┌─ Escherichia coli (8-395/413) BW2952 ├─ Escherichia coli (8-395/413) K12 ├─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (8-395/413) W3110 ┌┤└─ Escherichia coli (8-395/413) DH1 │└┬─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤ └─ Escherichia coli (8-395/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤└─ Escherichia coli (8-395/413) MS 115-1 ┌┤└─ Escherichia coli (8-395/413) MS 146-1 │└─ Escherichia coli (8-395/396) WV_060327 ┌──────┤ ┌─ Escherichia coli (8-395/413) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) H591 │ └─┼─ Escherichia coli (8-395/413) TA271 │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (8-395/413) 55989 ┌──┤ └─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-395/413) strain │ │ ┌─ Escherichia coli (8-397/398) ATCC 8739 │ │ ┌────┴─ Escherichia coli (8-393/403) M605 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 │ └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-396/413) 53638 │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (8-396/413) B185 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-396/414) 042 │ └────────┤ └─ Escherichia coli (8-396/414) 042 │ │┌─ Escherichia coli (8-396/413) O111:H- str. 11128 ┌──┤ └┤┌─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a │ │ └┼─ Escherichia coli (8-396/413) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (8-396/413) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (8-396/413) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (22-415/423) 042 │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (22-415/423) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-415/423) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-401/409) 101-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-401/409) BL21 │ └───────────┤ ├─ Escherichia coli (8-401/409) E24377A │ │ ┌┼─ Escherichia coli (35-428/436) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (35-428/436) E24377A │ │┌┤├─ Escherichia coli (DE3 8-401/409) BL21(DE3) │ │││└─ Escherichia coli (8-401/409) B str. REL606 │ └┤└─ Escherichia coli (8-401/409) MS 78-1 │ │┌─ Escherichia coli (22-417/423) ETEC H10407 ┌───┤ ││┌─ Escherichia coli (22-419/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┤│┌─ Escherichia coli (22-419/423) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-419/423) B7A │ │ └┤├─ Escherichia coli (22-419/423) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (22-419/423) KO11 │ │ │├─ Escherichia coli (22-419/423) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (22-419/423) SE11 │ │ └┼─ Escherichia coli (22-419/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (22-419/423) B171 │ │ └─ Escherichia coli (22-419/423) B088 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-395/412) O157:H7 str. EC4024 ┌─┤ └──────────────────────────┼─ Escherichia coli (6-395/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (6-395/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ └─ Escherichia coli (6-395/412) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (4-393/400) 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) CFT073 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (4-393/400) MS 45-1 │ │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) CFT073 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (4-393/400) ABU 83972 │ │ ││┌─ Escherichia coli (4-393/400) UTI89 │ │ ┌┤└┼─ Escherichia coli (4-393/400) UTI89 │ │ ││ └─ Escherichia coli (4-393/400) UM146 │ │ │└┬─ Escherichia coli (4-393/400) NC101 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-393/400) IHE3034 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (4-393/400) MS 116-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC869 │ └─────────────────────────────┤┌┼─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC869 │ ││└─ Escherichia coli (4-393/400) MS 200-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (4-393/405) E2348/69 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (4-393/405) O127:H6 str. E2348/69 │ ││┌┴┬─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (4-393/405) strain │ └┤│ └─ Escherichia coli (4-393/402) SMS-3-5 │ ││┌─ Escherichia coli (4-393/400) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (4-393/400) 536A │ ││├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 │ ││├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 EDL933 │ └┤├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. TW14359 │ └┼─ Escherichia coli (4-393/400) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) O111:H- str. 11128 │ ├─ Escherichia coli (4-393/400) 1212A │ └─ Escherichia coli (4-393/400) 1044A │ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) 1044A │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) 1212A │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/421) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-414/421) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) 536A │ ││└─ Escherichia coli (1-414/421) 1125A │ ││┌─ Escherichia coli (1-414/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) E22 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) O103:H2 str. 12009 │ ││├─ Escherichia coli (1-414/421) O127:H6 str. E2348/69 │ │└┼─ Escherichia coli (1-414/421) O26:H11 str. 11368 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O111:H- str. 11128 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) E22 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) B171 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) B171 │ ││ └─ Escherichia coli (1-414/421) B171 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) ATCC 8739 │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) ATCC 8739 │ │││ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) CFT073 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) CFT073 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) IAI39 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) IAI39 │ ┌──┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) IAI39 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) IAI39 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-414/420) APEC O1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-414/420) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-414/420) MS 119-7 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-414/420) APEC O1 │ │ │┌─ Escherichia coli (1-414/420) NC101 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) 536 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) F11 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/421) F11 │ │ ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-414/421) 536 │ │ ││ │└┬─ Escherichia coli (1-414/421) 042 │ │ ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/421) 042 │ │ ││ │└┬─ Escherichia coli (1-414/420) E24377A │ │ ││ │ └─ Escherichia coli (1-414/420) E24377A │ │ └┤ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-414/420) 042 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (1-414/420) 55989 │ │ │ │└┼─ Escherichia coli (1-414/420) 55989 │ │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-414/420) 042 │ │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (1-414/420) str. LB226692 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-410/421) O26:H11 str. 11368 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (1-412/419) O111:H- str. 11128 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-414/421) EC4100B │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) MS 124-1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) MS 84-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) M718 │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-414/421) MS 200-1 │ ┌──┤ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/421) MS 185-1 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-414/420) MS 187-1 │ │ │ ││ ┌─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (1-414/420) str. LB226692 │ │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/420) 55989 │ │ │ └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (1-414/420) 55989 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-414/420) 2362-75 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-414/420) H299 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) B185 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) M605 ┤ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) ATCC 8739 │ │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-414/420) ATCC 8739 │ │ │ └┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a │ │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/420) ED1a │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-414/420) H591 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) CFT073 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) CFT073 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) FVEC1302 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/421) MS 198-1 │ ┌─┤ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/421) UMN026 │ │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-414/421) FVEC1412 │ │ │ │ ││└─ Escherichia coli (1-414/421) MS 21-1 │ │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-414/421) ABU 83972 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) APEC O1 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-414/421) S88 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) APEC O1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-414/421) 83972 │ │ │ └──── Escherichia coli MS 115-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (23-444/444) E2348/69 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ ┌─┤└─ Escherichia coli 2362-75 │ │ │ ┌─────────┤ └─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ │ └──┬─ Escherichia coli ED1a │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli ED1a │ │ ││└┬───── Escherichia coli (1-414/420) MS 107-1 │ │ ││ └─── Escherichia coli (1-410/415) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-411/416) IAI1 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-411/416) IAI1 │ │ │┌───┴─ Escherichia coli (1-415/416) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-415/421) KO11 │ │ ││┌───┼─ Escherichia coli (1-415/421) W │ │ └┤│ └─ Escherichia coli (1-415/421) W │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-415/422) B7A │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-415/422) B7A │ │ └┤ ┌┴─┬─ Escherichia coli 042 │ │ │┌─┤ └─ Escherichia coli 042 │ │ ││ └──┬─ Escherichia coli (1-415/422) W │ ┌─┤ ││ └─ Escherichia coli (1-415/422) W │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli TA271 │ │ │ └┤┌─┴─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-414/420) 83972 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-414/420) F11 │ │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/420) UM146 │ │ │ ││ │├─ Escherichia coli (1-414/420) MS 200-1 │ │ │ └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (1-414/420) ABU 83972 │ │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-414/420) UTI89 │ │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-414/420) UTI89 │ │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-414/420) 536 │ │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-414/420) 536 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) 55989 │ │ │ └──┤ ├─ Escherichia coli (1-414/421) MS 124-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) MS 84-1 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-414/421) SMS-3-5 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-414/421) MS 45-1 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-414/421) 55989 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (1-414/421) M718 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (1-404/413) H736 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (1-414/421) ED1a │ ┌───────┤ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-414/421) ED1a │ │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (1-414/421) IAI39 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-414/421) MS 145-7 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-414/421) IAI39 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-414/421) ETEC H10407 │ │ │ │ ┌─────────── Escherichia coli (26-440/445) M605 │ │ │ └─────┤ ┌─ Escherichia coli (8-423/427) MS 116-1 │ │ │ │ ┌─────┴─ Escherichia coli (8-423/427) MS 175-1 │ │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-416/418) EC4100B │ │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (1-408/424) O157:H7 str. EC869 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli (1-408/424) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (1-408/424) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-416/421) TA280 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-416/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-420/422) WV_060327 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-420/422) IHE3034 │ │ │┌──────────── Escherichia coli (25-436/443) MS 145-7 │ │ ││ ┌─── Escherichia coli (1-415/420) WV_060327 │ │ ││ ┌──────┴──── Escherichia coli (2-411/420) TA206 │ │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (1-411/423) 536 │ │ └┤ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) IHE3034 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) MS 200-1 │ │ └───┤ ├─ Escherichia coli (1-411/423) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) UTI89 │ │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (1-411/423) UTI89 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) UM146 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) MS 45-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) MS 185-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-411/423) CFT073 │ │ └─────┤ ├─ Escherichia coli (1-411/423) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-411/423) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli ED1a │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli FVEC1302 │ │ └──┤┌┴─ Escherichia coli UMN026 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli IAI39 │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ ││└─ Escherichia coli IAI39 │ │ └┤┌─ Escherichia coli H299 │ │ ││┌─ Escherichia coli 53638 │ │ └┤├─ Escherichia coli 55989 │ │ │├─ Escherichia coli E110019 │ │ │├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ └┼─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli E110019 │ │ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ ├─ Escherichia coli 53638 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-383/392) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4024 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4401 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4486 │ │ │├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4206 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4115 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4076 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-383/392) O157:H7 str. EC4042 │ │ ┌─────────────────────┤│└─ Escherichia coli (1-383/392) 536A │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-383/392) MS 21-1 │ │ ┌───────┤ │ └─ Escherichia coli (1-383/392) O111:H- str. 11128 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-383/392) MS 78-1 │ │ │ └─────┬──────────── Escherichia coli (1-394/402) TA206 │ │ │ └────────────────── Escherichia coli (2-387/396) MS 21-1 │ │ ┌─────────┤ ┌─ Escherichia coli (406-792/807) 042 │ │ │ │ ┌───────────┴─ Escherichia coli (406-792/807) 042 │ │ │ │ ┌──┴────────────┬─ Escherichia coli (7-395/413) MS 84-1 └──┤ │ └───────────┤ └─ Escherichia coli (7-395/413) MS 124-1 │ │ │ ┌───────────── Escherichia coli (7-392/398) TA206 │ │ └───┤ ┌─ Escherichia coli (8-391/409) E110019 │ │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (14-397/415) E110019 │ │ └────────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-391/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-391/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (8-391/412) F11 │ ┌─────────┤ │┌┼─ Escherichia coli (8-391/412) MS 200-1 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli (8-391/412) F11 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-391/412) 53638 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (8-391/412) 53638 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-391/412) TA280 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (8-391/412) UM146 │ │ │ └─ Escherichia coli (8-391/412) IHE3034 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (38-436/453) E2348/69 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-402/419) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (4-402/419) TA206 │ │ └──────────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (4-401/417) 83972 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (4-401/417) ABU 83972 │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (24-421/440) O157:H7 str. EC4501 │ ┌────┤ │┌─┴─ Escherichia coli (24-421/440) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (32-431/447) 042 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (4-403/419) 042 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-403/419) 2362-75 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (4-403/419) MS 182-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (4-403/417) MS 21-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (2-391/395) HS │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-391/395) HS │ │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (2-391/396) B354 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (2-391/396) MS 115-1 │ │ │ ┌───────┤└─ Escherichia coli (2-391/395) 2362-75 │ │ │ │ └─┬─ Escherichia coli (2-391/402) B7A │ │ └─────────────┤ └─ Escherichia coli (2-391/402) B7A │ ┌────┤ │ ┌─ Escherichia coli (2-392/417) E2348/69 │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/417) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ └─────────┤┌─ Escherichia coli (2-392/415) M605 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (2-392/418) APEC O1 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (2-392/418) ETEC H10407 │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (2-392/416) MS 198-1 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (2-392/416) FVEC1302 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/418) MS 196-1 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (2-392/416) IHE3034 │ │ │ └─ Escherichia coli (2-392/416) IAI39 │ │ └───────────────────┬─ Escherichia coli (2-384/391) SE15 │ │ └─ Escherichia coli (2-384/391) WV_060327 │ │ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (14-393/397) BW2952 │ │ ├─ Escherichia coli (14-393/397) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (14-393/397) S88 │ │ ├─ Escherichia coli (14-393/397) UTI89 │ │ ├─ Escherichia coli (2-381/385) W3110 │ │ ├─ Escherichia coli (14-393/397) str. K-12 substr. DH10B │ │ ┌┼─ Escherichia coli (14-393/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (14-393/397) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │├─ Escherichia coli (2-381/385) str. K-12 substr. DH10B │ │ │├─ Escherichia coli (14-393/397) UTI89 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (2-381/385) UM146 │ │ ││├─ Escherichia coli (2-381/385) K12 │ │ ││├─ Escherichia coli (14-393/397) DH1 │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (2-381/385) APEC O1 │ │ ││└┬─ Escherichia coli (2-381/385) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (2-381/385) E2348/69 │ │ ││└─ Escherichia coli (2-381/385) MS 119-7 │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (2-381/385) B088 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 (14-392/394) str. LB226692 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (14-393/397) B354 │ │ ││┌─ Escherichia coli (2-382/385) 55989 │ │ │└┼─ Escherichia coli (2-382/385) 55989 │ │ ┌┤ └─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 (2-382/385) strain │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (14-393/397) H591 │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (14-393/397) TA143 │ │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (14-394/397) B7A │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-382/385) B7A │ │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (2-381/385) IAI39 │ │ ││ └─ Escherichia coli (2-381/385) IAI39 └─┤ │└─ Escherichia coli (2-381/385) TA271 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (2-381/385) FVEC1302 │ ││┌┴─ Escherichia coli (2-381/385) MS 198-1 │ │└┤┌─ Escherichia coli (2-381/385) W │ │ └┼─ Escherichia coli (2-381/385) W │ │ └─ Escherichia coli (2-381/385) KO11 │ │┌─ Escherichia coli (14-394/397) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┤│┌─ Escherichia coli (2-382/385) 1125A │ │││├─ Escherichia coli (2-382/385) 536A │ │││├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 EDL933 │ │││├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4024 │ │││├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 str. EC4045 │ │└┤├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. TW14359 │ │ └┼─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. TW14588 │ ┌───────────────┤ ├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 str. EC4042 │ ┌──┤ │ ├─ Escherichia coli (14-394/397) O157:H7 EDL933 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (2-382/385) O157:H7 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (14-394/397) 1212A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (14-394/397) 1044A │ │ │ └─ Escherichia coli (2-381/385) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-416/428) ATCC 8739 │ │ └────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (6-390/402) MS 187-1 │ │ └─┤┌─ Escherichia coli (35-419/431) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (35-419/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ └┼─ Escherichia coli (35-419/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (35-419/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (35-419/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ └─ Escherichia coli (35-419/431) BW2952 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/394) E24377A │ │ ┌┴─ Escherichia coli (11-398/404) E24377A │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/394) SMS-3-5 └───┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-388/396) MS 84-1 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) MS 124-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/392) MS 21-1 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) TA280 │ │ └───────────────┬─ Escherichia coli (1-391/393) ED1a │ │ └─ Escherichia coli (1-391/393) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/404) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/404) MS 84-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-388/404) ETEC H10407 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-388/404) NC101 │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-388/404) ABU 83972 │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (1-388/404) 83972 │ │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (1-388/404) strain │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-388/404) 55989 │ │ ┌─┤ ├─ Escherichia coli (1-388/404) 55989 │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (1-388/404) str. LB226692 │ │ │ └───┬─ Escherichia coli (1-387/396) SE11 │ │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (1-392/402) HS └─┤ │ │ └─ Escherichia coli (14-405/415) HS │┌─┤ └──── Escherichia coli (1-388/396) TA206 ││ └─────────┬─ Escherichia coli (1-391/396) MS 84-1 ││ └─ Escherichia coli (1-391/396) MS 124-1 ││ ┌─ Escherichia coli (18-403/410) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (18-403/410) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (18-403/410) O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli (18-403/410) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. Sakai ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. FRIK966 ││ │├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. EC869 ││ │├─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. EC4501 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (18-403/410) O157:H7 EDL933 └┤ ││├─ Escherichia coli (18-403/410) 536A │ ││└─ Escherichia coli (18-403/410) 1125A │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (18-403/410) O157:H7 str. EC4115 │ ││ └─ Escherichia coli (1-386/393) O157:H7 str. EC4024 │ ┌────┤└─ Escherichia coli (18-403/410) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬── Escherichia coli (1-386/391) WV_060327 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-386/392) MS 145-7 │┌┤└──────── Escherichia coli (17-402/407) SE15 ││└───────┬─ Escherichia coli (14-404/417) ED1a ││ └─ Escherichia coli (14-404/417) ED1a ││ ┌─ Escherichia coli (1-386/395) O157:H7 str. EC869 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-386/395) O157:H7 str. FRIK966 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-386/395) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-367/369) E110019 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-386/387) SMS-3-5 └┤ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (1-386/393) 042 │ ││ └─ Escherichia coli (1-386/393) 042 │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (1-386/391) ATCC 8739 │ ││ └─ Escherichia coli (1-386/391) ATCC 8739 │ ┌────┤└─ Escherichia coli (1-386/390) MS 185-1 │ │ └─ Escherichia coli (1-386/389) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (33-420/439) KO11 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (33-420/439) W └──┤ ┌──┤└─ Escherichia coli (1-388/407) W │ │ └─ Escherichia coli (1-386/399) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/393) 536 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/393) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli 101-1 └─┤ │ ├─ Escherichia coli BL21 │ │ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli M718 │ │ ┌┼─ Escherichia coli OP50 │ │ │├─ Escherichia coli MS 187-1 └─┤ │├─ Escherichia coli CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ ││└─ Escherichia coli B str. REL606 │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 str. LB226692 │┌┤ └┬─ Escherichia coli MS 182-1 │││ └┬─ Escherichia coli IAI39 │││ └─ Escherichia coli IAI39 ││└─ Escherichia coli (1-391/394) TA280 └┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) ETEC H10407 │┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) H299 ││ ┌─ Escherichia coli (25-410/427) 83972 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-386/403) MS 45-1 └┤┌┤└─ Escherichia coli (25-410/427) ABU 83972 ││└┬─ Escherichia coli (25-410/428) B7A ││ └─ Escherichia coli (1-386/404) B7A ││┌─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC508 └┤│┌─ Escherichia coli (25-415/417) 1125A ││├─ Escherichia coli (25-415/417) 536A ││├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4045 └┤├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. TW14588 └┼─ Escherichia coli (1-391/393) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (25-415/417) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (1-391/393) O157:H7 ├─ Escherichia coli (1-391/393) 1212A └─ Escherichia coli (25-415/417) 1044A
| Integrase | (262) |
| Phage integrase | (108) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (46) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (24) |
| integrase-like protein | (21) |
| Prophage CP4-57 integrase | (18) |
| Phage Integrase | (11) |
| Putative integrase | (7) |
| COG0582: Integrase | (7) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| prophage P4 integrase | (3) |
| putative P4-type integrase | (3) |
| putative enzyme; Integration, recombination | (3) |
| phage integrase family protein | (3) |
| putative integrase | (2) |
| putative phage integrase | (2) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| Others | (19) |