┌─ fig|1040638.4.peg.4061 O104:H4 str. LB226692 ├─ Escherichia coli 042 ├─ Escherichia coli 101-1 ├─ Escherichia coli 53638 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli ATCC 8739 ├─ Escherichia coli B str. REL606 ├─ Escherichia coli B171 ├─ Escherichia coli B185 ├─ Escherichia coli B7A ├─ Escherichia coli BL21 ├─ Escherichia coli BW2952 ├─ Escherichia coli E22 ├─ Escherichia coli E24377A ├─ Escherichia coli EC4100B ├─ Escherichia coli FVEC1302 ├─ Escherichia coli H299 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli IAI1 ├─ Escherichia coli IAI39 ├─ Escherichia coli K12 ├─ Escherichia coli M718 ├─ Escherichia coli MS 115-1 ├─ Escherichia coli MS 119-7 ├─ Escherichia coli MS 145-7 ├─ Escherichia coli MS 175-1 ├─ Escherichia coli MS 187-1 ├─ Escherichia coli MS 198-1 ├─ Escherichia coli MS 69-1 ├─ Escherichia coli MS 84-1 ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli OP50 ├─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli TA271 ├─ Escherichia coli UMN026 ├─ Escherichia coli W ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli W3110 │├─ Escherichia coli W │├─ Escherichia coli TA280 │├─ Escherichia coli TA143 │├─ Escherichia coli SE11 │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli MS 78-1 │├─ Escherichia coli MS 21-1 │├─ Escherichia coli MS 196-1 │├─ Escherichia coli MS 182-1 │├─ Escherichia coli MS 146-1 │├─ Escherichia coli MS 124-1 │├─ Escherichia coli MS 116-1 │├─ Escherichia coli MS 107-1 │├─ Escherichia coli KO11 │├─ Escherichia coli IAI39 │├─ Escherichia coli IAI1 │├─ Escherichia coli HS │├─ Escherichia coli H736 │├─ Escherichia coli FVEC1412 ┌┤├─ Escherichia coli ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli E24377A ││├─ Escherichia coli E22 ││├─ Escherichia coli DH1 ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli B7A ││├─ Escherichia coli B354 ││├─ Escherichia coli B171 ││├─ Escherichia coli B088 ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli 53638 ││├─ Escherichia coli 1827-70 ││├─ Escherichia coli 042 ││└─ fig|6666666.5357.peg.3277 TY-2482 strain ││ ┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 ││┌┴─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │││┌─ Escherichia coli 1125A │││├─ Escherichia coli 536A │││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ┌────────────────────────────────────────────────────────────────┤││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │└┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 ┤ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ └─ Escherichia coli 1044A │ └┬─ Escherichia coli E110019 │ └─ Escherichia coli E110019 │ ┌─ Escherichia coli (15-180/194) 1125A │ ┌──────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (15-180/194) O157:H7 │ │ └─ Escherichia coli (15-180/194) 536A │ │ ┌────────────── Escherichia coli (11-169/175) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4042 └────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. TW14588 └────────────────────────────────────────┤ ┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) 536A │ │└─ Escherichia coli (12-161/178) 1125A │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.4175 O104:H4 (12-161/178) str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) 55989 └─────────┤ ├─ Escherichia coli (12-161/178) H591 │ ┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) TA271 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) 55989 │┌┤└─ fig|6666666.5357.peg.4835 TY-2482 (12-161/178) strain │││┌─ Escherichia coli (12-161/178) E22 ││└┼─ Escherichia coli (12-161/178) O103:H2 str. 12009 ││ └─ Escherichia coli (12-161/178) E22 ││ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) IAI1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 124-1 ││┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) MS 84-1 │││└─ Escherichia coli (12-161/178) IAI1 │││ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) 101-1 │││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) B str. REL606 │││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) B7A └┤│ ├─ Escherichia coli (DE3 12-161/178) BL21(DE3) ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) DH1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) E110019 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) E24377A ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) HS ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) K12 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 116-1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 187-1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 78-1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O26:H11 str. 11368 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) W └┤ ├─ Escherichia coli (12-161/178) W3110 │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) W │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) OP50 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) KO11 │ │├─ Escherichia coli (12-161/178) HS │┌┤├─ Escherichia coli (12-161/178) H736 │││├─ Escherichia coli (12-161/178) EC4100B │││├─ Escherichia coli (12-161/178) E24377A │││├─ Escherichia coli (12-161/178) E110019 │││├─ Escherichia coli (12-161/178) BW2952 │││├─ Escherichia coli (12-161/178) BL21 │││├─ Escherichia coli (12-161/178) B7A │││├─ Escherichia coli (12-161/178) ATCC 8739 └┤│└─ Escherichia coli (12-161/178) 1827-70 │└─ Escherichia coli (12-161/178) SMS-3-5 │┌─ Escherichia coli (12-161/178) MS 115-1 ││ ┌─ Escherichia coli (12-178/178) H299 ││ ┌┼─ Escherichia coli (12-178/178) TA280 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (12-178/178) MS 69-1 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (12-178/178) B185 ││ │└─ Escherichia coli (12-178/178) NC101 ││ ┌┤┌─ Escherichia coli (12-178/178) 042 └┤ │└┼─ Escherichia coli (12-178/178) B354 │ │ └─ Escherichia coli (12-178/178) 042 │┌┤┌─ Escherichia coli (12-161/178) 53638 │││├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 21-1 ││└┼─ Escherichia coli (12-161/178) TA143 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) M718 ││ └─ Escherichia coli (12-161/178) 53638 └┤ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (12-161/178) M605 │┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) UMN026 ││├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 198-1 ││└─ Escherichia coli (12-161/178) FVEC1412 └┤┌─ Escherichia coli (12-161/178) SE15 ││ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) O83:H1 str. NRG 857C ││ ├─ Escherichia coli (12-161/178) UM146 └┤┌┼─ Escherichia coli (12-161/178) UTI89 ││├─ Escherichia coli (12-161/178) UTI89 ││├─ Escherichia coli (12-161/178) S88 ││└─ Escherichia coli (12-161/178) IHE3034 ││ ┌─ Escherichia coli (12-161/178) ED1a └┤ ┌┴─ Escherichia coli (12-161/178) ED1a │┌┴┬─ Escherichia coli (12-161/178) E2348/69 ││ └─ Escherichia coli (12-161/178) 2362-75 ││┌─ Escherichia coli (12-161/178) 536 ││├─ Escherichia coli (12-161/178) ABU 83972 └┤├─ Escherichia coli (12-161/178) CFT073 │├─ Escherichia coli (12-161/178) F11 │├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 200-1 │├─ Escherichia coli (12-161/178) TA206 └┼─ Escherichia coli (12-161/178) WV_060327 ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 45-1 ├─ Escherichia coli (12-161/178) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (12-161/178) F11 ├─ Escherichia coli (12-161/178) CFT073 ├─ Escherichia coli (12-161/178) 83972 └─ Escherichia coli (12-161/178) 536
| Transcriptional regulator yidN, Cro/CI family | (122) |
| Putrescine utilization regulator | (102) |
| hypothetical protein | (2) |
| Transcriptional regulator | (1) |
| Others | (4) |