┌─ Escherichia coli (3-144/293) 1044A (24) ┌┴─ Escherichia coli (3-144/293) O157:H7 EDL933 (1) ┌┴─ Escherichia coli (3-144/293) B185 ┌┴─ Escherichia coli (3-144/293) B171 (19) ┌┴─ fig|1040638.4.peg.4278 O104:H4 (3-144/293) str. LB226692 (13) ┌┴─ Escherichia coli (3-144/293) MS 21-1 ┌┴┬─ Escherichia coli (3-144/293) 53638 (9) │ └┬─ Escherichia coli (3-144/291) FVEC1302 (3) ┌┤ └─ Escherichia coli (3-144/291) 042 (1) │└┬─ Escherichia coli (3-144/293) K12 (24) │ └┬─ Escherichia coli (3-144/293) 536 (22) ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-144/293) 2362-75 (2) ││ └─ Escherichia coli (3-144/293) WV_060327 ┌───────────────────────────┤└─ Escherichia coli (3-144/293) SMS-3-5 ┌─────┤ └─ Escherichia coli (3-144/291) H299 │ └───────────────────────────── Escherichia coli (3-141/311) MS 119-7 ┌┤ ┌─ Escherichia coli (3-146/245) 042 (5) ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-146/292) 1044A (26) │└──┬─────────────────────────┴─ Escherichia coli (3-146/292) B354 (4) │ └─────────┬─────────────────────────────────────────── Escherichia coli (1-134/297) TA206 │ └─────────────────────────────┬─ Escherichia coli (4-135/311) 1044A (29) │ └┬─ Escherichia coli (4-135/311) 2362-75 (32) │ └─ Escherichia coli (4-135/311) K12 (68) │ ┌─ Escherichia coli (12-137/316) MS 185-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (12-143/316) MS 124-1 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (12-143/316) K12 (72) │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (12-143/316) ATCC 8739 (1) │ ┌──────────────┴──────────────── Escherichia coli (1-143/324) K12 (126) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-142/297) EC4100B │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-142/297) SMS-3-5 ┤ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-142/297) K12 (87) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-142/297) 53638 (1) │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-142/297) E22 (2) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-142/297) B171 (1) │ │ ┌────────┤└─ Escherichia coli (3-142/297) FVEC1302 (5) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-142/297) 83972 (12) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-142/297) E2348/69 (1) │ │ ┌─────────────┤ └─ Escherichia coli (3-142/297) 2362-75 (12) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-151/294) IAI39 (1) │ │ │ └────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (6-151/294) B354 (1) │ │ │ └──┬┴─ Escherichia coli (6-151/294) K12 (15) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-151/294) 536 (10) │ │ ┌─────┤ └┬─ Escherichia coli (6-151/294) 2362-75 (27) │ │ │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.2817 O104:H4 (6-151/294) str. LB226692 (2) └──┤ │ │ └─ Escherichia coli (11-156/299) E22 (2) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-147/296) FVEC1302 (1) │ │ └──────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-147/297) H299 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (29-175/325) 53638 (2) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-147/296) B354 │ ┌─┤ └┬┴─ Escherichia coli (3-147/296) IAI1 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-147/297) K12 (90) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (17-170/319) UMN026 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (22-175/324) 042 (4) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-147/296) 2362-75 (16) │ │ │ └─ Escherichia coli (22-175/324) APEC O1 (7) │ │ └───────────────────┬─ Escherichia coli (1-140/305) K12 (132) │ │ └─ Escherichia coli (1-140/305) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-140/307) O157:H7 str. EC4486 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-132/299) O55:H7 str. CB9615 (24) │ │ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.5351 O104:H4 (4-132/299) str. LB226692 (7) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-140/307) E22 (1) └─┤ ┌┤└─ Escherichia coli (4-132/299) 042 [2] │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-140/307) TA143 (2) │ │└┬─ Escherichia coli (16-144/311) MS 115-1 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (4-132/299) MS 198-1 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (4-140/307) FVEC1302 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (8-140/307) MS 69-1 │ ┌─────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (4-132/299) H591 (28) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-132/299) K12 (11) │ │ │ └─ Escherichia coli (7-144/311) 101-1 (3) │ │ └─ Escherichia coli (4-132/299) TA280 │ │ ┌─ Escherichia coli (48-197/354) O157:H7 EDL933 (25) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (48-197/354) M718 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-150/307) O111:H- str. 11128 └───┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (48-197/354) MS 21-1 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (48-197/354) K12 (8) │ ┌┤└─ Escherichia coli (48-197/354) E2348/69 (46) │ ┌┤└─ Escherichia coli TA280 │ │└┬─ Escherichia coli (48-197/354) E110019 (1) │ ┌────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (48-197/354) B7A (6) │ │ └─ fig|1040638.4.peg.4161 O104:H4 str. LB226692 │ │ ┌─ fig|6666666.5357.peg.2018 TY-2482 (2-144/312) strain (2) └────┤ ┌─────────────────────────────────────┴──── Escherichia coli (2-144/299) M718 (4) │ ┌───────┴─────────────── Escherichia coli (2-142/296) B7A (7) │ │ ┌─ Escherichia coli (5-141/308) 2362-75 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-141/308) MS 69-1 └───┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-141/308) K12 (106) │ ┌────────────┴─ Escherichia coli (5-141/308) O157:H7 str. EC4486 │ │ ┌─ Escherichia coli (9-151/223) 536 (4) └──────┤ ┌─────────────┴─ Escherichia coli (9-151/302) CFT073 (2) [2] │ ┌──┴──────────────── Escherichia coli (1-162/295) 101-1 └──────────────┤ ┌─ Escherichia coli (2-150/302) TA271 └───────────────┬┴─ Escherichia coli (2-150/302) SE11 └┬─ fig|1040638.4.peg.4749 O104:H4 (2-150/302) str. LB226692 (32) └┬─ Escherichia coli (2-150/302) IAI39 (1) └┬─ Escherichia coli (2-150/302) 53638 (1) └─ Escherichia coli (2-150/302) K12 (21)
| LysR family transcriptional regulator YneJ | (14) |
| Cyn operon transcriptional activator | (13) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (10) |
| HTH-type transcriptional regulator IlvY | (10) |
| LysR family transcriptional regulator YdcI | (9) |
| Xanthosine operon regulatory protein XapR, LysR family | (6) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (4) |
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (4) |
| Alkanesulfonate utilization operon LysR-family regulator CbI | (3) |
| Transcriptional activator protein LysR | (3) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (3) |
| LysR family transcriptional regulator STM2281 | (3) |
| Hydrogen peroxide-inducible genes activator | (2) |
| Cys regulon transcriptional activator CysB | (1) |
| Putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| Hypothetical transcriptional regulator ycjZ | (1) |
| Malonate utilization transcriptional regulator | (1) |
| putative transcriptional regulator LYSR-type | (1) |
| LysR family transcriptional regulator near succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase | (1) |
| Cys regulator cbl | (1) |
| Others | (6) |