┌─ Escherichia coli (114-167/225) 042 ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 ├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 ├─ Escherichia coli (104-157/215) CFT073 ├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 ├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 ├─ Escherichia coli (104-157/215) E110019 ├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 ├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 ├─ Escherichia coli (127-180/238) E22 ├─ Escherichia coli (114-167/225) E24377A ┌┼─ Escherichia coli (43-96/154) E24377A │├─ Escherichia coli (114-167/225) E24377A │├─ Escherichia coli (82-135/193) E22 │├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │├─ Escherichia coli (104-157/215) E22 │├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 ┌─────┤├─ Escherichia coli (114-167/225) E110019 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │├─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │└─ Escherichia coli (114-167/225) 2362-75 │ │ ┌─ Escherichia coli (114-167/225) B171 ┌───────────────────────────────┤ └─┼─ Escherichia coli (114-167/225) B171 │ │ └─ Escherichia coli (114-167/225) B171 │ │ ┌─ Escherichia coli (105-169/216) H299 │ │ ┌───┼─ Escherichia coli (105-169/216) MS 182-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (105-169/216) MS 124-1 │ │ │┌─ Escherichia coli (19-72/127) 53638 │ │ ││┌─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ └────────────────────┤│├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ └┤├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ └┼─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 ┌───────┤ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (105-169/213) 53638 │ │ └─ Escherichia coli (59-123/167) 53638 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ │ │┌─ Escherichia coli (22-95/134) H299 │ │ ││┌─ fig|1040638.4.peg.210 O104:H4 (22-78/134) str. LB226692 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ └─────────────────────────────────┤│├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (22-78/134) E110019 │ └┤├─ Escherichia coli (22-78/134) E110019 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) E22 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) ED1a │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) F11 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) FVEC1302 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) FVEC1412 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) UM146 │ │├─ Escherichia coli (22-78/134) UMN026 │ └┼─ Escherichia coli (22-78/134) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) SE15 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) MS 185-1 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) MS 116-1 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) F11 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) ED1a │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) E22 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) E110019 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) E110019 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 ┤ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ Escherichia coli (22-78/134) B171 │ ├─ fig|6666666.5357.peg.4488 TY-2482 (22-78/134) strain │ └─ Escherichia coli (22-78/134) MS 21-1 │ ┌─ fig|1040638.4.peg.2517 O104:H4 (23-89/144) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (23-89/144) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (24-90/145) 042 │ ┌┼─ fig|6666666.5357.peg.3445 TY-2482 (23-89/144) strain │ │├─ Escherichia coli (24-90/145) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (23-89/144) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (23-89/144) MS 198-1 │ ┌────────────────────┤├─ Escherichia coli (23-89/144) ED1a │ │ │├─ Escherichia coli (23-89/144) 55989 │ │ │└─ Escherichia coli (23-89/144) 042 │ ┌────┤ └┬─ Escherichia coli (23-89/144) TA280 │ │ │ └─ Escherichia coli (24-91/125) B088 │ │ └───────────────────────────┬─── Escherichia coli (24-86/136) TA271 │ │ └─ Escherichia coli (24-86/136) MS 182-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) 042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/118) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/77) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (25-93/144) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/124) ED1a │ │ ├─ fig|1040638.4.peg.682 O104:H4 (22-90/141) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) ED1a │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) H591 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) SMS-3-5 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (22-90/98) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) MS 145-7 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) ETEC H10407 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) 042 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) H299 │ │ │├─ Escherichia coli (22-90/124) ED1a │ │ │├─ Escherichia coli (1-69/77) O103:H2 str. 12009 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) SE15 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC869 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) MS 107-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-69/120) 55989 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (1-69/120) 55989 └──────────────────────────┤ ││└┬─ Escherichia coli (14-71/122) MS 175-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (22-90/141) HS │ ││ └─ Escherichia coli (1-69/120) HS │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) O103:H2 str. 12009 │ ││┌┼─ Escherichia coli (1-69/120) O55:H7 str. CB9615 │ │││└─ Escherichia coli (1-69/120) O103:H2 str. 12009 │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-69/120) B171 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (22-90/141) B171 │ ││ │├─ Escherichia coli (22-90/141) E2348/69 │ ││ └┼─ Escherichia coli (22-90/141) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ├─ Escherichia coli (22-90/141) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-69/120) E22 │ ││ └─ Escherichia coli (1-69/120) 2362-75 │ ││ ┌─ Escherichia coli (22-86/141) E110019 │ ││┌┴─ Escherichia coli (22-86/141) E110019 │ ┌┤└┤┌─ fig|1040638.4.peg.979 O104:H4 (22-90/141) str. LB226692 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (1-69/120) 55989 │ ││ │├─ Escherichia coli (22-90/141) ED1a │ ││ └┼─ Escherichia coli (22-90/141) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (22-90/141) ED1a │ ┌─┤│ ├─ Escherichia coli (22-90/141) EC4100B │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-69/120) 55989 │ │ │└─┬── fig|1040638.4.peg.356 O104:H4 (1-70/112) str. LB226692 │ │ │ └── Escherichia coli (1-69/80) O103:H2 str. 12009 │ ┌───┤ │ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) 536 │ │ │ └──────┼─ Escherichia coli (1-69/120) MS 200-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) F11 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-69/120) 536 │ │ └─┬── Escherichia coli (1-69/137) O26:H11 str. 11368 │ │ └─── Escherichia coli (1-69/111) M605 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) MS 200-1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. Sakai └────────┤ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) 1125A │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 str. EC4486 │ ┌──┼─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) MS 116-1 │ │ ├─ Escherichia coli (22-90/141) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4113 └───┤ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 EDL933 │ └─ Escherichia coli (1-69/120) 536A │ ┌─ Escherichia coli (22-90/131) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (1-69/120) FVEC1412 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-69/120) UMN026 │ │└─ Escherichia coli (1-69/120) FVEC1302 │┌┤┌─ Escherichia coli (1-69/120) MS 69-1 ││└┼─ Escherichia coli (22-90/141) ABU 83972 ││ └─ Escherichia coli (1-69/120) CFT073 ││┌─── Escherichia coli (22-92/141) 536 └┤│ ┌─ Escherichia coli (26-96/145) F11 ││ ├─ Escherichia coli (1-71/120) 536 ││┌──────┼─ Escherichia coli (1-71/120) F11 │││ └─ Escherichia coli (1-71/120) 536 └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (1-69/120) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (1-69/120) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (1-69/120) O26:H11 str. 11368 └┤ ┌┼─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4401 │┌┤├─ Escherichia coli (1-69/120) O157:H7 str. EC4076 │││├─ Escherichia coli (1-69/120) 536A │││└─ Escherichia coli (1-69/120) 1125A ││└┬─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 EDL933 └┤ └─ Escherichia coli (22-90/141) O157:H7 EDL933 │ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) ABU 83972 │┌┴─ Escherichia coli (1-69/120) MS 185-1 ││ ┌─ Escherichia coli (1-69/120) F11 └┤ ├─ Escherichia coli (1-69/120) UTI89 │┌┼─ Escherichia coli (1-69/120) UTI89 ││└─ Escherichia coli (1-69/120) UM146 └┤ ┌───── fig|6666666.5357.peg.4616 TY-2482 (22-83/84) strain │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.416 O104:H4 str. LB226692 │ │ ┌─┼─ Escherichia coli ED1a └──────────────┤ │ └─ Escherichia coli 55989 │ │ ┌─ Escherichia coli (22-91/94) TA271 │ │ ├─ Escherichia coli (1-70/73) ETEC H10407 └──────┤ ├─ Escherichia coli (1-70/73) MS 84-1 │┌┼─ Escherichia coli (1-70/73) NC101 ││├─ Escherichia coli (1-70/73) MS 124-1 ││└─ Escherichia coli (22-91/94) MS 200-1 ││┌─ Escherichia coli (22-83/84) 55989 └┤├─ Escherichia coli (22-83/84) 83972 │├─ Escherichia coli (22-83/84) SE15 │├─ Escherichia coli (1-62/63) 042 │├─ Escherichia coli (1-62/63) H299 │├─ Escherichia coli (1-62/63) MS 45-1 └┼─ Escherichia coli (1-62/63) TA206 ├─ Escherichia coli (1-62/63) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (1-62/63) ABU 83972 ├─ fig|1040638.4.peg.670 O104:H4 (1-62/63) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (22-83/84) CFT073 ├─ Escherichia coli (22-83/84) 55989 └─ Escherichia coli (22-83/84) 042
ISSfl3 orfA | (119) |
Insertion Sequence Associated | (59) |
unknown in ISEc8 | (29) |
hypothetical protein | (21) |
IS, phage, Tn; Transposon-related functions | (18) |
transposase 3 | (13) |
conserved hypothetical protein | (6) |
unknown in putative ISEc8 | (2) |
COG2963: Transposase and inactivated derivatives | (1) |
Unknown in ISEc8 | (1) |
Unknown protein encoded by ISEc8 | (1) |
Others | (10) |