┌─ Escherichia coli (29-149/152) 042 ├─ Escherichia coli (29-149/152) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (29-149/152) E2348/69 ├─ Escherichia coli (18-138/141) 101-1 ├─ Escherichia coli (18-138/141) 1125A ├─ Escherichia coli (18-138/141) 536A ├─ Escherichia coli (18-138/141) 55989 ├─ Escherichia coli (18-138/141) B185 ├─ Escherichia coli (18-138/141) BW2952 ├─ Escherichia coli (18-138/141) E110019 ├─ Escherichia coli (18-138/141) E22 ├─ Escherichia coli (18-138/141) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (18-138/141) F11 ├─ Escherichia coli (18-138/141) H591 ├─ Escherichia coli (18-138/141) HS ├─ Escherichia coli (18-138/141) IAI39 ├─ Escherichia coli (18-138/141) KO11 ├─ Escherichia coli (18-138/141) M718 ├─ Escherichia coli (18-138/141) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (18-138/141) NC101 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (18-138/141) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (18-138/141) OP50 ├─ Escherichia coli (18-138/141) SE15 ├─ Escherichia coli (18-138/141) UM146 ├─ Escherichia coli (18-138/141) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (18-138/141) str. K-12 substr. MG1655 ├─ fig|6666666.5357.peg.1798 TY-2482 (5-125/128) strain ├─ Escherichia coli (5-125/128) 1827-70 ├─ Escherichia coli (5-125/128) 536 ├─ Escherichia coli (5-125/128) 83972 ├─ Escherichia coli (5-125/128) APEC O1 ├─ Escherichia coli (5-125/128) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (5-125/128) B171 ├─ Escherichia coli (5-125/128) B7A ├─ Escherichia coli (DE3 5-125/128) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (5-125/128) EC4100B ├─ Escherichia coli (5-125/128) ED1a ├─ Escherichia coli (5-125/128) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (5-125/128) IAI1 ├─ Escherichia coli (5-125/128) IHE3034 ├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 187-1 ├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (5-125/128) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (5-125/128) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (5-125/128) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (5-125/128) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (5-125/128) S88 ├─ Escherichia coli (5-125/128) TA206 ├─ Escherichia coli (5-125/128) UTI89 ├─ Escherichia coli (5-125/128) W ├─ Escherichia coli (5-125/128) W3110 ┌┼─ Escherichia coli (5-125/128) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (5-125/128) W │├─ Escherichia coli (5-125/128) UTI89 │├─ Escherichia coli (5-125/128) UMN026 │├─ Escherichia coli (5-125/128) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (5-125/128) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (5-125/128) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (5-125/128) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (5-125/128) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 200-1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 185-1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 107-1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) IAI1 │├─ Escherichia coli (5-125/128) HS │├─ Escherichia coli (5-125/128) FVEC1302 │├─ Escherichia coli (5-125/128) ED1a │├─ Escherichia coli (5-125/128) CFT073 │├─ Escherichia coli (5-125/128) BL21 │├─ Escherichia coli (5-125/128) B354 │├─ Escherichia coli (5-125/128) B088 │├─ Escherichia coli (5-125/128) ATCC 8739 │├─ Escherichia coli (5-125/128) ABU 83972 │├─ Escherichia coli (5-125/128) 53638 │├─ Escherichia coli (5-125/128) 536 │├─ Escherichia coli (5-125/128) 1212A │├─ fig|1040638.4.peg.947 O104:H4 (5-125/128) str. LB226692 │├─ Escherichia coli (18-138/141) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (18-138/141) WV_060327 │├─ Escherichia coli (18-138/141) TA271 ┌┤├─ Escherichia coli (18-138/141) SE11 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O55:H7 str. CB9615 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. TW14359 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. FRIK2000 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC508 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4401 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4115 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4076 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) O111:H- str. 11128 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) MS 198-1 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) MS 119-7 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) M605 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) K12 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) IAI39 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) H736 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) H299 ││├─ Escherichia coli (18-138/141) F11 ┌┤│├─ Escherichia coli (18-138/141) E22 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) E110019 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) DH1 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) B7A │││├─ Escherichia coli (18-138/141) B171 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) 55989 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) 53638 │││├─ Escherichia coli (18-138/141) 1044A │││├─ Escherichia coli (18-138/141) 042 │││├─ Escherichia coli (29-149/152) CFT073 │││└─ Escherichia coli (29-149/152) APEC O1 ┌┤││ ┌─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 EDL933 ││││┌┴─ Escherichia coli (18-138/141) O157:H7 EDL933 │││└┤┌─ Escherichia coli (5-125/128) 2362-75 │││ └┼─ Escherichia coli (5-125/128) MS 84-1 │││ ├─ Escherichia coli (5-125/128) MS 124-1 │││ └─ Escherichia coli (18-138/141) MS 196-1 ┌─────┤││ ┌─ Escherichia coli (18-138/141) MS 175-1 │ ││└┬┴─ Escherichia coli (5-125/128) MS 116-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (5-125/128) E24377A │ ││ └─ Escherichia coli (18-138/141) E24377A │ │└┬─ Escherichia coli (18-138/141) MS 146-1 │ │ └─ Escherichia coli (18-138/141) MS 115-1 │ └┬─ Escherichia coli (18-138/141) TA280 │ └─ Escherichia coli (18-138/141) TA143 │ ┌─ Escherichia coli (2-125/129) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (18-141/145) E24377A │ │ ┌─ Escherichia coli (2-125/129) FVEC1302 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 198-1 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-125/129) UMN026 │ │┌┤└─ Escherichia coli (2-125/129) FVEC1412 ┌┤ ││└─ Escherichia coli (2-125/129) 2362-75 ││ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.3957 TY-2482 (2-125/129) strain ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 042 ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 1044A ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 1212A ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 536 ││ ││├─ Escherichia coli (18-141/145) 53638 ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 536A ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) 55989 ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) ABU 83972 ││ ││├─ Escherichia coli (18-141/145) APEC O1 ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) ATCC 8739 ││ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) B088 │└─────┤│├─ Escherichia coli (2-125/129) B171 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) B354 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) B7A │ ││├─ Escherichia coli (DE3 2-125/129) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (23-146/150) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) DH1 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) E22 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (18-141/145) F11 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) H299 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) H736 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) HS │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) K12 │ ││├─ Escherichia coli (2-125/129) M605 │ └┤├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 107-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 187-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) NC101 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) OP50 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) SE11 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) TA206 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) TA280 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) W │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) W3110 │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (2-125/129) str. K-12 substr. MG1655 ┌──────────────────────┤ └┼─ Escherichia coli (2-125/129) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) W │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) UM146 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) TA143 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (23-146/150) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 69-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 21-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) MS 115-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) M718 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) IAI1 ┤ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) HS │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) F11 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) ED1a │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) E2348/69 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) B str. REL606 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (2-125/129) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (18-141/145) 042 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.1690 O104:H4 (2-125/129) str. LB226692 │ └─────────┬───────────────── Escherichia coli (2-128/130) TA206 │ └──────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (20-120/129) SMS-3-5 │ └┬─ Escherichia coli (20-120/129) M718 │ └─ Escherichia coli (20-120/129) H299 │ ┌─ Escherichia coli (25-137/137) MS 124-1 │ │┌─ Escherichia coli MS 69-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ││┌┴─ Escherichia coli B354 │ │││ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │││ ├─ Escherichia coli 1212A │ │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 └────────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │││ ┌┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 └┤│ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ││ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││ ││├─ Escherichia coli 536A ││ ││└─ Escherichia coli 1125A ││ ││┌─ Escherichia coli FVEC1412 ││ ││├─ Escherichia coli TA143 ││ │└┼─ Escherichia coli UMN026 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli MS 198-1 ││ ││ └─ Escherichia coli FVEC1302 ││ ││ ┌─ Escherichia coli H736 ││ ││┌┴─ Escherichia coli MS 146-1 ││ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.2305 TY-2482 strain ││ │││├─ Escherichia coli 55989 ││ │└┤├─ Escherichia coli E110019 └┤ │ │├─ Escherichia coli KO11 │ │ │├─ Escherichia coli MS 78-1 │┌┤ │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │││ └┼─ Escherichia coli W │││ ├─ Escherichia coli W │││ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │││ ├─ Escherichia coli MS 182-1 │││ ├─ Escherichia coli EC4100B │││ ├─ Escherichia coli E110019 │││ ├─ Escherichia coli 55989 │││ └─ fig|1040638.4.peg.4619 O104:H4 str. LB226692 ││└─ Escherichia coli SE11 ││┌─ Escherichia coli 042 ││├─ Escherichia coli 1827-70 ││├─ Escherichia coli 536 ││├─ Escherichia coli 53638 ││├─ Escherichia coli 83972 ││├─ Escherichia coli APEC O1 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli B str. REL606 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli B185 ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli CFT073 ││├─ Escherichia coli DH1 ││├─ Escherichia coli E22 └┤├─ Escherichia coli E24377A │├─ Escherichia coli ED1a │├─ Escherichia coli ETEC H10407 │├─ Escherichia coli F11 │├─ Escherichia coli H591 │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli IAI1 │├─ Escherichia coli IAI39 │├─ Escherichia coli K12 │├─ Escherichia coli M718 │├─ Escherichia coli MS 115-1 │├─ Escherichia coli MS 119-7 │├─ Escherichia coli MS 175-1 │├─ Escherichia coli MS 187-1 │├─ Escherichia coli MS 200-1 │├─ Escherichia coli MS 45-1 │├─ Escherichia coli NC101 │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli S88 │├─ Escherichia coli SMS-3-5 │├─ Escherichia coli TA271 │├─ Escherichia coli UM146 │├─ Escherichia coli UTI89 │├─ Escherichia coli WV_060327 │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli W3110 ├─ Escherichia coli UTI89 ├─ Escherichia coli TA280 ├─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli SE15 ├─ Escherichia coli OP50 ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli MS 84-1 ├─ Escherichia coli MS 21-1 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli MS 185-1 ├─ Escherichia coli MS 145-7 ├─ Escherichia coli MS 116-1 ├─ Escherichia coli MS 107-1 ├─ Escherichia coli M605 ├─ Escherichia coli IHE3034 ├─ Escherichia coli IAI39 ├─ Escherichia coli IAI1 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli H299 ├─ Escherichia coli F11 ├─ Escherichia coli ED1a ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli E2348/69 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli CFT073 ├─ Escherichia coli BW2952 ├─ Escherichia coli BL21 ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B088 ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ├─ Escherichia coli APEC O1 ├─ Escherichia coli ABU 83972 ├─ Escherichia coli 53638 ├─ Escherichia coli 536 ├─ Escherichia coli 2362-75 ├─ Escherichia coli 101-1 └─ Escherichia coli 042
| Hypothetical protein TdcF in cluster with anaerobic degradation of L-threonine to propionate | (130) |
| Protein YjgF, putative endoribonuclease L-PSP | (128) |
| Possible ring-opening amidohydrolase RutC in novel pyrimidine catabolism pathway | (120) |
| Endoribonuclease L-PSP | (8) |
| UPF0076 protein rutC (Pyrimidine utilization protein C) | (1) |
| Others | (6) |