┌─ Escherichia coli (25-403/423) E2348/69 ┌─────────────────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (22-400/420) O127:H6 str. E2348/69 │ ┌─ Escherichia coli (1-355/356) 1125A │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) B171 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) E22 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) M605 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. TW14359 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-355/356) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4045 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-355/356) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (1-355/356) H736 │ ││├─ Escherichia coli (1-355/356) E22 │ ││├─ Escherichia coli (1-355/356) B171 │ ││└─ Escherichia coli (1-355/356) B str. REL606 │ │└┬─ Escherichia coli (1-355/356) MS 182-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-355/356) MS 115-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-355/356) 042 │ ││ └─ Escherichia coli (1-355/356) 042 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-355/356) H299 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-355/356) MS 84-1 │ ││┌┤└─ Escherichia coli (1-355/356) MS 124-1 │ │││└┬─ Escherichia coli (1-355/356) ATCC 8739 │ ┌┤└┤ └─ Escherichia coli (1-355/356) ATCC 8739 │ ││ │┌─ Escherichia coli (1-355/356) 2362-75 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (14-357/358) O111:H- str. 11128 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (1-355/356) O127:H6 str. E2348/69 │ ┌┤│ └┼─ Escherichia coli (1-355/356) O26:H11 str. 11368 │ │││ └─ Escherichia coli (1-355/356) E2348/69 │ ││└─ Escherichia coli (1-355/356) OP50 │ │└─ Escherichia coli (1-355/356) EC4100B │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-355/356) FVEC1302 │ ││┌┼─ Escherichia coli (1-355/356) UMN026 │ │││└─ Escherichia coli (1-355/356) FVEC1412 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-355/356) E24377A │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-355/356) E24377A │ ┌────────┤ └┤┌─ Escherichia coli (1-355/356) 55989 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-355/356) H591 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-355/356) MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-355/356) 55989 │ │ │ └─ fig|6666666.5357.peg.4258 TY-2482 (1-355/356) strain │ ┌───────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-355/356) IAI1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-355/356) IAI1 ┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-355/356) O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-355/356) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-355/357) 53638 │ │ └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-355/357) 53638 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-355/357) O83:H1 str. NRG 857C │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-355/357) 2362-75 │ ┌────────────┤ │┌┼─ Escherichia coli (1-355/357) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (1-355/357) E2348/69 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-355/357) E22 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-355/357) E22 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-355/357) B7A │ │ │ └─ Escherichia coli (1-355/357) B7A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-355/358) M605 │ │ └──────────────────────────────┬┴─ Escherichia coli (4-355/371) O26:H11 str. 11368 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-355/358) 53638 │ │ └─ Escherichia coli (4-355/358) 53638 │ │ ┌─ Escherichia coli 042 │ │ ├─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ ├─ Escherichia coli 536A │ │ ├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli S88 │ │ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ ││├─ Escherichia coli MS 21-1 │ │ ││├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ ││├─ Escherichia coli APEC O1 │ │ ││├─ Escherichia coli 83972 │ │ ││├─ Escherichia coli 2362-75 │ │ ││├─ Escherichia coli 1125A │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli 042 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli ED1a │ │ ││└┬┴─ Escherichia coli ED1a │ │ ││ └┬─ Escherichia coli 55989 └──────────────────────┤ ││ └─ Escherichia coli 55989 │ ││┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │││┌─ Escherichia coli (1-373/427) O55:H7 str. CB9615 │ │└┤│┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ││ └┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │││ └─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤│└┬─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │││ └─ Escherichia coli E2348/69 │ ││└─ Escherichia coli MS 196-1 │ ┌┤└┬─ fig|6666666.5357.peg.3394 TY-2482 strain │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.4577 O104:H4 str. LB226692 │ │└┬─ Escherichia coli B088 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli E24377A │ ││ └─ Escherichia coli E24377A │ ┌────────────────┤└─ Escherichia coli B185 │ │ └┬─ Escherichia coli E22 │ │ └─ Escherichia coli E22 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-372/372) B171 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-372/372) B171 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-372/372) O111:H- str. 11128 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-372/372) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-372/372) E2348/69 │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (4-372/372) 53638 │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (4-372/372) 53638 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-372/372) MS 175-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-372/372) MS 116-1 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (4-372/372) ETEC H10407 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-372/372) MS 198-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-372/372) MS 84-1 │ │ │└┼─ Escherichia coli (4-372/372) WV_060327 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-372/372) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-372/372) MS 69-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-372/372) MS 124-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-372/372) 2362-75 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-372/372) CFT073 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (4-372/372) MS 45-1 │ │ │││└─ Escherichia coli (4-372/372) CFT073 └───────────┤ │││┌─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 │ │││├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 EDL933 │ │└┤├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4045 │ │ │├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4486 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. FRIK966 │ ││ └┼─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. TW14359 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC869 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 str. EC4042 │ ┌──────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (4-372/372) O157:H7 EDL933 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-372/372) 1125A │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-372/372) B7A │ │ │ └─ Escherichia coli (4-372/372) B7A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-372/372) E24377A │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-372/372) E24377A │ │ │┌┴─ Escherichia coli (4-372/372) 101-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-372/372) O103:H2 str. 12009 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (4-372/372) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (4-372/372) E22 │ │ └┼─ Escherichia coli (4-372/372) O26:H11 str. 11368 └──┤ ├─ Escherichia coli (4-372/372) E22 │ └─ Escherichia coli (4-372/372) E110019 │ ┌─ Escherichia coli (3-375/375) K12 │ ├─ Escherichia coli (3-375/375) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (3-375/375) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌───────────┤└─ Escherichia coli (3-375/375) W3110 │ │ └─ Escherichia coli (3-370/376) B088 │ │ ┌─── Escherichia coli (3-372/380) MS 116-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-372/380) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 EDL933 └──┤ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. Sakai └────────┤ ┌┼─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) 536A │ │└─ Escherichia coli (3-372/380) 1125A └───┤ ┌─ Escherichia coli (3-372/380) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) IHE3034 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) NC101 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) S88 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) TA280 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) UTI89 │ ┌┼─ Escherichia coli (3-372/380) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) UM146 │ │├─ Escherichia coli (3-372/380) SE15 │┌┤├─ Escherichia coli (3-372/380) O83:H1 str. NRG 857C │││├─ Escherichia coli (3-372/380) M605 │││└─ Escherichia coli (3-372/380) APEC O1 ││└┬─ Escherichia coli (3-372/380) F11 ││ └─ Escherichia coli (3-372/380) F11 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-372/380) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (3-372/380) MS 198-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (3-372/380) UMN026 │┌┤└─ Escherichia coli (3-372/380) FVEC1412 ││└┬─ Escherichia coli (3-372/380) 1827-70 ││ └┬─ Escherichia coli (3-372/380) B354 └┤ └─ Escherichia coli (3-372/380) EC4100B │ ┌─ Escherichia coli (3-372/445) IAI39 │┌┴─ Escherichia coli (3-372/445) IAI39 ││┌─ Escherichia coli (3-372/380) ABU 83972 └┤├─ Escherichia coli (3-372/380) CFT073 │├─ Escherichia coli (3-372/380) MS 200-1 └┼─ Escherichia coli (3-372/380) MS 45-1 ├─ Escherichia coli (3-372/380) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (3-372/380) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (3-372/380) CFT073 └─ Escherichia coli (3-372/380) 83972
| Phage integrase | (154) |
| Integrase | (65) |
| Prophage lambda integrase | (12) |
| prophage lambda integrase | (1) |
| putative enzyme; Integration, recombination (Phage or Prophage Related) | (1) |
| putative integrase | (1) |
| Others | (3) |