┌─ Escherichia coli (8-391/413) BW2952 ├─ Escherichia coli (8-391/413) K12 ├─ Escherichia coli (8-391/413) str. K-12 substr. MG1655 ┌┼─ Escherichia coli (8-391/413) str. K-12 substr. MG1655 │├─ Escherichia coli (8-391/413) W3110 ┌┤└─ Escherichia coli (8-391/413) DH1 │└┬─ Escherichia coli (8-391/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤ └─ Escherichia coli (8-391/413) str. K-12 substr. DH10B ┌┤└─ Escherichia coli (8-391/413) MS 115-1 ┌┤└─ Escherichia coli (8-391/413) MS 146-1 │└─ Escherichia coli (8-390/396) WV_060327 ┌─────┤ ┌─ Escherichia coli (8-391/413) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (8-391/413) H591 │ └─┼─ Escherichia coli (8-391/413) TA271 │ ├─ Escherichia coli (8-391/413) MS 119-7 │ ├─ Escherichia coli (8-391/413) 55989 │ └─ fig|6666666.5357.peg.4073 TY-2482 (8-391/413) strain │ ┌─ Escherichia coli (8-391/395) B185 ┌─┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-391/403) M605 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (8-390/402) MS 124-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-390/395) MS 21-1 │ │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (8-390/397) MS 175-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (8-391/398) ATCC 8739 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-392/413) 53638 │ └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (8-392/413) 53638 │ │ ┌─┴─ Escherichia coli (8-392/413) B185 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (8-392/414) 042 │ └───────┤ └─ Escherichia coli (8-392/414) 042 ┌──┤ │┌─ Escherichia coli (6-392/413) O111:H- str. 11128 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (8-392/413) ED1a │ │ └┼─ Escherichia coli (8-392/413) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (8-392/413) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (8-392/413) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (22-411/423) 042 │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (22-411/423) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (22-411/423) 042 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-397/409) 101-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-397/409) BL21 │ └──────────┤ ├─ Escherichia coli (8-397/409) E24377A │ │ ┌┼─ Escherichia coli (35-424/436) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (35-424/436) E24377A │ │┌┤├─ Escherichia coli (DE3 8-397/409) BL21(DE3) │ │││└─ Escherichia coli (8-397/409) B str. REL606 │ └┤└─ Escherichia coli (8-397/409) MS 78-1 │ │┌─ Escherichia coli (22-411/423) ETEC H10407 ┌────┤ ││┌─ Escherichia coli (22-411/423) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┤│┌─ Escherichia coli (22-411/423) B171 │ │ ││├─ Escherichia coli (22-411/423) B7A │ │ └┤├─ Escherichia coli (22-411/423) E22 │ │ │├─ Escherichia coli (22-411/423) KO11 │ │ │├─ Escherichia coli (22-411/423) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (22-411/423) SE11 │ │ └┼─ Escherichia coli (22-411/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) W │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) MS 145-7 │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) B7A │ │ ├─ Escherichia coli (22-411/423) B171 │ │ └─ Escherichia coli (22-411/423) B088 │ │ ┌─ Escherichia coli (6-388/412) O157:H7 str. EC4024 ┌─┤ └───────────────────────┼─ Escherichia coli (6-388/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (6-388/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ └─ Escherichia coli (6-388/412) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (1-391/405) E2348/69 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-391/405) O127:H6 str. E2348/69 │ │ ┌┴┬─ fig|6666666.5357.peg.1533 TY-2482 (1-391/405) strain │ │ │ └─ Escherichia coli (1-391/402) SMS-3-5 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-391/400) UM146 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-391/400) UTI89 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (1-391/400) UTI89 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (1-391/400) NC101 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-391/400) IHE3034 │ │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-391/400) ABU 83972 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (1-391/400) CFT073 │ │ │ │└┼─ Escherichia coli (1-391/400) MS 45-1 │ └─────────────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) CFT073 │ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-391/400) 83972 │ │││┌─ Escherichia coli (1-391/400) MS 200-1 │ │││├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC869 │ ││└┼─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. FRIK2000 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC869 │ ││ └─ Escherichia coli (1-391/400) MS 116-1 │ ││┌─ Escherichia coli (1-391/400) 1125A │ ││├─ Escherichia coli (1-391/400) 536A │ ││├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 │ └┤├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. TW14359 │ └┼─ Escherichia coli (1-391/400) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) O111:H- str. 11128 │ ├─ Escherichia coli (1-391/400) 1212A │ └─ Escherichia coli (1-391/400) 1044A │ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) 1044A │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) 1212A │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. FRIK2000 │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. TW14588 │ ┌┼─ Escherichia coli (3-399/421) O55:H7 str. CB9615 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 str. EC4024 │ ┌┤├─ Escherichia coli (3-399/421) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (3-399/421) 536A │ ││└─ Escherichia coli (3-399/421) 1125A │ ││┌─ Escherichia coli (3-399/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (3-399/421) B171 │ ││├─ Escherichia coli (3-399/421) E22 │ ││├─ Escherichia coli (3-399/421) E2348/69 │ ││├─ Escherichia coli (3-399/421) O103:H2 str. 12009 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (3-399/421) O127:H6 str. E2348/69 │ ││└┼─ Escherichia coli (3-399/421) O26:H11 str. 11368 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O111:H- str. 11128 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) E22 │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (3-399/421) B171 │ │││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) B171 │ │││ └─ Escherichia coli (3-399/421) B171 │ ┌┤│└─ Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ ││└┬─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a │ ││ └─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (3-399/421) ATCC 8739 │ ││ └─ Escherichia coli (3-399/421) ATCC 8739 │ │└┬─ Escherichia coli (3-399/420) CFT073 │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/420) CFT073 │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) IAI39 │ ││┌┴─ Escherichia coli (3-399/420) IAI39 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) IAI39 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) IAI39 │ ┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (3-399/420) APEC O1 │ ││ └┼─ Escherichia coli (3-399/420) S88 │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/420) MS 119-7 │ ││ └─ Escherichia coli (3-399/420) APEC O1 │ │└─ Escherichia coli (3-399/420) NC101 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) EC4100B │ ┌┤┌┴─ Escherichia coli (3-397/419) O111:H- str. 11128 │ │││┌─ Escherichia coli (3-399/420) MS 187-1 │ ││││ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) 536 │ ││││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) F11 │ ││││ ┌┼─ Escherichia coli (3-399/421) F11 │ │└┤│ ┌┤└─ Escherichia coli (3-399/421) 536 │ │ ││ │└┬─ Escherichia coli (3-399/420) E24377A │ │ ││ │ └─ Escherichia coli (3-399/420) E24377A │ │ ││ ┌┤┌─ Escherichia coli (3-399/420) 042 │ │ ││ ││├─ Escherichia coli (3-399/420) 55989 │ │ ││ │└┼─ Escherichia coli (3-399/420) 55989 │ │ └┤ ┌┤ ├─ Escherichia coli (3-399/420) 042 │ │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.2500 O104:H4 (3-399/420) str. LB226692 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-399/421) 042 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/421) 042 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-399/420) H299 │ │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (3-399/420) 2362-75 │ │ │┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (3-399/420) 55989 │ │ │││ └┼─ Escherichia coli (3-399/420) 55989 │ │ │││ └─ fig|1040638.4.peg.832 O104:H4 (3-399/420) str. LB226692 │ │ ││└─ Escherichia coli (3-399/421) O26:H11 str. 11368 │ ┌──┤ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) B185 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) M605 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a │ │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/420) ED1a ┤ │ │ └┤ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-399/420) ATCC 8739 │ │ │ │┌┤ └─ Escherichia coli (3-399/420) ATCC 8739 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (3-399/420) H591 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) CFT073 │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (3-399/421) CFT073 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) FVEC1302 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/421) MS 198-1 │ │ │ └┤ ┌┼─ Escherichia coli (3-399/421) UMN026 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (3-399/421) FVEC1412 │ ┌──┤ │ ││└─ Escherichia coli (3-399/421) MS 21-1 │ │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-399/421) ABU 83972 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) APEC O1 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-399/421) S88 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) APEC O1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-399/421) 83972 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) MS 200-1 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (3-399/421) MS 185-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) M718 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/421) MS 84-1 │ ┌┤ │ └─ Escherichia coli (3-399/421) MS 124-1 │ ││ └─── Escherichia coli (3-399/417) MS 115-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-407/422) 2362-75 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-407/422) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (20-429/444) E2348/69 │ ││ ┌─┴─ Escherichia coli (3-407/424) O111:H- str. 11128 │ ││ ┌────────┴─┬─ Escherichia coli (3-407/424) ED1a │ ││┌┤ └─ Escherichia coli (3-407/424) ED1a │ │││└┬───── Escherichia coli (3-399/420) MS 107-1 │ │││ └─── Escherichia coli (3-399/415) MS 115-1 │ │││ ┌─ Escherichia coli (3-400/416) IAI1 │ │└┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-400/416) IAI1 │ │ │┌──┴─ Escherichia coli (3-400/416) MS 115-1 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (7-400/421) KO11 │ │ ││┌──┼─ Escherichia coli (7-400/421) W │ │ └┤│ └─ Escherichia coli (7-400/421) W │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-402/422) B7A │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-402/422) B7A │ │ ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-402/417) 042 │ │ └┤┌─┤ └─ Escherichia coli (3-402/417) 042 │ │ ││ └─┬─ Escherichia coli (3-400/422) W │ │ ││ └─ Escherichia coli (3-400/422) W │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-394/394) E22 │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (3-394/394) E22 │ │ └┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-399/414) O103:H2 str. 12009 │ ┌─┤ │┌┴─ Escherichia coli (3-399/414) TA271 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) 83972 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (3-399/420) F11 │ │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-399/420) UM146 │ │ │ ││ │├─ Escherichia coli (3-399/420) MS 200-1 │ │ │ └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (3-399/420) ABU 83972 │ │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-399/420) UTI89 │ │ │ │ │└┬┴─ Escherichia coli (3-399/420) UTI89 │ │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-399/420) 536 │ │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-399/420) 536 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-399/421) 55989 │ │ │ └─┤ ├─ Escherichia coli (3-399/421) MS 124-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-399/421) MS 84-1 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-399/421) SMS-3-5 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (3-399/421) MS 45-1 │ │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (3-399/421) 55989 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (3-399/421) M718 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-401/421) ED1a │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-401/421) ED1a │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-401/413) H736 │ ┌──────┤ │ │├─ Escherichia coli (3-401/421) IAI39 │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-401/421) MS 145-7 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-401/421) IAI39 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-401/421) ETEC H10407 │ │ │ │ ┌────────── Escherichia coli (23-425/445) M605 │ │ │ └─────┤ ┌─ Escherichia coli (10-406/427) MS 116-1 │ │ │ │ ┌────┴─ Escherichia coli (10-406/427) MS 175-1 │ │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (3-401/418) EC4100B │ │ │ └──┤ ┌─ Escherichia coli (3-401/422) IHE3034 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-401/422) WV_060327 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (3-401/421) TA280 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (3-401/420) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-401/424) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-401/424) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-401/424) O157:H7 str. EC869 │ │ │┌─────────── Escherichia coli (24-423/443) MS 145-7 │ │ ││ ┌──── Escherichia coli (1-400/420) TA206 │ │ ││ ┌─────┴─── Escherichia coli (3-400/420) WV_060327 │ │ ││ │ ┌─ Escherichia coli (7-400/423) 536 │ │ └┤ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) 83972 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) CFT073 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) IHE3034 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) MS 200-1 │ │ └──┤ ├─ Escherichia coli (7-400/423) NC101 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) UTI89 │ │ │ ┌─┼─ Escherichia coli (7-400/423) UTI89 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) UM146 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) MS 45-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) MS 185-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-400/423) CFT073 │ │ └────┤ ├─ Escherichia coli (7-400/423) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (7-400/423) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-400/420) ED1a │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-400/420) ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-400/420) FVEC1302 │ │ └─┤┌┴─ Escherichia coli (3-400/420) UMN026 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (3-400/420) IAI39 │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli (3-400/420) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ││└─ Escherichia coli (3-400/420) IAI39 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (3-400/420) H299 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-400/420) 53638 │ │ └┤├─ Escherichia coli (3-400/420) 55989 │ │ │├─ Escherichia coli (3-400/420) E110019 │ │ │├─ Escherichia coli (3-400/420) MS 124-1 │ │ └┼─ Escherichia coli (3-400/420) MS 84-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-400/420) MS 198-1 │ │ ├─ Escherichia coli (3-400/420) E110019 │ │ ├─ Escherichia coli (3-400/420) 55989 │ │ ├─ Escherichia coli (3-400/420) 53638 │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3509 O104:H4 (3-400/420) str. LB226692 │ │ ┌─ Escherichia coli (17-390/412) IHE3034 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-390/412) UM146 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (17-390/412) TA280 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (17-390/412) 53638 │ │ │ └─ Escherichia coli (17-390/412) 53638 │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (17-390/412) F11 │ │ │└┼─ Escherichia coli (17-390/412) MS 200-1 │ │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (17-390/412) F11 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (17-390/412) MS 175-1 │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (17-392/407) O157:H7 str. EC4501 │ │ ┌────────────────────────┤ └┬┴─ Escherichia coli (17-392/407) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ │ └┬─ Escherichia coli (17-390/412) O157:H7 str. EC4486 │ │ ┌──────────┤ │ └─ Escherichia coli (17-390/412) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ │ └─────── Escherichia coli (12-389/406) SMS-3-5 │ │ │ └────────┬──────────────── Escherichia coli (1-385/396) MS 21-1 │ │ │ └─────────── Escherichia coli (12-386/402) TA206 └──┤ ┌──┤ ┌─ Escherichia coli (7-403/423) E2348/69 │ │ │ ┌───────┴─ Escherichia coli (4-400/420) O127:H6 str. E2348/69 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-402/417) 83972 │ │ └────────────────┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-402/417) ABU 83972 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-402/420) 1125A │ │ └───┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-402/420) O157:H7 str. EC508 │ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-402/420) O103:H2 str. 12009 │ ┌───────┤ ││└┬─ Escherichia coli (19-422/440) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ └┤ └─ Escherichia coli (19-422/440) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (29-430/447) 042 │ │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-402/419) 042 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-402/419) 2362-75 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-402/417) MS 21-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-402/419) MS 182-1 │ │ └───────────────────────────────────────────┬─ Escherichia coli (5-418/438) O103:H2 str. 12009 │ │ └┬─ Escherichia coli (5-418/438) M718 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (5-418/438) B171 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/395) HS │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/395) HS │ │ │ ┌─┴┬─ Escherichia coli (1-388/396) B354 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-388/396) MS 115-1 │ │ │ │└─┬─ Escherichia coli (1-388/402) B7A │ │ │ ┌──────┤ └─ Escherichia coli (1-388/402) B7A │ │ │ │ └─ Escherichia coli (1-388/395) 2362-75 │ │ └────────────┤ ┌─ Escherichia coli (1-388/417) E2348/69 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-388/417) O127:H6 str. E2348/69 │┌────┤ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/416) IAI39 ││ │ └────────┤ ┌┼─ Escherichia coli (1-388/416) IHE3034 ││ │ │┌┤└─ Escherichia coli (1-388/416) IAI39 ││ │ └┤└─ Escherichia coli (1-388/418) MS 196-1 ││ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-388/418) APEC O1 ││ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-388/418) APEC O1 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/415) M605 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/416) FVEC1302 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-388/418) ETEC H10407 ││ │ └─ Escherichia coli (1-388/416) MS 198-1 ││ └────────────────┬─ Escherichia coli (1-383/391) SE15 ││ └─ Escherichia coli (1-383/391) WV_060327 ││ ┌─ Escherichia coli (1-380/385) APEC O1 ││ ├─ Escherichia coli (1-380/385) K12 ││ ├─ Escherichia coli (1-380/385) W3110 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-380/385) str. K-12 substr. DH10B ││ │├─ Escherichia coli (1-380/385) UM146 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-380/385) APEC O1 ││ ││┌─ Escherichia coli 55989 ││ ┌┤└┼─ Escherichia coli 55989 ││ ││ └─ fig|6666666.5357.peg.3503 TY-2482 strain ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-380/385) MS 119-7 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-380/385) B088 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-380/385) O127:H6 str. E2348/69 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-380/385) E2348/69 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-390/397) TA143 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-392/397) H591 ││ │ └┬─ Escherichia coli (1-380/385) B7A ││ │ └─ Escherichia coli (1-392/397) B7A ││ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-392/397) DH1 ││ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) S88 ││ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) UTI89 ││ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) str. K-12 substr. MG1655 ││ │└┼─ Escherichia coli (1-392/397) str. K-12 substr. MG1655 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-392/397) str. K-12 substr. DH10B ││ ││ ├─ Escherichia coli (1-392/397) UTI89 ││ ││ ├─ Escherichia coli (1-392/397) IHE3034 ││ ││ └─ Escherichia coli (1-392/397) BW2952 ││ ┌┤└┬─ Escherichia coli (1-390/397) B354 ││ ││ └─ fig|1040638.4.peg.3437 O104:H4 str. LB226692 ││ ││┌─ Escherichia coli (1-380/385) TA271 └┤ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-378/385) KO11 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (1-378/385) W │ │ └┤└─ Escherichia coli (1-378/385) W │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-380/385) IAI39 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-380/385) IAI39 │ ┌─────────────┤ └┬─ Escherichia coli (1-380/385) O26:H11 str. 11368 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (1-378/385) MS 198-1 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-378/385) FVEC1302 │ │ │┌─ Escherichia coli (1-392/397) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-392/397) 1044A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 EDL933 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 str. EC4113 │ │ └┤┌┼─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 str. Sakai │ │ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 str. EC869 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 str. EC4076 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-392/397) O157:H7 EDL933 │ │ ││└─ Escherichia coli (1-392/397) 1212A │ │ ││┌─ Escherichia coli (1-380/385) 536A │ │ └┤├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4024 │ │ │├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4115 │ ┌──┤ │├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC508 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-380/385) O157:H7 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-380/385) 1125A │ │ │ ┌─ Escherichia coli (33-415/428) ATCC 8739 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (33-415/428) ATCC 8739 │ │ └──────────────┤┌─ Escherichia coli (6-388/402) MS 187-1 │ │ └┤┌─ Escherichia coli (35-417/431) K12 │ │ │├─ Escherichia coli (35-417/431) str. K-12 substr. DH10B │ │ └┼─ Escherichia coli (35-417/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (35-417/431) str. K-12 substr. MG1655 │ │ ├─ Escherichia coli (35-417/431) str. K-12 substr. DH10B └───┤ └─ Escherichia coli (35-417/431) BW2952 │ ┌─ Escherichia coli (3-384/394) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (13-394/404) E24377A │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/394) SMS-3-5 │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-384/396) MS 84-1 │ ┌────┤ └─ Escherichia coli (3-384/396) MS 124-1 │ │ └┬─ Escherichia coli (3-384/392) MS 21-1 │ ┌──┤ └─ Escherichia coli (3-384/396) TA280 │ │ └──────────────┬─ Escherichia coli (3-384/393) ED1a │ │ └─ Escherichia coli (3-384/393) ED1a │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/404) MS 124-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) MS 84-1 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) ETEC H10407 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/404) NC101 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (3-384/404) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-384/404) 83972 │ │ ┌──┤┌─ fig|6666666.5357.peg.3044 TY-2482 (3-384/404) strain │ │ │ └┼─ Escherichia coli (3-384/404) 55989 │ │ ┌─┤ ├─ Escherichia coli (3-384/404) 55989 │ │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.5408 O104:H4 (3-384/404) str. LB226692 │ │ │ └───┬─ Escherichia coli (3-384/396) SE11 └─┤ ┌─┤ └┬─ Escherichia coli (3-384/394) SMS-3-5 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (3-384/402) HS │┌┤ │ └─ Escherichia coli (13-397/415) HS │││ └──── Escherichia coli (2-388/396) TA206 ││└────────┬─ Escherichia coli (3-386/396) MS 84-1 ││ └─ Escherichia coli (3-386/396) MS 124-1 ││ ┌─ Escherichia coli (24-401/410) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (24-401/410) 1212A ││ ├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (24-401/410) O157:H7 str. EC508 ││ ├─ Escherichia coli (24-401/410) O157:H7 str. FRIK2000 ││ ├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. Sakai ││ ┌┼─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. FRIK966 └┤ │├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. EC4501 │ ┌┤├─ Escherichia coli (24-401/410) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (24-401/410) 536A │ ││└─ Escherichia coli (24-401/410) 1125A │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (24-401/410) O157:H7 str. EC4115 │ ││ └─ Escherichia coli (7-384/393) O157:H7 str. EC4024 │ ┌───┤└─ Escherichia coli (24-401/410) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli (7-388/391) WV_060327 │┌──┤ └─ Escherichia coli (7-386/392) MS 145-7 ││ └─────── Escherichia coli (18-399/407) SE15 ││ ┌─ Escherichia coli (15-397/417) ED1a ││ ┌────┴─ Escherichia coli (15-397/417) ED1a ││┌──┴───── Escherichia coli (3-384/397) MS 115-1 └┤│ ┌─ Escherichia coli (3-384/395) O157:H7 str. EC869 ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-384/395) O157:H7 str. FRIK966 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (3-384/395) O157:H7 str. FRIK2000 ││ │└┬─ Escherichia coli (3-387/395) F11 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (3-387/395) F11 ││ ││ ┌─ Escherichia coli (3-386/391) ATCC 8739 └┤ │└┬┴─ Escherichia coli (3-386/391) ATCC 8739 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-386/387) SMS-3-5 │ ││ └┬─ Escherichia coli (3-384/393) 042 │ ┌────┤│ └─ Escherichia coli (3-384/393) 042 │ │ │└─ Escherichia coli (3-384/390) MS 185-1 │ │ └─ Escherichia coli (3-386/389) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (32-418/439) KO11 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (32-418/439) W └─┤ ┌┴─ Escherichia coli (3-386/407) W │ ┌─┴─ Escherichia coli (3-383/399) MS 145-7 │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/393) 536 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (3-384/393) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (3-384/394) 101-1 └─┤ │ ├─ Escherichia coli (3-384/394) BL21 │ │ ├─ Escherichia coli (3-384/394) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (3-384/394) M718 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (3-384/394) OP50 │ │ │├─ Escherichia coli (3-384/394) MS 187-1 └─┤ │├─ Escherichia coli (3-384/394) CFT073 │ ┌┤├─ Escherichia coli (DE3 3-384/394) BL21(DE3) │ ││└─ Escherichia coli (3-384/394) B str. REL606 │ ┌┤└─ fig|1040638.4.peg.393 O104:H4 (3-384/394) str. LB226692 │ │└┬─ Escherichia coli (3-384/394) MS 182-1 │┌┤ └┬─ Escherichia coli (3-384/394) IAI39 │││ └─ Escherichia coli (3-384/394) IAI39 ││└─ Escherichia coli (3-384/394) TA280 └┤ ┌─ Escherichia coli (3-384/396) H299 │┌┴─ Escherichia coli (3-384/396) ETEC H10407 ││ ┌─ Escherichia coli (27-408/427) 83972 ││ ┌┼─ Escherichia coli (3-384/403) MS 45-1 └┤┌┤└─ Escherichia coli (27-408/427) ABU 83972 ││└┬─ Escherichia coli (27-408/428) B7A ││ └─ Escherichia coli (3-384/404) B7A ││┌─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC508 └┤│┌─ Escherichia coli (27-408/417) 1125A ││├─ Escherichia coli (27-408/417) 536A ││├─ Escherichia coli (3-384/393) O157:H7 EDL933 ││├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4024 ││├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4045 └┤├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (3-384/393) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. Sakai │├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. TW14588 └┼─ Escherichia coli (3-384/393) O55:H7 str. CB9615 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (3-384/393) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (3-384/393) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (27-408/417) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (3-384/393) O157:H7 ├─ Escherichia coli (3-384/393) 1212A └─ Escherichia coli (27-408/417) 1044A
| Integrase | (263) |
| Phage integrase | (112) |
| Phage integrase, Phage P4-associated | (49) |
| FIG016809: Prophage P4 integrase | (25) |
| Prophage CP4-57 integrase | (18) |
| Phage Integrase | (14) |
| COG0582: Integrase | (10) |
| Putative integrase | (6) |
| Putative prophage Sf6-like integrase | (4) |
| putative prophage integrase | (4) |
| putative integrase prophage protein | (4) |
| prophage P4 integrase | (3) |
| putative P4-type integrase | (3) |
| putative enzyme; Integration, recombination | (3) |
| phage integrase family protein | (3) |
| putative integrase | (2) |
| IS, phage, Tn; Phage-related functions and prophages | (2) |
| CPZ-55 prophage; predicted integrase | (2) |
| phage and prophage-related functions; integration, recombination | (2) |
| site-specific recombinase, phage integrase family | (1) |
| Others | (16) |