┌─ Escherichia coli (7-322/332) ED1a (2) ┌┴─ Escherichia coli (7-322/332) APEC O1 (5) ┌┴─ Escherichia coli (7-322/332) 83972 (9) ┌┴─ Escherichia coli (7-322/332) MS 145-7 ┌┴┬─ Escherichia coli (7-322/332) B7A (1) │ └┬─ Escherichia coli (7-322/332) M718 ┌┤ └┬─ Escherichia coli (7-322/332) F11 (2) ││ └─ Escherichia coli (7-322/332) 536 (1) ┌──────────────────┤└┬─ Escherichia coli (7-322/332) MS 124-1 (1) │ │ └─ Escherichia coli (7-322/332) K12 (29) ┌─────────┤ └─ Escherichia coli (7-322/332) MS 196-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (8-321/331) 101-1 (7) │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-321/331) APEC O1 (6) │ └┬┴─ Escherichia coli (8-321/331) M718 │ └┬─ Escherichia coli (8-321/331) 042 (53) │ └┬─ Escherichia coli (8-321/331) MS 185-1 ┌─────────────┤ └┬─ Escherichia coli (8-321/331) MS 21-1 │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (8-321/331) str. LB226692 (13) │ │ └┬─ Escherichia coli (8-321/331) 1044A (41) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-311/321) O157:H7 EDL933 (1) ┌───────┤ │ └─ Escherichia coli (1-311/321) str. K-12 substr. DH10B │ │ └──────────────────────── Escherichia coli (14-338/339) H299 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (8-339/342) M718 │ │ │┌─ Escherichia coli (8-339/342) B354 (2) │ └─────────────────────────────┤│ ┌─ Escherichia coli (8-342/342) 83972 (5) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (8-342/342) APEC O1 (6) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (8-342/342) ED1a (1) │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-339/342) NC101 (2) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-339/342) M605 (1) │ │┌┴┬─ Escherichia coli (8-339/342) 536 (4) │ ││ └─ Escherichia coli (8-339/342) E110019 (1) │ └┤ ┌─ Escherichia coli (8-339/342) 1125A (12) │ │┌┴─ Escherichia coli (8-339/342) MS 21-1 │ └┤┌─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 (8-339/342) str. LB226692 (53) │ └┤ ┌─ Escherichia coli (8-339/342) K12 (20) │ └┬┴─ Escherichia coli (8-339/342) MS 115-1 ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-339/342) 101-1 (5) │ │ └┬─ Escherichia coli (1-322/325) 1827-70 │ │ └─ Escherichia coli (1-322/325) FVEC1412 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-330/343) 2362-75 (27) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/343) TA206 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/343) NC101 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/343) MS 21-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/343) B185 (4) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-330/343) 1044A (24) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-330/343) K12 (20) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-330/343) 53638 (1) │ │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.2734 O104:H4 (1-330/343) str. LB226692 (36) │ │ ┌───────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-330/343) MS 124-1 (1) │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-330/343) IAI1 (4) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-330/343) MS 115-1 │ └─────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-330/346) O111:H- str. 11128 ┌──┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-330/346) 2362-75 (25) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/346) NC101 │ │ └─────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-332/348) E2348/69 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/346) 1044A (25) │ │ │┌┴┬─ fig|1040638.4.peg.3225 O104:H4 (1-330/346) str. LB226692 (3) │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-330/346) 101-1 │ │ └┤ └─ Escherichia coli (1-330/346) B str. REL606 (3) │ │ │┌─ Escherichia coli (3-332/348) 042 (36) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-330/346) M718 ┌───┤ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/346) 53638 (1) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-330/346) K12 (12) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-330/346) IAI39 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-330/346) B7A (6) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-330/346) B171 (4) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-330/346) B185 │ │ └───────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (2-327/336) M718 (3) ┌─┤ │ └────┬─ Escherichia coli (2-323/336) E24377A (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (2-323/336) SMS-3-5 │ │ └──────────────────┬───────────────── Escherichia coli (5-328/360) H299 │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (6-329/356) H736 │ │ └─ Escherichia coli (6-329/356) MS 116-1 │ │ ┌──────────────────────────── Escherichia coli (4-328/332) 101-1 (5) │ └─────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-333/335) 2362-75 (12) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-333/335) MS 124-1 (1) │ └─────┬─────────────────────┴─ Escherichia coli (8-333/335) IAI39 (1) │ └───────────────────────┬─ Escherichia coli (3-330/334) DH1 │ └┬─ Escherichia coli (3-330/334) K12 (125) ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (3-330/334) 1125A (1) │ │ └─ Escherichia coli (3-330/334) FVEC1412 (1) │ │ ┌─ Escherichia coli 042 (20) │ │ ┌┴─ Escherichia coli B088 │ │ ┌┴─ Escherichia coli APEC O1 (8) │ │ ┌┴─ Escherichia coli 83972 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli ABU 83972 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli 2362-75 (13) │ │ ┌┴─ Escherichia coli K12 (75) │ │ ┌──────────────┴─ Escherichia coli E24377A (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-326/327) H591 (2) │ └───────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-326/327) E24377A (6) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-329/330) E24377A │ └─────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-329/330) K12 (12) │ │┌┴─ Escherichia coli (1-329/330) APEC O1 [2] │ └┤┌─ Escherichia coli (1-329/330) ATCC 8739 [2] ┌┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-326/327) M605 (1) ││ └┬┴─ Escherichia coli (1-326/327) B354 ││ └┬─ Escherichia coli (1-326/327) B str. REL606 (2) ││ └┬─ fig|1040638.4.peg.1465 O104:H4 (1-326/327) str. LB226692 (78) ││ └┬─ Escherichia coli (1-326/327) 2362-75 ││ └─ Escherichia coli (1-326/327) 1212A (1) ││ ┌─ Escherichia coli (4-325/332) M605 ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-325/332) SE15 ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-325/332) NC101 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-325/332) 2362-75 (14) ││ │└┬─ Escherichia coli (4-325/332) APEC O1 (6) ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-325/332) WV_060327 ││ │└┬─ Escherichia coli (4-325/332) MS 21-1 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-325/332) SMS-3-5 ││ │└─ Escherichia coli (4-325/332) ED1a (2) │└────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (4-325/332) 1044A (24) ┤ │┌┴─ Escherichia coli (4-325/332) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-325/332) H299 │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-325/332) IAI39 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-325/332) TA280 │ │┌┴┬─ Escherichia coli (4-329/332) M718 │ └┤ └─ Escherichia coli (4-325/332) MS 69-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-325/332) MS 196-1 │ └┬┴─ Escherichia coli (4-325/332) K12 (25) │ └┬─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-325/332) str. LB226692 (5) │ └┬─ Escherichia coli (4-325/332) E110019 (1) │ └┬─ Escherichia coli (4-325/332) O111:H- str. 11128 │ └─ Escherichia coli (4-325/332) B088 (23) │ ┌─ Escherichia coli (7-337/367) FVEC1302 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (30-360/390) MS 69-1 │ ┌──┴─ Escherichia coli (30-360/390) MS 21-1 │ ┌──────────────────────────────────────────┴──── Escherichia coli (7-337/356) 101-1 (8) └───┤ ┌─ Escherichia coli (1-320/327) TA271 └────────────────────────────────────────┤┌─ Escherichia coli (1-320/327) MS 124-1 (1) └┤┌─ fig|1040638.4.peg.2229 O104:H4 (1-320/327) str. LB226692 (20) ││┌─ Escherichia coli (1-320/327) B171 (1) └┤│ ┌─ Escherichia coli (13-332/339) 1827-70 (6) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) O111:H- str. 11128 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) K12 (22) │┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) 53638 (1) ││ ┌─ Escherichia coli (1-320/327) 042 (6) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) MS 69-1 │┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) B185 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-320/327) O157:H7 EDL933 [2] │┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) M718 └┤┌─ Escherichia coli (1-320/327) 1044A (23) └┤ ┌─ Escherichia coli (1-320/327) MS 115-1 │┌┴─ Escherichia coli (1-320/327) B354 └┤┌─ Escherichia coli (1-320/327) TA280 └┤┌─ Escherichia coli (1-320/327) 536 (1) └┤┌─ Escherichia coli (1-320/327) NC101 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-320/327) F11 (3) └┬┴─ Escherichia coli (1-320/327) H299 └┬─ Escherichia coli (1-320/327) O83:H1 str. NRG 857C └┬─ Escherichia coli (1-320/327) 83972 (5) └┬─ Escherichia coli (1-320/327) 2362-75 (2) └┬─ Escherichia coli (1-320/327) APEC O1 (9) └─ Escherichia coli (1-320/327) ED1a (2)
| Evolved beta-D-galactosidase transcriptional repressor | (25) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (20) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (16) |
| Mgl repressor and galactose ultrainduction factor GalS, HTH-type transcriptional regulator | (15) |
| Galactose operon repressor, GalR-LacI family of transcriptional regulators | (11) |
| Positive regulator of L-idonate catabolism | (11) |
| Ribose operon repressor | (11) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (9) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (8) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (5) |
| Fructose repressor FruR, LacI family | (5) |
| Transcriptional repressor of the lac operon | (3) |
| Sucrose operon repressor ScrR, LacI family | (3) |
| Putative ThuR, regulatory protein for trehalosemaltose transport | (3) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (1) |
| Others | (7) |