┌─ Escherichia coli (3-314/343) NC101 ┌┴─ Escherichia coli (3-314/343) 2362-75 (27) ┌┴─ Escherichia coli (3-314/343) TA206 ┌┴─ Escherichia coli (3-314/343) MS 21-1 ┌┴─ Escherichia coli (3-314/343) B185 (4) ┌┴┬─ Escherichia coli (3-314/343) 1044A (24) ┌┤ └─ Escherichia coli (3-314/343) K12 (20) ┌┤└─ Escherichia coli (3-314/343) 53638 (1) │└┬─ fig|1040638.4.peg.2734 O104:H4 (3-314/343) str. LB226692 (36) ┌─────────────┤ └┬─ Escherichia coli (3-314/343) IAI1 (4) │ │ └─ Escherichia coli (3-314/343) MS 124-1 (1) ┌──────────────┤ └─ Escherichia coli (3-314/343) MS 115-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-314/346) O111:H- str. 11128 │ └───────────┤┌─ Escherichia coli (3-309/346) B171 (4) │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-313/346) M718 │ └┤┌┴─ Escherichia coli (3-314/346) 53638 (1) │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-314/346) B185 │ └┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3225 O104:H4 (3-314/346) str. LB226692 (3) │ │┌┴┬─ Escherichia coli (3-314/346) 1044A (25) │ └┤ └─ Escherichia coli (3-314/346) IAI39 (1) │ └┬─ Escherichia coli (3-314/346) K12 (12) ┌─────────┤ └┬─ Escherichia coli (5-316/348) 042 (40) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-314/346) B7A (6) │ │ └─ Escherichia coli (3-314/346) 101-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (14-331/350) O111:H- str. 11128 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-331/350) B185 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-318/337) K12 (25) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (22-339/358) 042 (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-331/350) B354 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-331/350) TA143 │ └─────────────────────────┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (14-331/350) IAI39 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (14-331/350) O83:H1 str. NRG 857C (1) │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-318/337) B171 (8) │ ││└┬─ Escherichia coli (1-318/337) B088 (10) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-318/337) SMS-3-5 ┌──┤ └┤ └─ Escherichia coli (14-331/350) FVEC1302 (3) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (14-331/350) 1044A (25) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-331/350) MS 21-1 │ │ │┌┴┬─ Escherichia coli (14-331/350) MS 69-1 │ │ └┤ └─ fig|1040638.4.peg.2577 O104:H4 (14-331/350) str. LB226692 (6) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (14-331/350) NC101 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (14-331/350) 536 (11) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-318/337) H299 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-318/337) HS (1) │ │ └─ Escherichia coli (14-331/350) 101-1 (5) │ │ ┌─ Escherichia coli (5-322/356) MS 116-1 │ │ ┌────────────────┴─ Escherichia coli (5-322/356) H736 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-310/367) O157:H7 str. EC4042 │ └─────────────────────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (8-319/363) APEC O1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-316/360) M605 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-316/360) 536 (8) │ └───────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-316/360) H299 │ │ ┌┴┬─── Escherichia coli (1-316/360) CFT073 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-316/360) 83972 (7) │ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-316/360) TA206 │ ││└─ Escherichia coli (1-316/360) O83:H1 str. NRG 857C │ └┤┌─ Escherichia coli (1-316/360) 2362-75 (22) │ ││┌─ Escherichia coli (1-316/360) TA143 │ └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-316/360) B088 (6) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (8-319/320) E22 │ └┤ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (1-316/360) str. LB226692 (5) │ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-316/360) MS 115-1 ┌──┤ ││└┬─ Escherichia coli (8-319/363) E2348/69 (4) │ │ └┤ └─ Escherichia coli (8-319/363) 042 (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-316/360) MS 21-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-316/360) SMS-3-5 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-316/360) FVEC1302 (3) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-316/360) HS [2] │ │ └┬─ Escherichia coli (8-319/363) K12 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-316/360) 1827-70 (29) │ │ └─ Escherichia coli (1-316/360) E24377A [2] │ │ ┌─ Escherichia coli (8-323/342) APEC O1 (11) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-323/342) M605 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-323/342) 83972 (5) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-323/342) 536 (4) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (8-323/342) E110019 (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-306/325) FVEC1412 (1) │ │ │└┬─ Escherichia coli (8-323/342) 1125A (12) │ │ ┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 (8-323/342) str. LB226692 (53) │ │ │└┬─ Escherichia coli (8-323/342) B354 (2) │ │ ┌──────────────────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (8-323/342) MS 21-1 │ │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (8-323/342) M718 │ │ │ └───────────────────────── Escherichia coli (12-323/344) 83972 (13) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-315/315) MS 145-7 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-315/315) ED1a (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-315/315) 536 (12) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-315/315) 101-1 (2) │ │ │ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.942 O104:H4 (6-315/315) str. LB226692 (54) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-315/315) TA280 │ └──┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-315/315) K12 (8) │ │ │└┬─ Escherichia coli (6-315/315) B088 (16) │ │ ┌────────────────────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (6-315/315) 042 (1) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (6-315/315) TA143 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-315/315) 1125A (21) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-315/315) O157:H7 EDL933 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (6-315/315) 1044A (4) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-313/331) 1125A (43) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-313/331) FVEC1412 (3) │ └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (24-334/352) B354 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-313/331) SE11 │ │ ┌─────────────────────────────────────────────────┤ └─ fig|1040638.4.peg.2778 O104:H4 (3-313/331) str. LB226692 (19) ┌──┤ │ │ └─ Escherichia coli (3-313/331) 536 (4) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (14-319/343) ETEC H10407 (3) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (14-319/343) 83972 (7) │ │ │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.666 O104:H4 (14-319/343) str. LB226692 (6) │ │ └──┤ ┌────────────────────┴─ Escherichia coli (14-319/343) TA271 │ │ │ ┌────────────┴────────────────── Escherichia coli (14-326/339) H299 (1) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-302/321) O157:H7 EDL933 (1) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-302/321) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-312/331) 1044A (41) │ │ │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (6-312/331) str. LB226692 (13) │ │ └───────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (6-312/331) MS 21-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-312/331) MS 185-1 │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-312/331) 042 (60) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-312/331) M718 │ │ │ ┌────────────┤ └─ Escherichia coli (6-308/313) K12 │ │ └─────────┤ └─ Escherichia coli (6-312/331) 101-1 (7) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-318/332) MS 124-1 (1) │ │ └────────────────────┤┌─ Escherichia coli (7-318/332) MS 196-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (7-318/332) K12 (29) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-318/332) ED1a (2) │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (7-318/332) APEC O1 (5) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (7-318/332) 83972 (9) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (7-318/332) MS 145-7 │ │ └┬─ Escherichia coli (7-318/332) B7A (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (7-318/332) M718 │ │ └┬─ Escherichia coli (7-318/332) F11 (2) │ │ └─ Escherichia coli (7-318/332) 536 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-307/330) 101-1 (48) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (9-318/341) ED1a (1) ┌──┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-307/330) H736 (1) │ │ │ ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 (3-307/330) str. LB226692 (3) │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (9-318/341) 55989 (2) │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (9-318/341) K12 (64) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (9-318/341) M605 │ │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-307/330) SE15 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (9-318/341) MS 69-1 │ │ │ ┌─────────────────────────┤└─ Escherichia coli (9-318/341) 2362-75 (2) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (9-318/341) MS 115-1 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-321/341) 2362-75 (13) │ │ └─────┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-321/341) ABU 83972 (3) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-321/341) K12 (75) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-304/324) B088 │ │ │ ┌────────────────┴─ Escherichia coli (3-321/341) E24377A (1) │ │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (3-311/327) 2362-75 │ │ └────────────────┤┌─ Escherichia coli (3-311/327) M605 (1) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-311/327) H591 (2) │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-311/327) E24377A (6) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-314/330) E24377A │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-314/330) K12 (12) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-314/330) ATCC 8739 [2] │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-314/330) APEC O1 [2] │ │ └┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.1465 O104:H4 (3-311/327) str. LB226692 (78) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-311/327) B str. REL606 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-311/327) 1212A (1) │ │ └─ Escherichia coli (3-311/327) B354 │ │ ┌──────── Escherichia coli (1-330/336) O157:H7 str. EC4024 ┤ │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A (24) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ └─────────────────────────────────┤ │ ┌─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli B088 (23) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli E110019 (1) │ └──┤ ┌┴┬─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli K12 (25) │ │ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 str. LB226692 (5) │ │┌┤└─ Escherichia coli MS 69-1 │ ││└─ Escherichia coli M718 │ └┤ ┌─ Escherichia coli H299 │ │┌┴─ Escherichia coli TA280 │ └┤┌─ Escherichia coli IAI39 (1) │ └┤ ┌─ Escherichia coli MS 21-1 │ │┌┴─ Escherichia coli SMS-3-5 │ └┤ ┌─ Escherichia coli WV_060327 │ │┌┴─ Escherichia coli APEC O1 (6) │ └┤┌─ Escherichia coli ED1a (2) │ └┤ ┌─ Escherichia coli 2362-75 (14) │ └┬┴─ Escherichia coli NC101 │ └┬─ Escherichia coli SE15 │ └─ Escherichia coli M605 │ ┌─ Escherichia coli (8-321/335) 2362-75 (12) │ ┌┴─ Escherichia coli (8-321/335) IAI39 (1) │ ┌──┴─ Escherichia coli (8-321/335) MS 124-1 (1) │ ┌───────────────────────────┴─── Escherichia coli (7-330/334) MS 115-1 │ ┌───────────────┴───────────────────────────────── Escherichia coli (1-325/332) 101-1 (5) └──────┤ ┌─ Escherichia coli (15-335/339) 1827-70 (6) └──────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) O111:H- str. 11128 └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) K12 (22) ││┌─ Escherichia coli (3-323/327) 53638 (1) └┤│ ┌─ Escherichia coli (3-323/327) B171 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) MS 124-1 (1) └┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.2229 O104:H4 (3-323/327) str. LB226692 (20) │┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) TA271 ││ ┌─ Escherichia coli (3-323/327) B185 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) 042 (6) │┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) MS 69-1 └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) M718 └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) 1044A (23) └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) O157:H7 EDL933 [2] ││ ┌─ Escherichia coli (3-323/327) MS 115-1 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) TA280 │┌┴─ Escherichia coli (3-323/327) B354 └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) 536 (1) └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) NC101 └┤┌─ Escherichia coli (3-323/327) O83:H1 str. NRG 857C └┤ ┌─ Escherichia coli (3-323/327) H299 └┬┴─ Escherichia coli (3-323/327) F11 (3) └┬─ Escherichia coli (3-323/327) 83972 (5) └┬─ Escherichia coli (3-323/327) 2362-75 (2) └┬─ Escherichia coli (3-323/327) APEC O1 (9) └─ Escherichia coli (3-323/327) ED1a (2)
| Transcriptional repressor of the lac operon | (25) |
| Evolved beta-D-galactosidase transcriptional repressor | (25) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (21) |
| AscBF operon repressor | (20) |
| Trehalose operon transcriptional repressor | (12) |
| Galactose operon repressor, GalR-LacI family of transcriptional regulators | (11) |
| Positive regulator of L-idonate catabolism | (11) |
| Ribose operon repressor | (11) |
| Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (11) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (10) |
| Transcriptional (co)regulator CytR | (10) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (9) |
| Sucrose specific transcriptional regulator CscR, LacI family | (5) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (5) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (5) |
| Sucrose operon repressor ScrR, LacI family | (4) |
| Fructose repressor FruR, LacI family | (1) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (1) |
| Others | (13) |