┌─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 (1) ┌─┴─ Escherichia coli (8-396/413) B185 ┌┴─ Escherichia coli (8-396/414) 042 (1) ┌────────┴┬─ Escherichia coli (8-396/413) O111:H- str. 11128 ┌─┤ └─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a (3) │ └────┬─ Escherichia coli (8-393/403) M605 ┌──┤ └─ Escherichia coli (8-397/398) ATCC 8739 │ └──────┬── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-395/413) strain (5) │ └┬─ Escherichia coli (8-395/396) WV_060327 │ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) MS 146-1 ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. DH10B (1) │ │ └─ Escherichia coli (8-395/413) K12 (5) │ │ ┌── Escherichia coli (22-415/423) 042 (2) │ └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-401/409) 101-1 (6) ┌───┤ └┬┴─ Escherichia coli (8-401/409) MS 78-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (22-417/423) ETEC H10407 │ │ └┬─ Escherichia coli (22-419/423) B088 (13) │ │ └─ Escherichia coli (22-419/423) O55:H7 str. CB9615 ┌─┤ └─────────────────────────── Escherichia coli (6-395/412) 1125A (3) │ │ ┌─ Escherichia coli (4-393/400) 83972 (4) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-393/400) UM146 (2) │ └─────────────────────────────┬┴─ Escherichia coli (4-393/400) IHE3034 (1) │ └┬─ Escherichia coli (4-393/400) MS 116-1 (4) │ └┬─ Escherichia coli (4-393/400) 1044A (26) │ └┬─ Escherichia coli (4-393/405) E2348/69 (1) │ └┬─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (4-393/405) strain │ └─ Escherichia coli (4-393/402) SMS-3-5 │ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) FVEC1302 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) MS 21-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) 83972 (4) │ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) CFT073 (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-414/420) H591 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/420) ATCC 8739 (1) │ │└┬─ Escherichia coli (1-414/421) M605 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/420) B185 │ │└┬─ Escherichia coli (1-414/420) H299 │ ┌┤ └┬─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (1-414/420) str. LB226692 (2) │ ││ └─ Escherichia coli (1-414/420) 2362-75 │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-414/420) MS 187-1 │ ││┌─ Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) MS 185-1 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-414/421) MS 200-1 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-414/420) M718 │ ││ └─ Escherichia coli (1-414/421) MS 124-1 (1) │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) EC4100B │ │└┬┴─ Escherichia coli (1-412/419) O111:H- str. 11128 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-410/421) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤ └┬─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (1-414/420) str. LB226692 (4) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-414/420) E24377A (1) │ ││ └┬─ Escherichia coli (1-414/421) 042 (1) │ ││ └─ Escherichia coli (1-414/421) 536 (3) │ ┌──┤└─ Escherichia coli (1-414/420) NC101 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) B171 (12) │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) 1044A (25) │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-414/421) ATCC 8739 (1) │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ ┌──┤ └┬┴─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-414/420) CFT073 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-414/421) IAI39 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-414/420) IAI39 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-414/420) APEC O1 (3) │ │ └──── Escherichia coli MS 115-1 │ ┌─┤ ┌─ Escherichia coli (23-444/444) E2348/69 (2) │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌─────────┴─── Escherichia coli ED1a (1) ┤ │ │┌┴┬───── Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │ ││ └─── Escherichia coli (1-410/415) MS 115-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-415/416) MS 115-1 │ │ │┌───┴─ Escherichia coli (1-411/416) IAI1 (1) │ │ └┤┌──── Escherichia coli (1-415/421) KO11 (2) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-415/422) B7A (1) │ │ └┤ ┌┴── Escherichia coli 042 (1) │ │ │┌─┴─── Escherichia coli (1-415/422) W (1) │ ┌─┤ ││ ┌─ Escherichia coli TA271 │ │ │ └┤┌─┴─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) 83972 (4) │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) UTI89 (1) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) 536 (1) │ │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) M718 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-414/421) 55989 (5) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-404/413) H736 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-414/421) ED1a (1) │ ┌───────┤ │ └─ Escherichia coli (1-414/421) ETEC H10407 (3) │ │ │ └─────┬─────────── Escherichia coli (26-440/445) M605 │ │ │ └─┬────── Escherichia coli (8-423/427) MS 116-1 (1) │ │ │ └──┬─ Escherichia coli (1-416/418) EC4100B │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-408/424) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-420/422) IHE3034 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-416/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-416/421) TA280 │ │ │┌──────────── Escherichia coli (25-436/443) MS 145-7 │ │ └┤ ┌─── Escherichia coli (1-415/420) WV_060327 │ │ └───┬──────┴──── Escherichia coli (2-411/420) TA206 │ │ └─────┬── Escherichia coli (1-411/423) 536 (13) │ │ └──┬─ Escherichia coli ED1a (1) │ │ └┬─ Escherichia coli FVEC1302 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli IAI39 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli H299 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 str. LB226692 (9) │ │ ┌─ Escherichia coli (8-391/412) IHE3034 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-391/412) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-391/412) 53638 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-391/412) F11 (2) │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (8-391/412) O157:H7 str. EC4401 (1) │ │ ┌────────────┴─── Escherichia coli (8-391/409) E110019 (1) │ │ ┌───┴───────────── Escherichia coli (7-392/398) TA206 │ │ ┌───────────┴──┬───────────── Escherichia coli (7-395/413) MS 124-1 (1) │ │ │ └──────────── Escherichia coli (406-792/807) 042 (1) │ │ ┌─────────┤ ┌────────────────── Escherichia coli (2-387/396) MS 21-1 │ │ │ └───────┬─────┴──────────── Escherichia coli (1-394/402) TA206 │ │ │ └─────────────────────┬─ Escherichia coli (1-383/392) MS 78-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-383/392) 1212A (16) │ │ ┌─────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-383/392) MS 21-1 └──┤ │ │ └─ Escherichia coli (1-383/392) O111:H- str. 11128 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-402/419) TA206 │ │ └──────────────────────┬─┴─ Escherichia coli (38-436/453) E2348/69 (1) │ │ └──┬─ Escherichia coli (4-401/417) 83972 (1) │ │ └┬── Escherichia coli (24-421/440) O157:H7 str. EC4501 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (32-431/447) 042 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (4-403/419) 2362-75 │ ┌────┤ └┬─ Escherichia coli (4-403/419) MS 182-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-403/417) MS 21-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-391/396) MS 115-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/396) B354 │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (2-391/395) HS (1) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/395) 2362-75 │ │ │ ┌───────┴── Escherichia coli (2-391/402) B7A (1) │ │ └─────────────┤ ┌─ Escherichia coli (2-392/417) E2348/69 (1) │ ┌────┤ └─────────┤┌─ Escherichia coli (2-392/415) M605 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 (1) │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (2-392/418) MS 196-1 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-392/416) FVEC1302 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (2-392/416) MS 198-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-392/418) ETEC H10407 │ │ └───────────────────┬─ Escherichia coli (2-384/391) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (2-384/391) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) E2348/69 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) K12 (14) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) MS 119-7 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (2-381/385) B088 │ │ ┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 (14-392/394) str. LB226692 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (14-393/397) B354 │ │ ┌┤└─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-382/385) strain (2) └─┤ │└┬─ Escherichia coli (2-382/385) B7A (1) │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (14-393/397) TA143 │ ││ └─ Escherichia coli (14-393/397) H591 │ ┌┤└─ Escherichia coli (2-381/385) IAI39 (1) │ ┌┤└─ Escherichia coli (2-381/385) TA271 │ │└┬─ Escherichia coli (2-381/385) FVEC1302 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-381/385) KO11 (2) │ │└┬─ Escherichia coli (14-394/397) O55:H7 str. CB9615 │ ┌───────────────┤ └─ Escherichia coli (14-394/397) 1044A (24) │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (2-381/385) O26:H11 str. 11368 │ │ └────────────────┬─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 (1) │ │ └─┬─ Escherichia coli (6-390/402) MS 187-1 │ │ └─ Escherichia coli (35-419/431) K12 (5) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) MS 84-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-388/394) E24377A (1) │ │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (1-388/394) SMS-3-5 └───┤ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/392) MS 21-1 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) TA280 │ │ └──────────────── Escherichia coli (1-391/393) ED1a (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/404) NC101 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) MS 124-1 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) 83972 (1) │ │ ┌──┴─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (1-388/404) str. LB226692 (3) └─┤ ┌─┴───┬─ Escherichia coli (1-387/396) SE11 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (14-405/415) HS (1) │┌─┤ └──── Escherichia coli (1-388/396) TA206 ││ └────────── Escherichia coli (1-391/396) MS 124-1 (1) ││ ┌─ Escherichia coli (18-403/410) 1044A (13) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. EC4024 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli (18-403/410) O55:H7 str. CB9615 └┤ ┌────┴┬── Escherichia coli (1-386/391) WV_060327 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-386/392) MS 145-7 │┌┤└──────── Escherichia coli (17-402/407) SE15 ││└──────── Escherichia coli (14-404/417) ED1a (1) ││ ┌─ Escherichia coli (1-386/395) O157:H7 str. EC869 (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-367/369) E110019 └┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-386/393) 042 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-386/387) SMS-3-5 │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-386/391) ATCC 8739 (1) │ ┌────┤└─ Escherichia coli (1-386/390) MS 185-1 │ │ └─ Escherichia coli (1-386/389) O26:H11 str. 11368 └──┤ ┌─ Escherichia coli (33-420/439) KO11 (2) │ ┌──┴─ Escherichia coli (1-386/399) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/393) 536 (1) └─┤ │ ┌─ Escherichia coli IAI39 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli MS 182-1 └─┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 str. LB226692 │ ┌┴─ Escherichia coli 101-1 (8) │┌┴─ Escherichia coli (1-391/394) TA280 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) ETEC H10407 │┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) H299 └┤ ┌─ Escherichia coli (25-410/427) 83972 (2) └┬┴─ Escherichia coli (1-386/404) B7A (1) └┬─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC508 └─ Escherichia coli (25-415/417) 1044A (24)
| Integrase | (97) |
| Phage integrase | (26) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (23) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (9) |
| Prophage CP4-57 integrase | (7) |
| Putative integrase | (6) |
| integrase-like protein | (5) |
| Phage Integrase | (5) |
| COG0582: Integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (3) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| prophage P4 integrase | (1) |
| putative integrase of prophage | (1) |
| putative P4-type integrase | (1) |
| putative phage integrase | (1) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (1) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Prophage P4 integrase | (1) |
| Others | (9) |