┌─ Escherichia coli E22 (2) ┌┴─ Escherichia coli B171 (1) ┌┴─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3739 O104:H4 str. LB226692 (12) ┌┴─ Escherichia coli MS 124-1 (1) ┌┴─ Escherichia coli M718 (1) ┌┴─ Escherichia coli TA280 ┌┴─ Escherichia coli 101-1 (11) ┌┴┬─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 (2) ┌┤ └─ Escherichia coli 1044A (36) ┌┤└─ Escherichia coli 042 (1) │└┬─ Escherichia coli B185 │ └┬─ Escherichia coli ATCC 8739 (3) ┌┤ └─ Escherichia coli K12 (11) ││┌─ Escherichia coli M605 (1) │└┤ ┌─ Escherichia coli SE15 │ └┬┴─ Escherichia coli 2362-75 (2) ┌────────────────────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli 536 (15) │ │ └┬─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ └─ Escherichia coli APEC O1 (6) │ └─ Escherichia coli B7A (5) │ ┌─ Escherichia coli (323-539/555) IAI39 (1) ┌─┤ ┌┴─ Escherichia coli (323-539/555) B354 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (323-539/555) MS 124-1 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (323-539/555) K12 (97) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (323-539/555) 536 (25) │ │ ┌──────────────────────────┴─ Escherichia coli (323-539/555) O103:H2 str. 12009 │ └──────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-246/634) O157:H7 str. EC4024 │ └────────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-246/637) APEC O1 (6) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-246/637) TA143 │ └─┤┌┴─ Escherichia coli (1-246/637) FVEC1302 (3) │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-246/637) SMS-3-5 │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-246/637) O55:H7 str. CB9615 │ │┌┴─ Escherichia coli (1-246/637) SE15 │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-246/637) K12 (107) │ └┬┴─ Escherichia coli (1-246/637) IAI39 (1) │ └┬─ Escherichia coli (1-246/637) ED1a (1) │ └┬─ Escherichia coli (1-246/637) NC101 │ └┬─ Escherichia coli (1-246/637) MS 196-1 │ └─ Escherichia coli (1-246/637) B171 (1) │ ┌─ Escherichia coli (352-573/593) M605 (2) │ ┌┴─ Escherichia coli (390-611/631) E2348/69 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (352-573/593) 2362-75 (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (352-573/593) APEC O1 (10) │ │ └┬─ Escherichia coli (352-573/593) H299 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (352-573/593) 536 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (352-573/593) K12 (96) │ │ └┬─ Escherichia coli (352-573/593) KO11 (2) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (352-573/593) B185 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (352-573/593) H736 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli (352-573/593) SMS-3-5 │ ┌─────────────────────┤└─ Escherichia coli (352-573/593) IAI39 (2) │ │ └─ Escherichia coli (352-573/593) B354 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-221/222) O157:H7 str. EC4024 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (478-705/706) 1044A (24) │ ┌─────┤ ┌────┴─ Escherichia coli (478-705/706) O103:H2 str. 12009 (2) │ │ │ ┌──────────┴──┬─ Escherichia coli (480-705/707) CFT073 (8) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (480-705/707) E110019 (1) ┤ │ └─────┤ └─ Escherichia coli (480-705/707) 536 (7) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (366-570/609) 042 (26) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (357-561/600) 536 (9) │ ┌────────┤ └───┬─────────────────┴─ fig|1040638.4.peg.3512 O104:H4 (357-561/600) str. LB226692 (11) │ │ │ └─────────┬─ Escherichia coli (355-579/582) UM146 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (355-579/582) K12 (127) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (355-579/582) 2362-75 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (355-579/582) 101-1 │ │ └───────┬───────────────────────────────────── Escherichia coli (329-546/564) MS 124-1 (1) │ │ └───────────────────────────┬── Escherichia coli (488-713/715) TA206 │ │ └──┬─ Escherichia coli (485-692/715) B088 │ │ └─ Escherichia coli (485-692/715) 83972 (8) │ │ ┌─ Escherichia coli (4-226/250) B354 │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.3448 O104:H4 (4-226/250) str. LB226692 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-226/250) MS 115-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-226/250) 042 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-226/250) FVEC1302 (4) │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-226/250) EC4100B (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-226/250) MS 107-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-226/250) K12 (78) │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (4-226/250) B088 (1) │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-226/250) 1044A (24) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-226/250) ED1a (1) │ │ ┌──────────┤└─ Escherichia coli (4-226/250) MS 21-1 │ │ ┌─────┤ └─ Escherichia coli (4-226/250) B185 │ │ │ └───────┬─ Escherichia coli (1-219/240) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-219/240) K12 (27) │ │ ┌──┤ └┬─ fig|1040638.4.peg.4919 O104:H4 (1-219/240) str. LB226692 (100) │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-219/240) O157:H7 EDL933 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-219/240) 83972 (1) │ │ ┌───┤ └────────────────────────────── Escherichia coli (26-253/257) K12 (129) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (18-216/371) K12 (123) │ │ │ │ ┌──────────────────┴─ Escherichia coli (48-246/401) 042 (1) │ │ │ └──────┤┌────────────── Escherichia coli (3-219/365) NC101 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (21-219/348) 1044A (22) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (21-219/348) ED1a (1) │ │ │ └──┬────────────┴─ Escherichia coli (25-223/352) K12 (7) └─────────┤ │ └───────────┬─ Escherichia coli (9-211/359) 101-1 (19) │ │ └┬─ Escherichia coli (28-230/378) K12 (111) │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (28-230/378) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-232/255) F11 (2) │ │ │ ┌────────┴─ Escherichia coli (4-232/255) 536 (19) │ │ │ ┌──────────────────┴───────── Escherichia coli (4-218/257) NC101 │ │ │ ┌───────────────┴───────────────────┬─ Escherichia coli (12-230/265) K12 (22) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (12-230/265) MS 182-1 (1) │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (5-236/255) 1212A (1) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-236/255) B088 (7) │ │ └────┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-236/255) ETEC H10407 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-236/255) K12 (117) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-236/255) 2362-75 (2) │ │ │ ┌───────────────────────────┴─ Escherichia coli (5-236/255) B171 (1) │ │ │ ┌───┴──────────────────┬──────────── Escherichia coli (25-236/417) K12 (2) │ │ └────┤ └────────────────── Escherichia coli (5-228/515) MS 124-1 (3) │ │ │ ┌────────────────────────────────── Escherichia coli (47-261/277) 2362-75 │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (4-237/241) E24377A (1) │ │ │ ┌──────────────────────────┴─ Escherichia coli (4-237/241) K12 (130) │ │ └────┤ ┌─ Escherichia coli (329-541/578) MS 21-1 │ │ └─────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (329-541/578) B354 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (329-541/578) MS 196-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (329-541/578) 2362-75 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (329-541/578) K12 (99) │ │ └┬─ Escherichia coli (329-541/578) WV_060327 │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.4902 O104:H4 (329-541/578) str. LB226692 (19) │ │ └─ Escherichia coli (329-541/578) 536 (6) │ │ ┌─ Escherichia coli (23-244/326) 042 (5) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-226/308) MS 69-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-226/308) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-226/308) IAI39 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (5-226/308) B354 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (5-226/308) MS 21-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) M718 └─┤ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) B088 (3) │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.4230 O104:H4 (5-226/308) str. LB226692 (6) │ ┌┤└─ Escherichia coli (5-226/308) KO11 (2) │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-226/308) 101-1 (3) │ │└┬┴─ Escherichia coli (5-226/308) MS 187-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) MS 124-1 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (5-226/308) MS 116-1 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (5-226/308) K12 (24) │ │ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) B7A (7) │ │ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) E110019 (2) │ ┌───────────────┤ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) O157:H7 EDL933 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (5-226/308) 1125A │ ┌────┤ │ └─ Escherichia coli (5-226/308) 1044A (22) │ │ │ └─ Escherichia coli (5-226/308) TA143 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (38-244/334) B171 (4) │ │ └────────────┤┌─ Escherichia coli (38-244/334) K12 (46) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (38-244/334) 042 (32) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (38-244/334) E110019 (10) │ ┌─────┤ └┬┴─ Escherichia coli (38-244/334) 1044A (24) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (38-244/334) 536 (5) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (38-244/337) 2362-75 (3) │ │ │ └─ Escherichia coli (38-244/334) MS 21-1 (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (11-249/334) APEC O1 (6) │ │ └────────────┤┌─ Escherichia coli (11-249/334) MS 145-7 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (11-249/334) K12 (111) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (11-249/334) ATCC 8739 (1) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (11-249/334) W │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (11-249/334) KO11 (1) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (11-249/334) 2362-75 │ │ └┬─ Escherichia coli (11-249/334) O157:H7 EDL933 │ │ └┬─ Escherichia coli (11-249/334) 042 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (11-249/334) MS 187-1 └──────────┤ └─ Escherichia coli (11-249/334) O55:H7 str. CB9615 │ ┌─ Escherichia coli (5-228/252) WV_060327 │ ┌┴─ Escherichia coli (5-228/252) 2362-75 (21) │ ┌┴─ Escherichia coli (5-228/252) OP50 │ ┌────────────────────────────┴┬─ Escherichia coli (5-228/252) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (5-228/252) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ ┌─ Escherichia coli (16-227/317) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-237/327) MS 21-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-237/327) 2362-75 (27) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-237/327) IAI39 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-237/327) K12 (85) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-237/327) E110019 (8) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-237/327) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-237/327) O111:H- str. 11128 └──┤ ┌─────────────┤└─ Escherichia coli (16-227/317) B088 (2) │ │ └─ Escherichia coli (3-237/327) MS 146-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-240/612) K12 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (12-251/623) 101-1 (15) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.4672 O104:H4 (12-251/623) str. LB226692 (21) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (12-264/623) APEC O1 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (12-264/623) 2362-75 (4) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (12-264/623) 83972 (5) │ │ │└┬─ Escherichia coli (12-264/623) SMS-3-5 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (12-264/623) H299 └──────┤ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (12-264/623) MS 69-1 (2) │ ││ └┬─ Escherichia coli (12-251/623) FVEC1302 (3) │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (18-257/629) B354 │ ││└─ Escherichia coli (12-264/623) IAI39 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli (18-262/629) 042 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli (12-251/623) B185 │ ┌─────────┤└─ Escherichia coli (12-251/623) 1044A (22) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-240/612) O157:H7 EDL933 │ │ └─ Escherichia coli (1-240/612) O157:H7 │ │ ┌─ Escherichia coli (19-252/337) 042 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (19-252/337) MS 21-1 (1) └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (19-252/337) WV_060327 │ ┌┴─ Escherichia coli (19-252/337) H299 │ ┌┴─ Escherichia coli (19-252/337) 1044A (61) │ ┌──────────┴┬─ Escherichia coli (19-252/337) K12 (7) │ │ └┬─ Escherichia coli (19-252/337) MS 124-1 (1) └──┤ └─ fig|1040638.4.peg.4566 O104:H4 (19-252/337) str. LB226692 (53) │ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) H591 └──────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) B7A (3) │┌┴─ fig|1040638.4.peg.4231 O104:H4 (5-239/328) str. LB226692 (3) └┤┌─ Escherichia coli (5-239/328) MS 119-7 (3) └┤┌─ Escherichia coli (5-239/328) MS 115-1 ││ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) E110019 (2) └┤┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) B171 (4) ││ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) 1044A (24) └┤┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) O55:H7 str. CB9615 ││┌─ Escherichia coli (5-239/328) HS (4) └┤│ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) 042 (6) ││ ┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) TA143 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) B354 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) IAI39 (1) │ ┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) MS 21-1 │┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) SMS-3-5 └┤┌─ Escherichia coli (5-239/328) 101-1 (5) └┤ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) K12 (15) │┌┴─ Escherichia coli (5-239/328) MS 124-1 (1) └┤┌─ Escherichia coli (5-239/328) ETEC H10407 └┤┌─ Escherichia coli (5-239/328) B185 └┤ ┌─ Escherichia coli (5-239/328) ATCC 8739 (1) └┬┴─ Escherichia coli (5-239/328) E24377A (3) └┬─ Escherichia coli (5-239/328) MS 107-1 └┬─ Escherichia coli (5-239/328) EC4100B └─ Escherichia coli (5-239/328) B088 (1)
| Dipeptide transport system permease protein DppC (TC 3.A.1.5.2); Putative hemine transporter ATP-binding subunit | (25) |
| Dipeptide transport ATP-binding protein DppF (TC 3.A.1.5.2); puatative hemin transporter subunit | (21) |
| Iron-sulfur cluster assembly ATPase protein SufC | (20) |
| Glutothione ABC transporter ATP-binding protein | (15) |
| Multidrug resistance-like ATP-binding protein mdlB | (13) |
| Glutathione-regulated potassium-efflux system ATP-binding protein | (13) |
| Cystine ABC transporter, ATP-binding protein | (12) |
| Oligopeptide transport ATP-binding protein OppF (TC 3.A.1.5.1) | (11) |
| Dipeptide transport ATP-binding protein DppD (TC 3.A.1.5.2) | (10) |
| Dipeptide transport ATP-binding protein DppF (TC 3.A.1.5.2) | (8) |
| Oligopeptide transport ATP-binding protein OppD (TC 3.A.1.5.1) | (7) |
| ABC transporter multidrug efflux pump, fused ATP-binding domains | (7) |
| Branched-chain amino acid transport ATP-binding protein LivG (TC 3.A.1.4.1) | (6) |
| Phosphonates transport ATP-binding protein PhnK | (5) |
| Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA (EC 3.6.3.25) | (4) |
| ABC transporter ATP-binding protein yjjK | (3) |
| Putrescine transport ATP-binding protein PotA (TC 3.A.1.11.1) | (3) |
| ABC transporter, ATP-binding protein | (3) |
| ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter:Peptidase C39, bacteriocin processing | (3) |
| hemolysin B | (3) |
| Others | (37) |