┌─ Escherichia coli (85-122/124) O157:H7 str. EC508 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4024 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4113 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. TW14359 ├─ fig|6666666.5357.peg.3407 TY-2482 (78-115/117) strain ├─ Escherichia coli (99-136/138) O157:H7 str. EC4501 ┌────────────────────────────────────────────────────────┼─ Escherichia coli (81-118/120) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (99-136/138) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (90-127/129) O103:H2 str. 12009 │ ├─ fig|1040638.4.peg.408 O104:H4 (78-115/117) str. LB226692 │ ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4486 │ ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (86-123/125) O157:H7 str. EC4042 │ └─ Escherichia coli (86-123/125) 1125A │ ┌─ Escherichia coli (170-222/222) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O103:H2 str. 12009 │ ├─ Escherichia coli (132-184/184) 1212A │ ├─ Escherichia coli (132-184/184) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) 1125A │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. TW14588 │ ├─ Escherichia coli (118-170/170) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (118-170/170) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) 55989 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) MS 196-1 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) 1125A │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) 536A │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 EDL933 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4206 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4501 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC869 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. TW14359 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) ED1a │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O26:H11 str. 11368 │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) MS 21-1 │ ┌┼─ Escherichia coli (16-68/68) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) MS 145-7 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) ED1a │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. Sakai │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC508 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4486 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4196 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4113 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4045 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 EDL933 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) O103:H2 str. 12009 │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) 1212A │ │├─ Escherichia coli (204-256/256) 1044A │ ┌┤├─ Escherichia coli (204-256/256) 55989 │ ││├─ Escherichia coli (187-239/239) O157:H7 str. EC4401 │ ││├─ Escherichia coli (118-170/170) O157:H7 str. EC869 │ ││├─ Escherichia coli (118-170/170) O157:H7 str. EC4401 │ ││├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. Sakai │ ││├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4196 │ ││├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 str. EC4045 ┤ ││├─ Escherichia coli (119-171/171) O157:H7 EDL933 │ ││├─ Escherichia coli (132-184/184) O157:H7 str. EC4486 │ ┌┤│├─ Escherichia coli (132-184/184) 536A │ │││├─ Escherichia coli (132-184/184) 1044A │ │││└─ Escherichia coli (170-222/222) O157:H7 EDL933 │ │││ ┌─ Escherichia coli (117-169/169) E110019 │ │││┌┴─ Escherichia coli (86-138/138) E110019 │ ││└┤┌─ Escherichia coli (204-256/256) ABU 83972 │ ┌─┤│ └┼─ Escherichia coli (210-262/262) 042 │ │ ││ ├─ Escherichia coli (204-256/256) 042 │ │ ││ └─ Escherichia coli (204-256/256) 83972 │ │ │└─ Escherichia coli (204-256/256) SMS-3-5 │ │ │┌─ Escherichia coli (204-256/256) FVEC1412 │ ┌──┤ │├─ Escherichia coli (204-256/256) MS 69-1 │ │ │ └┼─ Escherichia coli (204-256/256) UMN026 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) MS 198-1 │ ┌─────┤ │ └─ Escherichia coli (204-256/256) FVEC1302 │ │ │ └────────┬─ Escherichia coli (204-247/256) ED1a │ │ │ └─ Escherichia coli (204-247/256) ED1a │ │ └─ Escherichia coli (204-256/256) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (204-245/253) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (204-245/253) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4113 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4196 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (195-236/244) O157:H7 │ │ ├─ Escherichia coli (189-230/238) O111:H- str. 11128 │ │ ├─ Escherichia coli (111-152/160) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (16-57/65) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (16-57/65) O157:H7 str. EC4024 │ │ │├─ Escherichia coli (111-152/160) O157:H7 EDL933 │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O103:H2 str. 12009 │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. Sakai │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC508 │ │ ┌───────┤├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4042 │ │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (189-230/238) 1212A │ │ ││ │├─ Escherichia coli (189-230/238) 1044A │ │ ││ │└─ Escherichia coli (141-182/190) O157:H7 str. EC4486 │ │ ││ └── Escherichia coli (129-170/178) O111:H- str. 11128 │ │ │└─ Escherichia coli (189-241/241) O26:H11 str. 11368 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (140-192/192) 53638 │ │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (118-170/170) 53638 │ │ ┌──┤ │ ┌─ Escherichia coli (185-226/232) E110019 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) 1044A │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) 1212A │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ └──┤ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4196 │ │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4401 └────────────────────────────────────────┤ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC869 │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. TW14359 │ │ └───────────┼─ Escherichia coli (207-248/254) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC508 │ ┌┤ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4486 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 str. EC4042 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O157:H7 EDL933 │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) 536A │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) 1125A │ ││ ├─ Escherichia coli (185-226/232) O26:H11 str. 11368 │ ││ └─ Escherichia coli (185-226/232) E110019 │ ││┌─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4042 │ ││├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4113 │ ││├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4115 │ ┌───┤│├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC508 │ │ ││├─ Escherichia coli (200-252/252) O157:H7 str. EC4196 │ │ ││├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. TW14588 │ │ ││├─ Escherichia coli (189-241/241) ED1a │ │ │└┼─ Escherichia coli (189-241/241) ED1a │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O103:H2 str. 12009 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4501 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. TW14359 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4206 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4115 │ │ │ ├─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4045 │ │ │ └─ Escherichia coli (204-256/256) O157:H7 str. EC4024 │ │ └─────┬─ fig|1040638.4.peg.328 O104:H4 str. LB226692 │ │ └── fig|6666666.5357.peg.2984 TY-2482 (204-256/256) strain │ │ ┌─ Escherichia coli (201-248/248) WV_060327 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) 1125A │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 EDL933 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4045 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4115 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (197-244/244) O111:H- str. 11128 └───┤ ┌─┼─ Escherichia coli (2-49/49) O26:H11 str. 11368 │ │ ├─ Escherichia coli (197-244/244) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. TW14359 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. FRIK966 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC869 │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4401 │ ┌──────────┤ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4076 │ │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 str. EC4024 │ │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) O157:H7 EDL933 │ │ │ ├─ Escherichia coli (146-193/193) 1212A │┌───┤ │ └─ Escherichia coli (146-193/193) 1044A ││ │ │ ┌─ Escherichia coli (20-67/67) E22 ││ │ └─┼─ Escherichia coli (20-67/67) E22 ││ │ └─ Escherichia coli (201-248/248) O103:H2 str. 12009 ││ └───┬─ Escherichia coli (16-57/66) B185 ││ └┬─ Escherichia coli (2-36/45) B185 ││ └─ Escherichia coli (2-36/45) B185 ││ ┌─ Escherichia coli (201-253/253) 1044A ││ ├─ Escherichia coli (201-253/253) O157:H7 str. EC4501 ││ ├─ Escherichia coli (201-253/253) O157:H7 str. TW14588 ││ ┌┼─ Escherichia coli (218-270/270) O157:H7 EDL933 ││ │├─ Escherichia coli (218-270/270) O157:H7 ││ ┌┤├─ Escherichia coli (201-253/253) O157:H7 str. Sakai ││ ││└─ Escherichia coli (201-253/253) O157:H7 EDL933 ││ ┌┤└─────┬─ Escherichia coli (201-253/253) E24377A └┤ ││ └─ Escherichia coli (201-253/253) E24377A │ ┌┤└┬─ Escherichia coli (201-253/253) MS 84-1 │ ││ └─ Escherichia coli (201-253/253) MS 124-1 │ │└┬─── Escherichia coli (201-253/253) M605 │ ┌┤ └┬─── Escherichia coli (201-253/253) B088 │ ││ └┬─ Escherichia coli (201-253/253) O26:H11 str. 11368 │┌┤│ └─ Escherichia coli (201-253/253) 101-1 │││└────── Escherichia coli (189-241/241) MS 182-1 ││└─ Escherichia coli (201-253/253) TA280 ││ ┌─ Escherichia coli (201-253/253) 042 ││ ├─ Escherichia coli (201-253/253) E22 ││ ├─ Escherichia coli (218-270/270) APEC O1 ││ ┌┼─ Escherichia coli (218-270/270) E22 ││ │├─ Escherichia coli (218-270/270) 042 ││ ┌──┤└─ Escherichia coli (201-253/253) APEC O1 └┤ │ └┬─ Escherichia coli (218-270/270) SE11 │ │ └─ Escherichia coli (201-253/253) MS 69-1 │ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (201-253/253) 1212A │ ││┌──┴─ Escherichia coli (201-253/253) 536A │ │└┤┌─ Escherichia coli (201-253/253) W │┌────┤ └┼─ Escherichia coli (218-270/270) M718 ││ │ ├─ Escherichia coli (201-253/253) W ││ │ └─ Escherichia coli (201-253/253) KO11 ││ └┬─── Escherichia coli (201-253/253) TA143 └┤ └──┬─ Escherichia coli (201-253/253) 53638 │ └─ Escherichia coli (201-253/253) 53638 │┌─ Escherichia coli (204-256/256) TA280 ││ ┌── Escherichia coli (204-245/253) 101-1 └┤ │ ┌──── Escherichia coli (204-245/252) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │┌─ Escherichia coli (189-230/238) 1044A └────┤ │├─ Escherichia coli (189-230/238) 1212A │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4024 │ │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4045 └────┤├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4113 │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4196 │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4401 │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4501 │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. FRIK2000 │├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. Sakai └┼─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. TW14588 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. FRIK966 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC869 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4486 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4115 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 EDL933 ├─ Escherichia coli (189-230/238) 536A ├─ Escherichia coli (189-230/238) 1125A └─ Escherichia coli (189-230/238) O157:H7 EDL933
| hypothetical protein | (243) |
| Phage protein | (3) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933U | (1) |
| Uncharacterized protein ydaW | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933O | (1) |
| unknown protein encoded by cryptic prophage CP-933M | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933N | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933O | (1) |
| Others | (4) |