┌─ Escherichia coli (174-648/648) 1125A ├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4042 ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4045 ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4206 ├─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. TW14359 ┌┼─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. TW14359 │├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4486 │├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4206 ┌┤├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4076 ││├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4045 ││├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4042 ┌┤│└─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4024 ││└┬─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4115 ││ └─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4196 ┌┤└┬─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4115 ││ └─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4024 ┌┤└─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4115 ││┌─ Escherichia coli (171-645/645) 1212A │└┼─ Escherichia coli (174-648/648) 536A ┌┤ └─ Escherichia coli (174-648/648) 1212A ││┌─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4501 │└┤┌─ Escherichia coli (171-645/645) O111:H- str. 11128 │ └┤┌─ Escherichia coli (174-648/648) O111:H- str. 11128 │ ││┌─ Escherichia coli (174-648/648) 1044A │ └┤├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 ┌┤ │├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 EDL933 ││ └┼─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. TW14588 ││ ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 EDL933 ┌┤│ ├─ Escherichia coli (174-648/648) 536A │││ └─ Escherichia coli (174-648/648) 1044A ││└┬─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. FRIK2000 ┌┤│ └─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC869 ││└─ Escherichia coli (174-648/648) O103:H2 str. 12009 ┌┤└┬─ Escherichia coli (174-648/648) 536A ││ └─ Escherichia coli (174-648/648) 1212A │└┬─ Escherichia coli (171-645/645) O111:H- str. 11128 │ └─ Escherichia coli (171-645/645) O103:H2 str. 12009 │ ┌─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4501 │ ┌┴─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. TW14588 ┌┤ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.327 O104:H4 str. LB226692 ││┌┴─ Escherichia coli (74-548/548) O103:H2 str. 12009 │││ ┌─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4024 │││ ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4045 │││ ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4113 │└┤ ├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4196 │ │┌┼─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. TW14359 │ ││├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4115 │ ││├─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4076 │ └┤└─ Escherichia coli (174-648/648) O157:H7 str. EC4042 │ │┌─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4024 │ ││ ┌─ Escherichia coli (174-648/648) E22 │ └┤┌┴─ Escherichia coli (174-648/648) E22 │ ││ ┌─ Escherichia coli (174-648/648) O55:H7 str. CB9615 ┌┤ ││ ┌┴─ Escherichia coli (74-548/548) O111:H- str. 11128 ││ └┤┌┴─ Escherichia coli (171-645/645) EC4100B ││ ││┌─ Escherichia coli (74-548/548) O157:H7 EDL933 ││ ││├─ Escherichia coli (74-548/548) O157:H7 str. EC4045 ││ └┤├─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4113 ││ │├─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4196 ││ │├─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 str. EC4486 ││ └┼─ Escherichia coli (74-548/548) O157:H7 str. TW14359 ┌───────┤│ ├─ Escherichia coli (74-548/548) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC4076 │ ││ ├─ Escherichia coli (74-548/548) O157:H7 str. EC4042 │ ││ └─ Escherichia coli (171-645/645) O157:H7 EDL933 │ │└┬─ Escherichia coli (171-645/645) O26:H11 str. 11368 ┌──────┤ │ └─ Escherichia coli (171-645/645) O26:H11 str. 11368 │ │ └┬─ Escherichia coli (92-566/566) O157:H7 str. EC508 │ │ └─ Escherichia coli (171-645/645) 1125A │ │ ┌─ Escherichia coli (142-611/614) 536A │ │ ├─ Escherichia coli (142-611/614) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (142-611/614) O157:H7 str. FRIK966 │ └──────────┼─ Escherichia coli (142-611/614) O157:H7 str. TW14588 ┌────────┤ ├─ Escherichia coli (142-611/614) O157:H7 str. Sakai │ │ ├─ Escherichia coli (142-611/614) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ ├─ Escherichia coli (207-676/679) O157:H7 │ │ └─ Escherichia coli (142-611/614) 1044A │ │ ┌────────────── Escherichia coli (174-646/646) B088 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (171-644/645) O157:H7 str. EC869 │ └─────┤ ┌┼─ Escherichia coli (128-601/602) O157:H7 str. FRIK966 │ │ │└─ Escherichia coli (119-592/593) O157:H7 str. FRIK2000 │ │ │┌─ Escherichia coli (171-644/645) 1125A │ └────┤├─ Escherichia coli (171-644/645) 536A │ │├─ Escherichia coli (171-644/645) E22 │ │├─ Escherichia coli (171-644/645) O157:H7 ┌──────────────┤ │├─ Escherichia coli (171-644/645) O157:H7 str. Sakai │ │ └┼─ Escherichia coli (171-644/645) O55:H7 str. CB9615 │ │ ├─ Escherichia coli (171-644/645) O157:H7 str. TW14588 │ │ ├─ Escherichia coli (171-644/645) O157:H7 str. EC4501 │ │ ├─ Escherichia coli (171-644/645) O103:H2 str. 12009 │ │ ├─ Escherichia coli (171-644/645) E22 │ │ ├─ Escherichia coli (171-644/645) 1212A │ │ └─ Escherichia coli (171-644/645) 1044A │ │ ┌─ Escherichia coli (135-634/634) ED1a │ │ ┌───────────────────────────┴─ Escherichia coli (135-634/634) ED1a │ │ │ ┌─ Escherichia coli (169-653/653) 83972 │ │ │ ┌┴─ Escherichia coli (169-653/653) ABU 83972 ┌┤ └────┤ ┌┴─ Escherichia coli (169-653/653) EC4100B ││ │ ┌───────────────┴─ Escherichia coli (169-653/653) S88 ││ │ ┌────┴────────────────────────────┬─ Escherichia coli (169-657/657) ED1a ││ │ │ └─ Escherichia coli (169-657/657) ED1a ││ └───────────┤ ┌─ Escherichia coli (171-662/662) ED1a ││ │ ┌┴─ Escherichia coli (171-662/662) ED1a ││ └─────────────────┤ ┌─ Escherichia coli (171-662/662) ED1a ││ │ ┌─┴─ Escherichia coli (171-662/662) ED1a ││ └───────┤ ┌─ Escherichia coli (171-660/660) ED1a ││ └────────┬┴─ Escherichia coli (171-660/660) ED1a ┤│ └┬─ Escherichia coli (171-660/660) ED1a ││ └─ Escherichia coli (171-660/660) ED1a │└──────────────────────────────── Escherichia coli (168-644/736) TA280 │ ┌──────── Escherichia coli (157-609/613) O55:H7 str. CB9615 │ │ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) 042 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/617) 042 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (122-577/582) MS 145-7 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/617) MS 21-1 │ │ ┌┴┬─ Escherichia coli (157-612/617) MS 196-1 │ │ │ └┬─ Escherichia coli (160-615/620) B171 └──────────────────────┤ ┌┤ └─ Escherichia coli (160-615/620) B171 │ │└┬─ Escherichia coli (160-615/620) 55989 │ │ └─ Escherichia coli (160-615/620) 55989 │ ┌──┤ ┌─ Escherichia coli (157-613/618) 55989 │ │ │┌─┴─ Escherichia coli (157-613/618) 55989 │ │ └┤ ┌─ Escherichia coli (162-617/621) E2348/69 │ │ └─┼─ Escherichia coli (157-612/616) O127:H6 str. E2348/69 │ │ └─ Escherichia coli (157-612/616) 2362-75 └───────┤ ┌──── Escherichia coli (166-625/625) O26:H11 str. 11368 │ │ ┌─ Escherichia coli (92-549/552) 55989 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (119-576/579) 55989 │ │ ┌┴─ fig|1040638.4.peg.52 O104:H4 (157-617/617) str. LB226692 │ │ ┌──┴─ Escherichia coli (166-625/625) MS 198-1 └──┤ │ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 │ │ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 │ │ │ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 │ │ │┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) EC4100B │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (54-509/513) O26:H11 str. 11368 └─┤ ││ ┌┴┬─ Escherichia coli (157-612/616) O127:H6 str. E2348/69 │ ││ ┌┤ └─ Escherichia coli (157-612/616) E2348/69 │ ││ │└─ Escherichia coli (157-612/616) O111:H- str. 11128 │ ││ ┌┤┌─ Escherichia coli (157-612/616) B171 │ ││ │└┼─ Escherichia coli (157-612/616) E22 │ ││ ┌┤ ├─ Escherichia coli (157-612/616) E22 │ ││ ││ └─ Escherichia coli (157-612/616) B171 └──┤│ ┌┤└─ Escherichia coli (157-612/616) O103:H2 str. 12009 ││ │└─ Escherichia coli (157-612/616) O55:H7 str. CB9615 ││ ┌┤ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) B171 ││ ││ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/617) B171 ││ │└─┤ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) 2362-75 ││ │ └─┤ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) E2348/69 ││ │ └─┼─ Escherichia coli (157-612/617) O127:H6 str. E2348/69 ││ │ └─ Escherichia coli (157-612/617) 2362-75 ││ │ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) 1044A ││ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) 1212A ││ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4042 ││ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4076 ││ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4115 └┤ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4206 │ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4486 │ │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14359 │ │ ┌┼─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14588 │ │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC869 │ │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4401 │ │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4196 │ │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4113 │ │ ┌┤├─ Escherichia coli (32-487/491) O157:H7 str. EC4045 │ │ ││├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││└─ Escherichia coli (157-612/616) 1125A │ │ ││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 │ │ ┌┤└┬┴─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 │ │ ││ └┬─ Escherichia coli (157-602/602) O157:H7 str. Sakai │ │ ││ └─ Escherichia coli (157-602/602) O157:H7 │ │ ┌┤└─ Escherichia coli (157-612/616) 536A │ │ ││┌─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 │ │ │││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC508 │ │ │└┤┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 │ │ │ ││ ┌── Escherichia coli (157-610/614) O157:H7 str. EC4113 │ │ │ ││ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) 1125A │ │ │ └┤┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14588 │ │ │ ││┌─ Escherichia coli (157-612/616) 1212A └─┤ │ ││├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4024 │ │ ││├─ Escherichia coli (29-484/488) O157:H7 str. EC4076 │ │ └┤├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4196 │ ┌┤ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4401 │ ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4501 │ ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. Sakai │ ││ └┼─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14359 │ ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC869 │ ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4486 │ ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4206 │ ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4115 │ ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4045 │┌┤│ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 ││││ └─ Escherichia coli (157-612/616) 1044A │││└─ Escherichia coli (157-612/616) 536A │││ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) 1044A │││ ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4501 │││┌┼─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. TW14588 ││││├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. Sakai ││││└─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 ││└┤ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 EDL933 ││ │┌┴─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 EDL933 ││ ││┌─ Escherichia coli (157-612/616) 1125A ││ ││├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 ││ └┤├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4045 ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4115 ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC508 ││ └┼─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14359 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4206 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4076 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4042 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 EDL933 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) 536A └┤ └─ Escherichia coli (157-612/616) 1044A │ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) 1044A │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) 1212A │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4042 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4076 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4115 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4401 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC508 │ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. Sakai │ ┌┼─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14588 │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. TW14359 │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC869 │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4501 │ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4206 │┌┤├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4113 │││├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4045 │││├─ Escherichia coli (157-612/616) O157:H7 str. EC4024 │││├─ Escherichia coli (157-612/616) 536A │││└─ Escherichia coli (157-612/616) 1125A ││└┬─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 EDL933 ││ └─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 EDL933 ││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) E22 └┤ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) E22 │ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) O55:H7 str. CB9615 │ ┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) 2362-75 │┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) WV_060327 ││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) O103:H2 str. 12009 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 ││ ┌┼─ Escherichia coli (157-612/616) O55:H7 str. CB9615 ││ │├─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 └┤ ┌┤└─ Escherichia coli (114-569/573) O103:H2 str. 12009 │ │└┬─ Escherichia coli (157-612/616) O111:H- str. 11128 │┌┤ └─ Escherichia coli (157-612/616) O111:H- str. 11128 │││┌─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 ││└┤ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 ││ └┬┴─ Escherichia coli (157-612/616) E110019 └┤ └┬─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 │ └─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 │ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) O103:H2 str. 12009 │┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) O26:H11 str. 11368 ││ ┌─ Escherichia coli (157-612/616) O111:H- str. 11128 └┤┌┴─ Escherichia coli (157-612/616) O111:H- str. 11128 ││┌─ Escherichia coli (157-612/617) O26:H11 str. 11368 └┤│ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4113 ││┌┴─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4486 │││ ┌─ Escherichia coli (157-612/617) 1212A └┤│ ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 ││ ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. Sakai ││ ┌┼─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. TW14588 ││ │├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC869 └┤ │└─ Escherichia coli (157-612/617) 536A │┌┤┌─ Escherichia coli (157-612/617) 1212A │││├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4501 ││└┼─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. Sakai ││ ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 ││ └─ Escherichia coli (157-612/617) 1044A └┤┌─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4024 │├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4045 │├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4115 │├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4206 │├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC508 └┼─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. TW14359 ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4401 ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4196 ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4076 ├─ Escherichia coli (157-612/617) O157:H7 str. EC4042 └─ Escherichia coli (157-612/617) 1125A
| hypothetical protein | (176) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933V | (100) |
| FIG00639776: hypothetical protein | (3) |
| orf; Other or unknown (Phage or Prophage Related) | (2) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933R | (1) |
| unknown protein encoded within prophage CP-933U | (1) |
| conserved hypothetical protein similar to yjhS for cryptic prophage CP-933M | (1) |
| unknown protein encoded by prophage CP-933N | (1) |
| conserved hypothetical YjhS family protein encoded by cryptic prophage CP-933P | (1) |
| Others | (2) |