┌─ Escherichia coli (408-525/799) 2362-75 (18) ┌┴─ Escherichia coli (416-533/807) H299 ┌┴─ Escherichia coli (408-525/799) 536 (6) ┌┴─ Escherichia coli (408-525/799) NC101 ┌┴─ Escherichia coli (416-533/564) IAI39 (4) ┌┴─ Escherichia coli (416-533/807) 042 (1) ┌┴┬─ Escherichia coli (3-109/383) 1044A (22) ┌┤ └─ Escherichia coli (413-530/804) O157:H7 EDL933 │└┬─ Escherichia coli (416-533/807) B354 ┌────────────────────────────────────────────────┤ └─ fig|1040638.4.peg.4236 O104:H4 (28-145/419) str. LB226692 (51) │ └─ Escherichia coli (416-533/807) K12 (15) │ ┌─ Escherichia coli (717-842/1105) 536 (25) │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) O83:H1 str. NRG 857C │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) 2362-75 │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) H299 │ ┌┴─ Escherichia coli (619-744/1007) B171 (6) │ ┌┴──── Escherichia coli (44-169/436) O157:H7 str. EC4024 │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) IAI1 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (223-348/611) O26:H11 str. 11368 │ ┌┴─ Escherichia coli (561-686/949) 53638 (4) │ ┌┴─ Escherichia coli (713-838/1101) B str. REL606 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) 83972 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (717-842/1105) K12 (77) │ ┌┴─ Escherichia coli (567-692/955) MS 124-1 (1) │ ┌───────────────────┴─ Escherichia coli (717-842/1105) TA143 │ ┌────────┤ ┌─ Escherichia coli (272-394/661) MS 21-1 │ │ └─────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (272-394/661) 042 (17) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (272-394/661) 536 (23) │ │ └┬─ Escherichia coli (127-249/516) MS 115-1 │ ┌─────┤ └┬─ Escherichia coli (272-394/661) 101-1 (39) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (272-394/431) O111:H- str. 11128 │ │ │ └─ Escherichia coli (272-394/661) K12 (47) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (211-326/341) IAI39 (2) ┤ │ └─────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (211-326/341) MS 69-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (211-326/341) K12 (97) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (254-369/384) MS 21-1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (254-369/384) B171 (4) │ ┌────────┤ │┌┴─ Escherichia coli (254-369/384) MS 182-1 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (254-369/384) SE15 │ │ │ └┬┴─ fig|1040638.4.peg.3865 O104:H4 (211-326/341) str. LB226692 (3) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (211-326/341) O157:H7 EDL933 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (254-369/384) H591 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (211-326/341) 101-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (254-369/384) 53638 (5) │ │ └───────────────────────────────── Escherichia coli (4-108/369) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌─ Escherichia coli (164-293/298) 042 (7) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (162-291/296) MS 21-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (162-299/303) MS 69-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (162-291/296) H299 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (162-291/296) IAI39 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (162-291/296) K12 (51) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (162-291/296) B185 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (162-291/296) ED1a (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (162-291/296) 2362-75 (25) │ │ │└┬─ Escherichia coli (162-291/296) 101-1 (6) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (162-291/296) HS (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (162-288/293) MS 124-1 └──┤ ┌─────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (162-291/296) 1044A (24) │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (162-291/296) H591 │ │ └──────────────────────┬─ Escherichia coli (217-341/344) MS 21-1 (1) │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (217-341/344) B354 (2) │ │ └────────────────────────┬─ Escherichia coli (330-453/460) MS 115-1 │ │ └──┬─ Escherichia coli (330-453/460) FVEC1302 (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (330-453/460) MS 124-1 (1) │ │ └─ Escherichia coli (330-453/460) K12 (96) │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3031 O104:H4 (224-348/349) str. LB226692 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (282-406/407) MS 107-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (282-406/407) IAI39 (3) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (282-406/407) 2362-75 (28) │ │ │└┬─ Escherichia coli (283-407/408) K12 (35) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (282-406/407) O26:H11 str. 11368 │ │ │└┬─ Escherichia coli (282-406/407) FVEC1302 (3) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (282-406/407) SE11 │ │ ││ └─ Escherichia coli (282-406/407) 101-1 (19) │ │ │└┬─ Escherichia coli (282-406/407) B185 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (282-406/407) 1044A (26) │ │ ┌───────────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (282-406/407) TA280 └──────┤ │ │ └┬─ Escherichia coli (282-406/407) TA143 │ │ │ └─ Escherichia coli (282-406/407) B354 │┌───────┤ └┬─ Escherichia coli (282-406/407) MS 69-1 ││ │ └─ Escherichia coli (283-407/408) 042 (1) ││ │ ┌──────────────── Escherichia coli (277-392/395) MS 21-1 ││ └───────────────┤ ┌─ Escherichia coli (325-439/442) B088 (24) ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (291-405/408) 1827-70 ││ └─┬┴─ Escherichia coli (325-439/442) 042 (70) ││ └┬─ Escherichia coli (291-405/408) MS 21-1 ││ └┬─ Escherichia coli (325-439/442) MS 115-1 ││ └─ Escherichia coli (325-439/442) K12 (33) ││ ┌─ Escherichia coli (288-408/410) B354 (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (308-428/430) ATCC 8739 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli (308-428/430) 2362-75 (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (308-428/430) 1212A ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (288-408/410) WV_060327 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (308-428/430) K12 (104) └┤ ┌──────────────────┤└─ Escherichia coli (308-428/430) 042 (1) │ │ └─ Escherichia coli (308-428/430) 83972 (14) │ │ ┌─ Escherichia coli (13-140/142) E2348/69 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-112/114) 2362-75 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (429-556/558) 83972 (10) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (429-556/558) 536 (5) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (404-531/533) 042 (12) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (429-556/558) MS 69-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (429-556/558) APEC O1 (6) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (276-403/405) HS (1) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (429-556/558) E24377A (1) │ │ ││ └─ Escherichia coli (435-562/564) 53638 (26) │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (122-249/251) MS 198-1 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3484 O104:H4 (122-249/251) str. LB226692 (5) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (440-567/569) K12 (42) │ │ ┌──────────────────────┤└─ Escherichia coli (435-562/564) O157:H7 EDL933 (1) └───┤ │ └─ Escherichia coli (429-556/558) 101-1 │ ┌────────┤ ┌─ Escherichia coli (381-495/496) 1044A (34) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (381-495/496) M718 │ │ └───────────────────────────────┬┴─ Escherichia coli (381-495/496) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli (441-555/556) B7A (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (381-495/496) O103:H2 str. 12009 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (441-555/556) K12 (88) │ ││ └┬─ Escherichia coli (381-495/496) IAI39 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (381-495/496) IAI1 (1) │ ││ ┌─ Escherichia coli (335-461/472) B171 (1) │ │└─────────────────────────┤┌─ fig|1040638.4.peg.4274 O104:H4 (335-461/472) str. LB226692 (70) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (178-304/315) ATCC 8739 (1) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (178-304/315) K12 (11) │ │ └┬─ Escherichia coli (335-460/472) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli (335-461/472) B7A (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (335-461/472) MS 21-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (335-461/472) WV_060327 └─────┤ └─ Escherichia coli (335-461/472) 042 (32) │ ┌─ Escherichia coli (245-369/371) MS 69-1 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (245-369/371) 1044A (25) │ ┌┴─ Escherichia coli (245-361/362) MS 196-1 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (240-364/366) 1827-70 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (245-369/371) K12 (66) │ │└┬─ Escherichia coli (245-369/371) 2362-75 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (245-369/371) E2348/69 (1) │ ┌──────────────────────┤└─ fig|1040638.4.peg.5068 O104:H4 (240-364/366) str. LB226692 (25) │ │ └─ Escherichia coli (240-364/366) KO11 (2) │ │ ┌─ Escherichia coli (313-439/443) MS 187-1 └───┤ ┌┴─ Escherichia coli (313-439/443) 55989 (2) │ ┌──────────────┴─ Escherichia coli (313-440/443) E24377A (3) │ │ ┌────────────── Escherichia coli (214-341/344) TA280 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (314-444/444) WV_060327 └───────┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (361-491/491) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (117-241/241) 1827-70 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (361-491/491) HS (1) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (361-491/491) K12 (82) └─────┤ │ └┬─ Escherichia coli (314-444/444) O157:H7 str. EC4024 (10) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (314-444/444) B354 │ ┌┤└─ Escherichia coli (361-491/491) O103:H2 str. 12009 │ ┌─────────────────────┤└─ Escherichia coli (314-444/444) 536 (28) │ │ └─ Escherichia coli (314-444/444) 2362-75 (2) │ │ ┌─ Escherichia coli (356-493/493) M718 └──────┤ ┌┴─ Escherichia coli (356-493/493) B185 │ ┌┴─ Escherichia coli (339-476/476) 1044A (25) │ │ ┌─ Escherichia coli (315-444/455) 83972 (13) └────┤ ┌┴─ Escherichia coli (315-444/455) MS 45-1 │┌┴─ Escherichia coli (315-444/455) 536 (9) └┤ ┌─ Escherichia coli (339-473/473) ETEC H10407 └┬┴─ Escherichia coli (315-452/452) 53638 (1) └┬─ Escherichia coli (315-452/452) K12 (43) └┬─ Escherichia coli (339-476/476) MS 187-1 └─ Escherichia coli (114-251/251) H736 (2)
| hypothetical protein | (82) |
| Inner membrane protein YfiN | (15) |
| Sensory box/GGDEF domain protein | (11) |
| Heme-regulated cyclic AMP phosphodiesterase (EC 3.1.4.-) | (10) |
| Inner membrane protein YeaI | (10) |
| Putative two-component response regulator and GGDEF family protein YeaJ | (8) |
| Protein YaiC | (8) |
| Putative Heme-regulated two-component response regulator | (4) |
| FIG00639031: hypothetical protein | (2) |
| GGDEF family protein | (2) |
| Sensory box/GGDEF family protein | (1) |
| COG2199: FOG: GGDEF domain | (1) |
| probable membrane protein STY2194 | (1) |
| FIG00638322: hypothetical protein | (1) |
| Others | (6) |