┌─ Escherichia coli (1-119/441) APEC O1 (6) ┌┴─ Escherichia coli (1-119/441) 042 (15) ┌┴─ Escherichia coli (1-119/441) M718 ┌┴─ Escherichia coli (1-119/441) MS 69-1 ┌┴─ Escherichia coli (1-119/441) K12 (59) ┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.1034 O104:H4 (1-119/441) str. LB226692 (5) ┌┤ └─ Escherichia coli (1-119/441) SE11 ┌─────────────┤└─ Escherichia coli (1-119/441) 101-1 (38) │ └─ Escherichia coli (1-119/441) MS 115-1 ┌────┤ ┌─ Escherichia coli (6-118/461) K12 (65) │ └───────────────┬┴─ Escherichia coli (6-118/461) 2362-75 │ └┬─ Escherichia coli (6-118/461) B354 │ └─ Escherichia coli (6-118/461) H299 (3) ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-113/415) NC101 ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-116/418) 53638 (2) ││ ┌───────────────────────────────┴─ Escherichia coli (1-113/415) 536 (13) │└─────┤ ┌─ Escherichia coli (1-123/444) ED1a (1) │ └───────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-123/444) MS 115-1 ┌──────┤ └┬┴─ Escherichia coli (1-123/444) B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-123/444) K12 (109) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-123/444) MS 69-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-123/444) IHE3034 │ │ └─ Escherichia coli (14-136/457) APEC O1 (14) │ └───────────┬─ Escherichia coli (11-109/472) O157:H7 EDL933 (1) ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (12-109/472) MS 185-1 │ │ └─ Escherichia coli (8-106/469) K12 (125) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-108/349) K12 (127) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-108/349) B088 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-108/349) M605 │ └─────┬──────────────────────┴─ Escherichia coli (3-108/349) H736 │ └────────────────────────────┬─ Escherichia coli (1-115/244) O26:H11 str. 11368 │ └┬─ Escherichia coli (1-115/244) ETEC H10407 ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (7-121/250) 042 (12) │ │ └─ Escherichia coli (1-115/244) K12 (116) │ │ ┌─ Escherichia coli (2-104/218) K12 (35) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-104/218) O111:H- str. 11128 │ │ ┌────────────────────────┴─ Escherichia coli (2-104/218) 042 (72) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-120/215) K12 (5) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-103/198) str. K-12 substr. DH10B (1) │ │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.540 TY-2482 (7-120/215) strain (91) │ └───────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (17-130/225) E110019 (1) │ │ ┌─────────┴┬─ Escherichia coli (7-120/215) 2362-75 (28) │ │ │ └─ Escherichia coli (7-120/215) M718 ┌┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-122/216) 83972 (1) ││ └─────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-122/216) H591 (2) ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-122/216) K12 (123) ││ │ ┌─────────┴─ Escherichia coli (1-122/216) FVEC1302 (3) ││ └────┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.2394 TY-2482 (4-126/204) strain ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-102/105) 1827-70 ││ └─────────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (5-126/204) O157:H7 EDL933 (1) ││ └┬┴─ Escherichia coli (4-126/204) MS 21-1 ││ └┬─ Escherichia coli (4-126/204) KO11 (2) ││ └─ Escherichia coli (4-126/204) K12 (118) │└──────────────────────────┬─ Escherichia coli (9-109/337) B088 (13) │ └┬─ Escherichia coli (9-109/337) APEC O1 (6) │ └─ Escherichia coli (9-109/337) K12 (110) │ ┌─ Escherichia coli 536 (24) │ ┌┴─ Escherichia coli MS 200-1 │ ┌┴─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ┌┴┬─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤ └─ Escherichia coli K12 (98) ┤ ┌┤└─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │└┬─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ┌──────────────────────┤ └─ Escherichia coli 042 (1) │ │ └─ Escherichia coli H299 │ │ ┌─ Escherichia coli (957-1075/1197) O157:H7 (25) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (957-1075/1197) F11 (4) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (957-1075/1197) APEC O1 (29) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (957-1075/1197) K12 (61) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (887-1005/1127) MS 69-1 │ │ ┌───────────┤ └─ Escherichia coli (887-1005/1127) FVEC1302 (3) │ │ │ └─ Escherichia coli (957-1075/1197) SMS-3-5 (3) │ │ ┌───────┤ ┌─ Escherichia coli (806-927/933) K12 (16) │ │ │ └──────────┬┴─ Escherichia coli (3-118/124) W3110 │ │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.3304 O104:H4 (60-181/187) str. LB226692 (83) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (806-927/933) MS 115-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (822-943/949) APEC O1 (6) │ │ ┌──────┤ └─ Escherichia coli (822-943/949) 2362-75 (21) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (668-781/918) E22 (1) └─┤ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (668-781/918) MS 187-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (668-781/918) K12 (126) │ │ └────────┬────────────────────┴─ Escherichia coli (668-781/918) MS 115-1 │ │ └────────────────────┬─ Escherichia coli (526-644/777) O157:H7 str. EC4024 │ │ └─┬─ Escherichia coli (3-107/241) O157:H7 str. EC4024 │ │ └┬─ Escherichia coli (106-224/358) MS 119-7 │ │ └┬─ Escherichia coli (526-644/778) 536 (10) │ │ └─ Escherichia coli (524-642/776) K12 (119) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-107/229) MS 107-1 │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.817 O104:H4 (3-107/229) str. LB226692 (24) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-107/229) 042 (16) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-107/229) K12 (7) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-107/229) 1044A (51) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-107/229) M605 │ │ ┌────────────────────┴─ Escherichia coli (3-107/229) 2362-75 (26) │ │ ┌───┤ ┌─ Escherichia coli (5-112/225) O157:H7 EDL933 └─┤ │ └────────────────┬┴─ fig|1040638.4.peg.5040 O104:H4 (5-112/225) str. LB226692 (65) │ ┌─────┤ └┬─ Escherichia coli (5-112/225) FVEC1302 (3) │ │ │ └─ Escherichia coli (5-112/225) K12 (59) │ │ └──────────┬─ Escherichia coli (4-123/229) CFT073 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-123/229) TA206 │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (4-123/229) K12 (128) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-123/235) 1044A (24) │ │ │ ┌─────────────────┴─ Escherichia coli (12-129/241) O157:H7 EDL933 (1) │ │ └─┤ ┌────────── Escherichia coli (3-117/232) K12 (23) │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (6-122/239) K12 (131) │ ┌──────┤ └─┬────────────┴─ Escherichia coli (8-122/239) B str. REL606 (2) │ │ │ └──────────────┬── Escherichia coli (6-122/240) MS 185-1 │ │ │ └─┬─ Escherichia coli (6-122/239) 536 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (6-122/239) 83972 (10) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-123/240) CFT073 (1) │ │ └────────────────┬─ Escherichia coli (7-110/238) B str. REL606 │ │ └─ Escherichia coli (7-110/238) K12 (132) │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.4458 O104:H4 (1-118/223) str. LB226692 (79) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/223) 042 (1) └───────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/223) 1044A (25) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/223) K12 (23) │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (1-118/223) E110019 (1) │ ┌─────┴───────────┬─ Escherichia coli (1-118/222) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-118/222) 2362-75 (26) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-118/222) B str. REL606 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.1159 O104:H4 (1-118/222) str. LB226692 (94) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-118/219) E2348/69 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/219) 2362-75 └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (7-109/210) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/219) TA280 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/219) K12 (60) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/219) 83972 (5) │ ┌─────────────────┴┬─ Escherichia coli (1-118/219) O157:H7 EDL933 │ │ └┬─ fig|6666666.5357.peg.2248 TY-2482 (1-118/219) strain (50) │ │ └┬─ Escherichia coli (7-109/210) O157:H7 str. EC4486 └─────┤ └┬─ Escherichia coli (1-118/219) B185 │ └─ Escherichia coli (1-114/215) E24377A (1) │ ┌──────── fig|1040638.4.peg.2084 O104:H4 (3-119/226) str. LB226692 (9) │ │ ┌─ Escherichia coli (17-123/239) K12 (131) └──────┤ ┌┴─ Escherichia coli (38-144/260) SE15 │ ┌─────────┴─ Escherichia coli (38-144/260) H736 └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-118/227) K12 (114) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-118/227) O111:H- str. 11128 └──────┬┴─ Escherichia coli (1-118/227) 101-1 (15) └┬─ Escherichia coli (1-118/226) MS 115-1 └┬─ fig|1040638.4.peg.2102 O104:H4 (1-118/226) str. LB226692 (5) └┬─ Escherichia coli (1-118/226) ATCC 8739 (1) └─ Escherichia coli (1-118/226) ETEC H10407
| Two-component system response regulator QseB | (10) |
| Chemotaxis regulator - transmits chemoreceptor signals to flagelllar motor components CheY | (9) |
| Nitrate/nitrite response regulator protein | (9) |
| Response regulator of zinc sigma-54-dependent two-component system | (8) |
| Putative sensory histidine kinase YfhA | (7) |
| Hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA | (7) |
| Two-component response regulator CreB | (6) |
| Copper-sensing two-component system response regulator CusR | (6) |
| Positive transcription regulator EvgA | (5) |
| Aerobic respiration control sensor protein arcB (EC 2.7.3.-) | (5) |
| Two-component sensor protein RcsC (EC 2.7.3.-) | (5) |
| Chemotaxis response regulator protein-glutamate methylesterase CheB (EC 3.1.1.61) | (4) |
| Transcriptional regulatory protein PhoP | (4) |
| Acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC | (4) |
| BarA sensory histidine kinase (= VarS = GacS) | (4) |
| Hypothetical response regulatory protein ypdB | (4) |
| Phosphoglycerate transport system transcriptional regulatory protein PgtA | (3) |
| Nitrogen regulation protein NR(I) | (3) |
| Putative response regulator | (3) |
| DNA-binding response regulator KdpE | (3) |
| Others | (34) |