┌───────────────────────────── Escherichia coli (1-137/138) 101-1 │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ ├─ Escherichia coli 1212A │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ ┌──┤├─ Escherichia coli O157:H7 │ │ │├─ Escherichia coli 536A │ │ │└─ Escherichia coli 1125A │ │ │┌─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 │ ┌───┤ └┼─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 ┤ ┌───────────────────────────────┤ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ │ │ │ └─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 │ │ │ └─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ └┬─ fig|6666666.5357.peg.2983 TY-2482 strain │ ┌─────────────────┤ └─ fig|1040638.4.peg.329 O104:H4 str. LB226692 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (6-135/135) 53638 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli 53638 │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-126/131) ED1a │ │ └───────────┤ ┌─┴─ Escherichia coli (1-126/131) ED1a │ │ │ │ ┌─ Escherichia coli (1-129/130) O103:H2 str. 12009 │ │ └──┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-129/130) O26:H11 str. 11368 │ │ │ │┌─ Escherichia coli (1-129/130) 042 │ │ └─┤├─ Escherichia coli (1-129/130) ABU 83972 │ ┌──────┤ │├─ Escherichia coli (1-129/130) FVEC1412 │ │ │ │├─ Escherichia coli (1-129/130) MS 69-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (1-129/130) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-129/130) SMS-3-5 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-129/130) MS 198-1 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-129/130) FVEC1302 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-129/130) 83972 │ │ │ └─ Escherichia coli (6-134/135) 042 │ │ │ ┌──────────────── Escherichia coli (1-134/139) 53638 │ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (1-134/143) ED1a │ │ └──────┬───────────┴─ Escherichia coli (1-134/143) ED1a │ │ └─┬─ Escherichia coli (1-139/140) 042 │ │ └─ Escherichia coli (1-139/140) 042 │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 │ │ ┌┼─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ │ ┌────┤├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 └─┤ │ │└─ Escherichia coli O157:H7 │ │ └┬── Escherichia coli SE11 │ ┌┤ └─┬─ Escherichia coli (1-136/143) MS 84-1 │ ││ └─ Escherichia coli (1-136/143) MS 124-1 │ ┌┤└─── Escherichia coli MS 69-1 │ │└┬─ Escherichia coli (1-137/140) M605 │ │ └───┬─ Escherichia coli (1-137/140) 536A │ │ └─ Escherichia coli (1-137/140) 1212A │ │ ┌─ Escherichia coli E22 │ │ ┌┴─ Escherichia coli E22 │ │ ┌┴──┬─ Escherichia coli B171 │ │ ┌┤ └─ Escherichia coli B171 │ │┌┤└─ Escherichia coli E22 │ ││└── Escherichia coli (1-135/136) B088 │ ││ ┌─ Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7 │ ││ ┌─┴─ Escherichia coli (1-136/140) TA271 │ ││ ┌┴────┬─ Escherichia coli (1-136/140) B7A │ ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-136/140) B7A │ ││ │ └──┬─ Escherichia coli (1-136/140) ED1a └──────┤│ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-136/140) ED1a ││ │└┬─ Escherichia coli (1-136/141) 55989 ││ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-136/141) 55989 ││ │ │ ┌─ Escherichia coli MS 124-1 ││ │ └─┬┴─ Escherichia coli MS 84-1 ││ ┌┤ └┬─ Escherichia coli (6-141/143) APEC O1 ││ ││ └┬─ Escherichia coli (1-136/138) 042 ││ ││ └─ Escherichia coli (6-141/143) 042 ││┌┤└─┬─ Escherichia coli (1-136/140) W ││││ └─ Escherichia coli (1-136/140) W │││└┬─────── Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7 │││ └─── Escherichia coli (1-136/140) TA143 │││ ┌─ Escherichia coli (1-137/140) 042 │││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) ATCC 8739 │││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) IAI1 │││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) IAI39 └┤│ ├─ Escherichia coli (1-137/140) KO11 ││ ├─ Escherichia coli (1-137/140) W ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-137/140) W ││ │├─ Escherichia coli (1-137/140) MS 21-1 ││ │├─ Escherichia coli (1-137/140) IAI39 ││ ┌──┤├─ Escherichia coli (1-137/140) IAI1 ││ │ │├─ Escherichia coli (1-137/140) ATCC 8739 ││ ┌┤ │└─ Escherichia coli (1-137/140) 042 ││ ││ └─ Escherichia coli (1-137/140) TA271 ││ │└┬─ Escherichia coli CFT073 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli CFT073 ││ ││ ┌─ Escherichia coli MS 116-1 ││ │└─┼─ Escherichia coli MS 45-1 ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli MS 175-1 ││ ││ └─ Escherichia coli ETEC H10407 ││ │└┬─ Escherichia coli (18-140/140) M718 ││ ┌┤ └─┬─ Escherichia coli WV_060327 ││ ││ └─ Escherichia coli O55:H7 str. CB9615 ││ ││┌─── Escherichia coli (1-136/141) IHE3034 ││ │└┤ ┌─ fig|6666666.5357.peg.955 TY-2482 (1-136/141) strain ││ ┌┤ └┬┴─ Escherichia coli (1-136/141) H299 ││ ││ └┬─ Escherichia coli (1-136/141) MS 145-7 ││ ││ └┬─ Escherichia coli (1-136/141) MS 124-1 └┤ ││ └─ Escherichia coli (1-136/141) MS 196-1 │ │└┬─── Escherichia coli (6-144/145) B088 │ │ └───┬─ Escherichia coli (1-133/135) O55:H7 str. CB9615 │ │ └─┬─ Escherichia coli (1-136/141) E110019 │ │ └─ Escherichia coli (1-136/141) E110019 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (1-121/139) 1827-70 │ ││ ├─ Escherichia coli (1-121/139) O26:H11 str. 11368 │ ││ ┌─┼─ Escherichia coli (1-121/139) MS 78-1 │ ││ │ └─ Escherichia coli (1-121/139) M718 │ ││ ┌┤┌─ Escherichia coli OP50 │ ││ │└┼─ Escherichia coli TA280 │ ││ │ └─ Escherichia coli B str. REL606 │ │└─┤ ┌─ Escherichia coli (1-136/140) H591 │ │ │ ├─ Escherichia coli (1-136/140) MS 107-1 │┌┤ │ ┌──┼─ Escherichia coli (1-136/140) MS 119-7 │││ │┌┤ └─ Escherichia coli (1-136/140) M718 │││ └┤└── Escherichia coli (1-136/140) O83:H1 str. NRG 857C │││ │┌─ Escherichia coli EC4100B │││ └┤┌─ Escherichia coli FVEC1412 │││ │├─ Escherichia coli MS 198-1 │││ └┼─ Escherichia coli UMN026 │││ ├─ Escherichia coli H299 │││ └─ Escherichia coli FVEC1302 ││└─┬─ Escherichia coli (1-139/140) E24377A ││ └─ Escherichia coli (1-139/140) E24377A ││ ┌─ Escherichia coli (1-136/140) IHE3034 ││ ├─ Escherichia coli (1-136/140) UTI89 ││ ┌┼─ Escherichia coli (1-136/140) UTI89 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-136/140) UM146 ││ │└┬─ Escherichia coli (1-136/140) S88 ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-136/140) APEC O1 ││ ┌┤└─ Escherichia coli (1-136/140) 101-1 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli MS 69-1 │ │└┬─ Escherichia coli (1-134/140) MS 107-1 │ ┌─┤ └─ Escherichia coli (1-134/140) B171 │ │ │┌─ Escherichia coli (1-134/140) 55989 │ ┌┤ └┼─ Escherichia coli (1-134/140) MS 145-7 │ ││ └─ Escherichia coli (1-134/140) 55989 │ │└┬─ Escherichia coli (1-139/140) B7A │ ┌┤ └─ Escherichia coli (1-139/140) B7A │ ││┌── Escherichia coli (1-139/140) O111:H- str. 11128 │ │└┤ ┌─ Escherichia coli (1-139/140) E22 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (1-139/140) E22 │ ┌┤ └┤┌─ Escherichia coli (1-139/140) E2348/69 │ ││ └┼─ Escherichia coli (1-139/140) O127:H6 str. E2348/69 │┌┤│ └─ Escherichia coli (1-139/140) 2362-75 │││└─── Escherichia coli (1-139/140) SE11 ││└┬─ fig|1040638.4.peg.4661 O104:H4 (1-137/140) str. LB226692 ││ └─┬─ Escherichia coli (1-137/140) 55989 ││ └─ Escherichia coli (1-137/140) 55989 ││ ┌─ Escherichia coli (1-139/140) E110019 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (1-139/140) E110019 │ ┌─┴─ Escherichia coli (1-139/140) O111:H- str. 11128 │┌─┴──── Escherichia coli (1-139/140) O26:H11 str. 11368 ││ ┌─ Escherichia coli (1-133/134) E22 ││ ┌───────┴─ Escherichia coli (1-133/134) E22 ││ ┌┴─ Escherichia coli (1-134/135) APEC O1 └┤ ┌──┴┬── Escherichia coli (1-134/135) TA280 │ │ └─ Escherichia coli (1-134/135) TA280 │ │ ┌───────── Escherichia coli (1-139/140) MS 182-1 │ │ │ ┌─ Escherichia coli 1044A └─┤ │ ├─ Escherichia coli 1212A │ │ ├─ Escherichia coli O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4024 └──┤ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4045 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4113 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4196 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. Sakai │ ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14588 └────┼─ Escherichia coli O26:H11 str. 11368 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4501 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli O157:H7 ├─ Escherichia coli 536A ├─ Escherichia coli 1125A └─ Escherichia coli (6-142/142) O157:H7 str. EC4486
| LygF | (192) |
| Phage LygF, possible repressor | (9) |
| Phage or Prophage Related | (1) |
| Putative exclusion protein ren of cryptic prophage CP-933P | (1) |
| hypothetical protein | (1) |
| Others | (5) |