┌─ Escherichia coli (8-391/395) B185 ┌┴─ Escherichia coli (8-391/403) M605 ┌┴─ Escherichia coli (8-390/402) MS 124-1 ┌┴┬─ Escherichia coli (8-390/395) MS 21-1 ┌────┤ └─ Escherichia coli (8-390/397) MS 175-1 │ └─ Escherichia coli (8-391/398) ATCC 8739 ┌─┤ ┌─ Escherichia coli (6-392/413) O111:H- str. 11128 │ └───────┬┴─ Escherichia coli (8-392/413) ED1a (3) │ └┬─ Escherichia coli (8-392/414) 042 (1) ┌─┤ └─┬─ Escherichia coli (8-392/413) B185 │ │ └─ Escherichia coli (8-392/413) 53638 (1) │ └─────┬── fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-391/413) strain (5) │ └┬─ Escherichia coli (8-390/396) WV_060327 │ └┬─ Escherichia coli (8-391/413) MS 146-1 ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (8-391/413) MS 115-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (8-391/413) K12 (5) │ │ └─ Escherichia coli (8-391/413) str. K-12 substr. DH10B (1) │ │ ┌── Escherichia coli (22-411/423) 042 (2) │ └──────────┤ ┌─ Escherichia coli (8-397/409) 101-1 (6) ┌────┤ └┬┴─ Escherichia coli (8-397/409) MS 78-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (22-411/423) ETEC H10407 │ │ └┬─ Escherichia coli (22-411/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ └─ Escherichia coli (22-411/423) B088 (13) ┌─┤ └──────────────────────── Escherichia coli (6-388/412) 1125A (3) │ │ ┌─ Escherichia coli (1-391/402) SMS-3-5 │ │ ┌┴─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (1-391/405) strain │ └─────────────────────────┬┴─ Escherichia coli (1-391/405) E2348/69 (1) │ └┬─ Escherichia coli (1-391/400) 1044A (26) │ └┬─ Escherichia coli (1-391/400) MS 116-1 (4) │ └┬─ Escherichia coli (1-391/400) 83972 (4) │ └┬─ Escherichia coli (1-391/400) IHE3034 (1) │ └─ Escherichia coli (1-391/400) UM146 (2) │ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) FVEC1302 (3) │ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) MS 21-1 │ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) 83972 (4) │ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) CFT073 (1) │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-399/420) H591 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) ATCC 8739 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a (1) │ │└┬─ Escherichia coli (3-399/421) M605 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/420) B185 │ ││┌─ Escherichia coli (3-399/421) O26:H11 str. 11368 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) 2362-75 │ │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (3-399/420) str. LB226692 (2) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-399/420) H299 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-399/421) 042 (1) │ ││ └┬─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (3-399/420) str. LB226692 (4) │ ││ └┬─ Escherichia coli (3-399/421) 536 (3) │ ┌┤│ └─ Escherichia coli (3-399/420) E24377A (1) │ ││└─ Escherichia coli (3-399/420) MS 187-1 │ │└┬─ Escherichia coli (3-397/419) O111:H- str. 11128 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/421) EC4100B │ ││┌─ Escherichia coli (3-399/420) NC101 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) APEC O1 (3) │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) IAI39 (1) │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-399/420) IAI39 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) CFT073 (1) │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (3-399/421) ATCC 8739 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/421) 1044A (25) │ │ │ └─ Escherichia coli (3-399/421) B171 (12) │ ┌──┤ │┌─ Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) MS 200-1 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-399/421) MS 185-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) M718 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-399/421) MS 124-1 (1) │ │ └─── Escherichia coli (3-399/417) MS 115-1 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (20-429/444) E2348/69 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-407/422) 2362-75 (1) │ ││ ┌─┴─ Escherichia coli (3-407/424) O111:H- str. 11128 ┤ ││ ┌────────┴── Escherichia coli (3-407/424) ED1a (1) │ ││┌┴┬───── Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ │││ └─── Escherichia coli (3-399/415) MS 115-1 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (3-400/416) IAI1 (1) │ │ │┌──┴─ Escherichia coli (3-400/416) MS 115-1 │ │ └┤┌─── Escherichia coli (7-400/421) KO11 (2) │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-402/422) B7A (1) │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-402/417) 042 (1) │ ┌─┤ │┌─┴── Escherichia coli (3-400/422) W (1) │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/414) O103:H2 str. 12009 │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-394/394) E22 (1) │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-399/414) TA271 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) 536 (1) │ │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/420) UTI89 (1) │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/420) 83972 (4) │ │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) 55989 (5) │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-399/421) M718 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-401/421) ED1a (1) │ ┌──────┤ │ └─ Escherichia coli (3-401/421) ETEC H10407 (4) │ │ │ └─────┬────────── Escherichia coli (23-425/445) M605 │ │ │ └─┬───── Escherichia coli (10-406/427) MS 116-1 (1) │ │ │ └──┬─ Escherichia coli (3-401/418) EC4100B │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-401/422) IHE3034 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-401/424) O157:H7 str. EC869 (2) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-401/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-401/421) TA280 │ │ │┌─────────── Escherichia coli (24-423/443) MS 145-7 │ │ └┤ ┌──── Escherichia coli (1-400/420) TA206 │ │ └──┬─────┴─── Escherichia coli (3-400/420) WV_060327 │ │ └────┬── Escherichia coli (7-400/423) 536 (13) │ │ └─┬─ Escherichia coli (3-400/420) ED1a (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-400/420) FVEC1302 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-400/420) IAI39 (2) │ │ └┬─ Escherichia coli (3-400/420) H299 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (3-400/420) str. LB226692 (9) │ │ ┌─ Escherichia coli (17-390/412) IHE3034 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-390/412) TA280 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-390/412) 53638 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-390/412) F11 (2) │ │ ┌──┴┬─ Escherichia coli (17-390/412) MS 175-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (17-392/407) O157:H7 str. EC4501 (1) │ │ ┌────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (17-390/412) O157:H7 str. EC4401 (1) │ │ ┌──────────┤ └─────── Escherichia coli (12-389/406) SMS-3-5 │ │ │ └────────┬──────────────── Escherichia coli (1-385/396) MS 21-1 │ │ ┌──┤ └─────────── Escherichia coli (12-386/402) TA206 │ │ │ │ ┌──────── Escherichia coli (7-403/423) E2348/69 (1) │ │ │ └────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-402/417) 83972 (1) │ │ │ └───┤ ┌─ Escherichia coli (19-422/440) O157:H7 str. EC4501 (1) └──┤ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-402/420) 1125A (2) │ ┌───────┤ └┬─ Escherichia coli (29-430/447) 042 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-402/419) 2362-75 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-402/417) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-402/419) MS 182-1 │ │ └───────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (5-418/438) O103:H2 str. 12009 │ │ └┬─ Escherichia coli (5-418/438) M718 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (5-418/438) B171 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/396) MS 115-1 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/396) B354 │ │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (1-388/395) HS (1) │ │ │ ┌┴── Escherichia coli (1-388/402) B7A (1) │ │ │ ┌──────┴─ Escherichia coli (1-388/395) 2362-75 │ │ └────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/417) E2348/69 (1) │┌────┤ └────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/418) MS 196-1 ││ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-388/416) IAI39 (2) ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/418) APEC O1 (1) ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/415) M605 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/416) FVEC1302 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/418) ETEC H10407 ││ │ └─ Escherichia coli (1-388/416) MS 198-1 ││ └────────────────┬─ Escherichia coli (1-383/391) SE15 ││ └─ Escherichia coli (1-383/391) WV_060327 ││ ┌─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 strain (2) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-380/385) K12 (5) ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-380/385) MS 119-7 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-380/385) B088 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-380/385) E2348/69 (1) ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-390/397) TA143 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-392/397) B7A [2] ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-392/397) H591 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (1-392/397) BW2952 (8) │ │└┬─ Escherichia coli (1-390/397) B354 │ ┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 str. LB226692 │ │└┬─ Escherichia coli (1-380/385) TA271 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-378/385) KO11 (2) │ ┌─────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-380/385) IAI39 (1) │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-378/385) FVEC1302 (1) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-380/385) O26:H11 str. 11368 │ ┌──┤ └┬─ Escherichia coli (1-392/397) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-380/385) 1125A (15) │ │ │ └─ Escherichia coli (1-392/397) 1044A (8) │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (33-415/428) ATCC 8739 (1) │ │ └┬─ Escherichia coli (6-388/402) MS 187-1 │ │ └─ Escherichia coli (35-417/431) K12 (5) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/396) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/396) MS 84-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-384/394) E24377A (1) └───┤ ┌────┤ └─ Escherichia coli (3-384/394) SMS-3-5 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-384/392) MS 21-1 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (3-384/396) TA280 │ │ └─────────────── Escherichia coli (3-384/393) ED1a (1) │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/404) MS 124-1 (1) │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) NC101 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) 83972 (1) │ │ ┌──┴─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (3-384/404) str. LB226692 (3) └─┤ ┌─┴───┬─ Escherichia coli (3-384/396) SE11 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-384/402) HS [2] │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (3-384/394) SMS-3-5 │┌┤ └──── Escherichia coli (2-388/396) TA206 ││└───────── Escherichia coli (3-386/396) MS 124-1 (1) ││ ┌─ Escherichia coli (24-401/410) 1044A (13) ││ ┌┴─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. EC4024 (1) └┤ ┌┴─ Escherichia coli (24-401/410) O55:H7 str. CB9615 │ ┌───┴┬─ Escherichia coli (7-388/391) WV_060327 │┌──┤ └─ Escherichia coli (7-386/392) MS 145-7 ││ └─────── Escherichia coli (18-399/407) SE15 ││ ┌───── Escherichia coli (3-384/397) MS 115-1 └┤┌──┴───── Escherichia coli (15-397/417) ED1a (1) ││ ┌─ Escherichia coli (3-386/387) SMS-3-5 ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/393) 042 (1) ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-386/391) ATCC 8739 (1) └┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-387/395) F11 (1) │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-384/395) O157:H7 str. EC869 (2) │ ┌────┤└─ Escherichia coli (3-384/390) MS 185-1 │ │ └─ Escherichia coli (3-386/389) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (32-418/439) KO11 (1) └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-386/407) W │ ┌─┴─ Escherichia coli (3-383/399) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/393) 536 (1) └─┤ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/394) MS 182-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/394) IAI39 (1) └─┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-384/394) 101-1 (8) │┌┤ └─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (3-384/394) str. LB226692 ││└─ Escherichia coli (3-384/394) TA280 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-384/396) H299 │┌┴─ Escherichia coli (3-384/396) ETEC H10407 └┤ ┌─ Escherichia coli (27-408/427) 83972 (2) └┬┴─ Escherichia coli (3-384/404) B7A (1) └┬─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC508 └─ Escherichia coli (27-408/417) 1044A (24)
| Integrase | (97) |
| Phage integrase | (33) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (26) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (9) |
| Phage Integrase | (8) |
| Prophage CP4-57 integrase | (7) |
| COG0582: Integrase | (6) |
| Putative integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (3) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| prophage P4 integrase | (1) |
| putative integrase of prophage | (1) |
| putative P4-type integrase | (1) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (1) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (1) |
| integrase-like protein | (1) |
| putative integrase prophage protein | (1) |
| Prophage P4 integrase | (1) |
| Others | (9) |