┌─ Escherichia coli (1-368/376) CFT073 ├─ Escherichia coli (1-368/376) E2348/69 ┌┼─ Escherichia coli (1-368/376) WV_060327 ┌┤└─ Escherichia coli (1-368/376) CFT073 │└┬─ Escherichia coli (1-368/376) TA206 │ └┬─ Escherichia coli (1-368/376) ABU 83972 ┌───┤ └─ Escherichia coli (1-368/376) 83972 │ │┌─ Escherichia coli (1-368/376) 536 ┌─────────────────────────────┤ └┼─ Escherichia coli (1-368/376) F11 │ │ └─ Escherichia coli (1-368/376) 536 ┌───────────────────────┤ └────── Escherichia coli (1-368/376) M605 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-375/389) TA280 │ └─────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (2-375/389) MS 69-1 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-375/389) 042 │ │┌┴─ Escherichia coli (2-375/389) 042 │ └┤┌─ Escherichia coli (2-375/389) FVEC1412 │ └┼─ Escherichia coli (2-375/389) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (2-375/389) MS 198-1 │ └─ Escherichia coli (2-375/389) FVEC1302 │ ┌─ Escherichia coli (5-393/401) CFT073 │ ┌┴─ Escherichia coli (5-393/401) MS 185-1 │ ┌─────────────────────────┴┬─ Escherichia coli (1-373/381) MS 45-1 ┤ │ └─ Escherichia coli (1-373/381) CFT073 │ │ ┌─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ ┌┴─ Escherichia coli UMN026 │ │ │ ┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 └─────────────────────────────────────────┤ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ ││└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ ││┌─ Escherichia coli 1125A │ │ │││ ┌─ Escherichia coli 536A │ │ │└┤┌┼─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │ ││└─ Escherichia coli O157:H7 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli 1212A │ │ ┌┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai └────────────────┤┌┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││││ └─ Escherichia coli 1044A │││└─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ││└─ Escherichia coli B185 ││ ┌─ Escherichia coli 101-1 ││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ├─ Escherichia coli B str. REL606 ││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││ ├─ Escherichia coli DH1 ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ││ ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ││ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ││ │├─ Escherichia coli BW2952 ││ ┌┤├─ Escherichia coli BL21 ││ ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ││└─ Escherichia coli 1827-70 ││ ┌┤└┬─ Escherichia coli HS ││ ││ └─ Escherichia coli HS ││ ┌┤└─ Escherichia coli H736 ││ │└┬─ Escherichia coli W3110 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli K12 ││ │└┬─ Escherichia coli 53638 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli 53638 └┤ ││┌─ Escherichia coli W │ │└┤ ┌─ Escherichia coli EC4100B │ │ │┌┴─ Escherichia coli SE11 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli SE11 │ ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli W │ ││ └┬─ Escherichia coli HS │ ││ └─ Escherichia coli HS │ ┌┤│┌─ Escherichia coli 55989 │ ││└┼─ Escherichia coli 55989 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.4173 O104:H4 str. LB226692 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ││ └─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │┌┤└┬─ Escherichia coli E110019 │││ └─ Escherichia coli E110019 ││└─ Escherichia coli 1827-70 ││ ┌─ Escherichia coli IAI1 ││ ┌┴─ Escherichia coli IAI1 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli MS 84-1 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli MS 124-1 ││ │└┬─ Escherichia coli E24377A ││ ┌┤ └─ Escherichia coli E24377A ││ │└┬─ Escherichia coli ED1a ││ ┌┤ └─ Escherichia coli ED1a ││┌┤└─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 └┤│└┬─ Escherichia coli (1-366/368) B7A ││ └┬─ Escherichia coli E24377A ││ └─ Escherichia coli E24377A ││ ┌─ Escherichia coli 1044A ││ ├─ Escherichia coli 536A ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ││ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 └┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤│└─ Escherichia coli 1125A │ ││└─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││┌─ Escherichia coli O157:H7 │ ┌┤└┼─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ││ └─ Escherichia coli 1212A │┌┤└─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │││┌─ fig|1040638.4.peg.904 O104:H4 str. LB226692 ││└┤ ┌─ Escherichia coli IAI1 ││ └┬┴─ Escherichia coli IAI1 ││ └┬─ Escherichia coli EC4100B ││ └┬─ Escherichia coli 55989 └┤ └─ Escherichia coli 55989 │┌─ Escherichia coli SE15 ││ ┌─ Escherichia coli 53638 ││ ┌┴─ Escherichia coli 53638 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli ATCC 8739 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli ATCC 8739 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli ETEC H10407 │┌┤└─ Escherichia coli ETEC H10407 ││└┬─ Escherichia coli MS 107-1 ││ └┬─ Escherichia coli (20-421/421) O103:H2 str. 12009 ││ └┬─ Escherichia coli E22 └┤ └─ Escherichia coli (20-421/421) E22 │ ┌─ Escherichia coli (20-421/421) B7A │ ┌┴─ Escherichia coli B7A │┌┴─ Escherichia coli MS 145-7 └┤┌─ Escherichia coli WV_060327 ││ ┌─ Escherichia coli IAI39 └┤ ┌┼─ Escherichia coli SMS-3-5 │┌┤└─ Escherichia coli IAI39 ││└─ Escherichia coli MS 119-7 └┤┌─ Escherichia coli MS 145-7 ││ ┌─ Escherichia coli EC4100B └┤┌┴─ Escherichia coli W ││ ┌─ Escherichia coli 042 ││ ┌┼─ Escherichia coli UMN026 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli FVEC1412 │┌┤└─ Escherichia coli 042 ││└┬─ Escherichia coli W ││ └─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 └┤ ┌─ Escherichia coli B171 │ ┌┼─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │┌┤└─ Escherichia coli B171 ││└┬─ Escherichia coli B7A └┤ └─ Escherichia coli B7A │┌─ Escherichia coli W └┤┌─ fig|1040638.4.peg.3869 O104:H4 str. LB226692 ││ ┌─ Escherichia coli IAI1 └┤┌┴─ Escherichia coli IAI1 ││ ┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 └┤ ┌┴─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │┌┴─ Escherichia coli MS 107-1 └┤┌─ Escherichia coli 55989 │├─ Escherichia coli E24377A └┼─ Escherichia coli SE11 ├─ Escherichia coli MS 119-7 ├─ Escherichia coli E24377A └─ Escherichia coli 55989
| putative virulence protein | (141) |
| Peyer's patch-specific virulence factor GipA | (11) |
| Transposase | (8) |
| Putative IS element transposase | (3) |
| putative factor; Not classified | (2) |
| putative factor | (1) |
| putative transposase | (1) |
| Others | (3) |