┌─ Escherichia coli (10-302/310) 101-1 ├─ Escherichia coli (10-302/310) ATCC 8739 ├─ Escherichia coli (10-302/310) B088 ├─ Escherichia coli (10-302/310) B171 ├─ Escherichia coli (DE3 10-302/310) BL21(DE3) ├─ Escherichia coli (10-302/310) E22 ├─ Escherichia coli (10-302/310) E24377A ├─ Escherichia coli (10-302/310) H591 ├─ Escherichia coli (10-302/310) HS ├─ Escherichia coli (10-302/310) KO11 ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 182-1 ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 196-1 ├─ Escherichia coli (10-302/310) O103:H2 str. 12009 ├─ Escherichia coli (10-302/310) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (10-302/310) SE11 ┌┼─ Escherichia coli (10-302/310) W │├─ Escherichia coli (10-302/310) W │├─ Escherichia coli (10-302/310) OP50 │├─ Escherichia coli (10-302/310) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 78-1 │├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 187-1 │├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 175-1 │├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 116-1 │├─ Escherichia coli (10-302/310) HS │├─ Escherichia coli (10-302/310) H736 ┌┤├─ Escherichia coli (10-302/310) ETEC H10407 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) E24377A ││├─ Escherichia coli (10-302/310) E22 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) BL21 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) B171 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) B str. REL606 ││└─ Escherichia coli (10-302/310) ATCC 8739 ││ ┌─ Escherichia coli (10-302/310) E110019 ││┌┴─ Escherichia coli (10-302/310) E110019 │││┌─ Escherichia coli (10-302/310) K12 ┌┤└┤├─ Escherichia coli (10-302/310) str. K-12 substr. DH10B ││ │├─ Escherichia coli (10-302/310) str. K-12 substr. MG1655 ││ └┼─ Escherichia coli (10-302/310) str. K-12 substr. MG1655 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) str. K-12 substr. DH10B ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) W3110 ││ └─ Escherichia coli (10-302/310) DH1 ││┌─ Escherichia coli (10-302/310) 042 ┌┤│├─ Escherichia coli (10-302/310) 55989 │││├─ Escherichia coli (10-302/310) B185 ││└┼─ Escherichia coli (10-302/310) MS 107-1 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) EC4100B ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) 55989 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) 042 ││ └─ fig|1040638.4.peg.5465 O104:H4 (10-302/310) str. LB226692 │└─ Escherichia coli (10-302/310) TA271 │┌─ Escherichia coli (10-302/310) 536 │├─ Escherichia coli (10-302/310) ABU 83972 ┌┤├─ Escherichia coli (10-302/310) APEC O1 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) CFT073 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) F11 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) IHE3034 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 185-1 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 45-1 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) O127:H6 str. E2348/69 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) S88 ││├─ Escherichia coli (10-302/310) TA206 │└┼─ Escherichia coli (10-302/310) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (10-302/310) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (10-302/310) SMS-3-5 ┌┤ ├─ Escherichia coli (10-302/310) O83:H1 str. NRG 857C ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) NC101 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) M605 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) F11 ││ ├─ Escherichia coli (30-322/330) E2348/69 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) CFT073 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) 83972 ││ └─ Escherichia coli (10-302/310) 536 ││┌─ Escherichia coli (10-302/310) SE15 │││ ┌─ Escherichia coli (10-302/310) FVEC1302 ┌┤└┤ ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 198-1 ││ │┌┼─ Escherichia coli (10-302/310) UMN026 ││ ││├─ Escherichia coli (10-302/310) TA143 ││ └┤└─ Escherichia coli (10-302/310) FVEC1412 ││ │┌─ Escherichia coli (10-302/310) H299 ││ │├─ Escherichia coli (10-302/310) IAI39 ││ └┼─ Escherichia coli (10-302/310) MS 69-1 ││ ├─ Escherichia coli (10-302/310) IAI39 ││ └─ Escherichia coli (10-302/310) B354 ┌──────────────────────────────────────────────────────────────┤│ ┌─ Escherichia coli (10-302/310) IAI1 │ ││┌┴─ Escherichia coli (10-302/310) IAI1 │ │└┤┌─ Escherichia coli (10-302/310) MS 145-7 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (10-302/310) B7A │ │ │├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 124-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (10-302/310) MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli (10-302/310) MS 115-1 │ │ └─ Escherichia coli (10-302/310) B7A │ └─ Escherichia coli (10-302/310) WV_060327 │ ┌─ fig|6666666.5357.peg.3951 TY-2482 (9-291/298) strain │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 042 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 1044A │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 1212A │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 536 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 53638 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 55989 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) 83972 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) APEC O1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) ATCC 8739 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) B str. REL606 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) B171 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) B185 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) B7A │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) BL21 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) BW2952 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) CFT073 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) E110019 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) E22 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) E2348/69 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) E24377A │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) ETEC H10407 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) F11 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) FVEC1412 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) H591 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) HS │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) IAI1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) K12 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) M605 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 107-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 182-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 187-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 21-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 69-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 84-1 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) O55:H7 str. CB9615 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) S88 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) SE15 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) TA143 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) TA271 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) UTI89 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) W ┤ ├─ Escherichia coli (9-291/298) WV_060327 │ ├─ Escherichia coli (9-291/298) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli (9-291/298) str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) W3110 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) W │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) UM146 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) TA206 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) SMS-3-5 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) SE11 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O83:H1 str. NRG 857C │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O26:H11 str. 11368 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) O111:H- str. 11128 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) NC101 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 45-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 200-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 196-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 185-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 146-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 124-1 │ │├─ Escherichia coli (9-291/298) MS 115-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-291/298) M718 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) KO11 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) IAI1 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) HS │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) H736 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) H299 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) FVEC1302 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) F11 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) EC4100B │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) E24377A │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) E22 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) E110019 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) DH1 │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (DE3 9-291/298) BL21(DE3) │ ││├─ Escherichia coli (9-291/298) B7A │ ┌┤│├─ Escherichia coli (9-291/298) B354 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) B171 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) B088 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) ATCC 8739 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) APEC O1 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) ABU 83972 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) 55989 │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) 536A │ │││├─ Escherichia coli (9-291/298) 53638 │ ┌┤││├─ Escherichia coli (9-291/298) 536 │ ││││├─ Escherichia coli (9-291/298) 1827-70 │ ││││├─ Escherichia coli (9-291/298) 1125A │ ││││├─ Escherichia coli (9-291/298) 101-1 │ ││││└─ Escherichia coli (9-291/298) 042 │ ┌───────────────────────────────────────────────┤││└┬─ Escherichia coli (9-291/298) TA280 │ │ │││ └─ Escherichia coli (1-277/284) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ││└─ Escherichia coli (9-291/298) IHE3034 │ │ │└┬─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 EDL933 │ │ │ └─ Escherichia coli (9-291/298) O157:H7 EDL933 │ │ └┬─ Escherichia coli (9-291/298) IAI39 └───────────────────┤ └─ Escherichia coli (9-291/298) IAI39 │ ┌─ Escherichia coli EC4100B │ │┌─ Escherichia coli ETEC H10407 │ ││┌─ Escherichia coli H299 │ │││ ┌─ Escherichia coli (8-316/316) 042 │ │││ ├─ Escherichia coli 1827-70 │ │││ ├─ Escherichia coli 53638 └───────────────────────────────────────┤││ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli (8-316/316) B171 │││ ├─ Escherichia coli (8-316/316) B7A │││ ├─ Escherichia coli BW2952 │││ ├─ Escherichia coli (8-316/316) E22 │││ ├─ Escherichia coli E24377A │││ ├─ Escherichia coli ED1a └┤│ ├─ Escherichia coli FVEC1302 ││ ├─ Escherichia coli H736 ││ ├─ Escherichia coli IAI1 ││ ├─ Escherichia coli KO11 ││ ├─ Escherichia coli MS 107-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 119-7 ││ ├─ Escherichia coli MS 182-1 ││ ├─ Escherichia coli MS 21-1 ││ ├─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ││ ├─ Escherichia coli TA143 ││ ├─ Escherichia coli UMN026 ││ ├─ Escherichia coli W ││ ├─ Escherichia coli (8-316/316) str. K-12 substr. DH10B └┤ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │├─ Escherichia coli W3110 │ │├─ Escherichia coli W │ │├─ Escherichia coli TA271 │ │├─ Escherichia coli SE11 │ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli MS 115-1 │ │├─ Escherichia coli M718 │ │├─ Escherichia coli K12 │┌┤├─ Escherichia coli IAI1 │││├─ Escherichia coli FVEC1412 │││├─ Escherichia coli ED1a │││├─ Escherichia coli (8-316/316) E24377A │││├─ Escherichia coli E22 │││├─ Escherichia coli DH1 │││├─ Escherichia coli B7A │││├─ Escherichia coli B171 │││├─ Escherichia coli B088 │││├─ Escherichia coli (8-316/316) ATCC 8739 │││├─ Escherichia coli 53638 └┤│└─ Escherichia coli 042 │└┬─ Escherichia coli S88 │ └─ Escherichia coli 101-1 │ ┌─ Escherichia coli MS 124-1 │┌┴─ Escherichia coli MS 84-1 ││ ┌─ Escherichia coli (8-316/316) E110019 ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 196-1 ││┌┤└─ Escherichia coli E110019 │││└─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │││ ┌─ Escherichia coli APEC O1 │││ ├─ Escherichia coli B str. REL606 │││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) └┤│ ├─ Escherichia coli IAI39 ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 78-1 ││ │├─ Escherichia coli MS 187-1 ││ │├─ Escherichia coli IAI39 ││┌┤├─ Escherichia coli BL21 ││││└─ Escherichia coli (8-316/316) APEC O1 │││└─ Escherichia coli OP50 │││ ┌─ Escherichia coli 1044A │││ ├─ Escherichia coli 1212A └┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (8-316/316) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 └┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ┌┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (8-316/316) O157:H7 EDL933 │ ┌┤│├─ Escherichia coli 536A │ │││└─ Escherichia coli 1125A │┌┤│└─ Escherichia coli MS 200-1 │││└─ Escherichia coli TA280 ││└┬─ Escherichia coli B354 ││ └┬─ Escherichia coli 2362-75 ││ └┬─ Escherichia coli (8-316/316) O127:H6 str. E2348/69 ││ └─ Escherichia coli (8-316/316) E2348/69 ││┌─ fig|6666666.5357.peg.1285 TY-2482 strain ││├─ Escherichia coli 536 ││├─ Escherichia coli 55989 ││├─ Escherichia coli ABU 83972 └┤├─ Escherichia coli (8-316/316) CFT073 │├─ Escherichia coli (8-316/316) F11 │├─ Escherichia coli (8-316/316) HS │├─ Escherichia coli IHE3034 │├─ Escherichia coli MS 116-1 │├─ Escherichia coli MS 175-1 │├─ Escherichia coli MS 45-1 │├─ Escherichia coli NC101 │├─ Escherichia coli SE15 │├─ Escherichia coli TA206 │├─ Escherichia coli UTI89 └┼─ Escherichia coli WV_060327 ├─ Escherichia coli UTI89 ├─ Escherichia coli UM146 ├─ Escherichia coli SMS-3-5 ├─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C ├─ Escherichia coli MS 69-1 ├─ Escherichia coli MS 185-1 ├─ Escherichia coli MS 146-1 ├─ Escherichia coli M605 ├─ Escherichia coli HS ├─ Escherichia coli F11 ├─ Escherichia coli CFT073 ├─ Escherichia coli B185 ├─ Escherichia coli 83972 ├─ Escherichia coli 55989 ├─ Escherichia coli 536 └─ fig|1040638.4.peg.3590 O104:H4 str. LB226692
| Hypothetical transcriptional regulator yeeY | (131) |
| LysR-family transcriptional regulator YhaJ | (126) |
| Putative HTH-type transcriptional regulator yahB | (94) |
| Others | (4) |