┌─ Escherichia coli (8-395/395) MS 21-1 ┌┴─ Escherichia coli (8-396/397) MS 175-1 ┌┴─ Escherichia coli (8-397/402) MS 124-1 ┌┴┬─ Escherichia coli (8-393/395) B185 ┌─────┤ └─ Escherichia coli (8-393/403) M605 │ └─ Escherichia coli (8-393/398) ATCC 8739 ┌┤ ┌─ Escherichia coli (8-399/413) O111:H- str. 11128 │└────────┬┴─ Escherichia coli (8-399/413) ED1a (3) │ └┬─ Escherichia coli (8-399/414) 042 (1) ┌──┤ └─┬─ Escherichia coli (8-399/413) B185 │ │ └─ Escherichia coli (8-399/413) 53638 (1) │ └─────┬── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (12-393/413) strain (5) │ └┬─ Escherichia coli (8-393/396) WV_060327 │ └┬─ Escherichia coli (8-398/413) MS 146-1 ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-398/413) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-398/413) K12 (5) │ │ └─ Escherichia coli (8-398/413) str. K-12 substr. DH10B (1) │ │ ┌── Escherichia coli (22-415/423) 042 (2) │ └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-401/409) MS 78-1 ┌────┤ └┬┴─ Escherichia coli (8-401/409) 101-1 (6) │ │ └┬─ Escherichia coli (22-415/423) ETEC H10407 │ │ └┬─ Escherichia coli (22-418/423) B088 (13) │ │ └─ Escherichia coli (22-418/423) O55:H7 str. CB9615 ┌───┤ └──────────────────────── Escherichia coli (6-391/412) 1125A (3) │ │ ┌─ Escherichia coli (22-403/406) CFT073 (4) │ │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (39-420/425) E2348/69 (1) │ └────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (4-395/402) SMS-3-5 │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (4-395/405) strain │ └────────────┬┴─ Escherichia coli (4-395/405) E2348/69 (1) │ └┬─ Escherichia coli (4-395/400) 1044A (26) │ └┬─ Escherichia coli (4-395/400) MS 116-1 (4) │ └┬─ Escherichia coli (4-395/400) IHE3034 (1) │ └┬─ Escherichia coli (4-395/400) 83972 (4) │ └─ Escherichia coli (4-395/400) UM146 (2) │ ┌─ Escherichia coli (1-401/421) FVEC1302 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/421) MS 21-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/421) 83972 (4) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/421) CFT073 (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-401/420) ED1a (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-401/420) H591 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-401/420) ATCC 8739 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-401/420) B185 │ │└─ Escherichia coli (1-405/421) M605 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-401/421) O26:H11 str. 11368 │ │└┤ ┌─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (1-401/420) str. LB226692 (2) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/420) 2362-75 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-401/420) H299 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-405/421) 042 (1) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-405/421) 536 (3) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-401/420) E24377A (1) │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (1-401/420) str. LB226692 (4) │ │└┬─ Escherichia coli (1-399/420) MS 187-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-399/419) O111:H- str. 11128 │ ││ └─ Escherichia coli (1-401/421) EC4100B │ ││┌─ Escherichia coli (1-401/420) NC101 │ │││ ┌─ Escherichia coli (1-401/420) APEC O1 (3) │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/421) IAI39 (1) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-401/420) IAI39 (1) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-401/420) CFT073 (1) │ ┌──┤ └┤┌─ Escherichia coli (1-401/421) ATCC 8739 (1) │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-401/420) ED1a (1) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-401/420) MS 107-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-405/421) 1044A (25) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-405/421) B171 (12) │ ┌──┤ │┌─ Escherichia coli (1-401/420) MS 107-1 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-401/421) MS 185-1 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-401/421) MS 200-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-401/420) M718 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-401/421) MS 124-1 (1) │ │ └─── Escherichia coli (1-403/417) MS 115-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-402/421) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-403/420) O26:H11 str. 11368 │ ┌─┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-406/424) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (1-402/422) IHE3034 (1) ┤ │ │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-407/418) EC4100B │ │ │ ┌─────┤ └───── Escherichia coli (8-410/427) MS 116-1 (1) │ │ │┌┤ └─────────── Escherichia coli (26-427/445) M605 │ │ ││└────────┬── Escherichia coli (1-409/424) ED1a (1) │ │ ││ └─┬─ Escherichia coli (1-409/424) O111:H- str. 11128 │ │ ││ └─ Escherichia coli (23-431/444) E2348/69 (2) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-406/416) IAI1 (1) │ │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (1-407/416) MS 115-1 │ │ │┌┴─┬───── Escherichia coli (1-401/420) MS 107-1 │ │ ││ └─── Escherichia coli (1-401/415) MS 115-1 │ │ └┤┌─── Escherichia coli (1-402/421) KO11 (2) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-401/422) B7A (1) │┌───────┤ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/417) 042 (1) ││ │ │┌─┴── Escherichia coli (1-406/422) W (1) ││ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-405/414) O103:H2 str. 12009 ││ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli E22 (1) ││ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-405/414) TA271 ││ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-401/420) 83972 (4) ││ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/420) UTI89 (1) ││ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-401/420) 536 (1) ││ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-401/421) 55989 (5) ││ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-401/421) M718 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-400/421) ED1a (1) ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-400/421) ETEC H10407 (3) ││ │ └─ Escherichia coli (1-406/413) H736 ││ │┌──────────── Escherichia coli (25-424/443) MS 145-7 ││ └┤ ┌──── Escherichia coli (2-401/420) TA206 ││ └───┬──────┴─── Escherichia coli (1-405/420) WV_060327 ││ └────┬── Escherichia coli (1-404/423) 536 (13) ││ └─┬─ Escherichia coli (1-406/420) ED1a (1) ││ └┬─ Escherichia coli (1-406/420) FVEC1302 (1) ││ └┬─ Escherichia coli (1-406/420) IAI39 (2) ││ └┬─ Escherichia coli (1-406/420) H299 ││ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (1-406/420) str. LB226692 (9) ││ ┌─ Escherichia coli IAI39 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 str. LB226692 ││ ┌┴─ Escherichia coli 101-1 (8) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-392/394) TA280 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-392/393) 536 (1) ││ │ └┬─ Escherichia coli (25-414/417) O157:H7 str. EC508 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (25-414/417) 1044A (24) ││ │└┬─ Escherichia coli (1-389/404) B7A (1) ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (25-414/427) 83972 (2) ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-394/396) ETEC H10407 ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-394/396) H299 ││ │ └─┬─ Escherichia coli (1-390/399) MS 145-7 ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (33-421/439) KO11 (2) ││ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-384/389) O26:H11 str. 11368 ││ │ └────┤┌─ Escherichia coli (1-386/390) MS 185-1 ││ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-386/391) ATCC 8739 (1) ││ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-386/395) F11 (1) └┤ ┌┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-386/393) 042 (1) │ ││ └┬┴─ Escherichia coli (1-384/387) SMS-3-5 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-386/395) O157:H7 str. EC869 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (1-365/369) E110019 │ ┌┤└──┬───── Escherichia coli (14-402/417) ED1a (1) │ ││ └────── Escherichia coli (1-389/397) MS 115-1 │ ││ ┌─────── Escherichia coli (17-404/407) SE15 │ │└──┤ ┌─ Escherichia coli (1-386/392) MS 145-7 │ │ └────┬┴─ Escherichia coli (1-383/391) WV_060327 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (18-403/410) O55:H7 str. CB9615 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. EC4024 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (18-403/410) 1044A (13) │ ││ ┌───────── Escherichia coli (1-389/396) MS 124-1 (1) │ │└─┤ ┌──── Escherichia coli (1-388/396) TA206 │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (14-401/415) HS (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-386/394) SMS-3-5 │ ┌──┤ └─┬───┴─ Escherichia coli (1-394/396) SE11 │ │ │ └──┬─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (1-389/404) str. LB226692 (3) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-389/404) 83972 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-389/404) NC101 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-389/404) MS 124-1 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-389/404) ETEC H10407 │ │ │ ┌─────────────── Escherichia coli (1-392/393) ED1a (1) │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli MS 21-1 │┌───┤ └────┤┌─ Escherichia coli (1-394/396) TA280 ││ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-394/396) MS 124-1 ││ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-394/396) MS 84-1 ││ │ └┬─ Escherichia coli E24377A (1) ││ │ └─ Escherichia coli SMS-3-5 ││ │ ┌─ Escherichia coli (35-420/431) K12 (5) ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-391/402) MS 187-1 ││ │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (33-418/428) ATCC 8739 (1) ││ └──┤ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) FVEC1302 (1) ││ └─────────────┤┌─ Escherichia coli (2-381/385) KO11 (2) ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) O26:H11 str. 11368 ││ │┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) IAI39 (1) ││ └┤ ┌─ Escherichia coli (14-393/397) 1044A (24) ││ │┌┴─ Escherichia coli (14-393/397) O55:H7 str. CB9615 ││ └┤┌─ Escherichia coli (2-381/385) TA271 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (14-393/397) H591 └┤ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (14-393/397) TA143 │ │┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) B7A (1) │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) K12 (14) │ │┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) E2348/69 (1) │ └┤┌─ Escherichia coli (2-381/385) B088 │ └┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-383/385) strain (2) │ └┬┴─ Escherichia coli (2-381/385) MS 119-7 │ └┬─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 (14-390/394) str. LB226692 │ └─ Escherichia coli (14-393/397) B354 │ ┌─ Escherichia coli (2-384/391) WV_060327 │ ┌──────────────────┴─ Escherichia coli (2-384/391) SE15 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-392/416) MS 198-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/418) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/416) FVEC1302 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/415) M605 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 (1) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 (2) └────┤ ┌────────┤ └─ Escherichia coli (2-392/418) MS 196-1 │ │ └─ Escherichia coli (2-397/417) E2348/69 (1) │ ┌────────────┤ ┌─ Escherichia coli (2-391/395) 2362-75 │ │ └───────┬┴── Escherichia coli (2-397/402) B7A (1) │ │ └─┬─ Escherichia coli (2-391/395) HS (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (2-396/396) MS 115-1 │ │ └─ Escherichia coli (2-396/396) B354 │ │ ┌─ Escherichia coli (5-422/438) B171 └────┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-422/438) O103:H2 str. 12009 │ ┌──────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (5-422/438) M718 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-406/417) MS 21-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-406/419) MS 182-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-406/419) 2362-75 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (32-434/447) 042 (1) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-408/420) 1125A (2) └──────┤ ┌─┤ └─ Escherichia coli (24-428/440) O157:H7 str. EC4501 (1) │ ┌──┤ └── Escherichia coli (4-406/417) 83972 (1) │ │ └──┬─ Escherichia coli (4-410/419) TA206 │ ┌────────────────────┤ └─ Escherichia coli (38-444/453) E2348/69 (1) │ │ └─────── Escherichia coli (7-409/423) E2348/69 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-398/412) MS 182-1 └──┤ ┌──────────────────────┴─ Escherichia coli (1-398/407) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-381/392) O111:H- str. 11128 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-381/392) 1212A (16) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-381/392) MS 78-1 └────────┤ ┌──────┴─ Escherichia coli (1-381/392) MS 21-1 │ ┌─────────────┴─────────┬─ Escherichia coli (1-381/389) 1125A (12) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-381/389) O157:H7 str. EC4501 (1) │ ┌───┤ └─ Escherichia coli (1-381/389) O103:H2 str. 12009 │ │ └─────┬──────────────── Escherichia coli (2-391/396) MS 21-1 └─┤ └───────────── Escherichia coli (1-393/402) TA206 │ ┌────────────────────── Escherichia coli (21-410/416) E22 (4) │ │ ┌───────────────── Escherichia coli (2-381/385) MS 146-1 └────┤ │ ┌─ Escherichia coli (17-401/411) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-401/411) H299 │ │ ┌──────┴─ Escherichia coli (61-445/455) WV_060327 └──────┤ ┌───┴──────────── Escherichia coli (12-399/413) MS 124-1 (1) │ ┌──┴─┬──────────── Escherichia coli (406-800/807) 042 (1) │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (7-394/398) M605 │ │ └─ Escherichia coli (7-394/398) TA206 └──┤ ┌───── Escherichia coli (11-393/406) SMS-3-5 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-397/412) IHE3034 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-397/412) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-397/412) 53638 (1) └───────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (17-397/412) F11 (2) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (17-397/412) O157:H7 str. EC4401 (1) │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (17-394/407) O157:H7 str. EC4501 (1) │ │ └─ Escherichia coli (17-397/412) MS 175-1 └──┤ ┌── Escherichia coli (11-394/409) E110019 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (14-390/405) O26:H11 str. 11368 └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (14-390/405) ED1a (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (18-394/409) E110019 (1) └┬┴─ Escherichia coli (18-394/409) 042 (1) └┬─ Escherichia coli (11-394/409) CFT073 └┬─ Escherichia coli (11-394/409) 1125A (13) └┬─ Escherichia coli (11-394/409) 1044A (7) └┬─ Escherichia coli (11-394/409) IAI39 (1) └┬─ Escherichia coli (11-394/409) E110019 (1) └┬─ Escherichia coli (11-394/409) O103:H2 str. 12009 └─ Escherichia coli (11-394/409) O26:H11 str. 11368
| Integrase | (102) |
| Phage integrase | (30) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (26) |
| Phage Integrase | (18) |
| Putative integrase | (10) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (10) |
| integrase-like protein | (7) |
| Prophage CP4-57 integrase | (7) |
| COG0582: Integrase | (6) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (5) |
| putative prophage integrase | (3) |
| prophage P4 integrase | (1) |
| putative integrase of prophage | (1) |
| putative P4-type integrase | (1) |
| putative phage integrase | (1) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (1) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (1) |
| putative enzyme; Integration, recombination | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Putative P4-family integrase | (1) |
| Others | (10) |