 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4486 ││ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4206 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4115 ││ ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4045 ││ ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 └┤ ┌┤│└─ Escherichia coli (291-616/616) 1212A │ ││└─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┤└┬─── Escherichia coli (291-614/614) O157:H7 str. EC4113 │ ││ └─ Escherichia coli (291-616/616) 1125A │ ┌┤└─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 │ │└─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 │ │┌─ Escherichia coli (291-616/616) 1125A │ │├─ Escherichia coli (291-616/616) 536A │ │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4042 │┌┤├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4076 │││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4115 │││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4206 │││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4486 │││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14359 ││└┼─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC869 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4401 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (166-491/491) O157:H7 str. EC4045 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4024 ││ ├─ Escherichia coli (291-616/616) 1212A ││ └─ Escherichia coli (291-616/616) 1044A └┤ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) 1044A │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) 536A │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (54-379/379) 1212A │┌┼─ Escherichia coli (54-379/379) O157:H7 str. EC4113 ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14359 ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC508 ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4115 ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 └┤├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 │└─ Escherichia coli (291-616/616) 1125A │ ┌─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 │┌┴─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 EDL933 ││ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 EDL933 ││ ┌┴─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 EDL933 ││┌┴┬─ Escherichia coli (291-602/602) O157:H7 str. Sakai └┤│ └─ Escherichia coli (291-602/602) O157:H7 ││ ┌─ Escherichia coli (291-617/617) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli (90-416/416) 536A └┤ │├─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 str. Sakai │┌┤└─ Escherichia coli (291-617/617) O157:H7 ││└─ Escherichia coli (41-364/364) O157:H7 str. EC869 ││┌─ Escherichia coli (291-616/616) 1125A ││├─ Escherichia coli (291-616/616) 536A ││├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4024 └┤├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14359 └┼─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (291-616/616) O157:H7 ├─ Escherichia coli (291-616/616) 1212A └─ Escherichia coli (291-616/616) 1044A
| hypothetical protein | (187) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933V | (113) |
| FIG00639776: hypothetical protein | (3) |
| orf; Other or unknown (Phage or Prophage Related) | (2) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933R | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933U | (1) |
| conserved hypothetical protein similar to yjhS for cryptic prophage CP-933M | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933N | (1) |
| conserved hypothetical YjhS family protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| Others | (3) |