fig|1040638.4.peg.462   Escherichia coli O104:H4 str. LB226692                        MRYKPNQYLICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRVQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMTALCLIGLYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHNLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPIELKKYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTL   
fig|6666666.5357.peg.3045   Escherichia coli TY-2482                        MRYKPNQYLICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRVQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMTALCLIGLYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHNLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPIELKKYIEFLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTL   
fig|573235.3.peg.310   Escherichia coli O26:H11 str. 11368                        MRYKPNQYLICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMMALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKKYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTP   
fig|670897.3.peg.422   Escherichia coli 2362-75                        MRYKPNQYLICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRVQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMTALCLIGLYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARLVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALILGHQRGNTETFRTYSKNAASPVELKKYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTP   
fig|749545.3.peg.683   Escherichia coli MS 182-1 (1-425/428)                        MRYKPNQYIICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMMALCLIGLYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTPytq
fig|550677.3.peg.697   Escherichia coli B354                        MRYKPNQYLICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMMALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTP   
fig|405955.9.peg.234   Escherichia coli APEC O1 (20-444/444)     mhynqfshykrsdtlagefMRYKPNQYIICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMIALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTP   
fig|405955.13.peg.279   Escherichia coli APEC O1                        MRYKPNQYIICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGNSAENKEMIALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRRKTTP   
fig|749533.3.peg.92   Escherichia coli MS 84-1                        MRYKPNQYIICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGDSAENKEMMALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRHKTTP   
fig|679205.4.peg.3915   Escherichia coli MS 124-1                        MRYKPNQYIICDSYGNYYLRITLPVYMQPFFEGKRTFVRSLHTSNLRVARRKRDQIADEYHCLRESVAPVN-STIENTLELLRSKAKYAKTATRMQDTAS-----SCPSLLKILEIYLTINSTKKKPATLAKARKAVEMFLSYRKKPDIALQDVSRTTVTGWIEHMQKTLSQQSIANYISPMAQLWELASSRYHDAPERALSPWRGHRLDVAQSRESYEAFSNKELLQVLQVFSGDSAENKEMMALCLIGAYTGMRINEIASLTIDDVKEIEGVLCFEITQGKTKAAARVVPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYHASITERADGKRSTWHTQRFTRAKRKALGEKGTERKVFHSLRHGVAQLLDRN--------QIPEDRIALLLGHTRGNTETFRTYSKNAASPVELKNYIELLRYPEIEKGLSINKKSNLRHKTTP   
fig|656414.3.peg.4845   Escherichia coli H736                        MSFKRDRYLVLDPCGNYLVRITVPAYMRSLFGNKRYFVKSTGTSDIRQARLFRDAIAVEWIRLREQVKPREGSKIEQAIAELRRVSARVHETP-VQHVMSNTQSQGVPSLLKMRDLYLLQFSEKRKLTTLSKTNKAVEVLLEHLKKRDVQLRDVNRTTVTGWLDQLKTEKAPQTIQNYVSALAQIWDLARNRYHDAPQE--NIWRGHALEAKSSKVSYEVFEPGELAKVFAVM----ANDEEMQNVTLIGMYSGMRLNEICSLRAANIREIEGVLCFEVTEGKTKSAARIIPVHSLITPLVLSLREKPHNGFLFYRASIADRADGKRSTWHSQRFTRAKRKALGEVGSELKVFHSLRHAVAQILDRGGVGRGKLKPVTEDRIALLLGHERGSTESFKTYSKNAASPIELQPYIELLRYPEIETEPQREKTDK          
fig|574521.7.peg.4712   Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69                        MSFKRDRYLVLDPCGNYLVRIAIPSYMRHLFQGKRYFMKSTGTRDIRQARLFRDAIALEWTRLRNLLKPQGGSSVDQIIDELRRVSVYAKEAP-ASFGAS---IQACPSLLKMRDLYLLQYSEKRKLTTLSKTNKAVEVLLTHLKKKDVQLRDINRTIVTGWLDKLKTERAPQTIQNYISALAQIWDLARNRYHDAPQD--NPWRGHALEAKSSKVSYEVFAPGELAKVYALL------DDEMKAVTAIGAYSGMRINEICTLRESSIKTIEGILCFEITEGKTKSAARIVPVHSKIIPLVKSLLKTTHSGFLFYHASITDRADGKRSTWHTQQFTRAKRKALGEPAAERKVFHSLRHAFVQQLDRA--------QVPEDRIALLVGHERGSTESFKTYSKNAASPIEIGKYVELIQHEGINI                   
fig|216593.1.peg.3694   Escherichia coli E2348/69                        MSFKRDRYLVLDPCGNYLVRIAIPSYMRHLFQGKRYFMKSTGTRDIRQARLFRDAIALEWTRLRNLLKPQGGSSVDQIIDELRRVSVYAKEAP-ASFGAS---IQACPSLLKMRDLYLLQYSEKRKLTTLSKTNKAVEVLLTHLKKKDVQLRDINRTIVTGWLDKLKTERAPQTIQNYISALAQIWDLARNRYHDAPQD--NPWRGHALEAKSSKVSYEVFAPGELAKVYALL------DDEMKAVTAIGAYSGMRINEICTLRESSIKTIEGILCFEITEGKTKSAARIVPVHSKIIPLVKSLLKTTHSGFLFYHASITDRADGKRSTWHTQQFTRAKRKALGEPAAERKVFHSLRHAFVQQLDRA--------QVPEDRIALLVGHERGSTESFKTYSKNAASPIEIGKYVELIQHEGINI                   
Consen1   Primary consensus                        MryKpnqYlicDsyGNYylRItlPvYMqpfFeGKRtFvrSlhTsnlRvARrkRDqIAdEyhcLResvaPvn-StientlelLRskakYAKtAtr qdtAS-----sCPSLLKileiYLtinStKkKpaTLaKarKAVEmfLsyrKKpDiaLqDvsRTtVTGWiehmqktlsqQsIaNYISpmAQlWeLAssRYHDAPeralsPWRGHrLdvaqSreSYEaFsnkELlqVlqvfsg saenkEM AlclIGaYtGMRINEIasLtiddvKeIEGvLCFEITqGKTKaAARvVPVHslItPLVlSLrekpHnGFLFYHASITeRADGKRSTWHTQrFTRAKRKALGEkgtERKVFHSLRHgvaQlLDRn--------QiPEDRIALLlGHtRGnTEtFrTYSKNAASPvElknYiELlrypeIekGLSINKKSNLRrKTTp   
Consen2   Secondary consensus                         sf rdr ivl pc   lv  ai s  rhl q   y mk tg rdi q  lf  a  l wtr  nllk qgg svdqiide  rvsv   e p- sfg     iqa      mrdl  lqy e r lt  s tn    vl thl  k vq r in  i    ldklkterap t q    al  i d  rn      qd--n     a eaks kv   v apg  ak yall-- ---dd    vta  l s       ct ressi t   i      e    s   i    nk i   k  lktt s          d            q           paa          afv q   a         v        v  e  s  s k         i igk v  iqheg ni           h   l   

Consensus 1 (when a gap)
Conservative difference
Consensus 2 (when a gap)
Nonconservative diff.
Other character