┌──────────────────────────────────────────────────────────── Escherichia coli (24-255/263) SE11 │ ┌─ Escherichia coli (1-250/252) 1044A │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) 1212A │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. TW14359 │ ┌┼─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4206 │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4115 │ ││├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4076 │ ││├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 EDL933 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (1-250/252) 536A │ │││└─ Escherichia coli (1-250/252) 1125A │ ┌──┤│└─ Escherichia coli (1-250/252) O157:H7 EDL933 │ │ │└─ Escherichia coli (1-250/252) O55:H7 str. CB9615 │ │ └┬─ Escherichia coli B185 │ │ └┬─ Escherichia coli (4-249/249) M718 │ │ └─ Escherichia coli (4-249/249) MS 187-1 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli 101-1 │ ││ ├─ Escherichia coli BL21 │ ││┌┼─ Escherichia coli OP50 │ │││├─ Escherichia coli (DE3) BL21(DE3) │ │││└─ Escherichia coli B str. REL606 │ │└┤┌─ Escherichia coli ETEC H10407 │ │ ││┌─ Escherichia coli DH1 │ │ ││├─ Escherichia coli K12 │ │ └┤├─ Escherichia coli MS 146-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 196-1 │ │ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ┌┤ │├─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ││ └┼─ Escherichia coli str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli str. K-12 substr. DH10B │ ││ ├─ Escherichia coli W3110 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 175-1 │ ││ ├─ Escherichia coli MS 116-1 │ ││ ├─ Escherichia coli H736 │ ││ └─ Escherichia coli BW2952 │ ││ ┌─ Escherichia coli E24377A │ ││┌┴─ Escherichia coli E24377A │ │││┌─ Escherichia coli MS 107-1 │ │└┤│┌─ Escherichia coli B088 │ │ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.591 TY-2482 strain │ │ └┤│├─ Escherichia coli 55989 │ │ ││├─ Escherichia coli B171 │ │ ││├─ Escherichia coli B7A │ │ ││├─ Escherichia coli E110019 │ │ └┤├─ Escherichia coli E22 │ │ │├─ Escherichia coli IAI1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli MS 78-1 │ │ │├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli W │ │ └┼─ Escherichia coli W │ │ ├─ Escherichia coli SE11 │ ┌────┤ ├─ Escherichia coli MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli KO11 │ │ │ ├─ Escherichia coli IAI1 │ │ │ ├─ Escherichia coli E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli B171 │ │ │ ├─ Escherichia coli 55989 │ │ │ └─ fig|1040638.4.peg.3423 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-249/249) 042 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-249/249) 042 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (6-249/249) B354 │ │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (6-249/249) E2348/69 │ │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli (6-249/249) 2362-75 │ │ │ │└─ Escherichia coli (6-249/249) TA280 │ │ │ ┌┤┌─ Escherichia coli (6-249/249) FVEC1412 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-249/249) MS 69-1 │ │ │ │└┼─ Escherichia coli (6-249/249) UMN026 │ │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (6-249/249) MS 198-1 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-249/249) FVEC1302 │ │ │┌──┤└─ Escherichia coli (6-249/249) TA143 │ │ ││ └─ Escherichia coli (6-249/249) H299 │ ┌──────────────────┤ ││ ┌─ Escherichia coli 1827-70 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli 53638 │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli HS │ │ │ │ │├─ Escherichia coli HS │ │ │ │ │├─ Escherichia coli ATCC 8739 │ │ │ └────┤└─ Escherichia coli 53638 │ │ │ │┌─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli H591 │ │ │ └┤├─ Escherichia coli MS 119-7 │ │ │ │├─ Escherichia coli O111:H- str. 11128 │ │ │ └┼─ Escherichia coli TA271 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 145-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 115-1 │ │ │ └─ Escherichia coli EC4100B │ │ │ ┌─ Escherichia coli IAI39 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli SMS-3-5 │ │ │ │└─ Escherichia coli IAI39 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli 536 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli F11 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli F11 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 200-1 │ │ └────┤ ┌┼─ Escherichia coli NC101 ┤ │ │ │├─ Escherichia coli F11 │ │ │┌┤├─ Escherichia coli F11 │ ┌──────┤ │││└─ Escherichia coli 536 │ │ │ ││└┬─ Escherichia coli ED1a │ │ │ ││ └─ Escherichia coli ED1a │ │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli O83:H1 str. NRG 857C │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli WV_060327 │ │ │ ││ ┌─ Escherichia coli APEC O1 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli IHE3034 │ │ │ └┤ ├─ Escherichia coli UM146 │ │ │ │┌┼─ Escherichia coli UTI89 │ │ │ ││├─ Escherichia coli UTI89 │ │ │ ││├─ Escherichia coli S88 │ │ │ └┤└─ Escherichia coli APEC O1 │ │ │ │┌─ Escherichia coli ABU 83972 │ │ │ │├─ Escherichia coli CFT073 │ │ │ │├─ Escherichia coli MS 45-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli TA206 │ │ │ ├─ Escherichia coli MS 185-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli CFT073 │ │ │ └─ Escherichia coli 83972 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (26-256/261) TA280 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (8-238/243) 536 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-238/243) F11 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (8-238/243) MS 124-1 │ │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (8-238/243) MS 84-1 │ │ │ │ │├─ Escherichia coli (8-238/243) MS 182-1 │ │ └─────────────────────┤┌─┤├─ Escherichia coli (8-238/243) MS 107-1 │ │ ││ │└─ Escherichia coli (8-238/243) 536 │ │ ││ └─ Escherichia coli (8-238/243) TA206 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (6-239/239) CFT073 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-239/239) FVEC1302 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-239/239) IAI39 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (6-239/239) UMN026 │ │ └┤ │├─ Escherichia coli (6-239/239) IAI39 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (6-239/239) FVEC1412 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (6-239/239) CFT073 │ │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (6-239/239) MS 69-1 │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (3-244/244) MS 198-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (3-244/244) CFT073 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-239/239) 536 │ │ └────────┤ ├─ Escherichia coli (11-244/244) F11 │ │ │┌┼─ Escherichia coli (6-239/239) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (11-244/244) MS 200-1 │ │ ││└─ Escherichia coli (11-244/244) F11 │ │ ││┌─ Escherichia coli (3-244/244) 83972 │ │ └┤├─ Escherichia coli (3-244/244) APEC O1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-244/244) H299 │ │ │├─ Escherichia coli (3-244/244) MS 124-1 │ │ │├─ Escherichia coli (3-244/244) UM146 │ ┌──────────┤ └┼─ Escherichia coli (3-244/244) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-244/244) UTI89 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-244/244) S88 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-244/244) MS 119-7 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-244/244) APEC O1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (3-244/244) ABU 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (3-244/244) 536 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (13-242/249) B088 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) B171 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) B7A │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) E110019 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) E22 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) IAI1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 107-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 124-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 182-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 84-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (13-242/249) TA271 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (13-242/249) W │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) W │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) SE11 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) O103:H2 str. 12009 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 78-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 145-7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) MS 119-7 │ │ │ │├─ Escherichia coli (13-242/249) KO11 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (13-242/249) IAI1 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (13-242/249) EC4100B │ │ │ ││├─ Escherichia coli (13-242/249) E22 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (16-245/252) E110019 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (13-242/249) B7A │ │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (13-242/249) B171 │ │ │ │││┌─ fig|6666666.5357.peg.4211 TY-2482 (13-242/249) strain │ │ │ ││└┼─ Escherichia coli (13-242/249) 55989 │ │ │ ││ ├─ Escherichia coli (13-242/249) 55989 │ │ │ ┌┤│ └─ fig|1040638.4.peg.2198 O104:H4 (13-242/249) str. LB226692 │ │ │ ││└┬─ Escherichia coli (16-245/252) E24377A │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (13-242/249) E24377A │ │ │ │└┬─ Escherichia coli (13-242/249) IAI39 │ │ │ ┌───────────────────────────────────┤ └─ Escherichia coli (13-242/249) IAI39 │ │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (13-242/249) ATCC 8739 │ │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (13-242/249) ATCC 8739 │ │ │ │ └┤┌─ Escherichia coli (13-242/249) HS │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (13-242/249) MS 115-1 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (13-242/249) HS │ │ └──────────┤ ┌─────────────── Escherichia coli (8-245/253) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (7-242/242) BW2952 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) ETEC H10407 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) K12 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) MS 146-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) MS 196-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) str. K-12 substr. DH10B │ │ └──────┤ ├─ Escherichia coli (7-242/242) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ┌───┼─ Escherichia coli (7-242/242) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) W3110 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) MS 175-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) MS 116-1 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-242/242) H736 │ │ └───────────┤ └─ Escherichia coli (7-242/242) DH1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (9-243/243) B185 └─────┤ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-243/243) O55:H7 str. CB9615 │ │ │└─ Escherichia coli (9-243/243) M718 │ │ │┌─ Escherichia coli (9-242/242) O157:H7 str. EC4401 │ │ ││┌─ Escherichia coli (9-243/243) 1125A │ └──────┤│├─ Escherichia coli (9-243/243) 536A │ ││├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4024 │ ││├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4045 │ └┤├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. FRIK2000 │ │├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. Sakai │ └┼─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. FRIK966 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (9-243/243) 1212A │ └─ Escherichia coli (9-243/243) 1044A │ ┌─ Escherichia coli (8-229/234) M605 │ ┌───────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (8-229/234) SE15 │ │ ┌─ Escherichia coli (4-228/230) E110019 │ │ ┌───────────────────────────────────────┴─ Escherichia coli (4-228/230) E110019 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (15-227/233) 53638 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-227/233) K12 │ │ │ ├─ Escherichia coli (15-227/233) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) 53638 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) B str. REL606 │ │ │ ├─ Escherichia coli (DE3 6-218/224) BL21(DE3) │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) DH1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 115-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 146-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 187-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) OP50 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ ┌┼─ Escherichia coli (6-218/224) str. K-12 substr. MG1655 │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) str. K-12 substr. DH10B │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 196-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 175-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 116-1 │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) H736 │ │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (6-218/224) BW2952 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) BL21 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) ATCC 8739 │ │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) 101-1 │ │ │ ┌┤│├─ Escherichia coli (15-227/233) W3110 │ │ │ │││└─ Escherichia coli (15-227/233) ATCC 8739 │ │ │ ││└─ Escherichia coli (6-218/224) ETEC H10407 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (6-218/224) M718 │ │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (6-218/224) B7A │ │ │ │ └┼─ Escherichia coli (6-218/224) MS 145-7 │ │ │ │ └─ Escherichia coli (15-227/233) B7A │ │ │ │┌─ fig|6666666.5357.peg.4744 TY-2482 (6-218/224) strain │ │ │ │├─ Escherichia coli (6-218/224) 55989 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-227/233) E110019 │ │ │ │├─ Escherichia coli (15-227/233) E22 └──────┤ │ ┌┤├─ Escherichia coli (6-218/224) E24377A │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) EC4100B │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) IAI1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) KO11 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 119-7 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 182-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 84-1 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) O111:H- str. 11128 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) SE11 │ │ ││├─ Escherichia coli (6-218/224) W │ │ │└┼─ Escherichia coli (6-218/224) W │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) TA271 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 78-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 124-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (6-218/224) MS 107-1 │ │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (6-218/224) IAI1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-218/224) H591 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (15-227/233) E24377A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-218/224) E22 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-218/224) E110019 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-218/224) B185 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (6-218/224) 55989 │ │ ││ └─ fig|1040638.4.peg.4796 O104:H4 (6-218/224) str. LB226692 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (15-227/233) HS │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (6-218/224) HS │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (6-218/224) 1827-70 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (7-218/224) IAI39 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (7-218/224) MS 21-1 │ │ │││ ┌┼─ Escherichia coli (7-218/224) SMS-3-5 │ │ │││┌┤└─ Escherichia coli (7-218/224) IAI39 │ │ ││││└┬─ Escherichia coli (7-218/224) B354 │ │ │└┤│ └┬─ Escherichia coli (7-218/224) MS 69-1 │ │ │ ││ └─ Escherichia coli (7-218/224) TA280 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (16-227/233) O157:H7 EDL933 └─────────────┤ │ ││├─ Escherichia coli (7-218/224) 1044A │ │ ││├─ Escherichia coli (7-218/224) 1212A │ │ ││├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 EDL933 │ ┌──────────────────────────┤ └┤├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4042 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC869 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ │├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (7-218/224) O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. Sakai │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC508 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4401 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) 536A │ │ │ ├─ Escherichia coli (7-218/224) 1125A │ │ │ ├─ Escherichia coli (16-227/233) O157:H7 str. EC4486 │ │ │ └─ Escherichia coli (16-227/233) O157:H7 │ │ └─ Escherichia coli (15-227/233) B088 │ │ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) 1044A │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) 1212A │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. Sakai │ │ ┌┼─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. TW14359 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4501 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4196 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4113 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) O157:H7 EDL933 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) 536A │ │ ┌┤│└─ Escherichia coli (1-224/230) 1125A │ │ ││└─ Escherichia coli (1-224/230) O55:H7 str. CB9615 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) O111:H- str. 11128 │ │ ││┌┴─ Escherichia coli (1-224/230) O26:H11 str. 11368 │ │ │└┤┌─ Escherichia coli (1-224/230) 53638 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-224/230) HS │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-224/230) HS │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-224/230) 53638 │ │ │ └─ Escherichia coli (1-224/230) 1827-70 │ │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) B088 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 119-7 │ │ ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-224/230) TA271 │ │ ││ │└─ Escherichia coli (1-224/230) H591 │ │ ││┌┤┌─ Escherichia coli (1-224/230) E110019 │ │ │││└┼─ Escherichia coli (1-224/230) SE11 │ │ │││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 107-1 │ │ │││ └─ Escherichia coli (1-224/230) E110019 │ │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) EC4100B │ │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (1-224/230) MS 182-1 │ │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-224/230) MS 78-1 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (5-223/229) MS 84-1 └───────┤ │ └┤│┌─ fig|6666666.5357.peg.235 TY-2482 (1-224/230) strain │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) 55989 │ │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) B171 │ ┌┤ └┤├─ Escherichia coli (1-224/230) E22 │ ││ │├─ Escherichia coli (1-224/230) E24377A │ ││ │├─ Escherichia coli (1-224/230) IAI1 │ ││ │├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 124-1 │ ││ │├─ Escherichia coli (1-224/230) W │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-224/230) W │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) O103:H2 str. 12009 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) KO11 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) IAI1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) E24377A │ ┌┤│ ├─ Escherichia coli (1-224/230) E22 │ │││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) B171 │ │││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) 55989 │ │││ └─ fig|1040638.4.peg.5237 O104:H4 (1-224/230) str. LB226692 │ ││└┬─ Escherichia coli (5-223/229) OP50 │ ││ └─ Escherichia coli (5-223/229) 101-1 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) FVEC1302 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 198-1 │ ││┌┼─ Escherichia coli (1-224/230) UMN026 │ │└┤└─ Escherichia coli (1-224/230) FVEC1412 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-224/230) IAI39 │ │ └┬┴─ Escherichia coli (1-224/230) IAI39 │ │ └┬─ Escherichia coli (1-224/230) MS 21-1 │ │ └─ Escherichia coli (28-251/257) SMS-3-5 │ ┌┤┌─ Escherichia coli (1-224/230) 042 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) ATCC 8739 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) B185 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) B7A │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) BL21 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) BW2952 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) H736 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) M718 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 116-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 146-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 196-1 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) TA143 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) W3110 │ ││├─ Escherichia coli (1-224/230) str. K-12 substr. DH10B │ │└┼─ Escherichia coli (1-224/230) str. K-12 substr. MG1655 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (1-224/230) str. K-12 substr. MG1655 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) str. K-12 substr. DH10B │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) TA280 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 69-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 175-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 145-7 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) MS 115-1 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) K12 │ ┌────────────────────────┤│ ├─ Escherichia coli (1-224/230) DH1 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (DE3 1-224/230) BL21(DE3) │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) B7A │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) B354 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) B str. REL606 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (1-224/230) ATCC 8739 │ │ ││ └─ Escherichia coli (1-224/230) 042 │ │ │└─ Escherichia coli (1-224/230) MS 187-1 │ │ └─ Escherichia coli (1-224/230) ETEC H10407 │ │ ┌─ Escherichia coli (18-234/241) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (18-234/241) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (18-234/241) MS 185-1 │ │ ├─ Escherichia coli (18-234/241) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ┌┼─ Escherichia coli (18-234/241) WV_060327 │ │ │├─ Escherichia coli (18-234/241) MS 45-1 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (18-234/241) M605 │ │ ││└─ Escherichia coli (18-234/241) CFT073 │ │ ┌─────────┤└┬─ Escherichia coli (18-234/241) MS 187-1 └──────┤ │ │ └─ Escherichia coli (18-234/241) ETEC H10407 │ │ └┬─ Escherichia coli (18-234/241) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (18-234/241) E2348/69 │ │ ┌─ Escherichia coli (12-232/239) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4042 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4076 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC508 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. TW14588 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-229/236) O55:H7 str. CB9615 │ │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. TW14359 └────────┤ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. FRIK966 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4401 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) 1212A │ │└─ Escherichia coli (9-229/236) 1044A │ │ ┌─ Escherichia coli (12-232/239) APEC O1 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) ABU 83972 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) CFT073 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) IHE3034 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O83:H1 str. NRG 857C │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) UM146 │ │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) UTI89 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (9-229/236) WV_060327 └───────────┤ │├─ Escherichia coli (9-229/236) UTI89 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) TA206 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 45-1 │ ┌┤├─ Escherichia coli (9-229/236) CFT073 │ ││├─ Escherichia coli (9-229/236) APEC O1 │ ││└─ Escherichia coli (9-229/236) 83972 │ │└┬─ Escherichia coli (9-229/236) NC101 │ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (9-229/236) SE15 │ ││ └─ Escherichia coli (9-229/236) M605 │ ││┌─ Escherichia coli (9-229/236) F11 │┌┤└┼─ Escherichia coli (9-229/236) MS 200-1 │││ └─ Escherichia coli (12-232/239) F11 │││┌─ Escherichia coli (7-229/236) MS 69-1 ││└┤┌─ Escherichia coli (9-229/236) FVEC1302 ││ │├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 198-1 ││ └┼─ Escherichia coli (9-229/236) UMN026 ││ ├─ Escherichia coli (9-229/236) TA143 ││ ├─ Escherichia coli (9-229/236) FVEC1412 ││ └─ Escherichia coli (9-229/236) SMS-3-5 ││ ┌─ Escherichia coli (12-232/239) 042 ││ ├─ Escherichia coli (12-232/239) E22 ││ ├─ Escherichia coli (9-229/236) TA280 └┤ ├─ Escherichia coli (9-229/236) 2362-75 │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) B7A │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) EC4100B │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 145-7 │ ├─ Escherichia coli (9-229/236) O103:H2 str. 12009 │ ┌┼─ Escherichia coli (9-229/236) O127:H6 str. E2348/69 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 78-1 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) H299 │ │├─ Escherichia coli (9-229/236) E22 │┌┤├─ Escherichia coli (9-229/236) B354 │││├─ Escherichia coli (9-229/236) 042 │││├─ Escherichia coli (12-232/239) E2348/69 │││└─ Escherichia coli (12-232/239) B7A └┤└─ Escherichia coli (9-229/236) B185 │┌─ Escherichia coli (9-229/236) M718 ││ ┌─ Escherichia coli (9-229/236) MS 115-1 ││┌┴─ Escherichia coli (9-229/236) TA271 └┤│┌─ fig|1040638.4.peg.4257 O104:H4 (9-229/236) str. LB226692 ││├─ Escherichia coli (9-229/236) 101-1 ││├─ Escherichia coli (9-229/236) 55989 ││├─ Escherichia coli (9-229/236) B088 └┤├─ Escherichia coli (9-229/236) H591 │├─ Escherichia coli (9-229/236) IAI1 │├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 107-1 │├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 124-1 │├─ Escherichia coli (9-229/236) O111:H- str. 11128 │├─ Escherichia coli (9-229/236) SE11 └┼─ Escherichia coli (9-229/236) W ├─ Escherichia coli (9-229/236) W ├─ Escherichia coli (9-229/236) O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 84-1 ├─ Escherichia coli (9-229/236) MS 119-7 ├─ Escherichia coli (9-229/236) KO11 ├─ Escherichia coli (9-229/236) IAI1 ├─ Escherichia coli (9-229/236) E110019 ├─ Escherichia coli (9-229/236) 55989 ├─ Escherichia coli (9-229/236) 1827-70 ├─ fig|6666666.5357.peg.1601 TY-2482 (9-229/236) strain └─ Escherichia coli (12-232/239) E110019
| Periplasmic fimbrial chaperone StfD | (125) |
| chaperone FimC | (123) |
| Putative chaperone | (116) |
| Fimbrial periplasmic chaperone SfmC | (102) |
| Hypothetical fimbrial chaperone yqiH | (38) |
| PapD protein | (24) |
| Hypothetical fimbrial chaperone YfcS precusor | (14) |
| Chaperone protein fimC precursor | (3) |
| Chaperone | (1) |
| COG3121: P pilus assembly protein, chaperone PapD | (1) |
| Putative chaperone protein | (1) |
| pili assembly chaperone | (1) |
| Periplasmic fimbrial chaperone | (1) |
| chaperone protein PapD | (1) |
| putative chaperone | (1) |
| Others | (10) |