┌─ fig|1040638.4.peg.2153 O104:H4 (26-314/323) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (26-314/323) 55989 ├─ Escherichia coli (26-314/323) B088 ├─ Escherichia coli (26-314/323) B171 ├─ Escherichia coli (26-314/323) B7A ├─ Escherichia coli (26-314/323) E22 ├─ Escherichia coli (26-314/323) E24377A ├─ Escherichia coli (26-314/323) H591 ├─ Escherichia coli (26-314/323) IAI1 ├─ Escherichia coli (26-314/323) M718 ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 115-1 ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (26-314/323) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (26-314/323) TA271 ┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) W │├─ Escherichia coli (26-314/323) W │├─ Escherichia coli (26-314/323) SE11 │├─ Escherichia coli (26-314/323) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 107-1 │├─ Escherichia coli (26-314/323) KO11 ┌┤├─ Escherichia coli (26-314/323) IAI1 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) EC4100B ││├─ Escherichia coli (26-314/323) E24377A ││├─ Escherichia coli (26-314/323) E22 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) B7A ││├─ Escherichia coli (26-314/323) B171 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) 55989 ││└─ fig|6666666.5357.peg.618 TY-2482 (26-314/323) strain │└┬─ Escherichia coli (26-314/323) O111:H- str. 11128 │ └┬─ Escherichia coli (26-314/323) E110019 │ └─ Escherichia coli (26-314/323) E110019 │ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) 042 │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 198-1 ┌┤ ├─ Escherichia coli (26-314/323) TA280 ││ ┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) UMN026 ││ │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 69-1 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (26-314/323) FVEC1412 ││ ││└─ Escherichia coli (26-314/323) 042 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (26-314/323) B354 ││ │└─ Escherichia coli (26-314/323) TA143 ││ ┌┤┌─ Escherichia coli (26-314/323) IAI39 ││ │└┼─ Escherichia coli (26-314/323) TA206 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (26-314/323) IAI39 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-284/293) SMS-3-5 ││┌┤ └─ Escherichia coli (26-314/323) MS 21-1 │││└─ Escherichia coli (26-314/323) B185 │││ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) MS 146-1 │└┤┌┴─ Escherichia coli (26-314/323) MS 187-1 │ ││┌─ Escherichia coli (26-314/323) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 26-314/323) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (26-314/323) DH1 ┌┤ └┤├─ Escherichia coli (26-314/316) H736 ││ │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 116-1 ││ │├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 196-1 ││ │├─ Escherichia coli (26-314/323) str. K-12 substr. DH10B ││ │├─ Escherichia coli (26-314/323) str. K-12 substr. MG1655 ││ └┼─ Escherichia coli (26-314/323) str. K-12 substr. MG1655 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) str. K-12 substr. DH10B ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) W3110 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 175-1 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) K12 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) BW2952 ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) BL21 ││ └─ Escherichia coli (26-314/323) 101-1 ││ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) M605 ││┌┴─ Escherichia coli (26-314/323) SE15 │││ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) 2362-75 │││┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) O127:H6 str. E2348/69 │└┤│└─ Escherichia coli (26-314/323) E2348/69 │ ││ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) APEC O1 │ ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) IHE3034 ┌┤ ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) S88 ││ └┤ ├─ Escherichia coli (26-314/323) UTI89 ││ │┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) UTI89 ││ ││├─ Escherichia coli (26-314/323) UM146 ││ ││├─ Escherichia coli (26-314/323) NC101 ││ ││└─ Escherichia coli (26-314/323) APEC O1 ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) 83972 ││ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) CFT073 ││ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) MS 185-1 ││ │┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) MS 45-1 ││ ││├─ Escherichia coli (26-314/323) CFT073 ││ └┤└─ Escherichia coli (26-314/323) ABU 83972 ┌┤│ │ ┌─ Escherichia coli (26-314/323) F11 │││ │┌┼─ Escherichia coli (26-314/323) MS 200-1 │││ └┤└─ Escherichia coli (26-314/323) F11 │││ │┌─ Escherichia coli (26-314/323) ED1a │││ └┼─ Escherichia coli (26-314/323) WV_060327 │││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O83:H1 str. NRG 857C │││ └─ Escherichia coli (26-314/323) ED1a │││┌─ Escherichia coli (26-314/323) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli (26-314/323) HS ││└┼─ Escherichia coli (26-314/323) HS ││ ├─ Escherichia coli (26-314/323) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (26-314/323) 1827-70 │└┬─ Escherichia coli (26-314/323) 53638 ┌┤ └─ Escherichia coli (26-314/323) 53638 ││┌─ Escherichia coli (26-314/323) 1125A ││├─ Escherichia coli (26-314/323) 536A ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4113 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4196 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4401 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4501 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC869 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. FRIK966 ││├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. TW14359 │└┼─ Escherichia coli (26-314/323) O55:H7 str. CB9615 ┌───────────────────────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4115 ┌──┤ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (26-314/323) 1212A │ │ │ └─ Escherichia coli (26-314/323) 1044A │ │ └─ Escherichia coli (26-314/323) H299 │ └─────┬───────────────────────────────────── Escherichia coli (10-303/318) TA206 │ └─────────────────────────── Escherichia coli (3-286/294) O157:H7 str. EC4024 │ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) 1044A │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) 1212A │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. TW14359 │ ┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4206 │ ┌┤├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4115 │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) 536A │ ││└─ Escherichia coli (7-289/304) 1125A │ ┌┤└─ Escherichia coli (7-289/304) M718 │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) O111:H- str. 11128 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (7-289/304) O26:H11 str. 11368 │ ││┌┴─ Escherichia coli (7-289/304) B088 │ │││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) HS │ │││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) KO11 │ │└┤┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) W │ │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) W │ │ ││└─ Escherichia coli (7-289/304) HS │ │ └┤┌─ Escherichia coli (7-289/304) 1827-70 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) ATCC 8739 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (7-289/304) BL21 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 115-1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (7-289/304) OP50 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 187-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3 7-289/304) BL21(DE3) │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) B str. REL606 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) ATCC 8739 │ ││ └─ Escherichia coli (7-289/304) 101-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) IAI39 │ ││┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) SMS-3-5 │ │││└─ Escherichia coli (7-289/304) IAI39 │ │└┤┌─ Escherichia coli (7-289/304) B185 │ ┌┤ ││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) B354 │ ││ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) MS 21-1 │ ││ │┌┤└─ Escherichia coli (7-289/304) ETEC H10407 │ ││ ││└─ Escherichia coli (7-289/304) MS 69-1 │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) 042 │ ││ │┌┴─ Escherichia coli (7-289/304) 042 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (7-289/304) TA280 │ ││ └┤┌─ Escherichia coli (7-289/304) FVEC1412 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) TA143 │ ││ └┼─ Escherichia coli (7-289/304) UMN026 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 198-1 │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (7-289/304) FVEC1302 │ ││└┬─ Escherichia coli (7-289/304) SE15 │ ││ └─ Escherichia coli (7-289/304) M605 │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) 2362-75 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) H299 │ ││┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) WV_060327 │ │││├─ Escherichia coli (7-289/304) O127:H6 str. E2348/69 │ │││└─ Escherichia coli (7-289/304) E2348/69 │ │││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) APEC O1 │ │││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) ED1a │ │││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) IHE3034 ┤ │└┤ ├─ Escherichia coli (7-289/304) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) UM146 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) UTI89 │ │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) UTI89 │ │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) S88 │ │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) NC101 │ │ ││├─ Escherichia coli (7-289/304) ED1a │ │ └┤└─ Escherichia coli (7-289/304) APEC O1 │ │ │┌─ Escherichia coli (7-289/304) 536 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) ABU 83972 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (7-289/304) CFT073 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) F11 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 200-1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (7-289/304) TA206 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 45-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 185-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) 83972 │ ││ └─ Escherichia coli (7-289/304) 536 │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-289/304) H591 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 182-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) SE11 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (7-289/304) TA271 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 78-1 │ ││┌┤└─ Escherichia coli (7-289/304) MS 119-7 │ │││└┬─ Escherichia coli (7-289/304) E110019 │ │││ └─ Escherichia coli (7-289/304) E110019 │ │││┌─ Escherichia coli (7-289/304) B7A │ ┌┤││├─ Escherichia coli (7-289/304) DH1 │ ││││├─ Escherichia coli (7-289/304) E24377A │ ││└┤├─ Escherichia coli (7-289/304) H736 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 107-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 145-7 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 196-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) str. K-12 substr. DH10B │ ││ │├─ Escherichia coli (7-289/304) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ └┼─ Escherichia coli (7-289/304) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) str. K-12 substr. DH10B │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) W3110 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 146-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 116-1 │ ┌─────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (7-289/304) K12 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) EC4100B │ │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) E24377A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (7-289/304) BW2952 │ │ ││ └─ Escherichia coli (7-289/304) B7A │ │ │└┬─ Escherichia coli (7-289/304) 53638 │ │ │ └─ Escherichia coli (7-289/304) 53638 │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.4342 TY-2482 (7-289/304) strain │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) 55989 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) B171 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) IAI1 │ │ │├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 84-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (7-289/304) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) B171 │ │ ├─ Escherichia coli (7-289/304) 55989 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5493 O104:H4 (7-289/304) str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (12-283/297) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (12-283/297) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (12-283/297) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (12-283/297) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌─────────────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (12-283/297) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-283/297) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-283/297) W3110 │ │ │ └─ Escherichia coli (12-283/297) DH1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-297/308) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) APEC O1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) F11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) IHE3034 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) MS 200-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) S88 └─┤ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) UM146 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-297/308) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (30-318/329) TA206 │ │ │├─ Escherichia coli (30-318/329) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) MS 185-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-297/308) F11 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-297/308) CFT073 │ │ ││├─ Escherichia coli (30-318/329) APEC O1 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-297/308) ABU 83972 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (9-297/308) 536 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (30-318/329) SE15 │ │ ││ └─ Escherichia coli (9-297/308) M605 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (30-318/329) WV_060327 │ │ ││┌─ Escherichia coli (9-297/308) IAI39 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-297/308) M718 │ │ │└┼─ Escherichia coli (30-318/329) SMS-3-5 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) MS 69-1 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (9-297/308) IAI39 │ │ ││ └─ Escherichia coli (9-297/308) B185 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (30-318/329) 2362-75 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (30-318/329) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │└┤└─ Escherichia coli (30-318/329) E2348/69 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (9-297/308) TA143 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (9-297/308) B354 │ │ ┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (8-296/307) 042 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (8-296/307) FVEC1412 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (9-297/308) UMN026 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (9-297/308) MS 198-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (9-297/308) FVEC1302 │ │ ││ └─ Escherichia coli (30-318/329) 042 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (9-297/308) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││┌─ Escherichia coli (9-297/308) 1212A │ │ ││├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 │ │ ││├─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 str. Sakai │ │ │└┼─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 str. TW14588 └───────┤ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) 536A │ ┌──────────────────────┤ └─ Escherichia coli (9-297/308) 1044A │ │ │┌─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4024 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4045 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ └┼─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (8-296/307) O157:H7 str. FRIK966 │ ┌───┤ ├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (30-318/329) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-297/308) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ └─ Escherichia coli (9-297/308) 1125A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-293/299) FVEC1412 │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-293/299) MS 69-1 │ │ └──────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (12-293/299) UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli (12-293/299) TA143 │ │ ├─ Escherichia coli (12-293/299) MS 198-1 │ │ └─ Escherichia coli (12-293/299) FVEC1302 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-292/299) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-292/299) O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC508 │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4206 │ │ ┌──────────────────────────────┤├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) O157:H7 EDL933 │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-292/299) 536A │ │ │ │└─ Escherichia coli (8-292/299) 1125A │ │ │ └─ Escherichia coli (8-292/299) M718 └──────┤ │ ┌─ Escherichia coli (2-289/302) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) B str. REL606 │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 2-289/302) BL21(DE3) │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) HS │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-289/302) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/302) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/302) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 187-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-289/302) HS │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-289/302) ETEC H10407 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) BW2952 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) BL21 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) ATCC 8739 │ │ ││└─ Escherichia coli (2-289/302) 1827-70 │ │ │└┬─ Escherichia coli (2-289/302) 53638 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-289/302) 53638 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-289/302) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) E24377A │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 78-1 │ │ │└┼─ Escherichia coli (2-289/302) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) E24377A │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (2-289/302) E22 │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-289/302) B171 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-289/302) H591 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) IAI1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 115-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) O111:H- str. 11128 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-289/302) W │ │ │└┼─ Escherichia coli (2-289/302) W └─┤ │ ├─ Escherichia coli (2-289/302) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-289/302) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-289/302) IAI1 │ ││ └─ Escherichia coli (2-289/302) EC4100B │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-289/302) B088 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-289/302) E110019 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 124-1 │ ││┌┼─ Escherichia coli (2-289/302) MS 84-1 │ │││├─ Escherichia coli (2-289/302) MS 107-1 │ ┌┤└┤└─ Escherichia coli (2-289/302) E110019 │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (2-289/302) B7A │ ││ │┌┼─ Escherichia coli (2-289/302) MS 145-7 │ ││ └┤└─ Escherichia coli (2-289/302) B7A │ ││ │┌─ fig|6666666.5357.peg.766 TY-2482 (2-289/302) strain │ ┌───────────────────┤│ └┼─ Escherichia coli (2-289/302) 55989 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (2-289/302) 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.4749 O104:H4 (2-289/302) str. LB226692 │ │ │└┬─ Escherichia coli (2-289/302) SE11 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-289/302) TA271 │ │ └┬─ Escherichia coli (2-289/302) IAI39 │ │ └─ Escherichia coli (2-289/302) IAI39 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-293/294) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (9-299/300) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-293/294) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (3-293/294) 536A │ │ ┌──┤│└─ Escherichia coli (3-293/294) 1125A │ │ │ │└─ Escherichia coli (3-293/294) O55:H7 str. CB9615 └─┤ │ │┌─ Escherichia coli (3-293/294) B185 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-293/294) 042 │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (3-293/294) 042 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-293/294) FVEC1302 │ │ └┤├─ Escherichia coli (3-293/294) M718 │ ┌─────────────────────┤ │├─ Escherichia coli (3-293/294) MS 69-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-293/294) TA280 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-293/294) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) TA143 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) MS 198-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-293/294) FVEC1412 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-293/294) B354 │ │ └─── Escherichia coli (4-294/295) 101-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-295/297) 536 │ │ ├─ Escherichia coli (1-295/297) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (1-295/297) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (1-295/297) NC101 │ │ ├─ Escherichia coli (1-295/297) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (1-295/297) UTI89 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-295/297) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (1-295/297) UM146 │ │ │├─ Escherichia coli (1-295/297) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (1-295/297) M605 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (26-320/322) APEC O1 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-295/297) 536 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-282/284) TA206 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-295/297) MS 45-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-295/297) ABU 83972 │ │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (1-295/297) CFT073 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-295/297) WV_060327 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-295/297) MS 185-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (26-320/322) CFT073 │ │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (1-295/297) 83972 └──────┤ ││└┬─ Escherichia coli (1-295/297) TA143 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-295/297) M718 │ ││ └─ Escherichia coli (1-295/297) B185 │ │└┬─ Escherichia coli (1-295/297) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (1-295/297) SMS-3-5 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-295/297) 042 │ ││├─ Escherichia coli (1-295/297) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (1-295/297) IAI39 │ ││├─ Escherichia coli (1-295/297) MS 198-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-295/297) MS 69-1 │ │└┼─ Escherichia coli (1-295/297) UMN026 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-295/297) SE15 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-295/297) MS 21-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-295/297) IAI39 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-295/297) FVEC1412 │ ┌────────────┤│ ├─ Escherichia coli (1-295/297) B354 │ │ ││ └─ Escherichia coli (15-309/311) 042 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-295/297) H299 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-295/297) 2362-75 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-295/297) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (26-320/322) E2348/69 │ │ ┌─ Escherichia coli E110019 │ │ ┌┴─ Escherichia coli E110019 │ │ │ ┌─ Escherichia coli 042 │ │ │ ├─ Escherichia coli 2362-75 │ │ │ ├─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ │ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli E2348/69 └────┤ │ ├─ Escherichia coli ED1a │ │ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ ├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ ├─ Escherichia coli UMN026 │ │ ┌┼─ Escherichia coli WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli TA280 │ │ │├─ Escherichia coli SE15 │ │ │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli M605 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli ED1a └───────────────────┤ ││├─ Escherichia coli CFT073 │ ││├─ Escherichia coli B354 │ ││├─ Escherichia coli 83972 │┌┤│└─ Escherichia coli 042 │││└─ Escherichia coli H299 │││┌─ Escherichia coli MS 185-1 ││││┌─ Escherichia coli TA206 ││└┤│┌─ Escherichia coli 536 ││ ││├─ Escherichia coli APEC O1 ││ └┤├─ Escherichia coli F11 ││ │├─ Escherichia coli MS 200-1 ││ │├─ Escherichia coli S88 ││ │├─ Escherichia coli UTI89 ││ └┼─ Escherichia coli UTI89 ││ ├─ Escherichia coli UM146 ││ ├─ Escherichia coli NC101 ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli F11 ││ ├─ Escherichia coli APEC O1 ││ └─ Escherichia coli 536 └┤┌─ Escherichia coli B185 ││ ┌─ Escherichia coli B088 ││ ├─ Escherichia coli E24377A ││ ├─ Escherichia coli H591 ││ ├─ Escherichia coli IAI1 ││ ├─ Escherichia coli MS 107-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 124-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 84-1 ││ ├─ Escherichia coli SE11 ││ ┌┼─ Escherichia coli W ││ │├─ Escherichia coli W ││ │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ││ │├─ Escherichia coli MS 78-1 ││ │├─ Escherichia coli MS 145-7 ││ │├─ Escherichia coli MS 119-7 ││ ┌┤├─ Escherichia coli KO11 ││ ││├─ Escherichia coli IAI1 └┤ ││├─ Escherichia coli EC4100B │ ││└─ Escherichia coli E24377A │┌┤│┌─ fig|6666666.5357.peg.1427 TY-2482 strain │││└┼─ Escherichia coli 55989 │││ ├─ Escherichia coli 55989 │││ └─ fig|1040638.4.peg.4093 O104:H4 str. LB226692 ││└─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ ┌─ Escherichia coli B str. REL606 ││ ├─ Escherichia coli B171 ││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││ ├─ Escherichia coli DH1 ││ ├─ Escherichia coli E22 ││ ├─ Escherichia coli HS ││ ├─ Escherichia coli K12 ││ ├─ Escherichia coli MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 187-1 ││ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli W3110 ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B └┤ ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli OP50 │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli MS 116-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli HS │ ││├─ Escherichia coli H736 │ ││├─ Escherichia coli E22 │ ││├─ Escherichia coli BW2952 │┌┤│├─ Escherichia coli BL21 ││││└─ Escherichia coli B171 │││└─ Escherichia coli (1-289/290) 101-1 ││└─ Escherichia coli ETEC H10407 ││ ┌─ Escherichia coli ATCC 8739 ││┌┼─ Escherichia coli MS 115-1 └┤│└─ Escherichia coli ATCC 8739 ││┌─ Escherichia coli 1125A ││├─ Escherichia coli 536A ││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 └┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli 1212A └─ Escherichia coli 1044A
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (129) |
| Transcriptional regulator LysR family, yafC | (127) |
| Putative LysR-like transcriptional regulator | (126) |
| LysR family transcriptional regulator YcjZ | (119) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (76) |
| Transcriptional regulator | (31) |
| putative transcriptional regulator LYSR-type | (10) |
| Hypothetical transcriptional regulator yafC | (3) |
| putative transcriptional regulator | (2) |
| Hypothetical transcriptional regulator ycjZ | (1) |
| transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| Others | (8) |