┌───────────────────────────── Escherichia coli (1-137/138) 101-1   
│                                                                 ┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 (11)  
│                                                              ┌──┴─ Escherichia coli 1044A (22)  
│                                                          ┌───┴─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009   
│                          ┌───────────────────────────────┴─ fig|1040638.4.peg.329 O104:H4 str. LB226692 (1)  
│        ┌─────────────────┴───────────┬─ Escherichia coli (6-135/135) 53638 (1)  
│        │                             └──┬── Escherichia coli (1-126/131) ED1a (1)  
┤ ┌──────┤                                └─┬─ Escherichia coli (1-129/130) O103:H2 str. 12009 (1)  
│ │      │                                  └─ Escherichia coli (6-134/135) 042 (9)  
│ │      └─┬──────────────── Escherichia coli (1-134/139) 53638   
│ │        └──────┬──────────── Escherichia coli (1-134/143) ED1a (1)  
│ │               └── Escherichia coli (1-139/140) 042 (1)  
│ │              ┌── Escherichia coli (1-136/143) MS 124-1 (1)  
│ │             ┌┴── Escherichia coli SE11   
│ │        ┌────┴─ Escherichia coli 1044A (6)  
└─┤       ┌┴─── Escherichia coli MS 69-1   
  │      ┌┴┬─ Escherichia coli (1-137/140) M605   
  │      │ └──── Escherichia coli (1-137/140) 1212A (1)  
  │      │   ┌─ Escherichia coli E22 (1)  
  │      │  ┌┴─── Escherichia coli B171 (1)  
  │      │ ┌┴─ Escherichia coli E22   
  │      │┌┴── Escherichia coli (1-135/136) B088   
  │      ││        ┌── Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7 (1)  
  └──────┤│       ┌┴───── Escherichia coli (1-136/140) B7A (1)  
         ││     ┌─┴─── Escherichia coli (1-136/140) ED1a (1)  
         ││    ┌┴─ Escherichia coli (1-136/141) 55989 (1)  
         ││  ┌─┴─┬─ Escherichia coli MS 124-1 (1)  
         ││  │   └┬─ Escherichia coli (6-141/143) APEC O1   
         ││ ┌┤    └─ Escherichia coli (6-141/143) 042 (1)  
         ││┌┤└── Escherichia coli (1-136/140) W (1)  
         └┤│└┬─────── Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7   
          ││ └─── Escherichia coli (1-136/140) TA143   
          ││           ┌─ Escherichia coli (1-136/140) APEC O1 (1)  
          ││          ┌┴─ Escherichia coli (1-136/140) IHE3034 (3)  
          ││         ┌┴─ Escherichia coli (1-136/140) 101-1   
          ││        ┌┴─ Escherichia coli MS 69-1   
          ││       ┌┴─ Escherichia coli (1-134/140) B171 (1)  
          ││     ┌─┴─ Escherichia coli (1-134/140) 55989 (2)  
          ││    ┌┴─ Escherichia coli (1-139/140) B7A (1)  
          ││   ┌┴┬── Escherichia coli (1-139/140) O111:H- str. 11128   
          └┤   │ └┬─ Escherichia coli (1-139/140) E22 (1)  
           │  ┌┤  └─ Escherichia coli (1-139/140) 2362-75 (2)  
           │ ┌┤└─── Escherichia coli (1-139/140) SE11   
           │ │└┬─ fig|1040638.4.peg.4661 O104:H4 (1-137/140) str. LB226692   
           │ │ └── Escherichia coli (1-137/140) 55989 (1)  
           │┌┤    ┌─ Escherichia coli (1-139/140) O111:H- str. 11128   
           │││  ┌─┴─ Escherichia coli (1-139/140) E110019 (1)  
           │││┌─┴──── Escherichia coli (1-139/140) O26:H11 str. 11368   
           ││└┤    ┌───── Escherichia coli (6-142/142) O157:H7 str. EC4486 (24)  
           ││ └─┬──┴───────── Escherichia coli (1-139/140) MS 182-1   
           ││   └──┬─ Escherichia coli (1-134/135) TA280  [2] 
           └┤      └┬──────── Escherichia coli (1-133/134) E22 (1)  
            │       └─ Escherichia coli (1-134/135) APEC O1   
            │┌── Escherichia coli (1-139/140) E24377A (1)  
            ││    ┌─ Escherichia coli EC4100B   
            ││   ┌┴─ Escherichia coli FVEC1302 (4)  
            ││  ┌┴┬── Escherichia coli (1-136/140) O83:H1 str. NRG 857C   
            └┤┌─┤ └─── Escherichia coli (1-136/140) H591 (3)  
             ││ └┬── Escherichia coli (1-121/139) 1827-70 (3)  
             ││  └─ Escherichia coli B str. REL606 (2)  
             ││     ┌─ Escherichia coli (1-133/135) O55:H7 str. CB9615   
             └┤ ┌───┴── Escherichia coli (1-136/141) E110019 (1)  
              │┌┴─── Escherichia coli (6-144/145) B088   
              ││    ┌─ Escherichia coli (1-136/141) MS 196-1   
              ││   ┌┴─ Escherichia coli (1-136/141) MS 124-1   
              └┤  ┌┴─ Escherichia coli (1-136/141) MS 145-7   
               │ ┌┴┬─ Escherichia coli (1-136/141) H299   
               │┌┤ └─ fig|6666666.5357.peg.955 TY-2482 (1-136/141) strain   
               ││└─── Escherichia coli (1-136/141) IHE3034   
               └┤   ┌─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615   
                │ ┌─┴─ Escherichia coli WV_060327   
                └┬┴─ Escherichia coli (18-140/140) M718   
                 └┬── Escherichia coli ETEC H10407 (3)  
                  └┬─ Escherichia coli CFT073 (1)  
                   └──┬─ Escherichia coli (1-137/140) TA271   
                      └─ Escherichia coli (1-137/140) 042 (11)  
  
LygF (67)
Phage LygF, possible repressor (5)
Phage or Prophage Related (1)
Others (3)