┌─ Escherichia coli (20-100/100) 042 ├─ Escherichia coli (20-100/100) CFT073 ├─ fig|1040638.4.peg.4380 O104:H4 str. LB226692 ├─ Escherichia coli 042 ├─ Escherichia coli 1044A ├─ Escherichia coli 1212A ├─ Escherichia coli 2362-75 ├─ Escherichia coli 536 ├─ Escherichia coli 53638 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 83972 ├─ Escherichia coli APEC O1 ├─ Escherichia coli B str. REL606 ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B185 ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli BL21 ├─ Escherichia coli BW2952 ├─ Escherichia coli DH1 ├─ Escherichia coli E110019 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli ED1a ├─ Escherichia coli ETEC H10407 ├─ Escherichia coli F11 ├─ Escherichia coli FVEC1412 ├─ Escherichia coli H591 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli IAI39 ├─ Escherichia coli IHE3034 ├─ Escherichia coli KO11 ├─ Escherichia coli M718 ├─ Escherichia coli MS 115-1 ├─ Escherichia coli MS 119-7 ├─ Escherichia coli MS 145-7 ├─ Escherichia coli MS 175-1 ├─ Escherichia coli MS 185-1 ├─ Escherichia coli MS 196-1 ├─ Escherichia coli MS 200-1 ├─ Escherichia coli MS 45-1 ├─ Escherichia coli MS 78-1 ├─ Escherichia coli NC101 ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli OP50 ├─ Escherichia coli SE11 ├─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli TA206 ├─ Escherichia coli UM146 ├─ Escherichia coli UTI89 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli W3110 ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli WV_060327 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli UTI89 │├─ Escherichia coli UMN026 │├─ Escherichia coli TA271 │├─ Escherichia coli TA143 │├─ Escherichia coli SE15 │├─ Escherichia coli S88 │├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli O157:H7 │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli MS 84-1 │├─ Escherichia coli MS 69-1 │├─ Escherichia coli MS 21-1 │├─ Escherichia coli MS 198-1 │├─ Escherichia coli MS 187-1 │├─ Escherichia coli MS 182-1 │├─ Escherichia coli MS 146-1 │├─ Escherichia coli MS 124-1 │├─ Escherichia coli MS 116-1 │├─ Escherichia coli MS 107-1 ┌┤├─ Escherichia coli M605 ││├─ Escherichia coli K12 ││├─ Escherichia coli IAI39 ││├─ Escherichia coli HS ││├─ Escherichia coli H736 ││├─ Escherichia coli H299 ││├─ Escherichia coli FVEC1302 ││├─ Escherichia coli F11 ││├─ Escherichia coli ED1a ││├─ Escherichia coli EC4100B ││├─ Escherichia coli E24377A ││├─ Escherichia coli E22 ││├─ Escherichia coli E110019 ││├─ Escherichia coli CFT073 ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli B354 ││├─ Escherichia coli B171 ┌──────────┤│├─ Escherichia coli B088 │ ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli ABU 83972 │ ││├─ Escherichia coli 55989 │ ││├─ Escherichia coli 536A │ ││├─ Escherichia coli 53638 │ ││├─ Escherichia coli 536 │ ││├─ Escherichia coli 1827-70 │ ││├─ Escherichia coli 1125A │ ││├─ Escherichia coli 101-1 │ ││├─ fig|6666666.5357.peg.1630 TY-2482 strain │ ││├─ Escherichia coli (20-100/100) E2348/69 │ ││└─ Escherichia coli (20-100/100) ATCC 8739 │ ││┌─ Escherichia coli TA280 │ │└┤┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ┌─────────┤ │ └─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ └┬─ Escherichia coli IAI1 │ │ └─ Escherichia coli IAI1 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-79/88) M605 │ │ ┌───────────────────────────────┴─── Escherichia coli (17-79/79) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (22-99/102) B7A │ │ │ ├─ fig|6666666.5357.peg.3997 TY-2482 (2-79/82) strain │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) MS 124-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) MS 200-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-79/82) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-79/82) SE11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-79/82) SE11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-79/82) O157:H7 str. EC4486 │ └───────────┤ │├─ Escherichia coli (2-79/82) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (2-79/82) MS 21-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-79/82) MS 196-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-79/82) H591 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-79/82) B7A │ │ ││└─ Escherichia coli (22-99/102) E22 │ │ ┌──────────────────────────┤│┌─ Escherichia coli (2-79/82) TA206 │ │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (2-79/82) W │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-79/82) W │ │ │ │ └─ Escherichia coli (2-79/82) KO11 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-79/82) TA271 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-79/82) H299 │ └─────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-76/77) ATCC 8739 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (25-100/101) ATCC 8739 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-76/77) EC4100B │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-76/77) M605 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-76/77) H591 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (1-76/77) CFT073 │ └────────────────────┤│ └─ Escherichia coli (25-100/101) CFT073 │ ││┌─ Escherichia coli (1-76/77) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 1-76/77) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (1-76/77) ED1a ┤ ││├─ Escherichia coli (1-76/77) KO11 │ └┤├─ Escherichia coli (1-76/77) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (1-76/77) MS 84-1 │ │├─ Escherichia coli (1-76/77) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (1-76/77) S88 │ │├─ Escherichia coli (1-76/77) TA206 │ │├─ Escherichia coli (1-76/77) W │ │├─ Escherichia coli (25-100/101) E2348/69 │ └┼─ Escherichia coli (25-100/101) HS │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) W │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) TA280 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) TA143 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) OP50 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) NC101 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) HS │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) ED1a │ ├─ Escherichia coli (1-76/77) BL21 │ └─ Escherichia coli (1-76/77) 2362-75 │ ┌─ Escherichia coli (5-80/81) E22 │ ┌──────────────────┴─ Escherichia coli (5-80/81) E22 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) ED1a │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-81/82) ED1a │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-66/67) ED1a │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-66/67) ED1a │ │ │└──┬─ Escherichia coli (1-81/82) ED1a │ │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-81/82) ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) IAI39 │ │ ┌────┤ └───┼─ Escherichia coli (1-81/82) MS 196-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-81/82) IAI39 │ │ │ └───┬─ Escherichia coli (1-81/82) E110019 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-81/82) E110019 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-67/72) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) 1125A │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) 536A │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) E22 └─────────┤ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (1-67/68) O26:H11 str. 11368 └──────────────┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-67/68) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4076 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) O103:H2 str. 12009 │ ││├─ Escherichia coli (1-67/68) 536A │ ┌┤│├─ Escherichia coli (1-67/68) 1212A │ │││├─ Escherichia coli (1-67/68) 1125A │ │││└─ Escherichia coli (1-67/68) 1044A │ │││┌─ Escherichia coli (39-110/115) O157:H7 EDL933 │ ││└┼─ Escherichia coli (8-79/80) O157:H7 │ ││ ├─ Escherichia coli (8-79/80) E22 │ ││ └─ Escherichia coli (39-110/111) O157:H7 EDL933 └──┤└─ Escherichia coli (1-67/68) O111:H- str. 11128 │ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) O111:H- str. 11128 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-67/68) CFT073 │ │┌┴─ Escherichia coli (1-67/68) CFT073 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) 53638 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) 1044A │ ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) 1212A │ ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 └─────┤│ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC508 └┤ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. TW14359 │┌┼─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. TW14588 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. Sakai ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4501 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4401 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4196 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4113 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) 536A ││├─ Escherichia coli (1-81/82) 1125A ││└─ Escherichia coli (1-81/82) 53638 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) UTI89 │┌┴─ Escherichia coli (1-81/82) UTI89 ││ ┌─ fig|6666666.5357.peg.4265 TY-2482 (1-81/82) strain ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) 53638 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) B171 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) EC4100B ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-81/82) ETEC H10407 ││ │├─ Escherichia coli (1-81/82) B171 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (1-81/82) 53638 ││ ││└─ Escherichia coli (1-81/82) 101-1 ││ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.362 O104:H4 (1-67/68) str. LB226692 ││ ┌┤└── Escherichia coli (1-81/82) O103:H2 str. 12009 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-81/82) IHE3034 └┤ │└─ Escherichia coli (1-62/63) 2362-75 │┌┤┌─ Escherichia coli (1-81/82) F11 ││└┼─ Escherichia coli (1-81/82) MS 200-1 ││ └─ Escherichia coli (1-81/82) F11 ││ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) B171 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) H591 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) MS 69-1 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) TA143 ││┌┼─ Escherichia coli (1-81/82) O111:H- str. 11128 └┤│├─ Escherichia coli (1-81/82) TA280 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) S88 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) MS 187-1 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) M605 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) H299 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) B171 ││└─ Escherichia coli (1-81/82) APEC O1 ││ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) 1125A ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) 536A ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4076 └┤ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. FRIK966 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4196 │┌┤├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4113 │││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4045 │││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4024 └┤│└─ Escherichia coli (1-81/82) 1212A │└─ Escherichia coli (1-81/82) O55:H7 str. CB9615 │┌─ Escherichia coli (1-85/86) O103:H2 str. 12009 ││┌─ Escherichia coli (1-62/66) O157:H7 str. FRIK966 └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC869 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-67/68) E110019 ││┌┴─ Escherichia coli (2-70/71) E110019 └┤│┌─ Escherichia coli (1-81/82) 1125A ││├─ Escherichia coli (1-81/82) 536A ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4042 └┤├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. TW14588 └┼─ Escherichia coli (1-81/82) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (1-81/82) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (1-81/82) 1212A └─ Escherichia coli (1-81/82) 1044A
| DNA-damage-inducible protein I | (149) |
| hypothetical protein | (127) |
| putative DNA damage-inducible protein | (36) |
| Protein ImpC | (22) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933V | (5) |
| putative damage-inducible protein dinI-like | (5) |
| orf, conserved hypothetical protein | (3) |
| Virulence protein msgA | (1) |
| Virulence protein MsgA | (1) |
| orf; Unknown function | (1) |
| unknown protein encoded within CP-933O | (1) |
| putative damage-inducible protein | (1) |
| phenotype | (1) |
| Others | (5) |