┌─ fig|1040638.4.peg.1465 O104:H4 (1-315/327) str. LB226692 ├─ Escherichia coli (1-315/327) 042 ├─ Escherichia coli (1-315/327) 1044A ├─ Escherichia coli (1-315/327) 1827-70 ├─ Escherichia coli (1-315/327) 536 ├─ Escherichia coli (1-315/327) 55989 ├─ Escherichia coli (1-315/327) 83972 ├─ Escherichia coli (1-315/327) B171 ├─ Escherichia coli (1-315/327) B7A ├─ Escherichia coli (1-315/327) E110019 ├─ Escherichia coli (1-315/327) EC4100B ├─ Escherichia coli (1-315/327) ED1a ├─ Escherichia coli (1-315/327) F11 ├─ Escherichia coli (1-315/327) FVEC1412 ├─ Escherichia coli (1-315/327) H736 ├─ Escherichia coli (1-315/327) IAI39 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 107-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 116-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 146-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 187-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 198-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 21-1 ├─ Escherichia coli (1-315/327) NC101 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O127:H6 str. E2348/69 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (1-315/327) O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli (1-315/327) SE15 ├─ Escherichia coli (1-315/327) TA143 ├─ Escherichia coli (1-315/327) UMN026 ├─ Escherichia coli (1-315/327) WV_060327 ┌┼─ Escherichia coli (1-315/327) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (1-315/327) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (1-315/327) W │├─ Escherichia coli (1-315/327) TA280 │├─ Escherichia coli (1-315/327) SMS-3-5 │├─ Escherichia coli (1-315/327) SE11 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. TW14588 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC508 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4076 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 str. EC4042 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O157:H7 EDL933 │├─ Escherichia coli (1-315/327) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 45-1 │├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 200-1 ┌┤├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 196-1 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 185-1 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 145-7 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 115-1 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) M718 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) IAI39 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) H299 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) FVEC1302 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) ED1a ││├─ Escherichia coli (1-315/327) E22 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) CFT073 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) B185 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) ABU 83972 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) 55989 ││├─ Escherichia coli (1-315/327) 53638 ┌┤│├─ Escherichia coli (1-315/327) 536 │││├─ Escherichia coli (1-315/327) 1125A │││├─ Escherichia coli (1-315/327) 101-1 │││└─ fig|6666666.5357.peg.2526 TY-2482 (1-315/327) strain ││└┬─ Escherichia coli (1-315/327) MS 69-1 ││ └─ Escherichia coli (1-315/327) M605 ││ ┌─ Escherichia coli (1-315/327) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (1-315/327) S88 ││ ├─ Escherichia coli (1-315/327) UM146 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-315/327) UTI89 ││ │├─ Escherichia coli (1-315/327) UTI89 ││┌┤├─ Escherichia coli (1-315/327) TA206 ││││└─ Escherichia coli (1-315/327) IHE3034 │││└─ Escherichia coli (3-318/330) APEC O1 ┌┤││┌─ Escherichia coli (3-318/330) 53638 ││└┤├─ Escherichia coli (3-318/330) B7A ││ │├─ Escherichia coli (3-318/330) E110019 ││ │├─ Escherichia coli (3-318/330) E2348/69 ││ │├─ Escherichia coli (3-318/330) K12 ││ │├─ Escherichia coli (3-318/330) O157:H7 EDL933 ││ └┼─ Escherichia coli (3-318/330) W3110 ││ ├─ Escherichia coli (3-318/330) O157:H7 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (3-318/330) F11 │││ ├─ Escherichia coli (3-318/330) E22 │││ ├─ Escherichia coli (3-318/330) CFT073 │││ ├─ Escherichia coli (3-318/330) B171 │││ └─ Escherichia coli (3-318/330) 042 ││└┬─ Escherichia coli (1-315/327) ATCC 8739 ││ └─ Escherichia coli (3-318/330) ATCC 8739 ┌┤│┌─ Escherichia coli (1-315/327) B354 ││└┤ ┌─ Escherichia coli (1-315/327) 1212A ││ │┌┴─ Escherichia coli (1-315/327) 536A ││ └┤┌─ Escherichia coli (1-315/327) BL21 ││ └┼─ Escherichia coli (DE3 1-315/327) BL21(DE3) ┌───────────┤│ └─ Escherichia coli (1-315/327) B str. REL606 │ │└─ Escherichia coli (1-315/327) 2362-75 │ │┌─ Escherichia coli (3-318/330) E24377A │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-315/327) H591 │ └┤┌┼─ Escherichia coli (1-315/327) TA271 │ ││└─ Escherichia coli (1-315/327) MS 119-7 │ └┤┌─ Escherichia coli (1-315/327) IAI1 │ │├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 78-1 │ └┼─ Escherichia coli (1-315/327) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (1-315/327) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (1-315/327) IAI1 │ └─ Escherichia coli (1-315/327) E24377A │ ┌─ Escherichia coli (3-326/341) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (3-326/341) E24377A │ │ ┌─ Escherichia coli (3-326/341) 2362-75 ┌────────┤ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 536 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) E2348/69 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) M605 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-326/341) UM146 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-326/341) WV_060327 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) TA206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 200-1 │ │ │┌┤├─ Escherichia coli (3-326/341) F11 │ │ │││├─ Escherichia coli (3-326/341) APEC O1 │ │ │││└─ Escherichia coli (3-326/341) 536 │ │ │││┌─ Escherichia coli (3-326/341) CFT073 │ │ ││└┼─ Escherichia coli (3-326/341) MS 45-1 │ └────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 185-1 │ ││ └─ Escherichia coli (3-326/341) ABU 83972 │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1860 TY-2482 (3-326/341) strain │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) 1044A │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) 1212A │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) B171 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) B7A │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) E22 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) H299 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) H736 │ ││├─ Escherichia coli (3-326/341) IAI1 │ └┤├─ Escherichia coli (3-326/341) IAI39 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) K12 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) M718 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 115-1 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 119-7 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4206 ┌┤ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (3-326/341) O26:H11 str. 11368 ││ │├─ Escherichia coli (3-326/341) SE11 ││ │├─ Escherichia coli (3-326/341) TA143 ││ │├─ Escherichia coli (3-326/341) TA280 ││ └┼─ Escherichia coli (3-326/341) W3110 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) W ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) TA271 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) SMS-3-5 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O55:H7 str. CB9615 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4196 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4113 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) O111:H- str. 11128 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 84-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 69-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 198-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 187-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 146-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 124-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 116-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) MS 107-1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) KO11 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) IAI39 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) IAI1 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) HS ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) H591 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) FVEC1412 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) ETEC H10407 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) E22 ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) E110019 ┌──┤│ ├─ Escherichia coli (3-326/341) B7A │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) B185 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) B171 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 536A │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 1827-70 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 1125A │ ││ ├─ Escherichia coli (3-326/341) 042 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3714 O104:H4 (3-326/341) str. LB226692 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-311/336) M718 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-311/336) MS 119-7 │ ││ ┌─────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (1-311/336) MS 175-1 │ │└──────┤ └─ Escherichia coli (1-311/336) MS 107-1 │ │ │ ┌─────────────── Escherichia coli (4-333/352) O157:H7 str. EC4024 │ │ └───────────────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (26-354/390) MS 21-1 │ │ └───────────────┤┌─ Escherichia coli (26-354/390) MS 69-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (26-354/390) FVEC1412 │ │ └┼─ Escherichia coli (3-331/367) UMN026 │ │ ├─ Escherichia coli (26-354/390) MS 198-1 │ │ └─ Escherichia coli (3-331/367) FVEC1302 │ │ ┌─ Escherichia coli (11-332/341) MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (11-332/341) 2362-75 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (11-332/341) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (13-334/343) E2348/69 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (11-332/341) ED1a │ │ ││ └─ Escherichia coli (11-332/341) ED1a │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-321/330) 101-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) 1125A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) B185 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) BL21 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) DH1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) E22 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) ETEC H10407 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) HS │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) IAI1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 107-1 │ └───────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 175-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 78-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4045 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. Sakai │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) O55:H7 str. CB9615 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) W │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) str. K-12 substr. DH10B │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-321/330) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ │├─ Escherichia coli (1-321/330) str. K-12 substr. MG1655 │ └┤ │├─ Escherichia coli (1-321/330) W │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) O111:H- str. 11128 │ │ │├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 84-1 │ │┌┤├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 187-1 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 124-1 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) MS 116-1 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) KO11 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) IAI1 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) H591 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) E24377A │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) E110019 │ │││├─ Escherichia coli (DE3 1-321/330) BL21(DE3) │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) B354 │ │││├─ Escherichia coli (1-321/330) 1212A │ │││└─ Escherichia coli (1-321/330) 1044A │ │││ ┌─ Escherichia coli (1-321/330) H736 │ ││└┬┴─ Escherichia coli (1-321/330) MS 146-1 │ ││ └┬─ Escherichia coli (11-332/341) M605 │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-321/330) SE15 │ ││ └─ Escherichia coli (11-332/341) MS 69-1 │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.1350 O104:H4 (1-321/330) str. LB226692 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-321/330) B7A │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-321/330) MS 145-7 │ │ │└─ fig|6666666.5357.peg.4011 TY-2482 (1-321/330) strain │ │┌┤┌─ Escherichia coli (11-332/341) 55989 │ ││└┼─ Escherichia coli (11-332/341) B7A │ ││ └─ Escherichia coli (11-332/341) 55989 │ ││┌─ Escherichia coli (11-332/341) 042 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) 536 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) 83972 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) APEC O1 │ ││├─ Escherichia coli (13-334/343) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) B171 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) E22 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) F11 │ ││├─ Escherichia coli (11-332/341) FVEC1412 │ └┤├─ Escherichia coli (11-332/341) HS │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) IAI39 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) K12 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 182-1 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) O83:H1 str. NRG 857C │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) SE11 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) TA143 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) TA271 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) UMN026 │ │├─ Escherichia coli (11-332/341) WV_060327 │ └┼─ Escherichia coli (11-332/341) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) W3110 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) TA280 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) TA206 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) S88 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) NC101 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 21-1 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) MS 185-1 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) M718 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) IHE3034 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) H299 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) F11 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) E24377A │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) E110019 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) B171 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) B088 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (13-334/343) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) 536A │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) 53638 │ ├─ Escherichia coli (11-332/341) 536 ┌─┤ └─ Escherichia coli (13-334/343) 042 │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.3669 O104:H4 str. LB226692 │ │ ├─ Escherichia coli 042 │ │ ├─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli 2362-75 │ │ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ ├─ Escherichia coli B088 │ │ ├─ Escherichia coli B171 │ │ ├─ Escherichia coli B7A │ │ ├─ Escherichia coli E22 │ │ ├─ Escherichia coli E2348/69 │ │ ├─ Escherichia coli E24377A │ │ ├─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ ├─ Escherichia coli IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli MS 107-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 182-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 78-1 │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli SE11 │ │ ├─ Escherichia coli TA280 │ │ ├─ Escherichia coli W │ │ ┌┼─ Escherichia coli W │ │ │├─ Escherichia coli UMN026 │ │ │├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │├─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │├─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ │├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │ │├─ Escherichia coli KO11 │ │ │├─ Escherichia coli IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli IAI1 │ │ │├─ Escherichia coli EC4100B │ │ │├─ Escherichia coli E24377A │ │ │├─ Escherichia coli E22 │ │ │├─ Escherichia coli B7A │ │ ┌┤├─ Escherichia coli B185 │ │ ││├─ Escherichia coli B171 │ │ ││├─ Escherichia coli 55989 │ │ ││├─ Escherichia coli 536A │ │ ││├─ Escherichia coli 1212A │ │ ││├─ Escherichia coli 042 │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.3940 TY-2482 strain │ │ ││ ┌─ Escherichia coli 1125A │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ │ ││┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ │└┤└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli NC101 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli WV_060327 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ ││└┬─ Escherichia coli SE15 │ │ ┌┤ ││ └─ Escherichia coli M605 │ │ ││ └┤ ┌─ Escherichia coli ED1a │ │ ││ │┌┴─ Escherichia coli ED1a │ │ ││ ││ ┌─ Escherichia coli 83972 │ │ ││ ││ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ││ └┤ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ ││ │┌┼─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ ││ ││├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ││ ││└─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ ││ └┤┌─ Escherichia coli APEC O1 │ │ ││ │├─ Escherichia coli S88 │ │ ││ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ ││ ├─ Escherichia coli UM146 │ │ ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ ││ └─ Escherichia coli APEC O1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli 536 │ │ ││ ├─ Escherichia coli F11 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 200-1 │ │ ││ │├─ Escherichia coli F11 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli 536 │ │ ││ │└┬─ Escherichia coli E110019 │ │ ││┌┤ └─ Escherichia coli E110019 │ │ │││└─ Escherichia coli M718 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli MS 21-1 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli TA271 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli 1827-70 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli 101-1 │ │ ┌───────────────────────┤ ││ ├─ Escherichia coli BL21 │ │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli MS 187-1 │ │ │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli OP50 │ │ │ │ ││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ │ │ │ ││└─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ │ │ ││┌─ Escherichia coli MS 115-1 │ │ │ │ └┤│┌─ Escherichia coli 53638 │ │ │ │ ││├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ │ │ ││├─ Escherichia coli DH1 │ │ │ │ ││├─ Escherichia coli H736 │ │ │ │ └┤├─ Escherichia coli HS │ │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌────────────┤ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli W3110 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli K12 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli HS │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli BW2952 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ │ │ │ └─ Escherichia coli 53638 │ │ ┌───┤ │ │┌─ Escherichia coli H299 │ │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli MS 69-1 │ │ │ │ │ └─ Escherichia coli B354 │ │ │ │ └──────────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (8-338/343) ETEC H10407 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-338/343) MS 175-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (8-338/343) H736 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-321/344) ABU 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-330/353) APEC O1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) M605 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) S88 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) UM146 │ │ │ └────────────────────┼─ Escherichia coli (9-321/344) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) SE15 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) MS 45-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) IHE3034 │ │ │ ├─ Escherichia coli (18-330/353) CFT073 │ │ │ ├─ Escherichia coli (9-321/344) APEC O1 │ │ │ └─ Escherichia coli (9-321/344) 83972 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-314/315) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 str. TW14588 │ └──┤ │├─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌───────────────────────────────────────────┤└─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 EDL933 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-314/315) O157:H7 EDL933 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (12-331/339) H299 │ │ │ ┌──────────────────────┴─ Escherichia coli (12-331/339) M718 │ │ │ │ ┌─ fig|1040638.4.peg.970 O104:H4 (5-320/332) str. LB226692 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) 2362-75 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) 55989 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 5-320/332) BL21(DE3) │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) DH1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) FVEC1302 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) HS │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) K12 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) MS 146-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) MS 69-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) SE15 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) UMN026 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) W │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (5-320/332) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (5-320/332) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) W3110 │ └────┤ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) W │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) TA143 │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) OP50 │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) MS 198-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) KO11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (5-320/332) HS │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (5-320/332) FVEC1412 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (5-320/332) EC4100B │ │ │ ││├─ Escherichia coli (5-320/332) BW2952 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (5-320/332) B str. REL606 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (5-320/332) 55989 │ │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.1198 TY-2482 (5-320/332) strain │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-320/332) MS 124-1 │ │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) MS 84-1 │ │ │ │││┌─ Escherichia coli (5-320/332) MS 145-7 │ │ │ │└┤│ ┌─ Escherichia coli (5-320/332) ED1a │ │ │ │ ││┌┼─ Escherichia coli (5-320/332) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ │ └┤│└─ Escherichia coli (5-320/332) ED1a │ │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-320/332) APEC O1 │ │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (5-320/332) IHE3034 │ │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli (5-320/332) UTI89 │ │ │ ┌┤ │┌┼─ Escherichia coli (5-320/332) UTI89 │ │ │ ││ ││├─ Escherichia coli (5-320/332) UM146 │ │ │ ││ ││└─ Escherichia coli (15-330/342) APEC O1 │ └───────────┤ ││ └┤┌─ Escherichia coli (5-320/332) ABU 83972 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (5-320/332) CFT073 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (5-320/332) IAI39 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (5-320/332) MS 45-1 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (5-320/332) TA206 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (5-320/332) SMS-3-5 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (5-320/332) MS 185-1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (5-320/332) IAI39 │ │ ┌──────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (15-330/342) CFT073 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (5-320/332) 83972 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (5-320/332) B7A │ │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) B7A │ │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (5-320/332) M718 │ │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (5-320/332) 536 │ │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (5-320/332) 536 │ │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (5-320/332) F11 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (5-320/332) MS 200-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (5-320/332) F11 │ │ │ └─ Escherichia coli (5-320/332) MS 196-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-319/331) 1044A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 1212A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) B171 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) B185 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 124-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) SE11 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-319/331) TA271 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. TW14359 │ └─────────┤ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4501 ┤ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-319/331) O103:H2 str. 12009 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 78-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 145-7 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 119-7 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) EC4100B │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) 536A │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (4-319/331) 1125A │ │ ││└┬─ Escherichia coli (6-309/321) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-309/321) O157:H7 EDL933 │ │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1745 TY-2482 (4-319/331) strain │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) 55989 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) E110019 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) IAI1 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 107-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (4-319/331) W │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) W │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O111:H- str. 11128 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) KO11 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) IAI1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) E110019 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2021 O104:H4 (4-319/331) str. LB226692 │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-319/331) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-319/331) MS 185-1 │ └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (4-319/331) 101-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) E24377A │ │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 187-1 │ │┌┼─ Escherichia coli (4-319/331) OP50 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 115-1 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) E24377A │ ││└─ Escherichia coli (4-319/331) B str. REL606 │ ││┌─ Escherichia coli (6-309/321) str. K-12 substr. DH10B │ │││ ┌─ Escherichia coli (4-312/331) APEC O1 │ │││ ├─ Escherichia coli (4-312/331) IHE3034 │ └┤│ ├─ Escherichia coli (4-312/331) UM146 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-312/331) UTI89 │ ││ │├─ Escherichia coli (4-312/331) UTI89 │ ││┌┤├─ Escherichia coli (4-312/331) S88 │ ││││└─ Escherichia coli (4-312/331) APEC O1 │ │││└─ Escherichia coli (4-319/331) M718 │ │││┌─ Escherichia coli (4-319/331) 042 │ └┤│├─ Escherichia coli (4-319/331) 2362-75 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) 536 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) 53638 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) ABU 83972 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 4-319/331) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) DH1 │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) ED1a │ ││├─ Escherichia coli (4-319/331) ETEC H10407 │ └┤├─ Escherichia coli (4-319/331) F11 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) FVEC1412 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) H736 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) HS │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) IAI39 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 116-1 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 175-1 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) NC101 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) SE15 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) TA143 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) TA280 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) W3110 │ │├─ Escherichia coli (4-319/331) str. K-12 substr. DH10B │ └┼─ Escherichia coli (4-319/331) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) str. K-12 substr. MG1655 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) TA206 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) SMS-3-5 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 200-1 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) MS 146-1 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) M605 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) IAI39 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) HS │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) H299 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) FVEC1302 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) F11 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) ED1a │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) E2348/69 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) B354 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 83972 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 53638 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 536 │ ├─ Escherichia coli (4-319/331) 1827-70 │ └─ Escherichia coli (4-319/331) 042 │ ┌─ Escherichia coli (4-314/332) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) 536 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) F11 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) MS 185-1 │ ├─ Escherichia coli (4-314/332) MS 45-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (4-314/332) O83:H1 str. NRG 857C │ │├─ Escherichia coli (4-314/332) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (4-314/332) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (4-314/332) F11 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-314/332) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (4-314/332) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (4-314/332) 83972 │ ┌┤│└─ Escherichia coli (4-314/332) 536 │ ││└─ Escherichia coli (4-314/332) NC101 │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-314/332) SE15 │ │└─ Escherichia coli (4-314/332) M605 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (4-314/332) WV_060327 │ │││┌─ Escherichia coli (4-314/332) APEC O1 │ │└┤├─ Escherichia coli (4-314/332) S88 │ │ │├─ Escherichia coli (4-314/332) UTI89 │ │ └┼─ Escherichia coli (4-314/332) UTI89 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-314/332) UM146 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-314/332) IHE3034 │ ││ └─ Escherichia coli (4-314/332) APEC O1 │ ││┌─ Escherichia coli (4-314/332) ED1a │ │└┼─ Escherichia coli (4-314/332) TA206 │ │ └─ Escherichia coli (4-314/332) ED1a │ ┌┤┌─ Escherichia coli (4-315/332) MS 196-1 │ │││┌─ Escherichia coli (4-315/332) 1827-70 │ │││├─ Escherichia coli (4-315/332) 53638 │ │││├─ Escherichia coli (4-315/332) ATCC 8739 │ │││├─ Escherichia coli (4-315/332) BL21 │ │││├─ Escherichia coli (4-315/332) BW2952 │ │└┤├─ Escherichia coli (4-315/332) ETEC H10407 │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) HS │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 175-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) str. K-12 substr. DH10B │ │ └┼─ Escherichia coli (4-315/332) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 187-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 146-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 115-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) HS │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) H736 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) DH1 │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3 4-315/332) BL21(DE3) │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) B str. REL606 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) ATCC 8739 │ ││ ├─ Escherichia coli (4-315/332) 53638 │ ││ └─ Escherichia coli (4-315/332) 101-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-329/332) TA280 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-314/332) H299 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-315/332) MS 69-1 │ ││┌┴─ Escherichia coli (4-315/332) M718 │ │││ ┌─ Escherichia coli (4-315/332) E110019 │ │└┤┌┴─ Escherichia coli (4-315/332) E110019 │ │ ││┌─ Escherichia coli (4-315/332) O111:H- str. 11128 │ │ │││┌─ Escherichia coli (4-315/332) B171 │ │ └┤│├─ Escherichia coli (4-315/332) B7A │ │ ││├─ Escherichia coli (4-315/332) E22 │ │ ││├─ Escherichia coli (4-315/332) E24377A │ ┌────────────────────────────┤ ││├─ Escherichia coli (4-315/332) EC4100B │ │ │ └┤├─ Escherichia coli (4-315/332) KO11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 124-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 182-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 84-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) TA271 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (4-315/332) W │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) W │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) SE11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 78-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) MS 119-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) E24377A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) B171 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-315/332) B088 │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.1436 TY-2482 (4-315/332) strain │ │ │├─ Escherichia coli (4-315/332) 55989 │ │ └┼─ Escherichia coli (4-315/332) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-315/332) 55989 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.4084 O104:H4 (4-315/332) str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) B185 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) 2362-75 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) IAI39 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) W │ │ ┌┼─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) W │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) TA280 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) IAI39 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. TW14359 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. EC4401 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) O157:H7 str. EC4115 │ │ ││└─ Escherichia coli (2-327/360) M718 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (2-324/344) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-327/360) MS 115-1 │ │ │││ ┌─ fig|1040638.4.peg.5358 O104:H4 (2-327/360) str. LB226692 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) 55989 │ │ │└┤ ├─ Escherichia coli (2-327/360) O111:H- str. 11128 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (2-327/360) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) 55989 │ │ │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.1942 TY-2482 (2-327/360) strain │ │ ┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (2-327/360) IAI1 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 145-7 │ │ ││ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 78-1 │ │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-327/360) O103:H2 str. 12009 │ │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 182-1 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) IAI1 │ │ │││ └─ Escherichia coli (2-327/360) B088 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (2-327/360) TA143 │ │ ││└─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-330/363) O157:H7 │ │ │└┼─ Escherichia coli (1-330/350) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-330/343) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-330/363) E2348/69 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (2-327/360) O83:H1 str. NRG 857C │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) 83972 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) ED1a │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 185-1 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) NC101 └─────┤ │└┤ ┌┼─ Escherichia coli (2-327/360) SE15 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 45-1 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-327/360) ED1a │ │ │ ││└─ Escherichia coli (2-327/360) ABU 83972 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (2-327/360) TA206 │ │ ││└── Escherichia coli (2-327/360) CFT073 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-330/363) APEC O1 │ ┌┤ ││ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) H299 │ ││ └┤┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) M605 │ ││ ││┌─ Escherichia coli (2-327/360) 536 │ ││ └┤├─ Escherichia coli (2-327/360) IHE3034 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-327/360) S88 │ ││ │├─ Escherichia coli (2-327/360) UTI89 │ ││ └┼─ Escherichia coli (2-327/360) UTI89 │ ││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) UM146 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 200-1 │ │││ ├─ Escherichia coli (2-327/360) APEC O1 │ │││ └─ Escherichia coli (2-327/360) 536 │ ││└┬─ Escherichia coli (1-330/363) 042 │ ││ └─ Escherichia coli (1-330/363) 042 │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-327/360) SMS-3-5 │ ││┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) MS 21-1 │ │└┤┌─ Escherichia coli (2-327/360) FVEC1412 │ ┌───────────────┤ └┼─ Escherichia coli (2-327/360) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 198-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-327/360) FVEC1302 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-330/363) HS │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) HS │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-330/363) E24377A │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (2-327/360) E24377A │ │ └┤│ ┌─ Escherichia coli (1-330/363) ATCC 8739 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-330/363) K12 │ │ │││┌─ Escherichia coli (2-327/360) 53638 │ │ └┤│├─ Escherichia coli (2-327/360) B str. REL606 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) BL21 │ │ ││├─ Escherichia coli (DE3 2-327/360) BL21(DE3) │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) DH1 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-327/360) H591 │ │ └┤├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 175-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 196-1 │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 84-1 │ ┌─────────────────┤ │├─ Escherichia coli (2-327/360) SE11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) W3110 │ │ │ │├─ Escherichia coli (2-327/360) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-327/360) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) TA271 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) OP50 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 69-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 187-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 146-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) MS 119-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) H736 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) ETEC H10407 │ │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 2-327/360) BL21(DE3) │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) BL21 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) B354 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-327/360) ATCC 8739 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-327/360) 1827-70 │ │ └───────────────┬─ Escherichia coli (3-325/356) H736 │ │ └─ Escherichia coli (3-325/356) MS 116-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (4-303/337) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (4-303/337) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (4-303/337) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. FRIK2000 └───┤ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (4-303/337) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4113 │ ┌┤├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (17-316/350) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (4-303/337) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (17-316/350) 536A │ ││└─ Escherichia coli (17-316/350) 1125A │ ││┌─ Escherichia coli (17-316/350) B str. REL606 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 17-316/350) BL21(DE3) │ │└┼─ Escherichia coli (17-316/350) OP50 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 187-1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) BL21 │ │ └─ Escherichia coli (17-316/350) 101-1 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) 1827-70 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) ATCC 8739 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) DH1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) H736 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) IAI1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) KO11 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 124-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-303/337) MS 175-1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) W └───────────────────────┤ ├─ Escherichia coli (4-303/337) str. K-12 substr. DH10B │ ├─ Escherichia coli (17-316/350) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (4-303/337) W3110 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) W │ │├─ Escherichia coli (4-303/337) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (4-303/337) MS 146-1 │ │├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 116-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-303/337) K12 │ ││├─ Escherichia coli (17-316/350) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (4-303/337) ETEC H10407 │ ││├─ Escherichia coli (17-316/350) BW2952 │┌┤│├─ Escherichia coli (4-303/337) ATCC 8739 ││││└─ Escherichia coli (4-303/337) 53638 │││└─ Escherichia coli (17-316/350) B185 ││└┬─ Escherichia coli (17-316/350) O26:H11 str. 11368 ││ └─ Escherichia coli (17-316/350) O111:H- str. 11128 ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.2577 O104:H4 (17-316/350) str. LB226692 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) M718 ││ ┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) SE11 ││ │├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 115-1 └┤ ┌┤├─ Escherichia coli (17-316/350) 55989 │ ││└─ fig|6666666.5357.peg.4361 TY-2482 (17-316/350) strain │┌┤└┬─ Escherichia coli (17-316/350) HS │││ └─ Escherichia coli (4-303/337) HS ││└─ Escherichia coli (17-316/350) MS 21-1 ││ ┌─ Escherichia coli (25-324/358) 042 ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-303/337) 042 ││ ┌┴─ Escherichia coli (17-316/350) TA143 ││ ┌┴─ Escherichia coli (17-316/350) B354 ││┌┴─ Escherichia coli (17-316/350) MS 69-1 └┤│ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) 536 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (4-303/337) F11 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) S88 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) UTI89 ││ ┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) UTI89 ││ │├─ Escherichia coli (17-316/350) UM146 └┤ │├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 200-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (17-316/350) F11 │ ││├─ Escherichia coli (25-324/358) APEC O1 │┌┤│└─ Escherichia coli (17-316/350) 536 │││└─ Escherichia coli (17-316/350) NC101 ││└─ Escherichia coli (4-303/337) H299 ││ ┌─ Escherichia coli (4-303/337) B171 ││ ├─ Escherichia coli (4-303/337) E22 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) H591 └┤ ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 119-7 │┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) TA271 ││├─ Escherichia coli (17-316/350) O103:H2 str. 12009 ││├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 107-1 ││├─ Escherichia coli (4-303/337) E22 ││└─ Escherichia coli (4-303/337) B171 └┤ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) O83:H1 str. NRG 857C │ ┌┴─ Escherichia coli (17-316/350) TA280 │┌┴┬─ Escherichia coli (17-316/350) IAI39 ││ └─ Escherichia coli (17-316/350) IAI39 ││ ┌─ Escherichia coli (17-316/350) FVEC1302 ││ ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 198-1 └┤ ┌┼─ Escherichia coli (17-316/350) UMN026 │┌┤└─ Escherichia coli (17-316/350) FVEC1412 ││└─ Escherichia coli (4-303/337) SMS-3-5 ││┌─ Escherichia coli (4-303/337) B7A └┤├─ Escherichia coli (4-303/337) E110019 │├─ Escherichia coli (17-316/350) E24377A │├─ Escherichia coli (17-316/350) EC4100B │├─ Escherichia coli (4-303/337) MS 182-1 └┼─ Escherichia coli (4-303/337) MS 78-1 ├─ Escherichia coli (17-316/350) MS 145-7 ├─ Escherichia coli (4-303/337) E24377A ├─ Escherichia coli (17-316/350) E110019 ├─ Escherichia coli (17-316/350) B7A └─ Escherichia coli (4-303/337) B088
| Transcriptional (co)regulator CytR | (130) |
| Gluconate utilization system Gnt-I transcriptional repressor | (129) |
| Maltose regulon regulatory protein MalI (repressor for malXY) | (128) |
| Ribose operon repressor | (120) |
| AscBF operon repressor | (117) |
| Transcriptional repressor of the lac operon | (110) |
| Purine nucleotide synthesis repressor | (94) |
| Transcriptional regulator YcjW, LacI family, possibly involved in maltodextrin utilization pathway | (89) |
| Positive regulator of L-idonate catabolism | (59) |
| Transcriptional regulator, LacI family | (22) |
| Trehalose operon transcriptional repressor | (7) |
| Putative ThuR, regulatory protein for trehalosemaltose transport | (4) |
| Ribitol operon repressor | (3) |
| hypothetical transcriptional regulator YcjW | (2) |
| hypothetical protein | (1) |
| Others | (18) |