fig|1040638.4.peg.3605
Escherichia coli O104:H4 str. LB226692
MKFSVL
L
S
L
Y
Y
K
E
S
ALF
L
HD
C
L
E
SI
AS
NT
CA
P
DQIV
I
VF
DG
Y
I
S
D
D
L
L
H
V
V
NE
F
SSR
L
P
I
DIVR
L
SN
N
V
GLG
K
ALN
----
H
GL
QY
C
RN
E
L
I
F
RMD
T
DDI
CLP
E
RF
AL
QL
SYMKS
H
P
E
V
V
L
LGS
AI
EEF
DNTMKIRQGKR
F
SVIYHED
I
KKFA
K
K
R
N
PFNH
M
TV
V
F
R
K
SV
I
EKL
GGY
-
Q
H
HYLM
EDY
N
LWLR
I
LA
ADYRTH
N
L
SE
VLV
NV
R
AGRN
M
LC
RR
K
G
YS
Y
IR
SE
ILL
-
AKLKYE
L
QLD
N
LTGV
I
YTG
V
I
R
II
PR
I
LP
VSLLKL
VY
NIL
RK
fig|585055.6.peg.2322
Escherichia coli 55989
MKFSVL
L
S
L
Y
Y
K
E
S
ALF
L
HD
C
L
E
SI
AS
NT
CA
P
DQIV
I
VF
DG
Y
I
S
D
D
L
L
H
V
V
NE
F
SSR
L
P
I
DIVR
L
SN
N
V
GLG
K
ALN
----
H
GL
QY
C
RN
E
L
I
F
RMD
T
DDI
CLP
E
RF
AL
QL
SYMKS
H
P
E
V
V
L
LGS
AI
EEF
DNTMKIRQGKR
F
SVIYHED
I
KKFA
K
K
R
N
PFNH
M
TV
V
F
R
K
SV
I
EKL
GGY
-
Q
H
HYLM
EDY
N
LWLR
I
LA
ADYRTH
N
L
SE
VLV
NV
R
AGRN
M
LC
RR
K
G
YS
Y
IR
SE
ILL
-
AKLKYE
L
QLD
N
LTGV
I
YTG
V
I
R
II
PR
I
LP
VSLLKL
VY
NIL
RK
fig|585055.8.peg.2330
Escherichia coli 55989
MKFSVL
L
S
L
Y
Y
K
E
S
ALF
L
HD
C
L
E
SI
AS
NT
CA
P
DQIV
I
VF
DG
Y
I
S
D
D
L
L
H
V
V
NE
F
SSR
L
P
I
DIVR
L
SN
N
V
GLG
K
ALN
----
H
GL
QY
C
RN
E
L
I
F
RMD
T
DDI
CLP
E
RF
AL
QL
SYMKS
H
P
E
V
V
L
LGS
AI
EEF
DNTMKIRQGKR
F
SVIYHED
I
KKFA
K
K
R
N
PFNH
M
TV
V
F
R
K
SV
I
EKL
GGY
-
Q
H
HYLM
EDY
N
LWLR
I
LA
ADYRTH
N
L
SE
VLV
NV
R
AGRN
M
LC
RR
K
G
YS
Y
IR
SE
ILL
-
AKLKYE
L
QLD
N
LTGV
I
YTG
V
I
R
II
PR
I
LP
VSLLKL
VY
NIL
RK
fig|749537.3.peg.3748
Escherichia coli MS 115-1 (1-268/271)
MKF
T
VL
L
S
L
Y
N
R
E
S
KHN
L
FD
C
L
E
SI
KS
NT
IK
P
EQIV
I
VY
DG
P
I
S
E
EL
D
S
IV
TS
F
IKY
L
P
I
EKIK
I
SE
N
I
GLG
N
ALN
----
Y
GL
NF
C
RH
E
I
V
F
RMD
T
DD
K
CKS
T
RF
ER
QL
EIIKI
K
N
D
I
V
LM
GS
AI
EEF
NESMTVSHGVR
F
SAEYHDD
I
INYA
K
R
R
N
PFNH
M
S
V
V
FKK
SI
I
QGL
GGY
-
Q
H
HYFM
EDY
N
LWLR
V
I
A
AGYKTY
NI
PE
VLV
YV
R
GGDK
M
LG
RR
K
G
IP
Y
VI
SE
VKL
-
AKLKYN
L
KID
S
NAGV
I
ISA
T
M
R
IL
PRLLP
VFLLKQ
I
Y
KVL
RK
fig|550672.3.peg.1753
Escherichia coli B088 (13-279/279)
E
FSVLMS
L
Y
C
NEK
PEF
L
NQ
C
L
I
SI
HE
QS
VK
P
NEII
I
VY
DG
Y
I
P
A
EL
D
N
V
V
IE
W
SKV
L
P
V
KVCK
L
HT
N
M
GLG
D
ALN
----
F
G
I
KH
C
NN
E
L
I
A
RMD
T
DDI
CAK
D
RF
KL
QL
QYFNE
N
P
T
L
T
LI
G
G
GI
EE
Y
DEEMQVLRGTR
F
TKEKHAD
I
VKYA
C
F
K
N
PFNH
M
TV
M
FKK
KD
I
QSV
GGY
-
K
K
HLLM
EDY
N
LWLR
L
L
N
NGYKTY
N
L
PE
I
LV
YA
R
TGIN
M
VR
K
R
R
G
MS
Y
FK
SE
IQL
-
FKLKRM
L
NCN
S
YSKN
C
VIF
L
I
R
VL
PR
F
LP
VSVLSI
VY
KIM
RK
fig|358709.5.peg.480
Escherichia coli 101-1 (8-272/275)
FSVLMS
L
Y
Y
K
E
D
PVY
L
DS
CF
A
S
L
AN
Q
L
LL
P
TEIV
C
VF
DG
P
L
N
A
A
L
E
SV
V
FK
W
SEK
L
N
I
TIVR
L
PV
N
V
GLG
N
ALN
----
N
GL
AH
C
SF
D
I
V
A
RMDSDDI
CLP
E
RF
QK
Q
I
PLFFS
D
K
D
L
I
L
LGS
NI
D
EF
EVCENTIKSVR
K
VPLSEAQ
I
RECC
K
I
K
N
PFNH
M
TV
V
F
R
K
NE
I
LSL
GGY
-
Q
H
HFLM
EDY
N
LWLR
V
I
A
KGYKVC
NI
DS
S
LV
KA
R
VGNG
M
VG
RR
K
G
IE
Y
IK
SE
WKL
-
FMLKKK
L
GFQ
S
VFSG
I
CIF
L
M
R
SV
PRLLP
KTVLSM
L
Y
SIS
R
fig|679207.4.peg.1669
Escherichia coli MS 107-1
M
L
L
S
L
Y
K
NE
S
PDN
L
DA
CF
Q
SI
ST
QS
LK
R
FKII
L
VI
DG
P
I
S
S
EL
N
E
V
V
GK
W
KSL
L
P
I
KIIN
L
ER
N
V
GLG
N
ALN
----
I
GL
KY
C
SC
D
Y
V
F
RMD
T
DDI
CHP
D
RF
SI
Q
F
SYLRK
H
P
D
I
D
L
LG
G
QI
V
EF
HECIEEPNGMR
L
VPSKYEE
I
LQYC
K
L
K
N
PFNH
M
TV
V
FK
R
ES
V
LKV
GGY
-
K
H
HLYM
EDY
N
LWLR
M
IS
IGCKVE
N
L
DD
V
I
V
FA
R
TDVN
S
LM
RR
R
G
WQ
Y
VK
SE
WKL
-
ALLKIK
L
RIN
N
PIVS
L
SVF
I
L
R
SI
PRLLP
IMLIRR
I
Y
AHN
RK
fig|585057.4.peg.1038
Escherichia coli IAI39 (7-273/275)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
V
RLLP
TSFRGY
I
Y
KKV
IR
R
fig|585057.6.peg.1035
Escherichia coli IAI39 (7-273/275)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
V
RLLP
TSFRGY
I
Y
KKV
IR
R
fig|749547.3.peg.2552
Escherichia coli MS 187-1 (7-273/275)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
V
RLLP
TSFRGY
I
Y
KKV
IR
R
fig|413997.3.peg.2030
Escherichia coli B str. REL606 (7-254/255)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
fig|511693.5.peg.2060
Escherichia coli BL21 (7-254/255)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
fig|469008.4.peg.1671
Escherichia coli BL21(DE3) (7-254/255)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLF
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
fig|637912.3.peg.3022
Escherichia coli OP50 (7-254/255)
KFSVLM
A
IY
I
KDS
PLL
L
SE
AL
Q
SI
YK
NT
VA
P
DEVI
I
IR
DG
K
V
T
S
EL
N
SVI
DS
W
RRY
L
N
I
KDFT
L
EK
N
M
GLG
A
ALN
----
F
GL
NQ
C
MH
D
L
V
I
R
A
DSDDI
NRT
NRF
EC
I
L
DFMTK
N
G
DV
H
IL
S
S
WV
EEF
EFNPGDKGIIK
K
VPSRNS-
I
LKYS
K
N
R
S
PFNHP
A
V
A
FKK
CE
I
MRV
GGY
-
G
N
EYLY
EDY
A
LWL
K
S
LA
NGCNGD
NI
QQ
VLV
DM
R
FSKE
T
AK
RR
G
G
IK
Y
AI
SE
IKA
-
QYHFYR
A
NYI
S
YQDF
I
INI
I
T
R
IF
fig|749531.3.peg.2106
Escherichia coli MS 69-1 (7-272/273)
RIA
V
I
MS
V
Y
I
N
D
K
FNE
F
KE
A
F
D
SI
IN
Q
T
YS
N
FVFF
I
YA
DG
K
I
N
P
DI
E
S
F
L
QN
Y
NSQ
-
H
V
IFIR
S
EK
N
K
GL
A
Y
ALN
KLIS
V
A
L
VN
N
EF
D
F
I
A
RMD
A
DDI
SLE
D
RF
QR
Q
I
DFFMA
N
P
E
L
D
VV
G
G
LC
Q
EF
GG--ESAREKC
K
IYFTDEA
I
KNNA
F
K
K
C
PF
V
HPTV
M
FK
S
SV
F
NNG
MR
Y
P
E
N
QPLT
ED
M
C
LWL
E
L
IS
ANKKFA
NI
DS
VL
L
KY
R
INEQ
T
LK
RR
R
G
LN
K
AV
T
E
LST
R
LYYAKK
L
KML
S
VRNL
L
YI-
L
I
H
FG
V
R
V
LP
SNIFKL
V
H
KL
fig|439855.10.peg.1180
Escherichia coli SMS-3-5 (7-272/273)
RIA
V
I
MS
V
Y
I
N
D
K
FNE
F
KE
A
F
D
SI
IN
Q
T
YS
N
FVFF
I
YA
DG
K
I
N
P
DI
E
S
F
L
QN
Y
NSQ
-
H
V
IFIR
S
EK
N
K
GL
A
Y
ALN
KLIS
V
A
L
VN
N
EF
D
F
I
A
RMD
A
DDI
SLE
D
RF
QR
Q
I
DFFMA
N
P
E
L
D
VV
G
G
LC
Q
EF
GG--ESAREKC
K
IYFTDEA
I
KNNA
F
K
K
C
PF
V
HPTV
M
FK
S
SV
F
NNG
MR
Y
P
E
N
QPLT
ED
M
C
LWL
E
L
IS
ANKKFA
NI
DS
VL
L
KY
R
INEQ
T
LK
RR
R
G
LN
K
AV
T
E
LST
R
LYYAKK
L
KML
S
VRNL
L
YI-
L
I
H
FG
V
R
V
LP
SNIFKL
V
H
KL
Consen1
Primary consensus
MkfsVlmsiY
kds
l
al
SI
nt
p
i
DG
it
el
svi
w
l
i
l
N
GLg
ALN
----
gL
c
d
v
RmDsDDI
nRF
ql
n
dv
ilgs
eEF
k
I
k
r
PFnHptV
Fkk
i
ggY
-
n
EDy
LWLr
la
Ni
vLv
R
t
RR
G
y
sE
-
l
s
i
i
r
pRlLP
vy
rkR
Consen2
Secondary consensus
ria
ila
nek
f
cf
qs
n
v
di
f
-
v
s
a
klis
a
n
e
i
a
ii
e
sg
f
f
k
v
ma
rs
f
mr
p
h
m
is
l
l
m
k
t
r
a
n
l
h
v
ih
ir
Consensus 1
(when a gap)
Conservative difference
Consensus 2
(when a gap)
Nonconservative diff.
Other character