┌─ fig|6666666.5357.peg.3962 TY-2482 (8-143/312) strain ├─ Escherichia coli (8-143/312) 042 ├─ Escherichia coli (8-143/312) 1044A ├─ Escherichia coli (8-143/312) 1212A ├─ Escherichia coli (8-143/312) 2362-75 ├─ Escherichia coli (8-143/312) 536 ├─ Escherichia coli (8-143/312) 53638 ├─ Escherichia coli (8-143/312) 55989 ├─ Escherichia coli (8-143/312) 83972 ├─ Escherichia coli (8-143/312) APEC O1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (8-143/312) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (8-143/312) B171 ├─ Escherichia coli (8-143/312) B354 ├─ Escherichia coli (8-143/312) B7A ├─ Escherichia coli (DE3 8-143/312) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (8-143/312) CFT073 ├─ Escherichia coli (8-143/312) DH1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) E110019 ├─ Escherichia coli (8-143/312) E22 ├─ Escherichia coli (8-143/312) E24377A ├─ Escherichia coli (8-143/312) EC4100B ├─ Escherichia coli (8-143/312) ED1a ├─ Escherichia coli (8-143/312) F11 ├─ Escherichia coli (8-143/312) FVEC1302 ├─ Escherichia coli (8-143/312) H299 ├─ Escherichia coli (8-143/312) H736 ├─ Escherichia coli (8-143/312) HS ├─ Escherichia coli (8-143/312) IAI1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) IAI39 ├─ Escherichia coli (8-143/312) K12 ├─ Escherichia coli (8-143/312) M605 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 175-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 185-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 200-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 69-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (8-143/312) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (8-143/312) OP50 ├─ Escherichia coli (8-143/312) SE11 ├─ Escherichia coli (8-143/312) SMS-3-5 ├─ Escherichia coli (8-143/312) TA206 ├─ Escherichia coli (8-143/312) TA280 ├─ Escherichia coli (8-143/312) UMN026 ├─ Escherichia coli (8-143/312) UTI89 ├─ Escherichia coli (8-143/312) W ├─ Escherichia coli (8-143/312) WV_060327 ├─ Escherichia coli (8-143/312) str. K-12 substr. DH10B ┌┼─ Escherichia coli (8-143/312) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (8-143/312) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (8-143/312) str. K-12 substr. DH10B │├─ Escherichia coli (8-143/312) W3110 │├─ Escherichia coli (8-143/312) W │├─ Escherichia coli (8-143/312) UTI89 │├─ Escherichia coli (8-143/312) UM146 │├─ Escherichia coli (8-143/312) TA271 │├─ Escherichia coli (8-143/312) TA143 │├─ Escherichia coli (8-143/312) SE15 │├─ Escherichia coli (8-143/312) S88 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O83:H1 str. NRG 857C │├─ Escherichia coli (8-143/312) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (8-143/312) O127:H6 str. E2348/69 │├─ Escherichia coli (8-143/312) NC101 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 198-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 182-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 146-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 124-1 │├─ Escherichia coli (8-143/312) MS 116-1 ┌┤├─ Escherichia coli (8-143/312) M718 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) KO11 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) IHE3034 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) IAI39 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) IAI1 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) HS ││├─ Escherichia coli (8-143/312) H591 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) FVEC1412 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) F11 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) ED1a ││├─ Escherichia coli (8-143/312) E24377A ││├─ Escherichia coli (8-143/312) E2348/69 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) E22 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) E110019 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) CFT073 ││├─ Escherichia coli (8-143/312) BW2952 ┌┤│├─ Escherichia coli (8-143/312) BL21 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) B7A │││├─ Escherichia coli (8-143/312) B185 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) B171 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) APEC O1 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) ABU 83972 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 55989 │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 536A ┌──────────────────────────────────────────┤││├─ Escherichia coli (8-143/312) 53638 │ │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 536 │ │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 1827-70 │ │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 1125A │ │││├─ Escherichia coli (8-143/312) 101-1 │ │││└─ Escherichia coli (8-143/312) 042 │ ││└┬─ Escherichia coli (8-143/312) MS 115-1 │ ││ └─ Escherichia coli (8-143/312) MS 21-1 │ │└─ Escherichia coli (8-143/312) O111:H- str. 11128 │ └─ Escherichia coli (8-143/312) B088 │ ┌─ Escherichia coli (1-139/293) O157:H7 EDL933 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-139/293) O157:H7 EDL933 │ ┌────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-139/291) H299 │ ┌──────┴────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (12-142/297) TA206 │ ┌───────┴───────────────────────────── Escherichia coli (8-149/320) MS 146-1 ┤ │ ┌───────────────────────────────────────── fig|1040638.4.peg.4031 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-142/294) 2362-75 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-147/299) APEC O1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) ED1a │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) M605 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 119-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 21-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) SE15 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) TA206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) UM146 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) UTI89 └──────┤ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-142/294) WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) TA271 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) SMS-3-5 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) SE11 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) O111:H- str. 11128 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 84-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 124-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 107-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) IHE3034 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) H299 │ │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) ED1a │ │ ││└─ Escherichia coli (9-142/294) APEC O1 │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.2817 O104:H4 (9-142/294) str. LB226692 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (9-142/294) 55989 └────┤ │└┤└─ Escherichia coli (9-142/294) 55989 │ ┌┤ │┌─ Escherichia coli (9-142/294) E22 │ ││ └┼─ Escherichia coli (9-142/294) O103:H2 str. 12009 │ ││ └─ Escherichia coli (14-147/299) E22 │ ││┌─ Escherichia coli (9-142/294) 536 │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) ABU 83972 │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (9-142/294) F11 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 200-1 │ ││└┼─ Escherichia coli (9-142/294) MS 45-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 185-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (14-147/299) F11 │ ││ ├─ Escherichia coli (14-147/299) CFT073 │ ││ ├─ Escherichia coli (9-142/294) 83972 │ ││ └─ Escherichia coli (9-142/294) 536 │ │└┬─ Escherichia coli (9-142/294) TA143 │ ┌──────────────────────┤ └─ Escherichia coli (9-142/294) B354 │ │ │┌─ Escherichia coli (9-142/294) 53638 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) DH1 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) H736 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 175-1 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (9-142/294) str. K-12 substr. DH10B │ │ └┼─ Escherichia coli (9-142/294) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (9-142/294) BW2952 └───────────────┤ └─ Escherichia coli (14-147/299) 53638 │ ┌─ Escherichia coli (3-144/297) SMS-3-5 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-144/297) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 45-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) UM146 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-144/297) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (3-144/297) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (3-144/297) S88 │ │ │├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 185-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-144/297) CFT073 │ │ │├─ Escherichia coli (3-144/297) APEC O1 │ │ │└─ Escherichia coli (3-144/297) ABU 83972 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (3-144/297) 536 └──────────┤ ││├─ Escherichia coli (3-144/297) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (3-144/297) F11 │ ││├─ Escherichia coli (3-144/297) H299 │ ││├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 200-1 │ ││├─ Escherichia coli (3-144/297) SE15 │ │└┼─ Escherichia coli (3-144/297) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (3-144/297) NC101 │┌┤ ├─ Escherichia coli (3-144/297) M605 │││ ├─ Escherichia coli (3-144/297) F11 │││ ├─ Escherichia coli (3-144/297) ED1a │││ ├─ Escherichia coli (3-144/297) 536 │││ └─ Escherichia coli (3-144/297) 2362-75 │││┌─ Escherichia coli (3-144/297) FVEC1412 │││├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 69-1 ││└┼─ Escherichia coli (3-144/297) UMN026 ││ ├─ Escherichia coli (3-144/297) TA280 └┤ ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 198-1 │ └─ Escherichia coli (3-144/297) FVEC1302 │┌─ Escherichia coli (3-144/297) EC4100B ││ ┌─ Escherichia coli (3-144/297) E22 ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-144/297) O103:H2 str. 12009 ││┌┤└─ Escherichia coli (3-144/297) E22 │││└┬─ Escherichia coli (3-144/297) B171 │││ └─ Escherichia coli (3-144/297) B171 │││ ┌─ Escherichia coli (3-144/297) 53638 │││┌┴─ Escherichia coli (3-144/297) 53638 └┤││┌─ fig|6666666.5357.peg.3526 TY-2482 (3-144/297) strain │││├─ Escherichia coli (3-144/297) 042 │││├─ Escherichia coli (3-144/297) 1044A │││├─ Escherichia coli (3-144/297) 1212A │││├─ Escherichia coli (3-144/297) 536A │││├─ Escherichia coli (3-144/297) 55989 │││├─ Escherichia coli (3-144/297) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli (3-144/297) B088 └┤│├─ Escherichia coli (3-144/297) B354 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) B7A ││├─ Escherichia coli (DE3 3-144/297) BL21(DE3) ││├─ Escherichia coli (3-144/297) DH1 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) E110019 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) E24377A ││├─ Escherichia coli (3-144/297) H591 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) HS ││├─ Escherichia coli (3-144/297) IAI1 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) IAI39 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) K12 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) M718 ││├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 115-1 └┤├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 119-7 │├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 182-1 │├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 21-1 │├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 84-1 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. TW14588 │├─ Escherichia coli (3-144/297) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (3-144/297) OP50 │├─ Escherichia coli (3-144/297) TA206 │├─ Escherichia coli (3-144/297) W │├─ Escherichia coli (3-144/297) W3110 │├─ Escherichia coli (3-144/297) str. K-12 substr. DH10B └┼─ Escherichia coli (3-144/297) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (3-144/297) str. K-12 substr. MG1655 ├─ Escherichia coli (3-144/297) str. K-12 substr. DH10B ├─ Escherichia coli (3-144/297) W ├─ Escherichia coli (3-144/297) TA271 ├─ Escherichia coli (3-144/297) SE11 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli (3-144/297) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (3-144/297) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) KO11 ├─ Escherichia coli (3-144/297) IAI39 ├─ Escherichia coli (3-144/297) IAI1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) HS ├─ Escherichia coli (3-144/297) H736 ├─ Escherichia coli (3-144/297) ETEC H10407 ├─ Escherichia coli (3-144/297) E24377A ├─ Escherichia coli (3-144/297) E110019 ├─ Escherichia coli (3-144/297) BW2952 ├─ Escherichia coli (3-144/297) BL21 ├─ Escherichia coli (3-144/297) B7A ├─ Escherichia coli (3-144/297) B185 ├─ Escherichia coli (3-144/297) B str. REL606 ├─ Escherichia coli (3-144/297) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (3-144/297) 55989 ├─ Escherichia coli (3-144/297) 1827-70 ├─ Escherichia coli (3-144/297) 1125A ├─ Escherichia coli (3-144/297) 101-1 ├─ Escherichia coli (3-144/297) 042 └─ fig|1040638.4.peg.3641 O104:H4 (3-144/297) str. LB226692
| Threonine catabolic operon transcriptional activator TdcA | (132) |
| LysR family transcriptional regulator YnfL | (127) |
| Xanthosine operon regulatory protein XapR, LysR family | (62) |
| LysR family transcriptional regulator YneJ | (3) |
| LysR-family transcriptional regulator | (1) |
| Malonate utilization transcriptional regulator | (1) |
| Others | (5) |