┌─ Escherichia coli (31-318/323) 1044A ├─ Escherichia coli (31-318/323) 1212A ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. FRIK2000 ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. Sakai ├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. TW14588 ┌┼─ Escherichia coli (31-318/323) O55:H7 str. CB9615 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. FRIK966 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC869 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4113 ┌┤├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (31-318/323) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (31-318/323) 536A ││└─ Escherichia coli (31-318/323) 1125A ││ ┌─ Escherichia coli (31-318/323) 53638 ┌┤│┌┴─ Escherichia coli (31-318/323) 53638 ││└┤┌─ Escherichia coli (31-318/323) ATCC 8739 ││ │├─ Escherichia coli (31-318/323) HS ││ └┼─ Escherichia coli (31-318/323) HS ││ ├─ Escherichia coli (31-318/323) ATCC 8739 ┌───────────────────────────────────────────────┤│ └─ Escherichia coli (31-318/323) 1827-70 │ │└─ Escherichia coli (31-319/323) H299 │ │ ┌─ Escherichia coli (31-318/323) IAI39 │ │┌┼─ Escherichia coli (31-318/323) TA206 │ └┤└─ Escherichia coli (31-318/323) IAI39 │ │┌─ Escherichia coli (31-318/323) TA143 │ └┤┌─ Escherichia coli (31-318/323) B354 │ ││┌─ Escherichia coli (31-318/323) 042 │ └┤├─ Escherichia coli (31-318/323) FVEC1412 │ │├─ Escherichia coli (31-318/323) MS 69-1 │ └┼─ Escherichia coli (31-318/323) UMN026 │ ├─ Escherichia coli (31-318/323) TA280 │ ├─ Escherichia coli (31-318/323) MS 198-1 │ ├─ Escherichia coli (31-318/323) FVEC1302 │ └─ Escherichia coli (31-318/323) 042 │ ┌─ Escherichia coli (11-315/315) CFT073 │ ├─ Escherichia coli 536 │ ├─ Escherichia coli ABU 83972 │ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ ├─ Escherichia coli MS 45-1 │ ├─ Escherichia coli UM146 │ ┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli UTI89 │ │├─ Escherichia coli NC101 │ │├─ Escherichia coli MS 200-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli CFT073 │ ││├─ Escherichia coli 83972 │ ┌┤│└─ Escherichia coli 536 │ ││└─ Escherichia coli MS 185-1 │ ┌┤└─ Escherichia coli MS 21-1 │ │└┬─ Escherichia coli SE15 │ ┌┤ └─ Escherichia coli M605 │ │└─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (11-315/315) APEC O1 │ ││┌┴─ Escherichia coli APEC O1 │ │└┤┌─ Escherichia coli 1827-70 │ │ │├─ Escherichia coli IAI39 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli TA206 │ ││ ├─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ├─ Escherichia coli IAI39 │ ││ └─ Escherichia coli (11-315/315) E2348/69 │ │└─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ ┌─ Escherichia coli (11-315/315) 042 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli H591 │ ││ ┌┼─ Escherichia coli MS 182-1 │ ││┌┤└─ Escherichia coli 042 │ │││└─ Escherichia coli WV_060327 │ │││ ┌─ Escherichia coli FVEC1302 │ │└┤ ┌┼─ Escherichia coli UMN026 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli FVEC1412 │ │ ││└─ Escherichia coli B354 │ │ ││┌─ fig|6666666.5357.peg.782 TY-2482 strain │ │ └┤├─ Escherichia coli 55989 │ │ │├─ Escherichia coli H299 │ │ │├─ Escherichia coli MS 175-1 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli MS 198-1 │ ││ ├─ Escherichia coli H736 │ ││ ├─ Escherichia coli 55989 │ ││ ├─ Escherichia coli 53638 │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3536 O104:H4 str. LB226692 │ ││ ┌─ Escherichia coli MS 69-1 │ ││┌┴─ Escherichia coli S88 │ │││┌─ Escherichia coli 1125A │ │││├─ Escherichia coli 536A │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │││├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │└┤├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4486 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ││ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ ││ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ┤ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. FRIK966 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │││ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │││ ├─ Escherichia coli MS 78-1 │ │││ ├─ Escherichia coli 1212A │ │││ └─ Escherichia coli 1044A │ ││└─ Escherichia coli TA280 │ ││┌─ Escherichia coli MS 196-1 │ │││┌─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │└┤├─ Escherichia coli HS │ │ │├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ └┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ ││ ├─ Escherichia coli HS │ ││ ├─ Escherichia coli B185 │ ││ └─ Escherichia coli ATCC 8739 │ ││ ┌─ Escherichia coli B171 │ ││┌┴─ Escherichia coli B171 │ │││┌─ Escherichia coli BL21 │ │││├─ Escherichia coli BW2952 │ │││├─ Escherichia coli EC4100B │ │││├─ Escherichia coli ED1a │ │││├─ Escherichia coli IAI1 │ │└┤├─ Escherichia coli M718 │ │ │├─ Escherichia coli MS 116-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli TA271 │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ││ ├─ Escherichia coli W3110 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 187-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 119-7 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 115-1 │ ││ ├─ Escherichia coli K12 │ ││ ├─ Escherichia coli IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli ED1a │ ││ ├─ Escherichia coli DH1 │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ ┌─────────────────────────────┤│ └─ Escherichia coli B str. REL606 │ │ ││┌─ Escherichia coli E24377A │ │ ││├─ Escherichia coli KO11 │ │ ││├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ││├─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │└┼─ Escherichia coli W │ │ │ ├─ Escherichia coli W │ │ │ ├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli E24377A │ │ │ └─ Escherichia coli B088 │ │ └─ Escherichia coli SE11 │ │ ┌─ Escherichia coli (13-296/299) 53638 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) ETEC H10407 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) K12 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 146-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 196-1 │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) str. K-12 substr. DH10B │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-291/294) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) W3110 │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 175-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 116-1 │ │ ┌────────────────────────────────────────────────┤├─ Escherichia coli (8-291/294) H736 │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) DH1 │ │ │ │└─ Escherichia coli (8-291/294) 53638 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (8-291/294) TA143 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-291/294) TA271 └───┤ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.2817 O104:H4 (8-291/294) str. LB226692 │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli (8-291/294) 55989 │ │ ││└─ Escherichia coli (8-291/294) 55989 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (13-296/299) E22 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (8-291/294) O103:H2 str. 12009 │ │ ││└─ Escherichia coli (8-291/294) E22 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-291/294) MS 107-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (8-291/294) O111:H- str. 11128 │ ┌────────┤ └┼─ Escherichia coli (8-291/294) SE11 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-291/294) MS 119-7 │ │ │ └─ Escherichia coli (8-291/294) H591 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-290/296) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/296) E24377A │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/296) IAI1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/296) MS 182-1 │ │ │ ┌─────────────────────────┼─ Escherichia coli (3-290/296) MS 78-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/296) IAI1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-290/296) E24377A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-290/296) B7A │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-289/308) 042 │ │ └─────┤ ├─ Escherichia coli (1-289/308) FVEC1302 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-289/308) MS 198-1 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-289/308) UMN026 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-289/308) TA143 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-289/308) FVEC1412 │ │ └───────────────────────────┤└─ Escherichia coli (1-289/308) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-289/308) H299 └─────┤ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-289/308) MS 21-1 │ │┌┴─ Escherichia coli (1-289/308) SMS-3-5 │ └┤┌─ Escherichia coli (1-289/308) MS 69-1 │ ││┌─ Escherichia coli (1-289/308) ABU 83972 │ └┤├─ Escherichia coli (1-289/308) CFT073 │ │├─ Escherichia coli (1-289/308) MS 45-1 │ └┼─ Escherichia coli (1-289/308) O83:H1 str. NRG 857C │ ├─ Escherichia coli (1-289/308) NC101 │ ├─ Escherichia coli (1-289/308) MS 185-1 │ ├─ Escherichia coli (1-289/308) CFT073 │ └─ Escherichia coli (1-289/308) 83972 │ ┌───────────────────────────────────── Escherichia coli (3-305/311) MS 119-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-292/311) FVEC1302 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) TA280 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-292/311) UMN026 │ │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) SMS-3-5 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-292/311) FVEC1412 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-292/311) MS 69-1 │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-292/311) 042 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-292/311) 042 └──────────────┤ │ ┌─ Escherichia coli (4-292/311) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (4-292/311) UTI89 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-292/311) UTI89 │ │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) UM146 │ │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 45-1 │ │┌┤├─ Escherichia coli (4-292/311) CFT073 └───────────────────────────────┤││├─ Escherichia coli (4-292/311) APEC O1 │││└─ Escherichia coli (4-292/311) ABU 83972 ││└─ Escherichia coli (4-292/311) MS 185-1 ││ ┌─ Escherichia coli (4-292/311) 2362-75 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) 536 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) ED1a ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) F11 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) H299 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) IAI39 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 200-1 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) NC101 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O83:H1 str. NRG 857C ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-292/311) TA206 └┤ │├─ Escherichia coli (4-292/311) SE15 │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 21-1 │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) M605 │┌┤├─ Escherichia coli (4-292/311) IAI39 │││├─ Escherichia coli (4-292/311) F11 │││├─ Escherichia coli (4-292/311) ED1a │││├─ Escherichia coli (4-292/311) E2348/69 │││└─ Escherichia coli (4-292/311) 536 ││└─ Escherichia coli (4-292/311) WV_060327 ││┌─ Escherichia coli (4-292/311) B354 │││ ┌─ Escherichia coli (4-292/311) 1044A │││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) 1212A │││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 │││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4042 └┤│ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4115 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4486 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli (4-292/311) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. TW14359 ││ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. FRIK966 └┤ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4401 │ ┌┤├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4196 │ ││├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4045 │ ││├─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (4-292/311) 536A │┌┤│└─ Escherichia coli (4-292/311) 1125A │││└┬─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 EDL933 │││ └─ Escherichia coli (4-292/311) O157:H7 EDL933 │││┌─ Escherichia coli (4-292/311) E24377A ││└┼─ Escherichia coli (4-292/311) MS 119-7 ││ ├─ Escherichia coli (4-292/311) H591 ││ └─ Escherichia coli (4-292/311) E24377A ││ ┌─ Escherichia coli (4-292/311) MS 182-1 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (4-292/311) MS 78-1 │┌┴┬─ Escherichia coli (4-292/311) M718 ││ └─ Escherichia coli (4-292/311) B185 ││┌─ fig|6666666.5357.peg.965 TY-2482 (4-292/311) strain ││├─ Escherichia coli (4-292/311) 55989 ││├─ Escherichia coli (4-292/311) B171 ││├─ Escherichia coli (4-292/311) B7A ││├─ Escherichia coli (4-292/311) E110019 ││├─ Escherichia coli (4-292/311) E22 └┤├─ Escherichia coli (4-292/311) EC4100B │├─ Escherichia coli (4-292/311) IAI1 │├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 107-1 │├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 145-7 │├─ Escherichia coli (4-292/311) O103:H2 str. 12009 │├─ Escherichia coli (4-292/311) O26:H11 str. 11368 │├─ Escherichia coli (4-292/311) TA143 │├─ Escherichia coli (4-292/311) W └┼─ Escherichia coli (4-292/311) W ├─ Escherichia coli (4-292/311) TA271 ├─ Escherichia coli (4-292/311) SE11 ├─ Escherichia coli (4-292/311) O111:H- str. 11128 ├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (4-292/311) MS 124-1 ├─ Escherichia coli (4-292/311) KO11 ├─ Escherichia coli (4-292/311) IAI1 ├─ Escherichia coli (4-292/311) E22 ├─ Escherichia coli (4-292/311) E110019 ├─ Escherichia coli (4-292/311) B7A ├─ Escherichia coli (4-292/311) B171 ├─ Escherichia coli (4-292/311) B088 ├─ Escherichia coli (4-292/311) 55989 └─ fig|1040638.4.peg.2736 O104:H4 (4-292/311) str. LB226692
| Nitrogen assimilation regulatory protein Nac | (113) |
| Transcriptional activator protein LysR | (104) |
| LysR family transcriptional regulator YhjC | (47) |
| Xanthosine operon regulatory protein XapR, LysR family | (31) |
| LysR family transcriptional regulator YfeR | (19) |
| LysR family transcriptional regulator near succinyl-CoA:3-ketoacid-coenzyme A transferase | (8) |
| Transcriptional regulator, LysR family | (1) |
| Nitrogen assimilation control protein | (1) |
| Others | (5) |