┌─ Escherichia coli (5-320/332) 83972 (9) ┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) APEC O1 (5) ┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) ED1a (2) ┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) MS 145-7 ┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) MS 124-1 (1) ┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) K12 (29) ┌┴┬─ Escherichia coli (5-320/332) B7A (1) │ └┬─ Escherichia coli (5-320/332) M718 ┌──────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (5-320/332) 536 (1) │ │ └─ Escherichia coli (5-320/332) F11 (2) │ └─ Escherichia coli (5-320/332) MS 196-1 │ ┌─ Escherichia coli (4-319/331) 1044A (41) ┌─────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (6-309/321) O157:H7 EDL933 (1) │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (4-319/331) str. LB226692 (13) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-319/331) MS 21-1 │ └───────────┤ └─ Escherichia coli (4-319/331) MS 185-1 │ └┬─ Escherichia coli (4-319/331) 101-1 (7) ┌───────────┤ └┬─ Escherichia coli (6-309/321) str. K-12 substr. DH10B │ │ └┬─ Escherichia coli (4-319/331) 042 (53) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-319/331) M718 ┌────┤ │ └─ Escherichia coli (4-312/331) APEC O1 (6) │ │ └─────────────────────── Escherichia coli (12-331/339) H299 (1) │ └───────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 EDL933 (1) ┌──┤ └─ Escherichia coli (4-314/315) 1044A (4) │ │ ┌───────────────────── Escherichia coli (9-321/344) 83972 (13) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-338/343) ETEC H10407 │ └───┤ ┌──────────────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (8-338/343) H736 (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli B354 (2) │ └────────────┤ │ ┌─ Escherichia coli 83972 (5) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli APEC O1 (6) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli ED1a (1) │ └───────────────────────┤ ┌┴┬─ Escherichia coli M605 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli NC101 (2) │ │┌┤└─ Escherichia coli 1125A (12) │ ││└─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 str. LB226692 (53) │ └┤ ┌─ Escherichia coli E110019 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli 536 (4) │ │┌┴─ Escherichia coli M718 │ └┤┌─ Escherichia coli MS 21-1 │ └┤ ┌─ Escherichia coli FVEC1412 (1) ┌─┤ └┬┴─ Escherichia coli 1827-70 │ │ └┬─ Escherichia coli 101-1 (5) │ │ └┬─ Escherichia coli MS 115-1 │ │ └─ Escherichia coli K12 (20) │ │ ┌─ Escherichia coli (11-332/341) MS 69-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-321/330) SE15 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (11-332/341) M605 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-321/330) H736 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-321/330) 101-1 (48) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (11-332/341) K12 (64) │ │ │ └┬─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 (1-321/330) str. LB226692 (3) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (11-332/341) 55989 (2) │ │ │└┬─ Escherichia coli (11-332/341) ED1a (1) │ │ ┌───────────────────────┤ └─ Escherichia coli (11-332/341) 2362-75 (2) │ │ │ └─ Escherichia coli (11-332/341) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-331/367) FVEC1302 (3) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (26-354/390) MS 69-1 │ └──┤ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (26-354/390) MS 21-1 │ │ ┌───────────────────────────────┴─────────────── Escherichia coli (4-333/352) O157:H7 str. EC4024 │ │┌──────┴────────────────────────────────────── Escherichia coli (1-311/336) M718 (3) │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-326/341) ABU 83972 (3) │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-326/341) 2362-75 (13) │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-326/341) K12 (75) │ │ ┌────────────────┴─ Escherichia coli (3-326/341) E24377A (1) │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-315/327) H591 (2) │ └────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-315/327) E24377A (6) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-318/330) E24377A │ └───────────┤┌─ Escherichia coli (1-315/327) 2362-75 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-315/327) B str. REL606 (2) │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-315/327) 1212A (1) ┤ │┌┴─ Escherichia coli (1-315/327) B354 │ └┤┌─ Escherichia coli (3-318/330) ATCC 8739 [2] │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-318/330) K12 (12) │ └┬┴─ Escherichia coli (3-318/330) APEC O1 [2] │ └┬─ fig|1040638.4.peg.1465 O104:H4 (1-315/327) str. LB226692 (78) │ └─ Escherichia coli (1-315/327) M605 (1) │ ┌─ Escherichia coli (4-314/332) 2362-75 (14) │ ┌┴─ Escherichia coli (4-314/332) NC101 │ ┌┴─ Escherichia coli (4-314/332) SE15 │ ┌┴─ Escherichia coli (4-314/332) M605 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (4-314/332) WV_060327 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (4-314/332) APEC O1 (6) │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-314/332) ED1a (2) │ │└┬─ Escherichia coli (4-315/332) MS 196-1 │ │ └─ Escherichia coli (4-315/332) K12 (25) │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (4-315/332) O111:H- str. 11128 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-315/332) B088 (23) │ │└┬┴─ Escherichia coli (4-315/332) E110019 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-315/332) M718 │ ┌────────────────────────────┤ └┬─ Escherichia coli (4-315/332) MS 69-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-314/332) H299 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-329/332) TA280 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-315/332) str. LB226692 (5) │ │ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) FVEC1302 (3) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-303/337) SMS-3-5 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-303/337) B088 (10) │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (17-316/350) IAI39 (1) │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (17-316/350) O83:H1 str. NRG 857C (1) │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-303/337) B171 (8) │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-303/337) H299 │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (17-316/350) NC101 └─────┤ ││ └─ Escherichia coli (17-316/350) 536 (11) │ │└┬─ Escherichia coli (17-316/350) MS 69-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (17-316/350) B354 │ ││ └┬─ Escherichia coli (17-316/350) TA143 │ ││ └─ Escherichia coli (25-324/358) 042 (1) │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (17-316/350) MS 21-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (4-303/337) HS (1) │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2577 O104:H4 (17-316/350) str. LB226692 (6) │ ┌───────────────────────┤└┬─ Escherichia coli (17-316/350) O111:H- str. 11128 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (17-316/350) B185 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-303/337) K12 (25) │ │ └┬─ Escherichia coli (17-316/350) 101-1 (5) └───┤ └─ Escherichia coli (17-316/350) 1044A (25) │ ┌─ Escherichia coli (3-325/356) MS 116-1 │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (3-325/356) H736 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-330/363) K12 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) 1827-70 (29) └─────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) E24377A [2] │ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/363) HS [2] │ │ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) SMS-3-5 └───────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) MS 21-1 │┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) FVEC1302 (3) ││┌─ Escherichia coli (1-330/363) 042 (1) └┤│ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) H299 ││ ┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) M605 ││ ┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) 536 (8) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-330/363) APEC O1 │ ┌┴┬── Escherichia coli (2-327/360) CFT073 │ │ └┬─ Escherichia coli (2-327/360) 83972 (7) │┌┤ └─ Escherichia coli (2-327/360) TA206 └┤└─ Escherichia coli (2-327/360) O83:H1 str. NRG 857C │┌─ Escherichia coli (1-330/363) E2348/69 (3) └┤┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 └┤┌─ Escherichia coli (2-327/360) TA143 └┤ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) B185 (21) └┬┴─ Escherichia coli (2-324/344) O157:H7 str. EC4486 └┬─ Escherichia coli (2-327/360) MS 115-1 └┬─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (2-327/360) str. LB226692 (5) └─ Escherichia coli (2-327/360) B088 (6)
| Transcriptional repressor of the lac operon | (25) |
| AscBF operon repressor | (20) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (16) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (15) |
| Ribose operon repressor | (11) |
| Positive regulator of L-idonate catabolism | (11) |
| Transcriptional (co)regulator CytR | (10) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (9) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (5) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (4) |
| Trehalose operon transcriptional repressor | (2) |
| Ribitol operon repressor | (2) |
| hypothetical protein | (1) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (1) |
| Putative ThuR, regulatory protein for trehalosemaltose transport | (1) |
| Others | (7) |